SCOPUS 정보 검색 플랫폼

MedChemComm

Volumn 2, Issue 12, 2011, Pages 1181-1187

Key interactions of the mutant HIV-1 reverse transcriptase/efavirenz: An evidence obtained from ONIOM method

(3) Boonsri, Pornthip a Kuno, Mayuso b Hannongbua, Supa a

a KASETSART UNIVERSITY (Thailand)

b SRINAKHARINWIROT UNIVERSITY (Thailand)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EFAVIRENZ; RNA DIRECTED DNA POLYMERASE;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; BINDING AFFINITY; BINDING KINETICS; BINDING SITE; DRUG INTERACTION; DRUG PROTEIN BINDING; ENERGY; ENZYME STRUCTURE; HYDROGEN BOND; MATHEMATICAL ANALYSIS; MUTANT; PRIORITY JOURNAL; WILD TYPE;

EID: 82455186221 PISSN: 20402503 EISSN: 20402511 Source Type: Journal
DOI: 10.1039/c1md00162k Document Type: Article

Times cited : (14)

References (37)

1
- 0021261510
- R. C. Gallo S. Z. Salahuddin M. Popovic G. M. Shearer M. Kaplan B. S. Haynes T. J. Palker R. Redfield G. Oleske B. Safai G. White P. Foster P. D. Markham Science 1984 224 500 503
- (1984) Science , vol.224 , pp. 500-503
- Gallo, R.C.¹ Salahuddin, S.Z.² Popovic, M.³ Shearer, G.M.⁴ Kaplan, M.⁵ Haynes, B.S.⁶ Palker, T.J.⁷ Redfield, R.⁸ Oleske, G.⁹ Safai, B.¹⁰ White, G.¹¹ Foster, P.¹² Markham, P.D.¹³

2
- 33645886644
- E. Muraglia O. D. Kinzel R. Laufer M. D. Miller G. Moyer V. Munshi F. Orvieto M. C. Palumbi G. Pescatore M. Rowley P. D. Williams V. Summa Bioorg. Med. Chem. Lett. 2006 16 2748 2752
- (2006) Bioorg. Med. Chem. Lett. , vol.16 , pp. 2748-2752
- Muraglia, E.¹ Kinzel, O.D.² Laufer, R.³ Miller, M.D.⁴ Moyer, G.⁵ Munshi, V.⁶ Orvieto, F.⁷ Palumbi, M.C.⁸ Pescatore, G.⁹ Rowley, M.¹⁰ Williams, P.D.¹¹ Summa, V.¹²

3
- 0041886575
- M. Udier-Blagovi E. K. Watkins J. Tirado-Rives W. L. Jorgensen Bioorg. Med. Chem. Lett. 2003 13 3337 3340
- (2003) Bioorg. Med. Chem. Lett. , vol.13 , pp. 3337-3340
- Udier-Blagovi, M.¹ Watkins, E.K.² Tirado-Rives, J.³ Jorgensen, W.L.⁴

4
- 0030596068
- K. Das J. Ding Y. Hsiou A. D. ClarkJr H. Moereels L. Koymans K. Andries R. Pauwels P. A. J. Janssen P. L. Boyer P. Clark R. H. Smith Jr M. B. K. Smith C. J. Michejda S. H. Hughes E. Arnold J. Mol. Biol. 1996 264 1085 1100
- (1996) J. Mol. Biol. , vol.264 , pp. 1085-1100
- Das, K.¹ Ding, J.² Hsiou, Y.³ Clarkjr, A.D.⁴ Moereels, H.⁵ Koymans, L.⁶ Andries, K.⁷ Pauwels, R.⁸ Janssen, P.A.J.⁹ Boyer, P.L.¹⁰ Clark, P.¹¹ Smith Jr., R.H.¹² Smith, M.B.K.¹³ Michejda, C.J.¹⁴ Hughes, S.H.¹⁵ Arnold, E.¹⁶

5
- 82455197218
- R. R. Sergio A. Q. Mario M. Marcela C. B. Margarita J. Chem. Inf. Model. 2011 51 130 138
- (2011) J. Chem. Inf. Model. , vol.51 , pp. 130-138
- Sergio, R.R.¹ Mario, A.Q.² Marcela, M.³ Margarita, C.B.⁴

6
- 0033840455
- L. T. Bacheler E. D. Anton P. Kudish D. Baker J. Bunville K. Krakowski L. Bolling M. Aujay X. V. Wang D. Ellis M. F. Becker A. L. Lasut H. J. George D. R. Spalding G. Hollis K. Abremski Antimicrob. Agents Chemother. 2000 44 2475 2484
- (2000) Antimicrob. Agents Chemother. , vol.44 , pp. 2475-2484
- Bacheler, L.T.¹ Anton, E.D.² Kudish, P.³ Baker, D.⁴ Bunville, J.⁵ Krakowski, K.⁶ Bolling, L.⁷ Aujay, M.⁸ Wang, X.V.⁹ Ellis, D.¹⁰ Becker, M.F.¹¹ Lasut, A.L.¹² George, H.J.¹³ Spalding, D.R.¹⁴ Hollis, G.¹⁵ Abremski, K.¹⁶

7
- 0035037383
- L. Bacheler S. Jeffrey G. Hanna R. D'Aquilla L. Wallace K. Logue J. Virol. 2001 75 4999
- (2001) J. Virol. , vol.75 , pp. 4999
- Bacheler, L.¹ Jeffrey, S.² Hanna, G.³ D'Aquilla, R.⁴ Wallace, L.⁵ Logue, K.⁶

8
- 0032585902
- B. Clotet Int. J. Clin. Pract. Suppl. 1999 103 21 25
- (1999) Int. J. Clin. Pract. Suppl. , vol.103 , pp. 21-25
- Clotet, B.¹

9
- 79955434216
- D. Kalyan D. B. Joseph S. R. Angela D. Chhaya Jr D.C. Arthur C. María-Jos B. Jan A. Eddy J. Med. Chem. 2011 54 2727 2737
- (2011) J. Med. Chem. , vol.54 , pp. 2727-2737
- Kalyan, D.¹ Joseph, D.B.² Angela, S.R.³ Chhaya Jr., D.⁴ Arthur, D.C.⁵ María-Jos, C.⁶ Jan, B.⁷ Eddy, A.⁸

10
- 0028785708
- S. D. Young S. F. Britcher L. O. Tran L. S. Payne W. C. Lumma T. A. Lyle J. R. Huff P. S. Anderson D. B. Olsen S. S. Carroll D. J. Pettibone J. A. O'Brien R. G. Ball S. K. Balani J. H. Lin I. W. Chen W. A. Schleif V. V. Sardana W. J. Long V. W. Byrnes E. A. Emini Antimic. Agents. Chemo. 1995 39 2602 2605
- (1995) Antimic. Agents. Chemo. , vol.39 , pp. 2602-2605
- Young, S.D.¹ Britcher, S.F.² Tran, L.O.³ Payne, L.S.⁴ Lumma, W.C.⁵ Lyle, T.A.⁶ Huff, J.R.⁷ Anderson, P.S.⁸ Olsen, D.B.⁹ Carroll, S.S.¹⁰ Pettibone, D.J.¹¹ O'Brien, J.A.¹² Ball, R.G.¹³ Balani, S.K.¹⁴ Lin, J.H.¹⁵ Chen, I.W.¹⁶ Schleif, W.A.¹⁷ Sardana, V.V.¹⁸ Long, W.J.¹⁹ Byrnes, V.W.²⁰ Emini, E.A.²¹ more..

11
- 16244380541
- P. Nunrium M. Kuno S. Saen-oon S. Hannongbua Chem. Phys. Lett. 2005 405 198 202
- (2005) Chem. Phys. Lett. , vol.405 , pp. 198-202
- Nunrium, P.¹ Kuno, M.² Saen-Oon, S.³ Hannongbua, S.⁴

12
- 47649126252
- P. Srivab S. Hannongbua Chem. Med. Chem. 2008 3 803 811
- (2008) Chem. Med. Chem. , vol.3 , pp. 803-811
- Srivab, P.¹ Hannongbua, S.²

13
- 33644683832
- C. F. Venezia K. J. Howard M. E. Ignatov L. A. Holladay M. D. Barkley Biochemistry 2006 45 2779 2789
- (2006) Biochemistry , vol.45 , pp. 2779-2789
- Venezia, C.F.¹ Howard, K.J.² Ignatov, M.E.³ Holladay, L.A.⁴ Barkley, M.D.⁵

14
- 0041886575
- M. Udier-Blagovic E. K. Watkins J. Tirado-Rives W. L. Jorgensen Bioorg. Med. Chem. Lett. 2003 13 3337 3340
- (2003) Bioorg. Med. Chem. Lett. , vol.13 , pp. 3337-3340
- Udier-Blagovic, M.¹ Watkins, E.K.² Tirado-Rives, J.³ Jorgensen, W.L.⁴

15
- 0025980022
- D. Richman A. S. Rosenthal M. Skoog R. J. Eckner T. C. Chou J. P. Sabo V. J. Merluzzi Antimicrob. Agents. Chemother. 1991 35 305 308
- (1991) Antimicrob. Agents. Chemother. , vol.35 , pp. 305-308
- Richman, D.¹ Rosenthal, A.S.² Skoog, M.³ Eckner, R.J.⁴ Chou, T.C.⁵ Sabo, J.P.⁶ Merluzzi, V.J.⁷

16
- 0027178052
- T. J. Dueweke S. M. Poppe D. L. Romero S. M. Swaney A. G. So K. M. Downey I. W. Althaus F. Reusser M. Busso L. Resnick D. L. Mayers J. Lane P. A. Aristoff R. C. Thomas W. G. Tarpley Antimic. Agents. Chemo. 1993 37 1127 1131
- (1993) Antimic. Agents. Chemo. , vol.37 , pp. 1127-1131
- Dueweke, T.J.¹ Poppe, S.M.² Romero, D.L.³ Swaney, S.M.⁴ So, A.G.⁵ Downey, K.M.⁶ Althaus, I.W.⁷ Reusser, F.⁸ Busso, M.⁹ Resnick, L.¹⁰ Mayers, D.L.¹¹ Lane, J.¹² Aristoff, P.A.¹³ Thomas, R.C.¹⁴ Tarpley, W.G.¹⁵

17
- 2342620790
- K. Das A. D. ClarkJr P. J. Lewi J. Heeres M. R. de Jonge L. M. H. Koymans H. M. Vinkers F. Daeyaert D. W. Ludovici M. J. Kukla B. De Corte R. W. Kavash C. Y. Ho H. Ye M. A. Lichtenstein K. Andries R. Pauwels M. P. de Bethune P. L. Boyer P. Clark S. H. Hughes P. A. J. Janssen E. Arnold J. Med. Chem. 2004 47 2550 2560
- (2004) J. Med. Chem. , vol.47 , pp. 2550-2560
- Das, K.¹ Clarkjr, A.D.² Lewi, P.J.³ Heeres, J.⁴ De Jonge, M.R.⁵ Koymans, L.M.H.⁶ Vinkers, H.M.⁷ Daeyaert, F.⁸ Ludovici, D.W.⁹ Kukla, M.J.¹⁰ De Corte, B.¹¹ Kavash, R.W.¹² Ho, C.Y.¹³ Ye, H.¹⁴ Lichtenstein, M.A.¹⁵ Andries, K.¹⁶ Pauwels, R.¹⁷ De Bethune, M.P.¹⁸ Boyer, P.L.¹⁹ Clark, P.²⁰ more..

18
- 77952724079
- E. B. Lansdon K. M. Brendza M. Hung R. Wang S. Mukund D. Jin G. Birkus N. Kutty X. Liu J. Med. Chem. 2010 53 4295 4299
- (2010) J. Med. Chem. , vol.53 , pp. 4295-4299
- Lansdon, E.B.¹ Brendza, K.M.² Hung, M.³ Wang, R.⁴ Mukund, S.⁵ Jin, D.⁶ Birkus, G.⁷ Kutty, N.⁸ Liu, X.⁹

19
- 26444446031
- X. He Y. Mei Y. Xiang D. W. Zhang J. Z. H. Zhang Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2005 61 423 432
- (2005) Proteins: Struct., Funct., Bioinf. , vol.61 , pp. 423-432
- He, X.¹ Mei, Y.² Xiang, Y.³ Zhang, D.W.⁴ Zhang, J.Z.H.⁵

20
- 17944362049
- Y. Mei X. He Y. Xiang D. W. Zhang J. Z. H. Zhang Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2005 59 489 495
- (2005) Proteins: Struct., Funct., Bioinf. , vol.59 , pp. 489-495
- Mei, Y.¹ He, X.² Xiang, Y.³ Zhang, D.W.⁴ Zhang, J.Z.H.⁵

21
- 1842779905
- M. Udier-Blagovic J. Tirado-Rives W. L. Jorgensen J. Med. Chem. 2004 47 2389 2392
- (2004) J. Med. Chem. , vol.47 , pp. 2389-2392
- Udier-Blagovic, M.¹ Tirado-Rives, J.² Jorgensen, W.L.³

22
- 38749116964
- M. B. Kroeger Smith L. H. Rader A. M. Franklin E. V. Taylor K. D. Smith R. H. Smith Jr. J. Tirado-Rives W. L. Jorgensen Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008 18 969 972
- (2008) Bioorg. Med. Chem. Lett. , vol.18 , pp. 969-972
- Kroeger Smith, M.B.¹ Rader, L.H.² Franklin, A.M.³ Taylor, E.V.⁴ Smith, K.D.⁵ Smith, Jr.R.H.⁶ Tirado-Rives, J.⁷ Jorgensen, W.L.⁸

23
- 18444381185
- P. Weinzinger S. Hannongbua P. Wolschann J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 2005 20 129 134
- (2005) J. Enzyme Inhib. Med. Chem. , vol.20 , pp. 129-134
- Weinzinger, P.¹ Hannongbua, S.² Wolschann, P.³

24
- 78751685186
- N. Kitisripanya P. Saparpakorn P. Wolschann S. Hannongbua Nanomed.: Nanotechnol., Biol. Med. 2011 7 60 68
- (2011) Nanomed.: Nanotechnol., Biol. Med. , vol.7 , pp. 60-68
- Kitisripanya, N.¹ Saparpakorn, P.² Wolschann, P.³ Hannongbua, S.⁴

25
- 0034435564
- J. Ren J. Milton K. L. Weaver S. A. Short D. I. Stuart D. K. Stammers Structure 2000 8 1089 1094
- (2000) Structure , vol.8 , pp. 1089-1094
- Ren, J.¹ Milton, J.² Weaver, K.L.³ Short, S.A.⁴ Stuart, D.I.⁵ Stammers, D.K.⁶

26
- 0141890719
- M. Kuno R. Palangsuntikul S. Hannongbua J. Chem. Inf. Model. 2003 43 1584 1590
- (2003) J. Chem. Inf. Model. , vol.43 , pp. 1584-1590
- Kuno, M.¹ Palangsuntikul, R.² Hannongbua, S.³

27
- 13944283878
- S. Promsri P. Chuichay V. Sanghiran V. Parasuk S. Hannongbua THEOCHEM 2005 715 47 53
- (2005) THEOCHEM , vol.715 , pp. 47-53
- Promsri, S.¹ Chuichay, P.² Sanghiran, V.³ Parasuk, V.⁴ Hannongbua, S.⁵

28
- 0142042931
- M. Kuno S. Hannongbua K. Morokuma Chem. Phys. Lett. 2003 380 456 463
- (2003) Chem. Phys. Lett. , vol.380 , pp. 456-463
- Kuno, M.¹ Hannongbua, S.² Morokuma, K.³

29
- 0142008937
- S. Saen-oon S. Hannongbua P. Wolschann J. Chem. Inf. Model. 2003 43 1412 1422
- (2003) J. Chem. Inf. Model. , vol.43 , pp. 1412-1422
- Saen-Oon, S.¹ Hannongbua, S.² Wolschann, P.³

30
- 31144441067
- M. Svensson S. Humbel R. D. J. Froese T. Matsubara S. Sieber K. Morokuma J. Phys. Chem. 1996 100 19357 19363
- (1996) J. Phys. Chem. , vol.100 , pp. 19357-19363
- Svensson, M.¹ Humbel, S.² Froese, R.D.J.³ Matsubara, T.⁴ Sieber, S.⁵ Morokuma, K.⁶

31
- 0033515394
- S. Dapprich I. Komaromi K. S. Byun K. Morokuma M. J. Frisch THEOCHEM 1999 461-462 1 21
- (1999) THEOCHEM , vol.461-462 , pp. 1-21
- Dapprich, S.¹ Komaromi, I.² Byun, K.S.³ Morokuma, K.⁴ Frisch, M.J.⁵

32
- 0037072710
- G. S. Tschumper K. Morokuma THEOCHEM 2002 592 137 147
- (2002) THEOCHEM , vol.592 , pp. 137-147
- Tschumper, G.S.¹ Morokuma, K.²

33
- 0036229823
- J. Lindberg S. Sigurdsson S. Löwgren H. O. Andersson C. Sahlberg R. Noréen K. Fridborg H. Zhang T. Unge Eur. J. Biochem. 2002 269 1670 1677
- (2002) Eur. J. Biochem. , vol.269 , pp. 1670-1677
- Lindberg, J.¹ Sigurdsson, S.² Löwgren, S.³ Andersson, H.O.⁴ Sahlberg, C.⁵ Noréen, R.⁶ Fridborg, K.⁷ Zhang, H.⁸ Unge, T.⁹

34
- 28644442414
- S. Saen-oon M. Kuno S. Hannongbua Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2005 61 859 869
- (2005) Proteins: Struct., Funct., Bioinf. , vol.61 , pp. 859-869
- Saen-Oon, S.¹ Kuno, M.² Hannongbua, S.³

35
- 1242346134
- Pittsburgh, Gaussian, Inc
- M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, et al., Gaussian03, Pittsburgh, Gaussian, Inc, 2003
- (2003) Gaussian03
- Frisch, M.J.¹ Trucks, G.W.² Schlegel, H.B.³

36
- 77953944390
- R. K. Raju N. A. Burton I. H. Hillier Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 7117 7125
- (2010) Phys. Chem. Chem. Phys. , vol.12 , pp. 7117-7125
- Raju, R.K.¹ Burton, N.A.² Hillier, I.H.³

37
- 38749147488
- Z. Zhang M. Zheng L. Du J. Shen X. Luo W. Zhu H. Jiang J. Comput.-Aided Mol. Des. 2006 20 281 293
- (2006) J. Comput.-Aided Mol. Des. , vol.20 , pp. 281-293
- Zhang, Z.¹ Zheng, M.² Du, L.³ Shen, J.⁴ Luo, X.⁵ Zhu, W.⁶ Jiang, H.⁷

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.