Cholesterol driven alteration of the conformation and dynamics of phospholamban in model membranes

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 13, Issue 45, 2011, Pages 20188-20198

  Manna, Moutusi ^a   Mukhopadhyay, Chaitali ^a  

^a UNIVERSITY OF CALCUTTA   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

1-PALMITOYL-2-OLEOYLPHOSPHATIDYLCHOLINE; 2 OLEOYL 1 PALMITOYLPHOSPHATIDYLCHOLINE; CALCIUM BINDING PROTEIN; CHOLESTEROL; PHOSPHATIDYLCHOLINE; PHOSPHOLAMBAN;

AMINO ACID SEQUENCE; ANIMAL; ARTICLE; CHEMICAL PHENOMENA; CHEMISTRY; LIPID BILAYER; METABOLISM; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR GENETICS; PROTEIN CONFORMATION; RABBIT;

AMINO ACID SEQUENCE; ANIMALS; CALCIUM-BINDING PROTEINS; CHOLESTEROL; HYDROPHOBIC AND HYDROPHILIC INTERACTIONS; LIPID BILAYERS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PHOSPHATIDYLCHOLINES; PROTEIN CONFORMATION; RABBITS;

EID: 81255129160     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1cp21793c     Document Type: Article

References (79)

1. M. Bloom E. Evans O. G. Mouritsen Q. Rev. Biophys. 1991 24 293 327
2. F. J. M. de Meyer B. Smit Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 3654 3658
3. C. Laing S. Baoukina D. P. Tieleman Phys. Chem. Chem. Phys. 2009 11 1916 1922
4. J. de Joannis P. S. Coppock F. Yin M. Mori A. Zamorano J. T. Kindt J. Am. Chem. Soc. 2011 133 3625 3634
5. S. Mondal C. Mukhopadhyay Chem. Phys. Lett. 2007 439 166 170
6. E. Ikonen Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008 9 125 138
7. F. R. Maxfield I. Tabas Nature 2005 438 612 621
8. L. V. Schäfer D. H. de Jong A. Holt A. J. Rzepiela A. H. de Vries B. Poolman J. A. Killian S. J. Marrink Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 1343 1348
9. F. J. M. de Meyer J. M. Rodgers T. F. Willems B. Smit Biophys. J. 2010 99 3629 3638
10. E. Lyman C. Higgs B. Kim D. Lupyan J. C. Shelley R. Farid G. A. Voth Structure 2009 17 1660 1668
11. T. D. Madden P. J. Quinn D. Chapman Nature 1979 279 538 541
12. M. H. Cheng Y. Xu P. Tang J. Phys. Chem. B 2009 113 6964 6970
13. A. Hung I. Yarovsky Biochemistry 2011 50 1492 1504
14. F. J. Cuevas D. M. Jameson C. P. Sotomayor Biochemistry 2006 45 13855 13868
15. J. R. Harris N. G. Milton Subcell. Biochem. 2010 51 47 75
16. R. M. Epand Prog. Lipid Res. 2006 45 279 294
17. B. N. Olsen P. H. Schlesinger N. A. Baker J. Am. Chem. Soc. 2009 131 4854 4865
18. D. Sengupta S. J. Marrink Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 12987 12996
19. M. Gustavsson N. J. Traaseth C. B. Karim E. L. Lockamy D. D. Thomas G. Veglia J. Mol. Biol. 2011 408 755 765
20. H. K. B. Simmerman L. R. Jones Physiol. Rev. 1998 78 921 947
21. M. Tada M. A. Kirchberger A. M. Katz Recent Adv. Stud. Card. Struct. Metab. 1976 9 225 239
22. A. Mattiazzi C. Mundina-Weilenmann C. Guoxiang L. Vittone E. Kranias Cardiovasc. Res. 2005 68 366 375
23. D. H. MacLennan E. G. Kranias Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2003 4 566 577
24. C. Hejase de Trad Conf. Proc. IEEE Eng. Med. Biol. Soc. 2005 3 2683 2686
25. Y. Kimura K. Kurzydlowski M. Tada D. H. MacLennan J. Biol. Chem. 1997 272 15061 15064
26. K. Oxenoid J. J. Chou Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 10870 10875
27. S. L. Robia K. S. Campbell E. M. Kelly Z. Hou D. L. Winters D. D. Thomas Circ. Res. 2007 101 1123 1129
28. J. Zamoon A. Mascioni D. D. Thomas G. Veglia Biophys. J. 2003 85 2589 2598
29. N. J. Traaseth L. Shi R. Verardi D. G. Mullen G. Barany G. Veglia Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 10165 10170
30. E. E. Metcalfe J. Zamoon D. D. Thomas G. Veglia Biophys. J. 2004 87 1205 1214
31. Y. Kimura K. Kurzydlowski M. Tada D. H. MacLennan J. Biol. Chem. 1996 271 21726 21731
32. C. B. Karim T. L. Kirby Z. Zhang Y. Nesmelov D. D. Thomas Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 14437 14442
33. J. Zamoon F. Nitu C. Karim D. D. Thomas G. Veglia Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 4747 4752
34. N. J. Traaseth J. J. Buffy J. Zamoon G. Veglia Biochemistry 2006 45 13827 13834
35. M. Sayadi S. Tanizaki M. Feig Biophys. J. 2010 98 805 814
36. Y. Houndonougbo K. Kuczera G. S. Jas Biochemistry 2005 44 1780 1792
37. Y. Sugita N. Miyashita T. Yoda M. Ikeguchi C. Toyoshima Biochemistry 2006 45 11752 11761
38. S. Pantano E. Carafoli Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2007 66 930 940
39. T. Kim J. Lee W. Im Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2009 76 86 98
40. S. Abu-Baker G. A. Lorigan Biochemistry 2006 45 13312 13322
41. X. M. Zhang Y. Kimura M. Inui Circ. J. 2005 69 1116 1123
42. N. J. Server Cell Tissue Res. 1982 224 613 624
43. K. M. D'Souza T. F. Ashavaid Indian J. Clin. Biochem. 2007 22 37 44
44. K. H. Cheng J. R. Lepock S. W. Hui P. L. Yeagle J. Biol. Chem. 1986 261 5081 5087
45. Y. Huang K. E. Walker F. Hanley J. Narula S. R. Houser T. N. Tulenko Circulation 2004 109 97 102
46. H. J. C. Berendsen D. van der Spoel R. van Drunen Comput. Phys. Commun. 1995 91 43 56
47. E. Lindahl B. Hess D. van der Spoel J. Mol. Model 2001 7 306 317
48. W. F. van Gunsteren and H. J. C. Berendsen, Gromos-87 manual, Biomos BV, Nijenborgh 4, 9747 AG Groningen, The Netherlands, 1987
49. O. Berger O. Edholm F. Jähnig Biophys. J. 1997 72 2002 2013
50. M. Manna C. Mukhopadhyay Langmuir 2011 27 3713 3722
51. A. A. Gurtovenko J. Anwar J. Phys. Chem. B 2009 113 1983 1992
52. A. A. Polyansky P. E. Volynsky D. E. Nolde A. S. Arseniev R. G. Efremov J. Phys. Chem. B 2005 109 15052 15059
53. M. Höltje T. Förster B. Brandt T. Engels W. von Rybinski H. D. Höltje Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2001 1511 156 167
54. H. J. C. Berendsen, J. P. M. Postma, W. F. van Gunsteren and J. Hermans, Interaction models for water in relation to protein hydration, in Intermolecular Forces, ed., B. Pullman, D. Reidel Publishing Company, Dordrecht, 1981, p. 331-342
55. H. J. C. Berendsen J. P. M. Postma W. F. van Gunsteren A. DiNola J. R. Haak J. Chem. Phys. 1984 81 3684 3691
56. M. Manna C. Mukhopadhyay Langmuir 2009 25 12235 12242
57. U. Essman L. Perela M. L. Berkowitz H. L. T. Darden L. G. Pedersen J. Chem. Phys. 1995 103 8577 8593
58. B. Hess H. Bekker H. J. C. Berendsen J. G. E. M. Fraaije J. Comput. Chem. 1997 18 1463 1472
59. W. Humphrey A. Dalke K. Schulten J. Mol. Graphics 1996 14 33 38
60. W. L. DeLano, The PyMOL Molecular Graphics System, DeLano Scientific, San Carlos, CA, 2002
61. K. Haghighi et al. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 1338 1393
62. P. James M. Inui M. Tada M. Chiesi E. Carafoli Nature 1989 342 90 92
63. C. Toyoshima M. Asahi Y. Sugita R. Khanna T. Tsuda D. H. MacLennan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 467 472
64. P. Sharma V. Ignatchenko K. Grace C. Ursprung T. Kislinger A. O. Gramolini PLoS One 2010 5 11496 11510
65. J. W. O'Connor J. B. Klauda J. Phys. Chem. B 2011 115 6455 6464
66. M. A. Hanson V. Cherezov M. T. Griffith C. B. Roth V.-P. Jaakola E. Y. T. Chien J. Velasquez P. Kuhn R. C. Stevens Structure 2008 16 897 905
67. F. Yin J. T. Kindt J. Phys. Chem. B 2010 114 8076 8080
68. J. H. Nyström M. Lönnfors T. K. M. Nyholm Biophys. J. 2010 99 526 533
69. R. M. Epand B. G. Sayer R. F. Epand Biochemistry 2003 42 14677 14689
70. A. A. Petruk M. A. Marti R. M. S. Álvarez J. Phys. Chem. B 2009 113 13357 13364
71. R. G. W. Anderson K. Jacobson Science 2002 296 1821 1825
72. T. Kim W. Im Biophys. J. 2010 99 175 183
73. P. S. Niemelä M. S. Miettinen L. Monticelli H. Hammaren P. Bjelkmar T. Murtola E. Lindahl I. Vattulainen J. Am. Chem. Soc. 2010 132 7574 7575
74. S. Ramadurai A. Holt V. Krasnikov G. van den Bogaat J. A. Killian B. Poolman J. Am. Chem. Soc. 2009 131 12650 12656
75. T. Róg M. Pasenkiewicz-Gierula I. Vattulainen M. Karttunen Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2009 1788 97 121
76. A. Filippov G. Orädd G. Lindblom Langmuir 2003 19 6397 6400
77. J.-M. Alakoskela K. Sabatini X. Jiang V. Laitala D. F. Covey P. K. J. Kinnunen Langmuir 2008 24 830 836
78. E. Falck M. Patra M. Karttunen M. T. Hyvönen I. Vattulainen Biophys. J. 2004 87 1076 1091
79. S. W. Chiu E. Jakobsson H. L. Scott Biophys. J. 2001 80 1104 1114