A proton spin diffusion based solid-state NMR approach for structural studies on aligned samples

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 16, 2011, Pages 4863-4871

  Xu, Jiadi ^a   Smith, Pieter E S ^a   Soong, Ronald ^a   Ramamoorthy, Ayyalusamy ^a  

^a UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL MATERIALS; DIFFUSION; ISOTOPES; LIQUID CRYSTALS; MOLECULES; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PROTONS; RESONANCE; SOLID STATE PHYSICS;

ALIGNED MOLECULES; ALIGNED SAMPLES; ATOMIC-LEVEL RESOLUTION; BICELLES; COLUMNAR LIQUID CRYSTALS; FUNCTIONAL MOLECULES; HETERONUCLEAR DIPOLAR COUPLINGS; HIGH RESOLUTION; LIQUID CRYSTALLINE MATERIALS; MOLECULAR ARCHITECTURE; MOLECULAR IMAGES; PROTON SPINS; PULSE SEQUENCE; RESONANCE ASSIGNMENTS; SEPARATED LOCAL FIELDS; SINGLE SITES; SOLID STATE NMR; SPIN DIFFUSIONS; STRUCTURAL STUDIES;

CRYSTAL ATOMIC STRUCTURE;

EID: 79955426449     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp201501q     Document Type: Article

References (71)

1. Schmidt-Rohr, K.; Spiess, H. W. Multidimensional Solid-State NMR and Polymers; Academic Press Inc.: San Diego, CA, 1994.
2. Ramamoorthy, A. In NMR Spectroscopy of biological solids; Ramamoorthy, A, Ed.; Taylor & Francis Group: New York, 2006; pp 33487 - 2742.
3. Lorieau, J. K.; Day, L. A.; McDermott, A. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 10366
4. Lange, A.; Giller, K.; Hornig, S.; Martin-Eauclaire, M. F.; Pongs, O.; Becker, S.; Baldus, M. Nature 2006, 440, 959-962
5. Durr, U. H.; Waskell, L.; Ramamoorthy, A. Biochim. Biophys. Acta 2007, 1768, 3235-3259
6. Hu, K. N.; Tycko, R. Biophys. Chem. 2010, 151, 10-21
7. Chen, B.; Tycko, R. Protein Sci. 2010, 19, 716-730
8. Wickramasinghe, N. P.; Parthasarathy, S.; Jones, C. R.; Bhardwaj, C.; Long, F.; Kotecha, M.; Mehboob, S.; Fung, L. W.; Past, J.; Samoson, A.; Ishii, Y. Nat. Methods 2009, 6, 215-218
9. Andronesi, O. C.; Becker, S.; Seidel, K.; Heise, H.; Young, H. S.; Baldus, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12965
10. Krabben, L.; van Rossum, B.-J.; Castellani, F.; Bocharov, E.; Schulga, A. A.; Arseniev, A. S.; Weise, C.; Hucho, F.; Oschkinat, H. FEBS Lett. 2004, 564, 319
11. Frericks, H. L.; Zhou, D. H.; Yap, L. L.; Gennis, R. B.; Rienstra, C. M. J. Biomol. NMR 2006, 36, 55
12. Cady, S. D.; Schmidt-Rohr, K.; Wang, J.; Soto, C. S.; DeGrado, W. F.; Hong, M. Nature 2010, 463, 689
13. Zhu, P. Z.; Xu, J. D.; Sahar, N.; Morris, M. D.; Kohn, D. H.; Ramamoorthy, A. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 17064
14. Han, Y.; Ahn, J.; Concel, J.; Byeon, I. J. L.; Gronenborn, A. M.; Yang, J.; Polenova, T. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1976
15. Lin, N. S.; Chao, J. C. H.; Cheng, H. M.; Chou, F. C.; Chang, C. F.; Chen, Y. R.; Chang, Y. J.; Huang, S. J.; Chan, J. C. C. Chem.-Eur. J. 2010, 16, 5492
16. Nielsen, J. T.; Bjerring, M.; Jeppesen, M. D.; Pedersen, R. O.; Pedersen, J. M.; Hein, Kim L.; Vosegaard, T.; Skrydstrup, T.; Otzen, D. E.; Nielsen, N. C. Angew. Chem. Int., Ed. Engl. 2009, 48, 2118
17. Ramamoorthy, A. Solid State Nucl. Magn. Reson. 2009, 35, 201-207
18. Cross, T. A.; Opella, S. J. Curr. Opin. Struct. Biol. 1994, 4, 574
19. Sugawara, M.; Resende, J. M.; Moraes, C. M.; Marquette, A.; Chich, J. F.; Metz-Boutigue, M. H.; Bechinger, B. FASEB J. 2010, 24, 1737
20. Nevzorov, A. A.; Mesleh, M. F.; Opella, S. J. Magn. Reson. Chem. 2004, 42, 162
21. Vosegaard, T.; Bertelsen, K.; Pedersen, J. M.; Thøgersen, L.; Schiøtt, B.; Tajkhorshid, E.; Skrydstrup, T.; Nielsen, N. C. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 502816
22. Yamamoto, K.; Soong, R.; Ramamoorthy, A. Langmuir 2009, 25, 7010
23. Lu, J.-X.; Damodaran, K.; Lorigan, G. A. J. Magn. Reson. 2006, 178, 283
24. Naito, A. Solid-State NMR Spectrosc. 2009, 36, 67-76
25. Strandberg, E.; Esteban-Martín, S.; Salgado, J.; Ulrich, A. S. Biophys. J. 2009, 96, 3223
26. Durr, U. H. N.; Yamamoto, K.; Im, S.-C.; Waskell, L.; Ramamoorthy, A. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 6670
27. Traaseth, N. J.; Buffy, J. J.; Zamoon, J.; Veglia, G. Biochemistry 2006, 45, 13827
28. Pan, Y. L.; Cheng, J. T. J.; Hale, J.; Pan, J.; Hancock, R. E.W.; Straus, S. K. Biophys. J. 2007, 92, 2854
29. Opella, S. J.; Waugh, J. S. J. Chem. Phys. 1977, 66, 4919
30. Aue, W. P.; Bartholdi, E.; Ernst, R. R. J. Chem. Phys. 1976, 64, 2229
31. Ramamoorthy, A.; Wei, Y. F.; Lee, D. K. Annu. Rep. NMR Spectrosc. 2004, 52, 1
32. Knox, R. W.; Lu, G. J.; Opella, S. J.; Nevzorov, A. A. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 8255
33. Ramamoorthy, A.; Thennarasu, S.; Lee, D. K.; Tan, A.; Maloy, L. Biophys. J. 2006, 91, 206
34. Caldarelli, S.; Hong, M.; Emsley, L.; Pines, A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 18696
35. Narasimhaswamy, T.; Lee, D. K.; Yamamoto, K.; Somanathan, N.; Ramamoorthy, A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 6958
36. Narasimhaswamy, T.; Monette, M.; Lee, D. K.; Ramamoorthy, A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 19696
37. Naito, A.; Imanari, M.; Akasaka, K. J. Chem. Phys. 1996, 105, 4504
38. Jayanthi, S.; Ramanathan, K. V. J. Chem. Phys. 2010, 132, 134501
39. Naito, A.; Ramamoorthy, A. In Thermotropic Liquid Crystals-Recent Advances; Ramamoorthy, A, Ed.; Springer: 2007; Chapter 3, pp 85 - 116.
40. Jayanthi, S.; Madhu, P. K.; Ramanathan, K. V. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 11159
41. Das, B. B.; Sinha, N.; Ramanathan, K. V. J. Magn. Reson. 2008, 194, 237
42. Marassi, F. M.; Ramamoorthy, A.; Opella, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 8551-8556
43. Jelinek, R.; Ramamoorthy, A.; Opella, S. J. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 12348-12349
44. Ramamoorthy, A.; Gierasch, L. M.; Opella, S. J. J. Magn. Reson. 1995, 109, 112
45. Ramamoorthy, A.; Gierasch, L. M.; Opella, S. J. J. Magn. Reson. 1996, 111, 81
46. Xu, J.; Struppe, J.; Ramamoorthy, A. J. Chem. Phys. 2008, 128, 052308
47. Knox, R. W.; Lu, G. J.; Opella, S. J.; Nevzorov, A. A. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 8255
48. Wu, C. H.; Ramamoorthy, A.; Opella, S. J. J. Magn. Reson. 1994, 109, 270
49. Ramamoorthy, A.; Wu, C. H.; Opella, S. J. J. Magn. Reson. 1999, 140, 131
50. Yamamoto, K.; Dvinskikh, S. V.; Ramamoorthy, A. Chem. Phys. Lett. 2005, 407, 289
51. Dvinskikh, S. V.; Yamamoto, K.; Ramamoorthy, A. J. Chem. Phys. 2006, 125, 034507
52. Yamamoto, K.; Dvinskikh, S. V.; Ramamoorthy, A. Chem. Phys. Lett. 2006, 419, 533
53. Nevzorov, A. A.; Opella, S. J. J. Magn. Reson. 2003, 164, 182
54. Fukuchi, M.; Ramamoorthy, A.; Takegoshi, K. J. Magn. Reson. 2009, 196, 105
55. Caravatti, P.; Braunschweiler, L.; Ernst, R. R. Chem. Phys. Lett. 1983, 100, 305
56. Caldarelli, S.; Hong, M.; Emsley, L.; Pines, A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 18696
57. Soong, R.; Smith, P. E. S.; Xu, J.; Yamamoto, K.; Im, S.-C.; Waskell, L.; Ramamoorthy, A. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 5779
58. Fung, B. M.; Khitrin, A. K.; Ermolaev, K. J. Magn. Reson. 2002, 142, 97-101
59. Burum, D. P.; Linder, M.; Ernst, R. R. J. Magn. Reson. 1981, 44, 173
60. Veshtort, M.; Griffin, R. G. J. Magn. Reson. 2006, 178, 248
61. Sanders, C. R.; Hare, B. J.; Howard, K. P.; Prestegard, J. H. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 1994, 26, 421-444
62. Prosser, R. S.; Evanics, F.; Kitevski, J. L.; Al-Abdul-Wahid, M. S. Biochemistry 2006, 45, 8453-8465
63. Inbaraj, J. J.; Cardon, T. B.; Laryukhin, M.; Grosser, S. M.; Lorigan, G. A. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 9549-9554
64. Prosser, S. R.; Volkov, V. B.; Shiyanovskaya, I. V. Biophys. J. 1998, 75, 2163-2169
65. Marcotte, I.; Auger, M. Concepts Magn. Reson., Part A 2005, 24A, 17
66. Ramamoorthy, A.; Thennarasu, S.; Lee, D. K.; Tan, A.; Maloy, L. Biophys. J. 2006, 91, 206-216
67. Barry, J.; Fritz, M.; Brender, J. R.; Smith, P. E. S.; Lee, D. K.; Ramamoorthy, A. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 4490-4498
68. Emsley, J. W.; Lesot, P.; Lesage, A.; De Luca, G.; Merlet, D.; Pileio, G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 2895
69. Waschinski, C. J.; Barnert, S.; Theobald, A.; Schubert, R.; Kleinschmidt, F.; Hoffmann, A.; Saalwachter, K.; Tiller, J. C. Biomacromolecules 2008, 9, 1764
70. Li, L. S.; Marjanska, M.; Park, G. H. J.; Pines, A.; Alivisatos, A. P. J. Phys. Chem. 2004, 120, 1149
71. Akasaka, K.; Kimura, M.; Naito, A.; Kawahara, H.; Imanari, M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 9523