Newborn umbilical cord blood DNA methylation and gene expression levels exhibit limited association with birth weight

Chemistry and Biodiversity

Volumn 9, Issue 5, 2012, Pages 888-899

  Adkins, Ronald M ^a   Tylavsky, Frances A ^a   Krushkal, Julia ^a  

^a UNIVERSITY OF TENNESSEE HEALTH SCIENCE CENTER   (United States)

Author keywords

DNA Methylation; Fetal growth restriction; Gene expression; Systems biology

Indexed keywords

AGGRECAN; DNA; GLUCOCORTICOID RECEPTOR; LEPTIN RECEPTOR; PROTEIN SERINE THREONINE KINASE; TRANSFORMING GROWTH FACTOR BETA; WNT2 PROTEIN;

AFRICAN AMERICAN; BIRTH WEIGHT; BLOOD LEVEL; CAUCASIAN; CONFERENCE PAPER; CORRELATION ANALYSIS; DNA METHYLATION; FETUS GROWTH; GENE EXPRESSION; GENE LOCUS; GENETIC ASSOCIATION; GESTATIONAL AGE; HUMAN; INTRAUTERINE GROWTH RETARDATION; LARGE FOR GESTATIONAL AGE; LEUKOCYTE; MOLECULAR DYNAMICS; NEWBORN; NEWBORN CARE; PARITY; PLACENTA; POSTNATAL GROWTH; PRENATAL GROWTH; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; SHORT STATURE; SMALL FOR DATE INFANT; UMBILICAL CORD BLOOD;

ADOLESCENT; ADULT; BIRTH WEIGHT; COHORT STUDIES; DNA METHYLATION; FEMALE; FETAL BLOOD; GENE EXPRESSION; GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY; GESTATIONAL AGE; HUMANS; INFANT, NEWBORN; LONGITUDINAL STUDIES; MALE; MOTHERS; PREGNANCY; PROTEINS; RISK FACTORS; YOUNG ADULT;

EID: 84861305389     PISSN: 16121872     EISSN: 16121880     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbdv.201100395     Document Type: Conference Paper

References (65)

1. W. W. Hay Jr., C. S. Catz, G. D. Grave, S. J. Yaffe, Pediatrics 1997, 99, 585.
2. M. W. Gillman, D. Barker, D. Bier, F. Cagampang, J. Challis, C. Fall, K. Godfrey, P. Gluckman, M. Hanson, D. Kuh, P. Nathanielsz, P. Nestel, K. L. Thornburg, Pediatr. Res. 2007, 61, 625.
3. D. J. Barker, 'Mother, babies, and health in later life', London, Churchill Livingstone, 1998, p. 13.
4. O. Basso, A. J. Wilcox, C. R. Weinberg, Am. J. Epidemiol. 2006, 164, 303.
5. F. Eckhardt, J. Lewin, R. Cortese, V. K. Rakyan, J. Attwood, M. Burger, J. Burton, T. V. Cox, R. Davies, T. A. Down, C. Haefliger, R. Horton, K. Howe, D. K. Jackson, J. Kunde, C. Koenig, J. Liddle, D. Niblett, T. Otto, R. Pettett, S. Seemann, C. Thompson, T. West, J. Rogers, A. Olek, K. Berlin, S. Beck, Nat. Genet. 2006, 38, 1378.
6. V. K. Rakyan, T. Hildmann, K. L. Novik, J. Lewin, J. Tost, A. V. Cox, T. D. Andrews, K. L. Howe, T. Otto, A. Olek, J. Fischer, I. G. Gut, K. Berlin, S. Beck, PLoS Biol. 2004, 2, e405.
7. F. Song, J. F. Smith, M. T. Kimura, A. D. Morrow, T. Matsuyama, H. Nagase, W. A. Held, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 3336.
8. M. K. Skinner, Birth Defects Res., Part C 2011, 93, 51.
9. T. Enklaar, B. U. Zabel, D. Prawitt, Expert Rev. Mol. Med. 2006, 8, 1.
10. C. Gicquel, S. Rossignol, S. Cabrol, M. Houang, V. Steunou, V. Barbu, F. Danton, N. Thibaud, M. Le Merrer, L. Burglen, A.-M. Bertrand, I. Netchine, Y. Le Bouc, Nat. Genet. 2005, 37, 1003.
11. J. Bliek, P. Terhal, M.-J. van den Bogaard, S. Maas, B. Hamel, G. Salieb-Beugelaar, M. Simon, T. Letteboer, J. van der Smagt, H. Kroes, M. Mannens, Am. J. Hum. Genet. 2006, 78, 604.
12. T. Eggermann, N. Schönherr, K. Eggermann, K. Buiting, M. B. Ranke, H. A. Wollmann, G. Binder, Clin. Genet. 2008, 73, 79.
13. I. Netchine, S. Rossignol, M.-N. Dufourg, S. Azzi, A. Rousseau, L. Perin, M. Houang, V. Steunou, B. Esteva, N. Thibaud, M.-C. Raux Demay, F. Danton, E. Petriczko, A.-M. Bertrand, C. Heinrichs, J.-C. Carel, G.-A. Loeuille, G. Pinto, M.-L. Jacquemont, C. Gicquel, S. Cabrol, Y. Le Bouc, J. Clin. Endocrinol. Metab. 2007, 92, 3148.
14. T. Eggermann, K. Eggermann, N. Schönherr, Trends Genet. 2008, 24, 195.
15. B. T. Heijmans, D. Kremer, E. W. Tobi, D. I. Boomsma, P. E. Slagboom, Hum. Mol. Genet. 2007, 16, 195.
16. A. P. Feinberg, R. A. Irizarry, D. Fradin, M. J. Aryee, P. Murakami, T. Aspelund, G. Eiriksdottir, T. B. Harris, L. Launer, V. Gudnason, M. D. Fallin, Sci. Transl. Med. 2010, 2, 49.
17. J. C. Ferreira, S. Choufani, D. Grafodatskaya, D. T. Butcher, C. Zhao, D. Chitayat, C. Shuman, J. Kingdom, S. Keating, R. Weksberg, Epigenetics 2011, 6, 440.
18. A. C. Filiberto, M. A. Maccani, D. Koestler, C. Wilhelm-Benartzi, M. Avissar-Whiting, C. E. Banister, L. A. Gagne, C. J. Marsit, Epigenetics 2011, 6, 566.
19. A. A. Fryer, R. D. Emes, K. M. K. Ismail, K. E. Haworth, C. Mein, W. D. Carroll, W. E. Farrell, Epigenetics 2011, 6, 86.
20. E. W. Tobi, B. T. Heijmans, D. Kremer, H. Putter, H. A. Delemarre-van de Waal, M. J. J. Finken, J. M. Wit, P. E. Slagboom, Epigenetics 2011, 6, 171.
21. S. Apostolidou, S. Abu-Amero, K. O'Donoghue, J. Frost, O. Olafsdottir, K. M. Chavele, J. C. Whittaker, P. Loughna, P. Stanier, G. E. Moore, J. Mol. Med. (Berlin) 2007, 85, 379.
22. J. Bassols, A. Prats-Puig, M. Vázquez-Ruíz, M.-M. García-González, M. Martinez-Pascual, P. Avellí, R. Martínez-Martínez, R. Fàbrega, C. Colomer-Virosta, P. Soriano-Rodríguez, M. Díaz, F. de Zegher, L. Ibánez, A. López-Bermejo, Int. J. Obes. (London) 2010, 34, 1365.
23. M. Koutsaki, S. Sifakis, A. Zaravinos, D. Koutroulakis, O. Koukoura, D. A. Spandidos, Growth Horm. IGF Res. 2011, 21, 31.
24. J. Männik, P. Vaas, K. Rull, P. Teesalu, T. Rebane, M. Laan, J. Clin. Endocrinol. Metab. 2010, 95, 2433.
25. J. McMinn, M. Wei, N. Schupf, J. Cusmai, E. B. Johnson, A. C. Smith, R. Weksberg, H. M. Thaker, B. Tycko, Placenta 2006, 27, 540.
26. C. L. McTernan, N. Draper, H. Nicholson, S. M. Chalder, P. Driver, M. Hewison, M. D. Kilby, P. M. Stewart, J. Clin. Endocrinol. Metab. 2001, 86, 4979.
27. V. Mericq, P. Medina, E. Kakarieka, L. Márquez, M. C. Johnson, G. Iñiguez, Eur. J. Endocrinol. 2009, 161, 419.
28. P. Murthi, J. M. Said, V. L. Doherty, S. Donath, C. J. Nowell, S. P. Brennecke, B. Kalionis, Mol. Hum. Reprod. 2006, 12, 763.
29. S. Sheikh, P. Satoskar, D. Bhartiya, Mol. Hum. Reprod. 2001, 7, 287.
30. E. Struwe, G. M. Berzl, R. L. Schild, M. W. Beckmann, H. G. Dörr, W. Rascher, J. Dötsch, Am. J. Obstet. Gynecol. 2007, 197, 43.
31. A. Tzschoppe, E. Struwe, H. Blessing, F. Fahlbusch, G. Liebhaber, H. G. Dörr, M. Rauh, W. Rascher, T. W. Goecke, R. L. Schild, E. Schleussner, C. Scheler, A. Hübler, P. Dahlem, J. Dötsch, Pediatr. Res. 2009, 65, 647.
32. E. Struwe, G. M. Berzl, R. L. Schild, J. Dötsch, Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol. 2009, 142, 38.
33. C. Buffat, F. Mondon, V. Rigourd, F. Boubred, B. Bessières, L. Fayol, J.-M. Feuerstein, M. Gamerre, H. Jammes, R. Rebourcet, F. Miralles, B. Courbières, A. Basire, F. Dignat-Georges, B. Carbonne, U. Simeoni, D. Vaiman, J. Pathol. 2007, 213, 337.
34. R. M. Adkins, F. Thomas, F. A. Tylavsky, J. Krushkal, BMC Med. Genet. 2011, 12, 47.
35. R. M. Adkins, J. Krushkal, C. K. Klauser, E. F. Magann, J. C. Morrison, G. Somes, Int. J. Obes. (London) 2008, 32, 372.
36. R. M. Adkins, J. Krushkal, E. F. Magann, C. K. Klauser, J. C. Morrison, R. Ramsey, G. Somes, Int. J. Pediatr. Obes. 2010, 5, 177.
37. R. M. Adkins, G. Somes, J. C. Morrison, J. B. Hill, E. M. Watson, E. F. Magann, J. Krushkal, Pediatr. Res. 2010, 68, 429.
38. V. L. Clifton, Placenta 2010, 31, S33.
39. K. L. Gatford, R. A. Simmons, M. J. De Blasio, J. S. Robinson, J. A. Owens, Placenta 2010, 31, S60.
40. K. L. Thornburg, P. F. O'Tierney, S. Louey, Placenta 2010, 31, S54.
41. J. R. Britton, Birth 1998, 25, 161.
42. J. S. Mercer, R. L. Skovgaard, J. Perinat. Neonat. Nurs. 2002, 15, 56.
43. R. K. C. Yuen, S. M. A. Neumann, A. K. Fok, M. S. Penaherrera, D. E. McFadden, W. P. Robinson, M. S. Kobor, Epigenet. Chromatin 2011, 4, 7.
44. R. C. Schoen, S. H. Cox, R. P. Wagner, Am. J. Hum. Genet. 1984, 36, 815.
45. Y. Itoh, Y. Kawamata, M. Harada, M. Kobayashi, R. Fujii, S. Fukusumi, K. Ogi, M. Hosoya, Y. Tanaka, H. Uejima, H. Tanaka, M. Maruyama, R. Satoh, S. Okubo, H. Kizawa, H. Komatsu, F. Matsumura, Y. Noguchi, T. Shinohara, S. Hinuma, Y. Fujisawa, M. Fujino, Nature 2003, 422, 173.
46. K. Ishibashi, M. Kuwahara, Y. Kageyama, S. Sasaki, M. Suzuki, M. Imai, in 'Molecular Biology and Physiology of Water and Solute Transport', Eds. S. Hohmann, S. Nielsen, Kluwer Academic/Plenum Publishers, New York, 2000, p. 123.
47. A. S. Green, P. J. Rozance, S. W. Limesand, J. Endocrinol. 2010, 205, 211.
48. M. Higgins, F. M. Auliffe, M. Soubt, B. E. Dunning, J. E. Foley, Curr. Diabetes Rev. 2010, 6, 116.
49. G. Carbunaru, P. Prasad, B. Scoccia, P. Shea, N. Hopwood, F. Ziai, Y. T. Chang, S. E. Myers, J. I. Mason, S. Pang, J. Clin. Endocrinol. Metab. 2004, 89, 783.
50. W. T. Parks, D. B. Frank, C. Huff, C. Renfrew Haft, J. Martin, X. Meng, M. P. de Caestecker, J. G. McNally, A. Reddi, S. I. Taylor, A. B. Roberts, T. Wang, R. J. Lechleider, J. Biol. Chem. 2001, 276, 19332.
51. T. Boutsikou, A. Malamitsi-Puchner, E. Economou, M. Boutsikou, K. P. Puchner, D. Hassiakos, Early Hum. Dev. 2005, 82, 235.
52. T. R. H. Regnault, B. de Vrijer, H. L. Galan, M. L. Davidsen, K. A. Trembler, F. C. Battaglia, R. B. Wilkening, R. V. Anthony, J. Physiol. 2003, 550, 641.
53. J. Nakae, Y. Kido, D. Accili, Endocrinol. Rev. 2001, 22, 818.
54. K. I. Rother, D. Accili, Pediatr. Nephrol. 2000, 14, 558.
55. J. M. Guízar-Mendoza, N. Amador-Licona, S. E. Flores- Martínez, M. G. López-Cardona, R. Ahuatzin-Trémary, J. Sánchez-Corona, J. Hum. Hypertens. 2005, 19, 341.
56. T. Salopuro, L. Pulkkinen, J. Lindström, J. G. Eriksson, T. T. Valle, H. Hämäläinen, P. Ilanne-Parikka, S. Keinänen- Kiukaanniemi, J. Tuomilehto, M. Laakso, M. Uusitupa, Int. J. Obes. Relat. Metab. Disord. 2005, 29, 1245.
57. D. C. Dias, G. Dolios, R. Wang, Z.-Q. Pan, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 16601.
58. Z. Gu, C. Flemington, T. Chittenden, G. P. Zambetti, Mol. Cell. Biol. 2000, 20, 233.
59. J. A. Cavanagh, I. Tammen, P. A. Windsor, J. F. Bateman, R. Savarirayan, F. W. Nicholas, H. W. Raadsma, Mamm. Genome 2007, 18, 808.
60. L. Gleghorn, R. Ramesar, P. Beighton, G. Wallis, Am. J. Hum. Genet. 2005, 77, 484.
61. S. W. Tompson, B. Merriman, V. A. Funari, M. Fresquet, R. S. Lachman, D. L. Rimoin, S. F. Nelson, M. D. Briggs, D. H. Cohn, D. Krakow, Am. J. Hum. Genet. 2009, 84, 72.
62. H. Watanabe, K. Nakata, K. Kimata, I. Nakanishi, Y. Yamada, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 6943.
63. W. E. Johnson, C. Li, A. Rabinovic, Biostatistics 2007, 8, 118.
64. S. M. Lin, P. Du, W. Huber, W. A. Kibbe, Nucleic Acids Res. 2008, 36, e11.
65. R. C. Gentleman, V. J. Carey, D. M. Bates, B. Bolstad, M. Dettling, S. Dudoit, B. Ellis, L. Gautier, Y. Ge, J. Gentry, K. Hornik, T. Hothorn, W. Huber, S. Iacus, R. Irizarry, F. Leisch, C. Li, M. Maechler, A. J. Rossini, G. Sawitzki, C. Smith, G. Smyth, L. Tierney, J. Y. H. Yang, J. Zhang, Genome Biol. 2004, 5, R80.