Substructure-Based Virtual Screening for Adenosine A 2A Receptor Ligands

ChemMedChem

Volumn 6, Issue 12, 2011, Pages 2302-2311

  vanderHorst, Eelke ^a   vanderPijl, Rianne ^a   Mulder Krieger, Thea ^a   Bender, Andreas ^a,b   Ijzerman, Adriaan P ^a  

^a LEIDEN UNIVERSITY   (Netherlands)

^b UNIVERSITY OF CAMBRIDGE   (United Kingdom)

Author keywords

Adenosine A 2A receptor; Antagonists; Drug discovery; GPCRs; Virtual screening

Indexed keywords

ADENOSINE A2A RECEPTOR; RADIOLIGAND;

ARTICLE; CONCENTRATION RESPONSE; CONTROLLED STUDY; CRYSTAL STRUCTURE; EVALUATION; HUMAN; HUMAN CELL; LIGAND BINDING; PRIORITY JOURNAL; VIRTUAL REALITY; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

ADENOSINE A2 RECEPTOR ANTAGONISTS; DRUG EVALUATION, PRECLINICAL; HUMANS; LIGANDS; PROTEIN BINDING; RECEPTOR, ADENOSINE A2A; SOFTWARE; STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP;

EID: 82955196855     PISSN: 18607179     EISSN: 18607187     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cmdc.201100369     Document Type: Article

References (40)

1. R. Fredriksson, M. C. Lagerström, L.-G. Lundin, H. B. Schioth, Mol. Pharmacol. 2003, 63, 1256-1272.
2. M. C. Lagerström, H. B. Schioth, Nat. Rev. Drug Discovery 2008, 7, 339-357.
3. J. P. Overington, B. Al-Lazikani, A. L. Hopkins, Nat. Rev. Drug Discovery 2006, 5, 993-996.
4. K. Palczewski, T. Kumasaka, T. Hori, C. A. Behnke, H. Motoshima, B. A. Fox, I. L. Trong, D. C. Teller, T. Okada, R. E. Stenkamp, M. Yamamoto, M. Miyano, Science 2000, 289, 739-745.
5. V. Cherezov, D. M. Rosenbaum, M. A. Hanson, S. G. F. Rasmussen, F. S. Thian, T. S. Kobilka, H.-J. Choi, P. Kuhn, W. I. Weis, B. K. Kobilka, R. C. Stevens, Science 2007, 318, 1258-1265.
6. T. Warne, M. J. Serrano-Vega, J. G. Baker, R. Moukhametzianov, P. C. Edwards, R. Henderson, A. G. W. Leslie, C. G. Tate, G. F. X. Schertler, Nature 2008, 454, 486-491.
7. V. Jaakola, M. T. Griffith, M. A. Hanson, V. Cherezov, E. Y. T. Chien, J. R. Lane, A. P. IJzerman, R. C. Stevens, Science 2008, 322, 1211-1217.
8. B. Wu, E. Y. T. Chien, C. D. Mol, G. Fenalti, W. Liu, V. Katritch, R. Abagyan, A. Brooun, P. Wells, F. C. Bi, D. J. Hamel, P. Kuhn, T. M. Handel, V. Cherezov, R. C. Stevens, Science 2010, 330, 1066-1071.
9. E. Y. T. Chien, W. Liu, Q. Zhao, V. Katritch, G. WonHan, M. A. Hanson, L. Shi, A. H. Newman, J. A. Javitch, V. Cherezov, R. C. Stevens, Science 2010, 330, 1091-1095.
10. S. M. Poucher, J. R. Keddie, P. Singh, S. M. Stoggall, P. W. Caulkett, G. Jones, M. G. Coll, Br. J. Pharmacol. 1995, 115, 1096-1102.
11. B. B. Fredholm, A. P. IJzerman, K. A. Jacobson, K.-N. Klotz, J. Linden, Pharmacol. Rev. 2001, 53, 527-552.
12. T. M. Palmer, M. A. Trevethick, Br. J. Pharmacol. 2008, 153, S27-S34.
13. T. Eckle, M. Koeppen, H. K. Eltzschig, Physiology 2009, 24, 298-306.
14. A. Ohta, E. Gorelik, S. J. Prasad, F. Ronchese, D. Lukashev, M. K. K. Wong, X. Huang, S. Caldwell, K. Liu, P. Smith, J.-F. Chen, E. K. Jackson, S. Apasov, S. Abrams, M. Sitkovsky, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006, 103, 13132-13137.
15. A. Ohta, M. Sitkovsky, Curr. Opin. Pharmacol. 2009, 9, 501-506.
16. P. Jenner, A. Mori, R. Hauser, M. Morelli, B. B. Fredholm, J. F. Chen, Parkinsonism Relat. Disord. 2009, 15, 406-413.
17. M. A. Hernán, B. Takkouche, F. Caamaño-Isorna, J. J. Gestal-Otero, Ann. Neurol. 2002, 52, 276-284.
18. R. A. Cunha, S. Ferré, J.-M. Vaugeois, J.-F. Chen, Curr. Pharm. Des. 2008, 14, 1512-1524.
19. V. Katritch, V.-P. Jaakola, J. R. Lane, J. Lin, A. P. IJzerman, M. Yeager, I. Kufareva, R. C. Stevens, R. Abagyan, J. Med. Chem. 2010, 53, 1799-1809.
20. J. Carlsson, L. Yoo, Z.-G. Gao, J. J. Irwin, B. K. Shoichet, K. A. Jacobson, J. Med. Chem. 2010, 53, 3748-3755.
21. K. A. Jacobson, Z.-G. Gao, Nat. Rev. Drug Discovery 2006, 5, 247-264.
22. E. Ongini, S. Dionisotti, S. Gessi, E. Irenius, B. B. Fredholm, Naunyn-Schmiedeberg's Arch. Pharmacol. 1999, 359, 7-10.
23. P. G. Baraldi, F. Fruttarolo, M. A. Tabrizi, D. Preti, R. Romagnoli, H. El-Kashef, A. Moorman, K. Varani, S. Gessi, S. Merighi, P. A. Borea, J. Med. Chem. 2003, 46, 1229-1241.
24. M. Mantri, O. deGraaf, J. vanVeldhoven, A. Göblyös, J. K. von Frijtag Drabbe Künzel, T. Mulder-Krieger, R. Link, H. deVries, M. W. Beukers, J. Brussee, A. P. IJzerman, J. Med. Chem. 2008, 51, 4449-4455.
25. J. P. D. vanVeldhoven, L. C. W. Chang, J. K. von Frijtag Drabbe Künzel, T. Mulder-Krieger, R. Struensee-Link, M. W. Beukers, J. Brussee, A. P. IJzerman, Bioorg. Med. Chem. 2008, 16, 2741-52.
26. S. Nijssen, J. N. Kok, in Proceedings of the 2004 IEEE International Conference on Systems, Man and Cybernetics, Vol.5, 2004, pp.4571-4577.
27. C. Borgelt, M. R. Berthold, D. E. Patterson in Symbolic and Quantitative Approaches to Reasoning with Uncertainty, Lecture Notes in Computer Science, Vol.3571, Springer Berlin/Heidelberg, 2005, pp.1002-1013.
28. J. Wei, S. Wang, S. Gao, X. Dai, Q. Gao, J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 613-625.
29. M. W. Beukers, H. denDulk, E. W. vanTilburg, J. Brouwer, A. P. IJzerman, Mol. Pharmacol. 2000, 58, 1349-1356.
30. J. H. Park, P. Scheerer, K. P. Hofmann, H.-W. Choe, O. P. Ernst, Nature 2008, 454, 183-187.
31. P. Scheerer, J. H. Park, P. W. Hildebrand, Y. J. Kim, N. Krauß, H.-W. Choe, K. P. Hofmann, O. P. Ernst, Nature 2008, 455, 497-502.
32. S. Nijssen, GASTON, 2004, (accessed September 27, 2011).
33. P. deMatos, R. Alcantara, A. Dekker, M. Ennis, J. Hastings, K. Haug, I. Spiteri, S. Turner, C. Steinbeck, Nucl. Acids Res. 2010, 38, D249-D254.
34. J. J. Irwin, B. K. Shoichet, J. Chem. Inf. Model. 2005, 45, 177-182.
35. J. Kazius, S. Nijssen, J. Kok, T. Bäck, A. P. IJzerman, J. Chem. Inf. Model. 2006, 46, 597-605.
36. E. van der Horst, Y. Okuno, A. Bender, A. P. IJzerman, J. Chem. Inf. Model. 2009, 49, 348-360.
37. S. Nijssen, J. N. Kok, in Proceedings of the 10th ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining, Seattle, WA (USA), 2004, pp.647-652.
38. E. van der Horst, A. P. IJzerman in Fragment-Based Drug Discovery: a Practical Approach, 1stEd. (Eds.: E.R. Zartler, M.J. Shapiro), Wiley, Chichester, 2008, pp.199-222.
39. L. C. W. Chang, R. F. Spanjersberg, J. K. von Frijtag Drabbe Künzel, T. Mulder-Krieger, J. Brussee, A. P. IJzerman, J. Med. Chem. 2006, 49, 2861-2867.
40. L. C. W. Chang, J. K. von Frijtag Drabbe Künzel, T. Mulder-Krieger, J. Westerhout, T. Spangenberg, J. Brussee, A. P. IJzerman, J. Med. Chem. 2007, 50, 828-34.