Water-soluble conjugated polymers for amplified fluorescence detection of template-independent DNA elongation catalyzed by polymerase

Advanced Functional Materials

Volumn 21, Issue 16, 2011, Pages 3143-3149

  He, Fang ^a   Liu, Libing ^b   Li, Lidong ^a  

^a UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY BEIJING   (China)

^b INSTITUTE OF CHEMISTRY   (China)

Author keywords

conjugated polymers; DNA elongation; fluorescent probes; terminal deoxynucleotidyl transferase

Indexed keywords

DIKETOPYRROLOPYRROLES; DNA ELONGATION; FLUORENES; FLUORESCENCE DETECTION; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; FLUORESCENCE SIGNALS; FLUORESCENT PROBES; INTRAMOLECULAR ENERGY TRANSFER; POLYFLUORENE DERIVATIVE; RED-SHIFTED EMISSION; REPLACEMENT METHODS; WATER-SOLUBLE CONJUGATED POLYMERS;

AMMONIUM COMPOUNDS; CATALYSIS; DNA; ELONGATION; ENERGY TRANSFER; FLUORESCENCE; FLUORINE CONTAINING POLYMERS;

CONJUGATED POLYMERS;

EID: 80051746250     PISSN: 1616301X     EISSN: 16163028     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/adfm.201100216     Document Type: Article

References (49)

1. U. Hubscher, G. Maga, S. Spadari, Annu. Rev. Biochem. 2002, 71, 133-163.
2. E. C. Friedberg, W. J. Feaver, V. L. Gerlach, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 5681-5683.
3. S. Aoufouchi, E. Flatter, A. Dahan, A. Faili, B. Bertocci, S. Storck, F. Delbos, L. Cocea, N. Gupta, J.-C. Weill, C.-A. Reynaud, Nucleic Acids Res. 2000, 28, 3684-3693.
4. M. Garcia-Diaz, O. Dominguez, L. A. Lopez-Fernandez, L. T. de Lera, M. L. Saniger, J. F. Ruiz, M. Parraga, M. J. Garcia-Ortiz, T. Kirchhoff, J. del Mazo, A. Bernad, L. Blanco, J. Mol. Biol. 2000, 301, 851-867.
5. O. Domnameínguez, J. F. Ruiz, T. Laín de Lera, M. García-Díaz, M. A. González, T. Kirchhoff, C. Martínez-A, A. Bernad, L. Blanco, EMBO J. 2000, 19, 1731-1742.
6. M. García-Díaz, K. Bebenek, R. Sabariegos, O. Domínguez, J. Rodríguez, T. Kirchhoff, E. García-Palomero, A. J. Picher, R. Juárez, J. F. Ruiz, T. A. Kunkel, L. Blanco, J. Biol. Chem. 2002, 277, 13184-13191.
7. K. Ramadan, G. Maga, I. V. Shevelev, G. Villani, L. Blanco, U. Hübscher, J. Mol. Biol. 2003, 328, 63-72.
8. K. Ramadan, I. V. Shevelev, G. Maga, U. Hübscher, J. Mol. Biol. 2004, 339, 395-404.
9. J. D. Fowler, Z. Suo, Chem. Rev. 2006, 106, 2092-2110.
10. P. Andrade, M. J. Martin, R. Juárez, F. L. de Saro, L. Blanco, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 16203-16208.
11. F. Delbos, S. Aoufachi, A. Faili, J. C. Weill, C. A. Reynaud, Immunity 2006, 25, 31-41.
12. T. T. Paull, Mol. Cells 2005, 5, 294-296.
13. J. W. Lee, L. Blanco, T. Zhou, M. Garcia-Diaz, K. Bebenek, T. A. Kunkel, Z. Wang, L. F. Povirk, J. Biol. Chem. 2004, 279, 805-811.
14. W. Fan, X. Wu, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004, 323, 1328-1333.
15. M. M. Purugganan, S. Shah, J. F. Kearney, D. B. Roth, Nucleic Acids Res. 2001, 29, 1638-1646.
16. K. N. Mahajan, L. Gangi-Peterson, D. H. Sorscher, J. Wang, K. N. Gathy, N. P. Mahajan, W. H. Reeves, B. S. Mitchell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 13926-13931.
17. T. B. Kepler, M. Borrero, B. Rugerio, S. K. McCray, S. H. Clarke, J. Immunol. 1996, 157, 4451-4457.
18. O. Peralta-Zaragoza, F. Recillas-Targa, V. Madrid-Marina, Immunology 2004, 111, 195-203.
19. J. F. McBlane, D. C. van Gent, D. A. Ramsden, C. Romeo, C. A. Cuomo, M. Gellert, M. A. Oettinger, Cell 1995, 83, 387-395.
20. A. J. Mastroianni, S. A. Claridge, A. P. Alivisatos, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 8455-8459.
21. J. Wang, F. E. Alemdaroglu, D. K. Prusty, A. Herrmann, R. Berger, Macromolecules 2008, 41, 2914-2919.
22. F. E. Alemdaroglu, J. Wang, M. Börsch, R. Berger, A. Herrmann, Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 974-976.
23. D. C. Chow, W. Lee, S. Zauscher, A. Chilkoti, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 14628-14639.
24. A. Ramanavicius, N. Kurilcik, S. Jursenas, A. Finkelsteinas, A. Ramanaviciene, Biosens. Bioelectron. 2007, 23, 499-505.
25. A. Ramanavicius, N. Ryskevic, Y. Oztekin, A. Kausaite-Minkstimiene, S. Jursenas, J. Baniukevic, J. Kirlyte, U. Bubniene, A. Ramanaviciene, Anal. Bioanal. Chem. 2010, 398, 3105-3113.
26. X. Duan, L. Liu, F. Feng, S. Wang, Acc. Chem. Res. 2010, 43, 260-270.
27. K. Li, B. Liu, Anal. Chem. 2009, 81, 4099-4150.
28. F. He, F. Feng, X. Duan, S. Wang, Y. Li, D. Zhu, Anal. Chem. 2008, 80, 2239-2243.
29. F. He, F. Feng, S. Wang, Trends Biotechnol. 2008, 26, 57-59.
30. S. W. Thomas, G. D. Joly, T. M. Swager, Chem. Rev. 2007, 107, 1339-1386.
31. X. Duan, Z. Li, F. He, S. Wang, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4154-4155.
32. B. Liu, G. C. Bazan, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 589-593.
33. H. Xu, H. Wu, F. Huang, S. Song, W. Li, Y. Cao, C. Fan, Nucleic Acids Res. 2005, 33, e83.
34. F. He, Y. Tang, S. Wang, Y. Li, D. Zhu, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12343-12346.
35. S. Wang, B. S. Gaylord, G. C. Bazan, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5446-5451.
36. V. Buschmann, K. D. Weston, M. Sauer, Bioconjugate Chem. 2003, 14, 195-204.
37. B. Oswald, L. Patsenker, J. Duschl, H. Szmacinski, O. S. Wolfbeis, E. Terpetschnig, Bioconjugate Chem. 1999, 10, 925-931.
38. B. Li, J. Li, Y. Fu, Z. Bo, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3430-3431.
39. C. Ego, D. Marsitzky, S. Becker, J. Zhang, A. C. Grimsdale, K. Müllen, J. D. Mackenzie, C. Silva, R. H. Friend, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 437-443.
40. J. W. Hong, W. L. Henme, G. E. Keller, M. T. Rinke, G. C. Bazan, Adv. Mater. 2006, 18, 878-882.
41. H. Sun, F. Feng, M. Yu, S. Wang, Macromol. Rapid Commun. 2007, 28, 1905-1911.
42. A. Iqbal, L. Cassar, A. C. Rochat, J. Pfenninger, J. Coat. Technol. 1988, 60, 37-45.
43. D. G. Farnum, G. Mehta, G. G. I. Moore, F. P. Siegel, Tetrahedron Lett. 1974, 29, 2549-2552.
44. D. Cao, Q. Liu, W. Zeng, S. Han, J. Peng, S. Liu, J. Polym. Sci., Part A: Polym. Chem. 2006, 44, 2395-2405.
45. D. Cao, Q. Liu, W. Zeng, S. Han, J. Peng, S. Liu, Macromolecules 2006, 39, 8347-8355.
46. M. Stork, B. S. Gaylord, A. J. Heeger, G. C. Bazan, Adv. Mater. 2002, 14, 361-366.
47. T. Beyerlein, B. Tieke, S. Forero-Lenger, W. Brütting, Synth. Met. 2002, 130, 115-119.
48. A. Satrijo, T. M. Swager, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 16020-16028.
49. M. Ranger, D. Rondeau, M. Leclerc, Macromolecules 1997, 30, 7686-7691.