Do monovalent mobile ions affect DNA's flexibility at high salt content?

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 14, Issue 7, 2012, Pages 2250-2254

  Savelyev, Alexey ^a,b  

^a INSTITUTE OF APPLIED PHYSICS   (Ukraine)

^b The University of North Carolina at Chapel Hill   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; INORGANIC SALT; ION;

ARTICLE; CHEMISTRY; CONFORMATION; MOLECULAR DYNAMICS;

DNA; IONS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; NUCLEIC ACID CONFORMATION; SALTS;

EID: 84856748887     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2cp23499h     Document Type: Article

References (39)

1. J. P. Peters L. J. Maher Q. Rev. Biophys. 2010 43 23 63
2. K. E. van Holde, Chromatin, Springer, New York, 1989
3. H. Schiessel J. Phys.: Condens. Matter 2003 15 R699 R774
4. K. Luger A. W. Mader R. K. Richmond D. F. Sargent T. J. Richmond Nature 1997 389 251 260
5. C. K. Materese A. Savelyev G. A. Papoian J. Am. Chem. Soc. 2009 131 15005 15013
6. A. Savelyev G. A. Papoian Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 20340 20345
7. G. Voordouw Z. Kam N. Borochov H. Eisenberg Biophys. Chem. 1978 8 171 189
8. Z. Kam N. Borochov H. Eisenberg Biopolymers 1981 20 2671 2690
9. N. Borochov H. Eisenberg Z. Kam Biopolymers 1981 20 231 235
10. E. S. Sobel J. A. Harpst Biopolymers 1991 31 1559 1564
11. R. E. Harrington Biopolymers 1978 17 919 936
12. K. L. Cairney R. E. Harrington Biopolymers 1982 21 923 934
13. V. Rizzo J. Schellman Biopolymers 1981 20 2143 2163
14. P. J. Hagerman Biopolymers 1981 20 1503 1535
15. P. J. Hagerman Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1988 17 265 286
16. R. J. Lewis R. Pecora D. Eden Macromolecules 1986 19 134 139
17. G. Maret G. Weill Biopolymers 1983 22 2727 2744
18. C. G. Baumann S. B. Smith V. A. Bloomfield C. Bustamante Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1997 94 6185 6190
19. T. Odijk J. Polym. Sci., Polym. Phys. Ed. 1977 15 477 483
20. J. Skolnick M. Fixman Macromolecules 1977 10 944 948
21. G. S. Manning Biophys. J. 2006 91 3607 3616
22. J. B. Mills E. Vacano P. J. Hagerman J. Mol. Biol. 1999 285 245 257
23. J. B. Mills P. J. Hagerman Nucleic Acids Res. 2004 32 4055 4059
24. A. Podesta M. Indrieri D. Brogioli G. S. Manning P. Milani R. Guerra L. Finzi D. Dunlap Biophys. J. 2005 89 2558 2563
25. L. D. Williams L. J. Maher Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2000 29 497 521
26. V. A. Bloomfield Biopolymers 1997 44 269 282
27. A. Savelyev C. K. Materese G. A. Papoian J. Am. Chem. Soc. 2011 133 19290 19293
28. A. Savelyev G. A. Papoian J. Am. Chem. Soc. 2006 128 14506 14518
29. A. Savelyev G. A. Papoian J. Am. Chem. Soc. 2007 129 6060 6061
30. J. Langowski Eur. Phys. J. E 2006 19 241 249
31. G. Arya Q. Zhang T. Schlick Biophys. J. 2006 91 133 150
32. T. A. Knotts N. Rathore D. Schwartz J. J. de Pablo J. Chem. Phys. 2007 126 084901
33. A. Savelyev G. A. Papoian Biophys. J. 2009 96 4044 4052
34. A. Savelyev G. A. Papoian J. Phys. Chem. B 2009 113 7785 7793
35. O. Kohlbacher H. P. Lenhof Bioinformatics 2000 16 815 824
36. S. Plimpton J. Comput. Phys. 1995 117 1 19
37. M. Doi and S. Edwards, The theory of polymer dynamics, Oxford Science Publications, 1986
38. G. S. Manning Biopolymers 1981 20 1751 1755
39. C. B. Post Biopolymers 1983 22 1087 1096