Role of the N-terminal domain of the chaperone ClpX in the recognition and degradation of lambda phage protein O

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 116, Issue 23, 2012, Pages 6717-6724

  Thibault, Guillaume ^a   Houry, Walid A ^a  

^a UNIVERSITY OF TORONTO   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING SITES; BIOSENSORS; DEGRADATION; MACHINERY;

COFACTORS; DUAL POLARIZATION INTERFEROMETRY; HEXAMERS; HYDROPHOBIC PATCH; KEY ELEMENTS; N-TERMINAL DOMAINS; OPTICAL BIO-SENSORS; PROTEASE COMPLEX; PROTEIN QUALITY CONTROL; ZINC-BINDING DOMAINS;

PROTEINS;

EID: 84862272387     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp212024b     Document Type: Article

References (41)

1. Wickner, S.; Maurizi, M. R.; Gottesman, S. Science 1999, 286, 1888-1893
2. Thompson, M. W.; Maurizi, M. R. J. Biol. Chem. 1994, 269, 18201-18208
3. Brotz-Oesterhelt, H.; Beyer, D.; Kroll, H. P.; Endermann, R.; Ladel, C.; Schroeder, W.; Hinzen, B.; Raddatz, S.; Paulsen, H.; Henninger, K. Nat. Med. 2005, 11, 1082-1087
4. Leung, E.; Datti, A.; Cossette, M.; Goodreid, J.; McCaw, S. E.; Mah, M.; Nakhamchik, A.; Ogata, K.; El Bakkouri, M.; Cheng, Y. Q. Chem. Biol. 2011, 18, 1167-1178
5. Baker, T. A.; Sauer, R. T. Biochim. Biophys. Acta 2012, 1823, 15-28
6. Schirmer, E. C.; Glover, J. R.; Singer, M. A.; Lindquist, S. Trends Biochem. Sci. 1996, 21, 289-296
7. Wang, J.; Hartling, J. A.; Flanagan, J. M. Cell 1997, 91, 447-456
8. Donaldson, L. W.; Wojtyra, U.; Houry, W. A. J. Biol. Chem. 2003, 278, 48991-48996
9. Wojtyra, U. A.; Thibault, G.; Tuite, A.; Houry, W. A. J. Biol. Chem. 2003, 278, 48981-48990
10. Park, E. Y.; Lee, B. G.; Hong, S. B.; Kim, H. W.; Jeon, H.; Song, H. K. J. Mol. Biol. 2007, 367, 514-526
11. Thibault, G.; Yudin, J.; Wong, P.; Tsitrin, V.; Sprangers, R.; Zhao, R.; Houry, W. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 17724-17729
12. Kim, Y. I.; Burton, R. E.; Burton, B. M.; Sauer, R. T.; Baker, T. A. Mol. Cell 2000, 5, 639-648
13. Gribun, A.; Kimber, M. S.; Ching, R.; Sprangers, R.; Fiebig, K. M.; Houry, W. A. J. Biol. Chem. 2005, 280, 16185-16196
14. Sprangers, R.; Gribun, A.; Hwang, P. M.; Houry, W. A.; Kay, L. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 16678-16683
15. Kimber, M. S.; Yu, A. Y.; Borg, M.; Leung, E.; Chan, H. S.; Houry, W. A. Structure 2010, 18, 798-808
16. Gottesman, S.; Clark, W. P.; de Crecy-Lagard, V.; Maurizi, M. R. J. Biol. Chem. 1993, 268, 22618-22626
17. Wojtkowiak, D.; Georgopoulos, C.; Zylicz, M. J. Biol. Chem. 1993, 268, 22609-22617
18. Roberts, J. D.; McMacken, R. Nucleic Acids Res. 1983, 11, 7435-7452
19. Dodson, M.; Roberts, J.; McMacken, R.; Echols, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1985, 82, 4678-4682
20. Schnos, M.; Zahn, K.; Inman, R. B.; Blattner, F. R. Cell 1988, 52, 385-395
21. Zylicz, M.; Liberek, K.; Wawrzynow, A.; Georgopoulos, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 15259-15263
22. Wawrzynow, A.; Wojtkowiak, D.; Marszalek, J.; Banecki, B.; Jonsen, M.; Graves, B.; Georgopoulos, C.; Zylicz, M. EMBO J. 1995, 14, 1867-1877
23. Gonciarz-Swiatek, M.; Wawrzynow, A.; Um, S. J.; Learn, B. A.; McMacken, R.; Kelley, W. L.; Georgopoulos, C.; Sliekers, O.; Zylicz, M. J. Biol. Chem. 1999, 274, 13999-14005
24. Lehnherr, H.; Yarmolinsky, M. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 3274-3277
25. Frank, E. G.; Ennis, D. G.; Gonzalez, M.; Levine, A. S.; Woodgate, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 10291-10296
26. Levchenko, I.; Yamauchi, M.; Baker, T. A. Genes Dev. 1997, 11, 1561-1572
27. Zhou, Y.; Gottesman, S. J. Bacteriol. 1998, 180, 1154-1158
28. Flynn, J. M.; Neher, S. B.; Kim, Y. I.; Sauer, R. T.; Baker, T. A. Mol. Cell 2003, 11, 671-683
29. Weber-Ban, E. U.; Reid, B. G.; Miranker, A. D.; Horwich, A. L. Nature 1999, 401, 90-93
30. Levchenko, I.; Seidel, M.; Sauer, R. T.; Baker, T. A. Science 2000, 289, 2354-2356
31. Dougan, D. A.; Weber-Ban, E.; Bukau, B. Mol. Cell 2003, 12, 373-380
32. Thibault, G.; Tsitrin, Y.; Davidson, T.; Gribun, A.; Houry, W. A. EMBO J. 2006, 25, 3367-3376
33. Cross, G. H.; Reeves, A. A.; Brand, S.; Popplewell, J. F.; Peel, L. L.; Swann, M. J.; Freeman, N. J. Biosens. Bioelectron. 2003, 19, 383-390
34. Swann, M. J.; Peel, L. L.; Carrington, S.; Freeman, N. J. Anal. Biochem. 2004, 329, 190-198
35. Tanaka, N.; Tani, Y.; Hattori, H.; Tada, T.; Kunugi, S. Protein Sci. 2004, 13, 3214-3221
36. Hinnerwisch, J.; Reid, B. G.; Fenton, W. A.; Horwich, A. L. J.Biol. Chem. 2005, 280, 40838-40844
37. Barnett, M. E.; Nagy, M.; Kedzierska, S.; Zolkiewski, M. J. Biol. Chem. 2005, 280, 34940-34945
38. Chowdhury, T.; Chien, P.; Ebrahim, S.; Sauer, R. T.; Baker, T. A. Protein Sci. 2010, 19, 242-254
39. Wang, F.; Mei, Z.; Qi, Y.; Yan, C.; Hu, Q.; Wang, J.; Shi, Y. Nature 2011, 471, 331-335
40. Bolon, D. N.; Wah, D. A.; Hersch, G. L.; Baker, T. A.; Sauer, R. T. Mol. Cell 2004, 13, 443-449
41. Larkin, M. A.; Blackshields, G.; Brown, N. P.; Chenna, R.; McGettigan, P. A.; McWilliam, H.; Valentin, F.; Wallace, I. M.; Wilm, A.; Lopez, R. Bioinformatics 2007, 23, 2947-2948