Intermolecular interactions in electron transfer through stretched helical peptides

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 14, Issue 29, 2012, Pages 10332-10344

  López Pérez, Daniel E ^a   Revilla López, Guillermo ^a   Jacquemin, Denis ^b   Zanuy, David ^a   Palys, Barbara ^c   Sek, Slawomir ^c   Alemán, Carlos ^a  

^a UNIVERSITAT POLITÈCNICA DE CATALUNYA   (Spain)

^b UNIVERSITÉ DE NANTES   (France)

^c UNIVERSITY OF WARSAW   (Poland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

OLIGOPEPTIDE; WATER;

ARTICLE; BIOMECHANICS; CHEMISTRY; ELECTRON; ELECTRON TRANSPORT; MECHANICS; MOLECULAR DYNAMICS; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; QUANTUM THEORY;

BIOMECHANICS; ELECTRON TRANSPORT; ELECTRONS; MECHANICAL PROCESSES; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; OLIGOPEPTIDES; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; QUANTUM THEORY; WATER;

EID: 84863676475     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2cp40761b     Document Type: Article

References (48)

1. S. S. Isied M. Y. Ogawa J. F. Wishart Chem. Rev. 1992 92 381 394
2. C. Shih A. K. Museth M. Abrahamsson A. M. Blanco-Rodriguez A. J. Di Bilio J. Sudhamsu B. R. Crane K. L. Ronayne M. Towrie A. Vlcek J. H. Richards J. R. Winkler H. B. Gray Science 2008 320 1760 1762
3. K. Fujita N. Nakamura H. Ohno B. S. Leigh K. Niki H. B. Gray J. H. Richards J. Am. Chem. Soc. 2004 126 13954 13961
4. T. Morita S. Kimura J. Am. Chem. Soc. 2003 125 8732 8733
5. X. Y. Xiao B. Q. Xu N. J. Tao J. Am. Chem. Soc. 2004 126 5370 5371
6. Y. Arikuma H. Nakayama M. Morita S. Kimura Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 1800 1804
7. M. Sisido S. Hoshino H. Kusano M. Kuragaki M. Makino H. Sasaki T. A. Smith K. P. Ghiggino J. Phys. Chem. B 2001 105 10407 10415
8. R. J. Brea L. Castedo J. R. Granja M. A. Herranz L. Sánchez N. Martín W. Seitz D. M. Guldi Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 5291 5294
9. E. Galoppini M. A. Fox J. Am. Chem. Soc. 1996 118 2299 2300
10. J. Gao P. Müller M. Wang S. Eckhardt M. Lauz K. M. Fromm B. Giese Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 1926 1930
11. H. B. Kraatz I. Bediako-Amoa S. H. Gyepi-Garbrah T. C. Sutherland J. Phys. Chem. B 2004 108 20164 20172
12. S. Sek A. Misicka K. Swiatek E. Maicka J. Phys. Chem. B 2006 110 19671 19677
13. S. Yasutomi T. Morita Y. Imanishi S. Kimura Science 2004 304 1944 1947
14. M. Kai K. Takeda T. Morita S. Kimura J. Pept. Sci. 2008 14 192 202
15. S. Sek A. Tolak A. Misicka B. Palys R. Bilewicz J. Phys. Chem. B 2005 109 18433 18438
16. K. Kitagawa T. Morita S. Kimura Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 6330 6333
17. J. Watanabe T. Morita S. Kimura J. Phys. Chem. B 2005 109 14416 14425
18. A. J. Wain H. N. L. Do H. S. Mandal H.-B. Kraatz F. Zhou J. Phys. Chem. C 2008 112 14513 14519
19. S. Antonello F. Formaggio A. Moretto C. Toniolo F. Maran J. Am. Chem. Soc. 2003 125 2874 2875
20. Y.-T. Long E. Abu-Rhayen H.-B. Kraatz Chem.-Eur. J. 2005 11 5186 5194
21. S. Sek K. Swiatek A. Misicka J. Phys. Chem. B 2005 109 23121 23124
22. M. M. Walczak D. D. Popenoe R. S. Deinhammer B. D. Lamp C. Chung M. D. Porter Langmuir 1991 7 2687 2693
23. J. Clavilier J. Electroanal. Chem. 1980 107 211 216
24. B. Xu N. J. Tao Science 2003 301 1221 1223
25. W. Haiss H. van Zalinge S. J. Higgins D. Bethell H. Hobenreich D. J. Schiffrin R. J. Nichols J. Am. Chem. Soc. 2003 125 15294 12595
26. F. Iori R. Di Felice E. Molinari S. Corni J. Comput. Chem. 2009 30 1465 1476
27. S. Kumaran R. P. Roy J. Pept. Res. 1999 53 284 293
28. W. D. Cornell P. Cieplak C. L. Bayly I. R. Gould K. M. Merz D. M. Ferguson D. C. Spellmeyer T. Fox J. W. Caldwell P. A. Kollman J. Am. Chem. Soc. 1995 117 5179 5197
29. W. L. Jorgensen J. Chandrasekhar J. D. Madura R. W. Impey M. L. Klein J. Chem. Phys. 1983 79 926 935
30. J. C. Phillips R. Braun W. Wang J. Gumbart E. Tajkhorshid E. Villa C. Chipot R. D. Skeel L. Kale K. Schulten J. Comput. Chem. 2005 26 1781 1802
31. A. Toukmaji C. Sagui J. Board T. Darden J. Chem. Phys. 2000 113 10913 10927
32. H. J. C. Berendsen J. P. M. Postma W. F. van Gunsteren A. DiNola J. R. Haak J. Chem. Phys. 1984 81 3684 3690
33. J. P. Ryckaert G. Ciccotti H. J. C. Berendsen J. Comput. Phys. 1977 23 327 341
34. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery Jr, J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski and D. J. Fox, Gaussian 09 Revision A.02, Gaussian Inc, Wallingford CT. 2009
35. J. D. Chai M. Head-Gordon Phys. Chem. Chem. Phys. 2008 10 6615 6620
36. K. S. Thanthiriwatte E. G. Hohenstein L. A. Burns D. C. Sherrill J. Chem. Theory Comput. 2011 7 88 96
37. L. A. Burns A. Vazquez-Mayagoitia B. G. Sumpter D. C. Sherrill J. Chem. Phys. 2011 134 084107
38. L. Goerigk S. Grimme Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 6670 6688
39. Y. Zhao J. Chem. Theory Comput. 2011 7 669 676
40. M. K. Shukla J. Leszczynski Mol. Phys. 2010 108 3131 3146
41. D. Jacquemin E. A. Perpète I. Ciofini C. Adamo Theor. Chem. Acc. 2011 128 127 136
42. S. Grimme J. Comput. Chem. 2006 27 1787 1799
43. K. Toyoda I. Hamada K. Lee S. Yanagisawa Y. Morikawa J. Chem. Phys. 2010 132 1347303
44. D. F. Kennedy M. Crisma C. Toniolo T. D. Chapman Biochemistry 1991 30 6541 6548
45. Y. Miura S. Kimura Y. Imanishi J. Umemura Langmuir 1998 14 6935 6940
46. G. Y. Liu S. Xu Y. Qian Acc. Chem. Res. 2000 33 457 466
47. L. Scullion T. Doneux L. Bouffier D. G. Fernig S. J. Higgins D. Bethell R. J. Nichols J. Phys. Chem. C 2011 115 8361 8368
48. B. Cappella G. Dietler Surf. Sci. Rep. 1999 34 1 3