Dissimilatory nitrite and nitric oxide reductases

Chemical Reviews

Volumn 96, Issue 7, 1996, Pages 2951-2964

  Averill, Bruce A ^a  

^a UNIVERSITY OF AMSTERDAM   (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001076517     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr950056p     Document Type: Article

References (137)

1. (1) Ye, R. W.; Averill, B. A.; Tiedje, J. M. Appl. Environ. Microbiol. 1994, 60, 1053-8.
2. Berks, B. C.; Ferguson, S. J.; Moir, J. W. B.; Richardson, D. J. Biochim. Blophys. Acta 1995, 1232, 97-173.
3. Hauck, R. D. In Terrestrial Nitrogen Cycles; Clark, F. E., Rosswall, T., Eds.; Swedish Natural Resource Council: Stockholm, 1981; Vol. 33, p 558.
4. Rasmussen, R. A.; Khalil, M. A. K. Science 1986, 232, 1623-24.
5. Hutchins, H. R. Appl. Environ. Microbiol. 1991, 57, 2403-07.
6. Mellor, R. B.; Ronnenberg, J.; Campbell, W. H.; Diekmann, S. Nature 1992, 355, 717-9.
7. Wang, J. H.; Baltzis, B. C.; Lewandowski, G. A. Biotechnol. Bioeng. 1995, 46, 159-71.
8. Koshland, D. E. J. Science 1992, 258, 1861.
9. Payne, W. J. Denitrification; John Wiley & Sons: New York, 1981.
10. Knowles, R. Microbiol. Rev. 1982, 46, 43-70.
11. Tiedje, J. M. In Biology of anaerobic microorganisms; Zehnder, A. J. B., Ed.; John Wiley & Sons, Inc: New York, 1988; pp 179-243.
12. Stouthammer, A. F.; Boogerd, F. C.; van Verseveld, H. W. Antonie van Leeuwenhoek J. Microbiol. Serol. 1985, 48, 545-53.
13. Brittain, T.; Blackmore, R.; Greenwood, C.; Thomson, A. J. Eur. J. Biochem. 1992, 209, 793-802.
14. Liu, M. C.; Bakel, B. W.; Liu, M. Y.; Dao, T. N. Arch. Biochem. Biophys. 1988, 262, 259-65.
15. Crane, B. R.; Siegel, L. M.; Getzoff, E. D. Science 1995, 270, 59-67.
16. Shoun, H.; Kim, D.-H.; Uchiyama, H.; Sugiyama, J. FEMS Microbiol. Lett. 1992, 94, 277-82.
17. Hochstein, L. I.; Tomlinson, G. A. Annu. Rev. Microbiol. 1988, 42, 231-61.
18. Averill, B. A.; Tiedje, J. M. FEBS Lett. 1982, 138, 8-12.
19. Zumft, W. G. Arch. Microbiol. 1993, 160, 253-64.
20. Kim, C. H.; Hollocher, T. C. J. Biol. Chem. 1984, 259, 2092-9.
21. Ye, R. W.; Toro-Suarez, I.; Tiedje, J. M.; Averill, B. A. J. Biol. Chem. 1991, 266, 12848-51.
22. Coyne, M. S.; Arunakumari, A.; Pankratz, H. S.; Tiedje J. M. J. Bacteriol. 1990, 172, 2558-62.
23. Körner, H.; Mayer, F. Arch. Microbiol. 1992, 157, 218-22.
24. Burgmayer, S. J. N.; Stiefel, E. I. J. Chem. Educ. 1985, 62, 943-53.
25. Antholine, W. E.; Kastrau, D. H. W.; Steffens, G. C. M.; Buse, G.; Zumft, W. G.; Kroneck, P. M. H. Eur. J. Biochem. 1993, 209, 875-81.
26. Andrew, C. R.; Han, J,; de Vries, S.; van der Oost, J.; Averill, B. A.; Loehr, T. M.; Sanders-Loehr, J. J. Am Chem Soc. 1994, 116, 10805-06.
27. Kroneck, P. M. H.; Antholine, W. A.; Riester, J.; Zumft, W. G. FEBS Lett. 1989, 248, 212-3.
28. Stedman, G. Adv. Inorg. Chem. Radiochem. 1979, 22, 113-65.
29. Bonner, F. T.; Hughes, M. N. Commun. Inorg. Chem. 1988, 7, 215-34.
30. Stamler, J. S.; Singel, D. J.; Loscalzo, J. Science 1992, 258, 1898-902.
31. Bonner, F. T.; Hughes, M. N. Science 1993, 260, 145-6.
32. Coyne, M. S.; Arunakumari, A.; Averill, B. A.; Tiedje, J. M. Appl. Environ. Microbiol. 1989, 55 , 2924-31.
33. Dhesi, R.; Timkovich, R. Biochem. Biophys. Res. Commun 1984, 123, 966-72.
34. Payne, W. J.; Riley, P. S.; Cox, C. D., Jr., J. Bacteriol. 1971, 106, 356-61.
35. Kukimoto, M.; Nishiyama, M.; Murphy, M. E. P.; Turley, S.; Adman, E. T.; Horinouchi, S.; Beppu, T. Biochemistry 1994, 33, 5246-52.
36. Jüngst, A.; Wakabayashi, S.; Matsubara, H.; Zumft, W. G FEBS Lett. 1991, 279, 205-9.
37. Silvestrini, M. C.; Galeotti, C. L.; Gervais, M.; Schinia, E.; Barra, D.; Bossa, F.; Brunori, M. FEBS Lett. 1989, 254, 33-8.
38. Smith, G. B.; Tiedje, J. M. Appl. Environ. Microbiol. 1992, 58, 376-84.
39. Chang, C. K. J. Biol. Chem. 1985, 260, 9520-2.
40. Weeg-Aerssens, E.; Wu, W.; Ye, R. W.; Tiedje, J. M.; Chang, C. K. J. Biol. Chem. 1991, 266, 7496-502.
41. Walsh, T. A.; Johnson, M. K.; Thomson, A. J.; Barber, D.; Greenwood, C. J. Inorg. Biochem. 1981, 14, 1-14.
42. Johnson, M. K.; Thomson, A. J.; Walsh, T. A.; Barber, D.; Greenwood, C. Biochem. J. 1980, 189, 285-94.
43. Sutherland, J.; Greenwood, C.; Peterson, J.; Thomson, A. J. Biochem. J. 1986, 233, 893-8.
44. Barber, D.; Parr, S. R.; Greenwood, C. Biochem. J. 1978, 175, 239-49.
45. Parr, S. R.; Wilson, M. T.; Greenwood, C. Biochem. J. 1975, 151, 51-9.
46. Shimada, H.; Orii, Y. FEBS Lett. 1975, 54, 237-40.
47. Muhoberac, B. B.; Wharton, D. C. J. Biol. Chem. 1980, 255, 8437-42.
48. Muhoberac, B. B.; Wharton, D. C. J. Biol. Chem. 1983, 258, 3019-27.
49. Shimada, H.; Orii, Y. J. Biochem. (Tokyo) 1978, 84, 1553-8.
50. Silvestrini, M. C.; Tordi, M. G.; Musci, G.; Brunori, M. J. Biol. Chem. 1990, 265, 11783-87.
51. Traylor, T. G.; Sharma, V. S. Biochemistry 1992, 31, 2847-9.
52. Antonini, E.; Brunori, M. Hemoglobin and myoglobin in their reactions with ligands; North-Holland Publishing Co.: Amsterdam, 1971.
53. Fujita, E.; Fajer, J. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 6743-5.
54. Olson, L. W.; Schaeper, D.; Lacon, D.; Kadish K. M. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 2042-4.
55. Wang, Y.; Averill, B. A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 3972-3.
56. Sampath, V.; Zhao, X.-J.; Caughey, W. S. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1994, 198, 281-7.
57. Cox, C. D. J.; Payne, W. J.; DeVertanian, D. V. Biochim Biophys Acta 1971, 253, 290-4.
58. LeGall, J.; Payne, W. J.; Morgan, T. V.; DerVartanian, D. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1979, 87, 355-62.
59. Liu, M. C.; DerVartanian, D.; Peck, H. D., Jr. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1980, 96, 278-85.
60. Dodd, F. E.; Hasnain, S. S.; Hunter, W. N.; Abraham, Z. H. L.; Debenham, M.; Kanzler, H.; Eldridge, M.; Eady, R. R.; Ambler, R. P.; Smith, B. E. Biochemistry 1995, 34, 10180-6.
61. Parr, S. R.; Barber, D.; Greenwood, C.; Brunori, M. Biochem. J. 1977, 167, 447-55.
62. Moir, J. W. B.; Baratta, D.; Richardson, D. J.; Ferguson, S. J. Eur. J. Biochem. 1993, 212, 377-85.
63. Yamanaka, T.; Ota, A.; Okunuki, K. Biochim. Biophys. Acta 1961, 53, 294-308.
64. Fülöp, V.; Moir, J. W. B.; Ferguson, S. J.; Hajdu, J. Cell 1995, 81, 360-77.
65. Reid, T. J., III; Murthy, M. R. N.; Sicignano, A.; Tanaka, N.; Musick, W. D. L.; Rossman, M. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1981, 78, 4767-71.
66. Fito, I.; Rossman, M. G. J. Mol. Biol. 1985, 87, 21-37.
67. Perutz, M. F.; Lehmann, H. Nature 1968, 219, 902-9.
68. Dickerson, R. E.; Geis, I. Hemoglobin: Structure, Function, Evolution, and Pathology; Benjamin/Cummings: Menlo Park, CA, 1983.
69. Weatherall, D. J.; Clegg, J. B.; Higgs, D. R.; Wood, W. G. In The Metabolic Basis of Inherited Disease, 6th ed.; Scriver, C. R., Beaudet, A. L., Sly, W. S., Valle, D., Eds.; McGraw-Hill: 1989; pp 2281-339.
70. Cowan, J. A. In Inorganic Biochemistry. An Introduction; VCH Publisher, Inc.: New York, 1993; p 265.
71. Ohshima, T.; Sugiyama, M.; Uozumi, N.; Iijima, S.; Kobayashi, T. J. Ferm. Bioeng. 1993, 76, 82-8.
72. de Boer, A. P. N.; Reijnders, W. N. M.; Juenen, J. G.; Stouthamer, A. H.; van Spanning, R. J. M. Antonie van Leeuwenhoek 1994, 66, 111-27.
73. Jüngst, A.; Braun, C.; Zumft, W. G. Mol. Gen. Genet. 1991, 225, 241-8.
74. Michalski, W. P.; Nicholas, D. J. D. Phytochemistry 1988, 27, 2451-6.
75. Godden, J. W.; Turley, S.; Teller, D. C.; Adman, E. T.; Liu, M. Y.; Payne, W. J.; LeGall, J. Science 1991, 253, 438-42.
76. Glockner, A. B.; Zumft, W. G. Arch. Microbiol. 1993, 160, 18-26.
77. Ye, R. W.; Fries, M. R.; Bezborodnikov, S. G.; Averill, B. A.; Tiedje, J. M. Appl. Environ. Microbiol. 1993, 59, 250-4.
78. Fenderson, F. F.; Kumar, S.; Adman, E. T.; Liu, M. Y.; Payne, W. J.; LeGall, J. Biochemistry 1991, 30, 7180-5.
79. Adman, E. T.; Godden, J. W.; Turley, S. J. Biol. Chem. 1995, 270, 27458-74.
80. Han, J.; Loehr, T. M.; Lu, Y.; Selverstone-Valentine, J.; Averill, B. A.; Sander-Loehr, J. J. Am. Chern. Soc. 1993, 115, 4256-63.
81. Messerschmidt, A.; Rossi, A.; Ladenstein, R.; Huber, R.; Bolognesi, M.; Gatti, G.; Marchesini, A.; Petruzzelli, R.; Finazzi-Agró, A. J. Mol. Biol. 1989, 206, 513-29.
82. Adman, E. T.; Godden, J. W.; Turley, S. J. Biol. Chem. 1995, 270, 27458-74.
83. Libby, E.; Averill, B. A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1992, 187, 1529-35.
84. Suzuki, S.; Kohzuma, T.; Deligeer; Yamaguchi, K.; Nakamura, N.; Shidara, S.; Kobayashi, K.; Tagawa, S. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11145-6.
85. Zumft, W. G.; Gotzmann, D. J.; Kroneck, P. M. H. Eur. J. Biochem. 1987, 168, 301-7.
86. Masuko, M.; Iwasaki, H.; Sakurai, T.; Suzuki, S.; Nakahara, A. J. Biochem. (Tokyo) 1984, 96, 447-54.
87. Suzuki, S.; Yoshimura, T.; Kohzuma, T.; Shidara, S.; Masuko, M.; Sakurai, T.; Iwasaki, H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1989, 164, 1366-72.
88. Hulse, C. L.; Yang, W.; Averill, B. A. Manuscript in preparation.
89. Kohzuma, T.; Shidara, S.; Suzuki, S. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1994, 67, 138-43.
90. Kohzuma, T.; Takase, S.; Shidara, S.; Suzuki, S. Chem. Lett. 1993, 149-52.
91. Abraham, Z. H. L.; Lowe, D. J.; Smith, B. E. Biochem. J. 1993, 235, 587-93.
92. Howes, B. D.; Abraham, Z. H. L.; Löwe, D. J.; Bruser, T.; Eady, R. R.; Smith, B. E. Biochemistry 1994, 33, 3171-7.
93. Strange, R. W.; Dodd, F. E.; Abraham, Z. H. L.; Grossmann, J. G.; Brüser, T.; Eady, R. R.; Smith, B. E.; Hasnain, S. S. Nature Struct. Biol. 1995, 2, 287-92.
94. Hulse, C. L.; Averill, B. A. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 2322-3.
95. Averill, B. A. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1994, 33, 2003-4.
96. Tolman, W. B. Inorg. Chem. 1991, 30, 4877-80.
97. Halfen, J. A.; Mahapatra, S.; Olmstead, M. M.; Tolman, W. B. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 2173-4.
98. Halfen, J. A.; Mahapatra, S.; Wilkinson, E. C.; Gengenbach, A. J.; Young, V. G., Jr.; Que, L., Jr.; Tolman, W. B. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 763-76.
99. Halfen, J. A.; Tolman, W. B. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 5475-6.
100. Murphy, M. E. P.; Turley, S.; Kukimoto, M.; Nishiyama, M.; Horinouchi, S.; Sasaki, H.; Tanokura, M.; Adman, E. T. Biochemistry 1995, 34, 12107-17.
101. Jackson, M. A.; Tiedje, J. M.; Averill, B. A. FEBS Lett. 1991, 291, 41-4.
102. Ruggiero, C. E.; Carrier, S. M.; Tolman, W. B. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1994, 33, 895-7.
103. Heiss, B.; Frunzke, K.; Zumft, W. G. J. Bacteriol. 1989, 171, 3288-97.
104. Kastrau, D. H. W.; Heiss, B.; Kroneck, P. M. H.; Zumft, W. G. Eur. J. Biochem. 1994, 222, 293-303.
105. Carr, G. J.; Ferguson, S. J. Biochem. J. 1990, 269, 423-9.
106. Dermastia, M.; Turk, T.; Hollocher, T. C. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10899-905.
107. Jones, A. M.; Hollocher, T. C. Biochim. Biophys. Acta 1993, 1144, 359-66.
108. Ye, R. W.; Averill, B. A.; Tiedje, J. M. J. Bacteriol. 1992, 174, 6653-8.
109. Ye, R., W.; Arunakumari, A.; Averill, B. A.; Tiedje, J. M. J. Bacteriol. 1992, 174, 2560-4.
110. Turk, T.; Hollocher, T. C. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1992, 183, 983-8.
111. Strother, V. L.; Ye, R.; Tiedje, J. M.; Averill, B. A. Manuscript in preparation.
112. Zhao, X.-J.; Sampath, V.; Caughey, W. S. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1995, 212, 1054-60.
113. Paul, P. P.; Karlin, K. D. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 6331-2.
114. Eisenberg, R.; Meyer, C. D. Acc. Chem. Res. 1975, 8, 26-34.
115. Bottomley, F. In Reactions of Coordinated Ligands; Braterman, B. S., Ed.; Plenum Publishing Corporation: New York, 1989; Vol. 2, pp 115-222.
116. Zumft, W. G.; Braun, C.; Cuypers, H. Eur. J. Biochem. 1994, 219, 481-90.
117. Oost van der, J.; de Boer, A. P. N.; de Gier, J.-W. L.; Zumft, W. G.; Stouthamer, A. H.; Spanning van; R. J. M. FEMS Microbiol. Lett. 1994, 121, 1-10.
118. Saraste, M.; Castresana, J, FEBS Lett. 1994, 341, 1-4.
119. Martens, C. F.; Murthy, N. N.; Obias, H. V.; Karlin, K. D. J. Chem. Soc. Chem. Commun. 1996, 629-30.
120. Robertson, G. P.; Tiedje, J. M. Soil Biol. Biochem. 1987, 19, 187-93.
121. Tanimoto, T.; Hatano, K.-H.; Kim, D. H.; Uchiyama, H.; Shoun, H. FEMS Microbiol. Lett. 1992, 93, 177-80.
122. Garber, E. A. E.; Hollocher, T. C. J. Biol. Chem. 1982, 257, 8091-7.
123. Kobayashi, M.; Shoun, H. J. Biol. Chem. 1995, 270, 4146-51.
124. Shoun, H.; Kim, D.; Uchiyama, H.; Sugiyama, J. FEMS Microbiol. Lett. 1992, 94, 277-82.
125. Shoun, H.; Sudo, Y.; Seto, Y.; Beppu, T. J. Biochem. (Tokyo) 1983, 94, 1219-29.
126. Shoun, H.; Tanimoto, T. J. Biol. Chem. 1991, 266, 11078-82.
127. Kizawa, H.; Tomura, D.; Oda, M.; Fukamizu, A.; Hoshino, T.; Gotoh, O.; Yasui, T.; Shoun, H. J. Biol. Chem. 1991, 226, 10632-7.
128. Nakahara, K.; Shoun, H.; Adachi, S.-I.; Iizuka, T.; Shiro, Y. J. Mol. Biol. 1994, 239, 158-9.
129. Shiro, Y.; Kato, M.; Nakahara, K.; Shoun, H. Biochemistry 1994, 33, 8673-7.
130. Shiro, Y.; Fujii, M.; Isogai, Y.; Adachi, S.; Iizuka, T.; Obayashi, E.; Makino, R.; Nakahara, K.; Shoun, H. Biochemistry 1995, 34, 9052-8.
131. Shiro, Y.; Fujii, M.; Iizuka, T.; Adachi, S.-i.; Tsukamoto, K.; Nakahara, K.; Shoun, H. J. Biol. Chem. 1995, 270, 1617-23.
132. Nakahara, K.; Tanimoto, T.; Hatano, K-I.; Usuda, K.; Shoun, H. J. Biol. Chem. 1993, 268, 8350-5.
133. Obika, O.; Tomura, D.; Fukamizu, A.; Shoun, H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1993, 196, 1255-60.
134. Kakutani, T.; Watanabe, H.; Arime, K.; Beppu, T. J. Biochem. (Tokyo) 1981, 89, 453-61.
135. Liu, M. Y.; Liu, M. C.; Payne, W. J.; LeGall, J. J. Bacteriol. 1986, 166, 604-608.
136. Denariaz, G.; Payne, W. J.; LeGall, J. Biochim. Biophys. Acta 1991, 1056, 225-32.
137. Michalski, W. P.; Nicholas, D. J. D. Biochim. Biophys. Acta 1985, 828, 130-7.