-
4
-
-
80052893521
-
-
Mereghetti, P.; Kokh, D.; McCammon, J. A.; Wade, R. C. BMC Biophys. 2011, 4, 2
-
(2011)
BMC Biophys.
, vol.4
, pp. 2
-
-
Mereghetti, P.1
Kokh, D.2
McCammon, J.A.3
Wade, R.C.4
-
7
-
-
65249099497
-
-
Schreiber, G.; Haran, G.; Zhou, H. X. Chem. Rev. 2009, 109, 839-860
-
(2009)
Chem. Rev.
, vol.109
, pp. 839-860
-
-
Schreiber, G.1
Haran, G.2
Zhou, H.X.3
-
8
-
-
0026702928
-
-
Furfine, E. S.; Dsouza, E.; Ingold, K. J.; Leban, J. J.; Spector, T.; Porter, D. J. T. Biochemistry 1992, 31, 7886-7891
-
(1992)
Biochemistry
, vol.31
, pp. 7886-7891
-
-
Furfine, E.S.1
Dsouza, E.2
Ingold, K.J.3
Leban, J.J.4
Spector, T.5
Porter, D.J.T.6
-
10
-
-
62449198130
-
-
Horn, J. R.; Sosnick, T. R.; Kossiakoff, A. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 2559-2564
-
(2009)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.106
, pp. 2559-2564
-
-
Horn, J.R.1
Sosnick, T.R.2
Kossiakoff, A.A.3
-
11
-
-
33947667899
-
-
Kozer, N.; Kuttner, Y. Y.; Haran, G.; Schreiber, G. Biophys. J. 2007, 92, 2139-2149
-
(2007)
Biophys. J.
, vol.92
, pp. 2139-2149
-
-
Kozer, N.1
Kuttner, Y.Y.2
Haran, G.3
Schreiber, G.4
-
12
-
-
33746769416
-
-
Wang, J.; Zhang, K.; Lu, H. Y.; Wang, E. Biophys. J. 2006, 91, 866-872
-
(2006)
Biophys. J.
, vol.91
, pp. 866-872
-
-
Wang, J.1
Zhang, K.2
Lu, H.Y.3
Wang, E.4
-
15
-
-
0000901098
-
-
Szabo, A.; Shoup, D.; Northrup, S. H.; McCammon, J. A. J. Chem. Phys. 1982, 77, 4484-4493
-
(1982)
J. Chem. Phys.
, vol.77
, pp. 4484-4493
-
-
Szabo, A.1
Shoup, D.2
Northrup, S.H.3
McCammon, J.A.4
-
17
-
-
0005241362
-
-
Kohl, N. E.; Emini, E. A.; Schleif, W. A.; Davis, L. J.; Heimbach, J. C.; Dixon, R. A. F.; Scolnick, E. M.; Sigal, I. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 4686-4690
-
(1988)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.85
, pp. 4686-4690
-
-
Kohl, N.E.1
Emini, E.A.2
Schleif, W.A.3
Davis, L.J.4
Heimbach, J.C.5
Dixon, R.A.F.6
Scolnick, E.M.7
Sigal, I.S.8
-
18
-
-
1542502945
-
-
Krausslich, H. G.; Ingraham, R. H.; Skoog, M. T.; Wimmer, E.; Pallai, P. V.; Carter, C. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 807-811
-
(1989)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.86
, pp. 807-811
-
-
Krausslich, H.G.1
Ingraham, R.H.2
Skoog, M.T.3
Wimmer, E.4
Pallai, P.V.5
Carter, C.A.6
-
19
-
-
33744940504
-
-
Chang, C. E.; Shen, T.; Trylska, J.; Tozzini, V.; McCammon, J. A. Biophys. J. 2006, 90, 3880-3885
-
(2006)
Biophys. J.
, vol.90
, pp. 3880-3885
-
-
Chang, C.E.1
Shen, T.2
Trylska, J.3
Tozzini, V.4
McCammon, J.A.5
-
20
-
-
0035871240
-
-
Markgren, P. O.; Lindgren, M. T.; Gertow, K.; Karlsson, R.; Hamalainen, M.; Danielson, U. H. Anal. Biochem. 2001, 291, 207-218
-
(2001)
Anal. Biochem.
, vol.291
, pp. 207-218
-
-
Markgren, P.O.1
Lindgren, M.T.2
Gertow, K.3
Karlsson, R.4
Hamalainen, M.5
Danielson, U.H.6
-
21
-
-
0038058949
-
-
Shuman, C. F.; Markgren, P. O.; Hamalainen, M.; Danielson, U. H. Antiviral Res. 2003, 58, 235-242
-
(2003)
Antiviral Res.
, vol.58
, pp. 235-242
-
-
Shuman, C.F.1
Markgren, P.O.2
Hamalainen, M.3
Danielson, U.H.4
-
22
-
-
0026344399
-
-
Spinelli, S.; Liu, Q. Z.; Alzari, P. M.; Hirel, P. H.; Poljak, R. J. Biochimie 1991, 73, 1391-1396
-
(1991)
Biochimie
, vol.73
, pp. 1391-1396
-
-
Spinelli, S.1
Liu, Q.Z.2
Alzari, P.M.3
Hirel, P.H.4
Poljak, R.J.5
-
23
-
-
70349976185
-
-
Ang, W. H.; Parker, L. J.; De Luca, A.; Juillerat-Jeanneret, L.; Morton, C. J.; Lo Bello, M.; Parker, M. W.; Dyson, P. J. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 3854-3857
-
(2009)
Angew. Chem., Int. Ed.
, vol.48
, pp. 3854-3857
-
-
Ang, W.H.1
Parker, L.J.2
De Luca, A.3
Juillerat-Jeanneret, L.4
Morton, C.J.5
Lo Bello, M.6
Parker, M.W.7
Dyson, P.J.8
-
24
-
-
0028057975
-
-
Lam, P. Y. S.; Jadhav, P. K.; Eyermann, C. J.; Hodge, C. N.; Ru, Y.; Bacheler, L. T.; Meek, J. L.; Otto, M. J.; Rayner, M. M.; Wong, Y. N.; Chang, C. H.; Weber, P. C.; Jackson, D. A.; Sharpe, T. R.; Ericksonviitanen, S. Science 1994, 263, 380-384
-
(1994)
Science
, vol.263
, pp. 380-384
-
-
Lam, P.Y.S.1
Jadhav, P.K.2
Eyermann, C.J.3
Hodge, C.N.4
Ru, Y.5
Bacheler, L.T.6
Meek, J.L.7
Otto, M.J.8
Rayner, M.M.9
Wong, Y.N.10
Chang, C.H.11
Weber, P.C.12
Jackson, D.A.13
Sharpe, T.R.14
Ericksonviitanen, S.15
-
25
-
-
80053933244
-
-
DOI: 10.2210/pdb2b60/pdb.
-
Clemente, J. C.; Stow, L. R.; Janka, L. K.; Jeung, J. A.; Desai, K. A.; Govindasamy, L.; Agbandje-McKenna, M.; McKenna, R.; Goodenow, M. M.; Dunn, B. M., In vivo, kinetic, and structural analysis of the development of ritonavir resistance. DOI: 10.2210/pdb2b60/pdb.
-
In vivo, kinetic, and structural analysis of the development of ritonavir resistance
-
-
Clemente, J.C.1
Stow, L.R.2
Janka, L.K.3
Jeung, J.A.4
Desai, K.A.5
Govindasamy, L.6
Agbandje-Mckenna, M.7
McKenna, R.8
Goodenow, M.M.9
Dunn, B.M.10
-
26
-
-
80053979098
-
-
DOI: 10.2210/pdb3ekq/pdb.
-
King, N. M.; Prabu-Jeyabalan, M.; Bandaranayake, R. M.; Nalam, M. N. L.; Ozen, A.; Hailloglu, T.; Schiffer, C. A., Extreme entropy-enthalpy compensation correlates with a drug resistant variant of HIV-1 protease. DOI: 10.2210/pdb3ekq/pdb.
-
Extreme entropy-enthalpy compensation correlates with a drug resistant variant of HIV-1 protease
-
-
King, N.M.1
Prabu-Jeyabalan, M.2
Bandaranayake, R.M.3
Nalam, M.N.L.4
Ozen, A.5
Hailloglu, T.6
Schiffer, C.A.7
-
27
-
-
77951212412
-
-
Gopal, S. M.; Mukherjee, S.; Cheng, Y. M.; Feig, M. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2010, 78, 1266-1281
-
(2010)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf.
, vol.78
, pp. 1266-1281
-
-
Gopal, S.M.1
Mukherjee, S.2
Cheng, Y.M.3
Feig, M.4
-
28
-
-
33746606875
-
-
Chu, J. W.; Izvekov, S.; Voth, G. A. Mol. Simul. 2006, 32, 211-218
-
(2006)
Mol. Simul.
, vol.32
, pp. 211-218
-
-
Chu, J.W.1
Izvekov, S.2
Voth, G.A.3
-
31
-
-
24144478280
-
-
Trylska, J.; Tozzini, V.; McCammon, J. A. Biophys. J. 2005, 89, 1455-1463
-
(2005)
Biophys. J.
, vol.89
, pp. 1455-1463
-
-
Trylska, J.1
Tozzini, V.2
McCammon, J.A.3
-
33
-
-
33847116895
-
-
Tozzini, V.; Trylska, J.; Chang, C. E.; McCammon, J. A. J. Struct. Biol. 2007, 157, 606-615
-
(2007)
J. Struct. Biol.
, vol.157
, pp. 606-615
-
-
Tozzini, V.1
Trylska, J.2
Chang, C.E.3
McCammon, J.A.4
-
34
-
-
33847126878
-
-
Chang, C. E. A.; Trylska, J.; Tozzini, V.; McCammon, J. A. Chem. Biol. Drug Design 2007, 69, 5-13
-
(2007)
Chem. Biol. Drug Design
, vol.69
, pp. 5-13
-
-
Chang, C.E.A.1
Trylska, J.2
Tozzini, V.3
McCammon, J.A.4
-
35
-
-
0042783950
-
-
Reith, D.; Putz, M.; Muller-Plathe, F. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1624-1636
-
(2003)
J. Comput. Chem.
, vol.24
, pp. 1624-1636
-
-
Reith, D.1
Putz, M.2
Muller-Plathe, F.3
-
37
-
-
0026124585
-
-
Davis, M. E.; Madura, J. D.; Luty, B. A.; McCammon, J. A. Comput. Phys. Commun. 1991, 62, 187-197
-
(1991)
Comput. Phys. Commun.
, vol.62
, pp. 187-197
-
-
Davis, M.E.1
Madura, J.D.2
Luty, B.A.3
McCammon, J.A.4
-
39
-
-
36549102274
-
-
Northrup, S. H.; Allison, S. A.; McCammon, J. A. J. Chem. Phys. 1984, 80, 1517-1526
-
(1984)
J. Chem. Phys.
, vol.80
, pp. 1517-1526
-
-
Northrup, S.H.1
Allison, S.A.2
McCammon, J.A.3
-
40
-
-
0035819645
-
-
Judd, D. A.; Nettles, J. H.; Nevins, N.; Snyder, J. P.; Liotta, D. C.; Tang, J.; Ermolieff, J.; Schinazi, R. F.; Hill, C. L. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 886-897
-
(2001)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.123
, pp. 886-897
-
-
Judd, D.A.1
Nettles, J.H.2
Nevins, N.3
Snyder, J.P.4
Liotta, D.C.5
Tang, J.6
Ermolieff, J.7
Schinazi, R.F.8
Hill, C.L.9
-
41
-
-
21644434754
-
-
Brynda, J.; Rezacova, P.; Fabry, M.; Horejsi, M.; Stouracova, R.; Soucek, M.; Hradilek, M.; Konvalinka, J.; Sedlacek, J. Acta Crystallogr. Sect. D. Biol. Crystallogr. 2004, 60, 1943-1948
-
(2004)
Acta Crystallogr. Sect. D. Biol. Crystallogr.
, vol.60
, pp. 1943-1948
-
-
Brynda, J.1
Rezacova, P.2
Fabry, M.3
Horejsi, M.4
Stouracova, R.5
Soucek, M.6
Hradilek, M.7
Konvalinka, J.8
Sedlacek, J.9
-
42
-
-
33646536078
-
-
Minh, D. D. L.; Chang, C. E.; Trylska, J.; Tozzini, V.; McCammon, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 6006-6007
-
(2006)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.128
, pp. 6006-6007
-
-
Minh, D.D.L.1
Chang, C.E.2
Trylska, J.3
Tozzini, V.4
McCammon, J.A.5
-
43
-
-
8344235033
-
-
Senapati, S.; Wong, C. F.; McCammon, J. A. J. Chem. Phys. 2004, 121, 7896-7900
-
(2004)
J. Chem. Phys.
, vol.121
, pp. 7896-7900
-
-
Senapati, S.1
Wong, C.F.2
McCammon, J.A.3
-
44
-
-
80053996815
-
-
Li, D. C.; Liu, M. S.; Ji, B. H.; Hwang, K.; Huang, Y. G. J. Chem. Phys. 2009, 130
-
(2009)
J. Chem. Phys.
, pp. 130
-
-
Li, D.C.1
Liu, M.S.2
Ji, B.H.3
Hwang, K.4
Huang, Y.G.5
-
47
-
-
77149164191
-
-
Qin, S. B.; Minh, D. D. L.; McCammon, J. A.; Zhou, H. X. J. Phys. Chem. Lett. 2010, 1, 107-110
-
(2010)
J. Phys. Chem. Lett.
, vol.1
, pp. 107-110
-
-
Qin, S.B.1
Minh, D.D.L.2
McCammon, J.A.3
Zhou, H.X.4
-
48
-
-
68949110091
-
-
Zaid, I. M.; Lomholt, M. A.; Metzler, R. Biophys. J. 2009, 97, 710-721
-
(2009)
Biophys. J.
, vol.97
, pp. 710-721
-
-
Zaid, I.M.1
Lomholt, M.A.2
Metzler, R.3
-
49
-
-
16344389134
-
-
Cheung, M. S.; Klimov, D.; Thirumalai, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 4753-4758
-
(2005)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.102
, pp. 4753-4758
-
-
Cheung, M.S.1
Klimov, D.2
Thirumalai, D.3
-
50
-
-
79851504498
-
-
Stagg, L.; Christiansen, A.; Wittung-Stafshede, P. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 646-648
-
(2011)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.133
, pp. 646-648
-
-
Stagg, L.1
Christiansen, A.2
Wittung-Stafshede, P.3
-
55
-
-
0037028049
-
-
Markgren, P. O.; Schaal, W.; Hamalainen, M.; Karlen, A.; Hallberg, A.; Samuelsson, B.; Danielson, U. H. J. Med. Chem. 2002, 45, 5430-5439
-
(2002)
J. Med. Chem.
, vol.45
, pp. 5430-5439
-
-
Markgren, P.O.1
Schaal, W.2
Hamalainen, M.3
Karlen, A.4
Hallberg, A.5
Samuelsson, B.6
Danielson, U.H.7
|