Sequence specific association of tryptic peptides with multiwalled carbon nanotubes: Effect of localization of hydrophobic residues

Biomacromolecules

Volumn 13, Issue 5, 2012, Pages 1410-1419

  Deshpande, Megha S ^a   Mazumdar, Shyamalava ^a  

^a TATA INSTITUTE OF FUNDAMENTAL RESEARCH   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMPHIPHILICS; FTIR; HOMOGENEOUS DISPERSIONS; HYDROPHOBIC RESIDUES; MODEL FREE; MODEL-BASED OPC; MOLECULAR BASIS; SEQUENCE ANALYSIS; STABLE DISPERSIONS; TANDEM MS; TRYPTIC DIGESTION; TRYPTIC PEPTIDES;

ASSOCIATION REACTIONS; CIRCULAR DICHROISM SPECTROSCOPY; DISPERSIONS; HYDROPHOBICITY; MULTIWALLED CARBON NANOTUBES (MWCN); NANOTUBES;

PEPTIDES;

MULTI WALLED NANOTUBE; PEPTIDE;

ABSORPTION; AQUEOUS SOLUTION; ARTICLE; CIRCULAR DICHROISM; CONTROLLED STUDY; DISPERSION; HYDROPHOBICITY; INFRARED SPECTROSCOPY; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR INTERACTION; NEAR INFRARED SPECTROSCOPY; PH; PRIORITY JOURNAL; RAMAN SPECTROMETRY; SEQUENCE ANALYSIS; TRANSMISSION ELECTRON MICROSCOPY;

CAMPHOR 5-MONOOXYGENASE; HYDROPHOBIC AND HYDROPHILIC INTERACTIONS; MODELS, MOLECULAR; NANOTUBES, CARBON; PARTICLE SIZE; PEPTIDES; PSEUDOMONAS PUTIDA; SURFACE PROPERTIES;

EID: 84861141333     PISSN: 15257797     EISSN: 15264602     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/bm300137d     Document Type: Article

References (60)

1. Zorbas, V.; Smith, A. L.; Xie, H.; Ortiz-Acevedo, A.; Dalton, A. B.; Dieckmann, G. R.; Draper, R. K.; Baughman, R. H.; Musselman, I. H. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127 (35) 12323-8
2. Bianco, A.; Prato, M. Adv. Mater. 2003, 15 (20) 1765-1768
3. Ajayan, P. M. Chem. Rev. 1999, 99 (7) 1787-1800
4. Xin, H.; Woolley, A. T. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125 (29) 8710-1
5. Chen, R. J.; Zhang, Y.; Wang, D.; Dai, H. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123 (16) 3838-9
6. Williams, K. A.; Veenhuizen, P. T.; de la Torre, B. G.; Eritja, R.; Dekker, C. Nature 2002, 420 (6917) 761
7. Liu, Z.; Sun, X.; Nakayama-Ratchford, N.; Dai, H. ACS Nano 2007, 1 (1) 50-56
8. Bhirde, A. A.; Patel, V.; Gavard, J.; Zhang, G.; Sousa, A. A.; Masedunskas, A.; Leapman, R. D.; Weigert, R.; Gutkind, J. S.; Rusling, J. F. ACS Nano 2009, 3 (2) 307-316
9. Welsher, K.; Liu, Z.; Daranciang, D.; Dai, H. Nano Lett. 2008, 8 (2) 586-90
10. Tasis, D.; Tagmatarchis, N.; Bianco, A.; Prato, M. Chem. Rev. 2006, 106 (3) 1105
11. Moore, V. C.; Strano, M. S.; Haroz, E. H.; Hauge, R. H.; Smalley, R. E. Nano Lett. 2003, 3 (10) 1379
12. Rao, A. M.; Richter, E.; Bandow, S.; Chase, B.; Eklund, P. C.; Williams, K. A.; Fang, S.; Subbaswamy, K. R.; Menon, M.; Thess, A.; Smalley, R. E.; Dresselhaus, G.; Dresselhaus, M. S. Science 1997, 275 (5297) 187-91
13. Bandow, S.; Rao, A. M.; Williams, K. A.; Thess, A.; Smalley, R. E.; Eklund, P. C. J. Phys. Chem. B 1997, 101 (44) 8839
14. Bachilo, S. M.; Strano, M. S.; Kittrell, C.; Hauge, R. H.; Smalley, R. E.; Weisman, R. B. Science 2002, 298 (5602) 2361-6
15. Wang, H.; Zhou, W.; Ho, D. L.; Winey, K. I.; Fischer, J. E.; Glinka, C. J.; Hobbie, E. K. Nano Lett. 2004, 4 (9) 1789
16. Riggs, J. E.; Walker, D. B.; Carroll, D. L.; Sun, Y.-P. J. Phys. Chem. B 2000, 104 (30) 7071
17. Gong, X. Y.; Liu, J.; Baskaran, S.; Voise, R. D.; Young, J. S. Chem. Mater. 2000, 12 (4) 1049
18. Arnold, M. S.; Green, A. A.; Hulvat, J. F.; Stupp, S. I.; Hersam, M. C. Nat. Nano 2006, 1, 60-65
19. Grant, R. L.; Acosta, D. Fundam. Appl. Toxicol. 1996, 33 (1) 71-82
20. Dong, L.; Joseph, K. L.; Witkowski, C. M.; Craig, M. M. Nanotechnology 2008, 19 (25) 255702
21. Tamerler, C.; Sarikaya, M. ACS Nano 2009, 3 (7) 1606-1615
22. Kriplani, U.; Kay, B. K. Curr. Opin. Biotechnol. 2005, 16 (4) 470-5
23. Whaley, S. R.; English, D. S.; Hu, E. L.; Barbara, P. F.; Belcher, A. M. Nature 2000, 405 (6787) 665-8
24. Hartgerink, J. D.; Clark, T. D.; Ghadiri, M. R. Chem.-Eur. J. 1998, 4 (8) 1367
25. Kong, J.; Franklin, N. R.; Zhou, C.; Chapline, M. G.; Peng, S.; Cho, K.; Dai, H. Science 2000, 287 (5453) 622-5
26. Dai, H.; Kong, J.; Zhou, C.; Franklin, N.; Tombler, T.; Cassell, A.; Fan, S.; Chapline, M. J. Phys. Chem. B 1999, 103 (51) 11246
27. Kuang, Z.; Kim, S. N.; Crookes-Goodson, W. J.; Farmer, B. L.; Naik, R. R. ACS Nano 2010, 4 (1) 452-458
28. Witus, L. S.; Rocha, J.-D. R.; Yuwono, V. M.; Paramonov, S. E.; Weisman, R. B.; Hartgerink, J. D. J. Mater. Chem. 2007, 17 (19) 1909
29. Salzmann, C. G.; Ward, M. A. H.; Jacobs, R. M. J.; Tobias, G.; Green, M. L. H. J. Phys. Chem. C 2007, 111 (50) 18520
30. Arnold, M. S.; Guler, M. O.; Hersam, M. C.; Stupp, S. I. Langmuir 2005, 21 (10) 4705-9
31. Ortiz-Acevedo, A.; Xie, H.; Zorbas, V.; Sampson, W. M.; Dalton, A. B.; Baughman, R. H.; Draper, R. K.; Musselman, I. H.; Dieckmann, G. R. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127 (26) 9512-7
32. Wang, S.; Humphreys, E. S.; Chung, S. Y.; Delduco, D. F.; Lustig, S. R.; Wang, H.; Parker, K. N.; Rizzo, N. W.; Subramoney, S.; Chiang, Y. M.; Jagota, A. Nat. Mater. 2003, 2 (3) 196-200
33. Zheng, L.; Jain, D.; Burke, P. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 3978-3985
34. Poenitzsch, V. Z.; Winters, D. C.; Xie, H.; Dieckmann, G. R.; Dalton, A. B.; Musselman, I. H. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129 (47) 14724-32
35. Brahmachari, S.; Das, D.; Shome, A.; Das, P. K. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50 (47) 11243-7
36. Cousins, B. G.; Das, A. K.; Sharma, R.; Li, Y.; McNamara, J. P.; Hillier, I. H.; Kinloch, I. A.; Ulijn, R. V. Small 2009, 5 (5) 587-90
37. Liu, Z.; Tabakman, S.; Welsher, K.; Dai, H. Nano Res. 2009, 2 (2) 85-120
38. Alves, P.; Arnold, R. J.; Clemmer, D. E.; Li, Y.; Reilly, J. P.; Sheng, Q.; Tang, H.; Xun, Z.; Zeng, R.; Radivojac, P. Bioinformatics 2008, 24 (1) 102
39. Behera, R. K.; Mazumdar, S. Biophys. Chem. 2008, 135 (1-3) 1-6
40. Manna, S. K.; Mazumdar, S. Biochemistry 2006, 45 (42) 12715-22
41. Manna, S. K.; Mazumdar, S. Dalton Trans. 2010, 39 (12) 3115-23
42. Dieckmann, G. R.; Dalton, A. B.; Johnson, P. A.; Razal, J.; Chen, J.; Giordano, G. M.; Munoz, E.; Musselman, I. H.; Baughman, R. H.; Draper, R. K. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125 (7) 1770-7
43. Bakota, E. L.; Aulisa, L.; Tsyboulski, D. A.; Weisman, R. B.; Hartgerink, J. D. Biomacromolecules 2009, 10 (8) 2201-6
44. Eisenberg, D.; Schwarz, E.; Komaromy, M.; Wall, R. J. Mol. Biol. 1984, 179 (1) 125-142
45. Lu, Z.; Duan, J.; He, L.; Hu, Y.; Yin, Y. Anal. Chem. 2010, 82 (17) 7249-7258
46. Blanch, A. J.; Lenehan, C. E.; Quinton, J. S. J. Phys. Chem. B 2010, 114 (30) 9805-11
47. Bonard, J. M.; Stora, T.; Salvetat, J. P.; Maier, F.; Stockli, T.; Duschl, C.; Forro, L.; De Heer, W. A.; Chatelain, A. Adv. Mater. 1997, 9 (10) 827
48. Liu, Z.; Zhang, J.; Gao, B. Chem. Commun. 2009, 45, 6902
49. Bendiab, N.; Spina, L.; Zahab, A.; Poncharal, P.; Marlière, C.; Bantignies, J. L.; Anglaret, E.; Sauvajol, J. L. Phys. Rev. B 2001, 63 (15) 153407
50. Rao, A. M.; Eklund, P. C.; Bandow, S.; Thess, A.; Smalley, R. A. Nature 1997, 388 (6639) 257
51. Surewicz, W. K.; Mantsch, H. H.; Stahl, G. L.; Epand, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1987, 84 (20) 7028-30
52. Haris, P. I.; Chapman, D. Biopolymers 1995, 37 (4) 251-63
53. Singh, K. V.; Pandey, R. R.; Wang, X.; Lake, R.; Ozkan, C. S.; Wang, K.; Ozkan, M. Carbon 2006, 44 (9) 1730
54. Kong, J.; Yu, S. Acta Biochim. Biophys. Sin. 2007, 39 (8) 549-559
55. Su, Z.; Mui, K.; Daub, E.; Leung, T.; Honek, J. J. Phys. Chem. B 2007, 111 (51) 14411-7
56. Cheng, Y.; Liu, G. R.; Li, Z. R.; Lu, C. Phys. A 2006, 367, 293-304
57. Su, Z.; Leung, T.; Honek, J. F. J. Phys. Chem. B 2006, 110 (47) 23623-7
58. Pender, M. J.; Sowards, L. A.; Hartgerink, J. D.; Stone, M. O.; Naik, R. R. Nano Lett. 2006, 6 (1) 40-4
59. Li, X.; Chen, W.; Zhan, Q.; Dai, L.; Sowards, L.; Pender, M.; Naik, R. R. J. Phys. Chem. B 2006, 110 (25) 12621-5
60. Grigoryan, G.; Kim, Y. H.; Acharya, R.; Axelrod, K.; Jain, R. M.; Willis, L.; Drndic, M.; Kikkawa, J. M.; DeGrado, W. F. Science 2011, 332 (6033) 1071-6