Selectivity in DNA replication. Interplay of steric shape, hydrogen bonds, π-stacking and solvent effects

Chemical Communications

Volumn 47, Issue 26, 2011, Pages 7326-7328

  Poater, Jordi ^a,b   Swart, Marcel ^b,c   Guerra, Célia Fonseca ^a   Bickelhaupt, F Matthias ^a  

^a VU UNIVERSITY AMSTERDAM   (Netherlands)

^b UNIVERSITY OF GIRONA   (Spain)

^c INSTITUCIÓ CATALANA DE RECERCA I ESTUDIS AVANÇATS ICREA   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA BASE; WATER;

AQUEOUS SOLUTION; ARTICLE; BASE PAIRING; BINDING AFFINITY; DNA REPLICATION; DNA TEMPLATE; ENTROPY; HYDROGEN BOND; PHASE PARTITIONING; PROCESS OPTIMIZATION; SOLVENT EFFECT; STEREOCHEMISTRY;

EID: 79959421490     PISSN: 13597345     EISSN: 1364548X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0cc04707d     Document Type: Article

References (36)

1. L. Stryer, Biochemistry, Freeman, New York, 1988
2. A. Kornberg and T. A. Baker, DNA Replication, Freeman, New York, 1992
3. E. T. Kool J. C. Morales K. M. Guckian Angew. Chem., Int. Ed. 2000 39 990
4. K. M. Guckian T. R. Krugh E. T. Kool J. Am. Chem. Soc. 2000 122 6841
5. J. C. Morales E. T. Kool J. Am. Chem. Soc. 2000 122 1001
6. D. Summerer A. Marx Angew. Chem., Int. Ed. 2001 40 3693
7. M. Strerath J. Cramer T. Restle A. Marx J. Am. Chem. Soc. 2002 124 11230
8. H. O. Sintim E. T. Kool Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 1974
9. M. Berger A. K. Ogawa D. L. McMinn Y. Wu P. G. Schultz F. E. Romesberg Angew. Chem., Int. Ed. 2000 39 2940
10. Y. Wu A. K. Ogawa M. Berger D. L. McMinn P. G. Schultz F. E. Romesberg J. Am. Chem. Soc. 2000 122 7621
11. A. K. Ogawa Y. Wu M. Berger P. G. Schultz F. E. Romesberg J. Am. Chem. Soc. 2000 122 8803
12. A. K. Ogawa Y. Wu D. L. McMinn J. Liu P. G. Schultz F. E. Romesberg J. Am. Chem. Soc. 2000 122 3274
13. C. Fonseca Guerra F. M. Bickelhaupt Angew. Chem., Int. Ed. 2002 41 2092
14. C. Fonseca Guerra F. M. Bickelhaupt J. Chem. Phys. 2003 119 4262
15. P. Hagenbuch E. Kervio A. Hochgesand U. Plutowski C. Richert Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 6588
16. T. Wu L. E. Orgel J. Am. Chem. Soc. 1992 114 7963
17. A. D. Becke Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys. 1988 38 3098
18. J. P. Perdew Phys. Rev. B 1986 33 8822
19. S. H. Vosko L. Wilk M. Nusair Can. J. Phys. 1980 58 1200
20. S. Grimme J. Comput. Chem. 2006 27 1787
21. G. te Velde F. M. Bickelhaupt E. J. Baerends C. Fonseca Guerra S. J. A. van Gisbergen J. G. Snijders T. Ziegler J. Comput. Chem. 2001 22 931
22. M. Swart F. M. Bickelhaupt Int. J. Quantum Chem. 2006 106 2536
23. A. Klamt G. Schüürmann J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1993 799
24. A. Klamt V. Jones J. Chem. Phys. 1996 105 9972
25. C. C. Pye T. Ziegler Theor. Chem. Acc. 1999 101 396
26. M. Swart E. Rösler F. M. Bickelhaupt Eur. J. Inorg. Chem. 2007 3646
27. C. Fonseca Guerra F. M. Bickelhaupt J. G. Snijders E. J. Baerends J. Am. Chem. Soc. 2000 122 4117
28. T. van der Wijst C. Fonseca Guerra M. Swart F. M. Bickelhaupt Chem. Phys. Lett. 2006 426 415
29. C. Fonseca Guerra T. van der Wijst J. Poater M. Swart F. M. Bickelhaupt Theor. Chem. Acc. 2010 125 245
30. C. Fonseca Guerra F. M. Bickelhaupt J. G. Snijders E. J. Baerends Chem.-Eur. J. 1999 5 3581
31. J. Sponer J. Leszczynski P. Hobza J. Phys. Chem. 1996 100 1965
32. C. Fonseca Guerra F. M. Bickelhaupt E. J. Baerends Cryst. Growth Des. 2002 2 239
33. R. E. A. Kelly Y. J. Lee L. N. Kantorovich J. Phys. Chem. B 2005 109 11933
34. R. Rucker P. Oelschlaeger A. Warshel Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2010 78 671
35. L. Wang S. Broyde Y. Zhang J. Mol. Biol. 2009 389 787
36. J. Florián M. F. Goodman A. Warshel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 109 6819