HNO binding in a heme protein: Structures, spectroscopic properties, and stabilities

Journal of the American Chemical Society

Volumn 133, Issue 35, 2011, Pages 13814-13817

  Yang, Liu ^a   Ling, Yan ^b   Zhang, Yong ^a,b  

^a Stevens Institute of Technology   (United States)

^b UNIVERSITY OF SOUTHERN MISSISSIPPI   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ATOMIC LEVEL STRUCTURE; HEME PROTEINS; HIGH STABILITY; QUANTUM CHEMICAL CALCULATIONS; SMALL MOLECULES; SPECTROSCOPIC PROPERTY; STRUCTURAL MODELS;

ATOMIC SPECTROSCOPY; HYDROGEN BONDS; MODEL STRUCTURES; PORPHYRINS; QUANTUM CHEMISTRY;

PROTEINS;

CARBON MONOXIDE; HEMOPROTEIN; MYOGLOBIN; NITRIC OXIDE; OXYGEN;

ARTICLE; HYDROGEN BOND; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN STABILITY; PROTEIN STRUCTURE; QUANTUM CHEMISTRY;

ANIMALS; CATALYTIC DOMAIN; HORSES; MODELS, MOLECULAR; MYOGLOBIN; NITROGEN OXIDES; PROTEIN BINDING; QUANTUM THEORY; SPECTRUM ANALYSIS;

EID: 80052339896     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja204072j     Document Type: Article

References (37)

1. Miranda, K. M. Coord. Chem. Rev. 2005, 249, 433-455
2. Nagasawa, H. T.; Demaster, E. G.; Redfern, B.; Shirota, F. N.; Goon, J. W. J. Med. Chem. 1990, 33, 3120-3122
3. Sidorkina, O.; Espey, M. G.; Miranda, K. M.; Wink, D. A.; Laval, J. Free Radical Biol. Med. 2003, 35, 1431-1438
4. Shinyashiki, M.; Chiang, K. T.; Switzer, C. H.; Gralla, E. B.; Valentine, J. S.; Thiele, D. J.; Fukuto, J. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 2491-2496
5. Boje, K. M. K.; Lakhman, S. S. J. Pharmacol. Exp. Ther. 2000, 293, 545-550
6. Booth, B. P.; Tabrizi-Fard, M. A.; Fung, H. L. Biochem. Pharmacol. 2000, 59, 1603-1609
7. Nagasawa, H. T.; Demaster, E. G.; Redfern, B.; Shirota, F. N.; Goon, J. W. J. Med. Chem. 1990, 33, 3120-3122
8. Averill, B. A. Chem. Rev. 1996, 96, 2951-2964
9. Farmer, P. J.; Sulc, F. J. Inorg. Biochem. 2005, 99, 166-184
10. Rusche, K. M.; Spiering, M. M.; Marletta, M. A. Biochemistry 1998, 37, 15503-15512
11. Huang, J. M.; Sommers, E. M.; Kim-Shapiro, D. B.; King, S. B. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 3473-3480
12. Miranda, K. M.; Paolocci, N.; Katori, T.; Thomas, D. D.; Ford, E.; Bartberger, M. D.; Espey, M. G.; Kass, D. A.; Feelisch, M.; Fukuto, J. M.; Wink, D. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 9196-9201
13. Lehnert, N.; Praneeth, V. K. K.; Paulat, F. J. Comput. Chem. 2006, 27, 1338-1351
14. Lin, R.; Farmer, P. J. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 2393-2394
15. Sulc, F.; Immoos, C. E.; Pervitsky, D.; Farmer, P. J. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1096-1101
16. Sulc, F.; Fleischer, E.; Farmer, P. J.; Ma, D. J.; La Mar, G. N. J. Biol. Inorg. Chem. 2003, 8, 348-352
17. Immoos, C. E.; Sulc, F.; Farmer, P. J.; Czarnecki, K.; Bocian, D. F.; Levina, A.; Aitken, J. B.; Armstrong, R. S.; Lay, P. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 814-815
18. Kumar, M. R.; Pervitsky, D.; Chen, L.; Poulos, T.; Kundu, S.; Hargrove, M. S.; Rivera, E. J.; Diaz, A.; Colon, J. L.; Farmer, P. J. Biochemistry 2009, 48, 5018-5025
19. Montenegro, A. C.; Amorebieta, V. T.; Slep, L. D.; Martin, D. F.; Roncaroli, F.; Murgida, D. H.; Bari, S. E.; Olabe, J. A. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 4213-4216
20. Pellegrino, J.; Bari, S. E.; Bikiel, D. E.; Doctorovich, F. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 989-995
21. Kumar, M. R.; Fukuto, J. M.; Miranda, K. M.; Farmer, P. J. Inorg. Chem. 2010, 49, 6283-6292
22. Lai, J.-F.; Niks, D.; Wang, Y.-C.; Domratcheva, T.; Barends, T. R. M.; Schwarz, F.; Olsen, R. A.; Elliott, D. W. F., M. Q.; Chang, C.-E. A.; Schlichting, I.; Dunn, M. F.; Mueller, L. J. J. Am. Chem. Soc. 2010, 133, 4-7
23. Vulpetti, A.; Schiering, N.; Dalvit, C. Proteins 2010, 78, 3281-3291
24. Viegas, A.; Brás, N. F.; Cerqueira, N. M.; Fernandes, P. A.; Prates, J. A.; Fontes, C. M.; Bruix, M.; Romão, M. J.; Carvalho, A. L.; Ramos, M. J.; Macedo, A. L.; Cabrita, E. J. FEBS J. 2008, 275, 2524-2535
25. Mao, J. H.; Mukherjee, S.; Zhang, Y.; Cao, R.; Sanders, J. M.; Song, Y. C.; Zhang, Y. H.; Meints, G. A.; Gao, Y. G.; Mukkamala, D.; Hudock, M. P.; Oldfield, E. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 14485-14497
26. Ling, Y.; Mills, C.; Weber, R.; Yang, L.; Zhang, Y. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1583-1591
27. Ling, Y.; Zhang, Y. In Annual Reports in Computational Chemistry; Wheeler, R. A., Ed.; Elsevier: New York, 2010; Vol. 6, pp 65-77.
28. Liu, Y.; Liu, W. Q.; Li, H. Y.; Liu, J. G.; Yang, Y. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 11760-11764
29. Sellmann, D.; Gottschalk-Gaudig, T.; Haussinger, D.; Heinemann, F. W.; Hess, B. A. Chem.-Eur. J. 2001, 7, 2099-2103
30. Derat, E.; Shaik, S.; Rovira, C.; Vidossich, P.; Alfonso-Prieto, M. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 6346-6347
31. Lai, W.; Chen, H.; Shaik, S. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 7912-7917
32. Smith, R. D.; Blouin, G. C.; Johnson, K. A.; Phillips, G. N.; Olson, J. S. Biochemistry 2010, 49, 4977-4986
33. Blouin, G. C.; Olson, J. S. Biochemistry 2010, 49, 4968-4976
34. Miller, L. M.; Pedraza, A. J.; Chance, M. R. Biochemistry 1997, 36, 12199-12207
35. Soldatova, A. V.; Ibrahim, M.; Olson, J. S.; Czernuszewicz, R. S.; Spiro, T. G. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 4614-4625
36. Zhang, Y.; Gossman, W.; Oldfield, E. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 16387-16396
37. Jue, T.; Krishnamoorthi, R.; La Mar, G. N. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 5701-5703