Identifying specific small-molecule interactions using electrospray ionization mass spectrometry

Analytical Chemistry

Volumn 83, Issue 13, 2011, Pages 5160-5167

  Kitova, Elena N ^a   Soya, Naoto ^a   Klassen, John S ^a  

^a UNIVERSITY OF ALBERTA   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTROSPRAY IONIZATION MASS SPECTROMETRY; HETEROCOMPLEXES; ION-LIGAND INTERACTION; MATHEMATICAL FRAMEWORKS; NON-COVALENT INTERACTION; NON-SPECIFIC BINDING; PROBE METHODS; SIMPLE METHOD; SMALL MOLECULES; SPECIFIC INTERACTION;

ELECTROSPRAY IONIZATION; IONIZATION; MACROMOLECULES; MASS SPECTROMETRY; METAL IONS; PROBES;

COMPLEXATION;

ARTICLE; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; METHODOLOGY; MOLECULAR PROBE;

MOLECULAR PROBES; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION;

EID: 79959966816     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac200244u     Document Type: Article

References (57)

1. Daniel, J. M.; Friess, S. D.; Rajagopalan, S.; Wendt, S.; Zenobi, R. Int. J. Mass Spectrom. 2002, 216, 1-27
2. Heck, A. J. R.; van den Heuvel, R. H. H. Mass Spectrom. Rev. 2004, 23, 368-389
3. Schug, K. A.; Serrano, C.; Frycak, P. Mass Spectrom. Rev. 2010, 29, 806-829
4. Simmons, D. A.; Wilson, D. J.; Lajoie, G. A.; Doherty-Kirby, A.; Konermann, L. Biochemistry 2004, 43, 14792-14801
5. Natan, E.; Hirschberg, D.; Morgner, N.; Robinson, C. V.; Fersht, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 14327-14332
6. Wortmann, A.; Kistler-Momotova, A.; Zenobi, R.; Heine, M. C.; Wilhelm, O.; Pratsinis, S. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 385-393
7. Sharon, M.; Robinson, C. V. Annu. Rev. Biochem. 2007, 76, 167-193
8. Benesch, J. L. P.; Robinson, C. V. Curr. Opin. Struct. Biol. 2006, 16, 245-251
9. Heck, A. J. R. Nat. Methods 2008, 5, 927-933
10. Aquilina, J. A.; Benesch, J. L.; Bateman, O. A.; Slingsby, C.; Robinson, C. V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 10611-10616
11. Gabelica, V.; Galic, N.; Rosu, F.; Houssier, C.; De Pauw, E. J. Mass Spectrom. 2003, 38, 491-501
12. Kempen, E. C.; Brodbelt, J. S. Anal. Chem. 2000, 72, 5411-5416
13. Gabelica, V.; Rosu, F.; De Pauw, E. Anal. Chem. 2009, 81, 6708-6715
14. Wortmann, A.; Rossi, F.; Lelais, G.; Zenobi, R. J. Mass Spectrom. 2005, 40, 777-784
15. Van Dongen, W. D.; Heck, A. J. R. Analyst 2000, 125, 583-589
16. Sun, J.; Kitova, E. N.; Klassen, J. S. Anal. Chem. 2007, 79, 416-425
17. Clark, S. M.; Konermann, L. Anal. Chem. 2004, 76, 7077-7083
18. Robinson, C. V.; Chung, E. W.; Kragelund, B. B.; Knudsen, J.; Aplin, R. T.; Poulsen, F. M.; Dobson, C. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 8646-8653
19. El-Hawiet, A.; Kitova, E. N.; Liu, L.; Klassen, J. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2010, 21, 1893-1899
20. Wang, W.; Kitova, E. N.; Klassen, J. S. Anal. Chem. 2005, 77, 3060-3071
21. Sun, J.; Kitova, E. N.; Wang, W.; Klassen, J. S. Anal. Chem. 2006, 78, 3010-3018
22. Sun, N.; Soya, N.; Kitova, E. N.; Klassen, J. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2010, 21, 472-481
23. Sun, N.; Sun, J.; Kitova, E. N.; Klassen, J. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009, 20, 1242-1250
24. Tang, L.; Kebarle, P. Anal. Chem. 1993, 65, 3654-3668
25. Cech, N. B.; Enke, C. G. Anal. Chem. 2000, 72, 2717-2723
26. P. Frycak, P.; Schug, K. A. Anal. Chem. 2008, 80, 1385-1393
27. Page, J. S.; Kelly, R. T.; Tang, K.; Smith, R. D. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 1582-1590
28. Pan, P.; McLuckey, S. A. Anal. Chem. 2003, 75, 1491-1499
29. Sterner, J. L.; Johnston, M. V.; Nicol, G. R.; Ridge, D. P. J. Mass Spectrom. 2000, 35, 385-391
30. Vaidyanathan, S.; Douglas, B.; Kell, D. B.; Goodacre, R. Anal. Chem. 2004, 76, 5024-5032
31. Deng, L.; Sun, N.; Kitova, E. N.; Klassen, J. S. Anal. Chem. 2010, 82, 2170-2174
32. Dole, M.; Mach, L. L.; Hines, R. L.; Mobley, R. C.; Ferguson, L. P.; Alice, M. B. J. Chem. Phys. 1968, 49, 2240-2249
33. de la Mora, J. F. Anal. Chim. Acta 2000, 406, 93-104
34. Peschke, M.; Verkerk, U. H.; Kebarle, P. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2004, 15, 1424-1434
35. Kebarle, P. J. Mass Spectrom. 2000, 35, 804-817
36. Daubenfeld, T.; Bouin, A. P.; van der Rest, G. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2006, 17, 1239-1248
37. Shimon, L.; Sharon, M.; Horovitz, A. Biophys. J. 2010, 99, 1645-1649
38. Lane, L. A.; Ruotolo, B. T.; Robinson, C. V.; Favrin, G.; Benesch, J. L. P. Int. J. Mass Spectrom. 2009, 283, 169-177
39. Gabelica, V.; Galic, N.; De Pauw, E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2002, 13, 946-953
40. Meng, C. K.; Fenn, J. B. Org. Mass Spectrom. 1991, 26, 542-549
41. Nemes, P.; Schlosser, G.; Vekey, K. J. Mass Spectrom. 2005, 40, 43-49
42. Cooks, R. G.; Zhang, D.; Koch, K. J.; Gozzo, F. C.; Eberlin, M. N. Anal. Chem. 2001, 73, 3646-3655
43. Koch, K. J.; Gozzo, F. C.; Zhang, D.; Eberlin, M. N.; Cooks, R. G. Chem. Commun. 2001, 18, 1854-1855
44. Koch, K. J.; Gozzo, F. C.; Nanita, S. C.; Takats, Z.; Eberlin, M. N.; Cooks, R. G. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 1721-1724
45. Counterman, A. E.; Hilderbrand, A. E.; Barnes, C. A. S.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2001, 12, 1020-1035
46. Camero-Castano, M.; de la Mora, J. F. Anal. Chim. Acta 2000, 406, 67-71
47. Wang, G.; Cole, R. B. Anal. Chem. 1998, 70, 873-881
48. Spenser, E. A. C.; Ly, T.; Julian, R. R. Int. J. Mass Spectrom. 2008, 270, 166-172
49. Iribarne, J. V.; Thomson, B. A. J. Chem. Phys. 1976, 64, 2287-2294
50. Wang, G.; Cole, R. B. Anal. Chim. Acta 2000, 406, 53-65
51. Wang, W.; Kitova, E. N.; Klassen, J. S. Anal. Chem. 2003, 75, 4945-4955
52. Ibe, O. Fundamentals of Applied Probability and Random Processes; Elsevier Academic Press: Boston, MA, 2005.
53. Ogino, H. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1965, 38, 771-777
54. Martell, A. E.; Smith, R. M.; Motekaitis, R. J. NIST Critically Selected Stability Constants of Metal Complexes; NIST Standard Reference Database 46; National Institute of Standards and Technology: Gaithersburg, MD, 2004.
55. Nieto, M.; Perkins, H. R. Biochem. J. 1971, 123, 789-803
56. Patnaik, P. Dean's Analytical Chemistry Handbook, 2 nd ed.; McGraw-Hill: New York, 2004.
57. i +1 species, respectively.