Puzzle of protein dynamical transition

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 24, 2011, Pages 7736-7743

  Magazù, Salvatore ^a   Migliardo, Federica ^a   Benedetto, Antonio ^a  

^a UNIVERSITY OF MESSINA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DATA REDUCTION; MATHEMATICAL MODELS; RELAXATION TIME;

BIOLOGICAL MACROMOLECULE; DATA ANALYSIS PROTOCOL; DYNAMICAL CROSSOVER; DYNAMICAL PROPERTIES; DYNAMICAL TRANSITION; ENERGY RESOLUTIONS; MEAN SQUARE DISPLACEMENT; NEUTRON SCATTERING EXPERIMENTS; NUMERICAL ERRORS; TEMPERATURE BEHAVIOR;

DYNAMICAL SYSTEMS;

EID: 79959338256     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp111421m     Document Type: Article

References (55)

1. Doster, W.; Cusak, S.; Petry, W. Nature 1989, 337, 754
2. Rasmussen, B. F.; Stock, A. M.; Ringe, D.; Petsko, G. A. Nature 1992, 357, 423
3. Zaccai, G. Science 2000, 288, 1604
4. Doster, W. Eur. Biophys. J. 2008, 37, 591
5. Sokolov, A. P.; Roh, J. H.; Mamontov, E.; Garcia Sakai, V. Chem. Phys. 2008, 345, 212
6. Magazù, S.; Migliardo, F.; Benedetto, A. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 9268
7. Lee, A. L.; Wand, J. Nature 2001, 411, 501
8. Ferrand, M.; Dianoux, A. J.; Petry, W.; Zaccai, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 9668
9. Parak, F. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 552
10. Fenimore, P. W.; Frauenfelder, H.; McMahon, B. H.; Young, R. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 14408
11. Daniel, R. M.; Smith, J.; Ferrand, M.; Hery, S.; Dunn, R.; Finney, J. L. Biophys. J. 1998, 75, 2504
12. Kurkal, V.; Daniel, R. M.; Finney, J. L.; Tehei, M.; Dunn, R. V.; Smith, J. C. Biophys. J. 2005, 89, 1282
13. Mamontov, E.; ONeill, H.; Zhang, Q. J. Biol. Phys. 2010, 36, 291
14. Cerveny, S.; Schwartz, G. A.; Bergman, R.; Swenson, J. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 245702
15. Velikov, V.; Borick, S.; Angell, C. A. Science 2001, 294, 2335
16. Giovambattista, N.; Angell, C. A.; Sciortino, F.; Stanley, H. E. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 47801
17. Chen, S. H.; Liu, L.; Fratini, E.; Baglioni, P.; Faraone, A.; Mamontov, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 9012
18. Khodadadi, S.; Pawlus, S.; Roh, J. H.; Garcia Sakai, V.; Mamontov, E.; Sokolov, A. P. J. Chem. Phys. 2008, 128, 195106
19. Doster, W.; Busch, S.; Gasper, A. M.; Appavou, M. S.; Wuttke, J.; Scheer, H. Phys. Rev. Lett. 2010, 104, 098101
20. Liu, L.; Chen, S. H.; Faraone, A.; Yen, C. W.; Mou, C. Y. Phys. Rev. Lett. 2005, 95, 117802
21. Chen, S. H.; Liu, L.; Faraone, A. Phys. Rev. Lett. 2006, 97, 189803
22. Faraone, A.; Liu, L.; Mou, C. Y.; Yen, C. W.; Chen, S. H. J. Chem. Phys. 2004, 121, 10843
23. Chen, S. H.; Liu, L.; Chu, X.; Zhang, Y.; Fratini, E.; Baglioni, P.; Faraone, A.; Mamontov, E. J. Chem. Phys. 2006, 125, 171103
24. Chu, X.; Fratini, E.; Baglioni, P.; Faraone, A.; Chen, S. H. Phys. Rev. E 2008, 77, 011908
25. Khodadadi, S.; Pawlus, S.; Sokolov, A. P. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 14273
26. Pawlus, S.; Khodadadi, S.; Sokolov, A. P. Phys. Rev. Lett. 2008, 100, 108103
27. Swenson, J. Phys. Rev. Lett. 2006, 97, 189801
28. Swenson, J.; Jansson, H.; Bergman, R. Phys. Rev. Lett. 2006, 96, 247802
29. Vogel, M. Phys. Rev. Lett. 2008, 101, 225701
30. Kneller, G. R.; Calandrini, V. J. Chem. Phys. 2007, 126, 125107
31. Becker, T.; Smith, J. C. Phys. Rev. E 2003, 67, 021904
32. Becker, T.; Hayward, J. A.; Finney, J. L.; Daniel, R. M.; Smith, J. C. Biophys. J. 2004, 87, 1436
33. Careri, G. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1998, 70, 223
34. Gregory, R. B. Protein-Solvent Interactions; Dekker: New York, 1995.
35. Teeter, M. M. Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 577
36. Benedetto, A.; Magazù, S.; Maisano, G.; Migliardo, F. Complexity, Metastability Nonextensivity 2007, 965, 245
37. Magazù, S.; Maisano, G.; Migliardo, F.; Benedetto, A. J. Mol. Struct. 2008, 882, 140
38. Magazù, S.; Maisano, G.; Migliardo, F.; Benedetto, A. Phys. Rev. E 2008, 77, 061802
39. Magazù, S.; Maisano, G.; Migliardo, F.; Benedetto, A. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 8936
40. Magazù, S.; Maisano, G.; Migliardo, F.; Galli, G.; Benedetto, A.; Morineau, D.; Affouard, F.; Descamps, M. J. Chem. Phys. 2008, 129, 155103
41. Magazù, S.; Maisano, G.; Migliardo, F.; Benedetto, A. Phys. Rev. E 2009, 79, 041915
42. Magazù, S.; Maisano, G.; Migliardo, F.; Benedetto, A. Biochim. Biophys. Acta 2010, 1804, 49
43. Magazù, S.; Migliardo, F.; Benedetto, A.; Gonzalez, M.; Mondelli, C. Spectroscopy 2010, 24, 387
44. Magazù, S.; Migliardo, F.; Benedetto, A.; Mondelli, C.; Gonzalez, M. J. Non-Cryst. Solids 2011, 357, 664
45. Caliskan, G.; Mechtani, D.; Roh, J. H.; Kisliuk, A.; Sokolov, A. P.; Azzam, S.; Cicerone, M. T.; Lin-Gibson, S.; Peral, I. J. Chem. Phys. 2004, 121, 1978
46. Volino, F. Spectroscopic Methods for the Study of Local Dynamics in Polyatomic Fluids; Plenum: New York, 1978.
47. Bee, M. Quasielastic Neutron Scattering; Adam Hilger: Bristol, 1988; p 84.
48. Lerbret, A.; Bordat, P.; Affouard, F.; Hedoux, A.; Guinet, Y.; Descamps, M. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 9410
49. Jansson, H.; Swenson, J. Biochim. Biophys. Acta 2010, 1804, 20
50. Schirò, G.; Caronna, C.; Natali, F.; Cupane, A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 10215
51. Cornicchi, E.; Marconi, M.; Onori, G.; Paciaroni, A. Biophys. J. 2006, 91, 289
52. Di Bari, M.; Deriu, A.; Albanese, G.; Cavatorta, F. Chem. Phys. 2003, 292, 333
53. Van den Dries, I. J.; Besseling, N. A. M.; Van Dusschoten, D.; Hemminga, M. A.; Van Der Linden, E. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 9260
54. Green, J. L.; Angell, C. A. J. Phys. Chem. 1989, 93, 2880
55. Noel, T. R.; Parker, R.; Ring, S. G. Carbohydr. Res. 1996, 282, 193