On-line liquid chromatography neutral loss-triggered electron transfer dissociation mass spectrometry for the targeted analysis of citrullinated peptides

Analytical Methods

Volumn 3, Issue 2, 2011, Pages 259-266

  Creese, Andrew J ^a   Grant, Melissa M ^a   Chapple, Iain L C ^a   Cooper, Helen J ^a  

^a UNIVERSITY OF BIRMINGHAM   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COLLISION-INDUCED DISSOCIATION; ELECTRON TRANSFER DISSOCIATION; FALSE POSITIVE; HIGH CONFIDENCE; ISOCYANIC ACIDS; MULTIPLE SCLEROSIS; NEUTRAL LOSS; PEPTIDE BACKBONES; PEPTIDE SEQUENCES; POST-TRANSLATIONAL MODIFICATIONS; RHEUMATOID ARTHRITIS; SIDE-CHAIN; SYNTHETIC PEPTIDE; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

ACTIVATION ANALYSIS; AMINO ACIDS; ARGININE; DISSOCIATION; ELECTRON TRANSITIONS; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY;

PEPTIDES;

EID: 79952966753     PISSN: 17599660     EISSN: 17599679     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0ay00414f     Document Type: Article

References (54)

1. R. Bischoff H. V. J. Kolbe J. Chromatogr., B: Biomed. Appl. 1994 662 261 278
2. E. R. Vossenaar A. J. W. Zendman W. J. van Venrooij G. J. M. Pruijn BioEssays 2003 25 1106 1118
3. A. P. Nicholas T. Sambandam J. D. Echols W. W. Tourtellotte J. Comp. Neurol. 2004 473 128 136
4. J. de Seze S. Dubucquoi D. Lefranc F. Virecoulona I. Nueza V. Dutoita P. Vermerschb L. Prina J. Neuroimmunol. 2001 117 149 155
5. A. Ishigami T. Ohsawa M. Hiratsuka H. Taguchi S. Kobayashi Y. Saito S. Murayama H. Asaga T. Toda N. Kimura N. Maruyama J. Neurosci. Res. 2005 80 120 128
6. A. Union L. Meheus R. L. Humbel K. Conrad G. Steiner H. Moereels H. Pottel G. Serre F. De Keyser Arthritis Rheum. 2002 46 1185 1195
7. A. Kinloch K. Lundberg R. Wait N. Wegner N. H. Lim T. Saxne V. Malmstrom P. J. Venables Rheumatology 2008 47 Ii57 Ii57
8. T. Cantaert L. De Rycke T. Bongartz E. L. Matteson P. P. Tak A. P. Nicholas D. Baeten Arthritis Rheum. 2006 54 3381 3389
9. F. G. Mastronardi D. D. Wood J. Mei R. Raijmakers V. Tseveleki H. M. Dosch L. Probert P. Casaccia-Bonnefil M. A. Moscarello J. Neurosci. 2006 26 11387 11396
10. T. Hagiwara Y. Hidaka M. Yamada Biochemistry 2005 44 5827 5834
11. M. Shrivastav B. Mittal A. Aggarwal R. Misra Clin. Rheumatol. 2002 21 505 510
12. P. de Pablo I. L. C. Chapple C. D. Buckley T. Dietrich Nat. Rev. Rheumatol. 2009 5 218 224
13. A. D. Haffajee S. S. Socransky Periodontology 2000 1994 5 78 111
14. A. L. Griffen M. R. Becker S. R. Lyons M. L. Moeschberger E. J. Leys J. Clin. Microbiol. 1998 36 3239 3242
15. E. D. Rosenstein G. Weissmann R. A. Greenwald Med. Hypotheses 2009 73 457 458
16. V. Johnson B. D. Johnson T. J. Sims C. W. Whitney B. J. Moncla L. D. Engel R. C. Page J. Periodontol. 1993 64 559 565
17. J. Matto M. Saarela S. Alaluusua V. Oja H. Jousimies-Somer S. Asikainen J. Clin. Microbiol. 1998 36 157 160
18. J. J. Coon J. E. P. Syka J. Shabanowitz D. F. Hunt BioTechniques 2005 38 519 523
19. R. Aebersold M. Mann Nature 2003 422 198 207
20. J. M. Wells S. A. McLuckey Biol. Mass Spectrom. 2005 402 148 185
21. S. M. M. Sweet C. M. Bailey D. L. Cunningham J. K. Heath H. J. Cooper Mol. Cell. Proteomics 2009 8 904 912
22. M. Mann O. N. Jensen Nat. Biotechnol. 2003 21 255 261
23. E. C. Huang J. D. Henion J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1990 1 158 165
24. G. D. Chen B. N. Pramanik Drug Discovery Today 2009 14 465 471
25. K. R. Jennings Int. J. Mass Spectrom. Ion Phys. 1968 1 227 235
26. P. Roepstorff J. Fohlman Biomed. Mass Spectrom. 1984 11 601 601
27. M. P. Washburn D. Wolters J. R. Yates Nat. Biotechnol. 2001 19 242 247
28. R. A. Zubarev N. L. Kelleher F. W. McLafferty J. Am. Chem. Soc. 1998 120 3265 3266
29. J. E. P. Syka J. J. Coon M. J. Schroeder J. Shabanowitz D. F. Hunt Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 9528 9533
30. H. J. Cooper R. R. Hudgins K. Hakansson A. G. Marshall Int. J. Mass Spectrom. 2003 228 723 728
31. R. A. Zubarev D. M. Horn E. K. Fridriksson N. L. Kelleher N. A. Kruger M. A. Lewis B. K. Carpenter F. W. McLafferty Anal. Chem. 2000 72 563 573
32. A. J. Creese H. J. Cooper J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007 18 891 897
33. N. L. Kelleher R. A. Zubarev K. Bush B. Furie B. C. Furie F. W. McLafferty C. T. Walsh Anal. Chem. 1999 71 4250 4253
34. A. Stensballe O. N. Jensen J. V. Olsen K. F. Haselmann R. A. Zubarev Rapid Commun. Mass Spectrom. 2000 14 1793 1800
35. S. D. H. Shi M. E. Hemling S. A. Carr D. M. Horn I. Lindh F. W. McLafferty Anal. Chem. 2001 73 19 22
36. A. Chi C. Huttenhower L. Y. Geer J. J. Coon J. E. P. Syka D. L. Bai J. Shabanowitz D. J. Burke O. G. Troyanskaya D. F. Hunt Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 2193 2198
37. H. Molina D. M. Horn N. Tang S. Mathivanan A. Pandey Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 2199 2204
38. K. Hakansson H. J. Cooper M. R. Emmett C. E. Costello A. G. Marshall C. L. Nilsson Anal. Chem. 2001 73 4530 4536
39. E. Mirgorodskaya P. Roepstorff R. A. Zubarev Anal. Chem. 1999 71 4431 4436
40. I. Perdivara R. Petrovich B. Allinquant L. J. Deterding K. B. Tomer M. Przybylski J. Proteome Res. 2009 8 3786 3786
41. Z. Q. Guan J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2002 13 1443 1447
42. Z. Q. Guan N. A. Yates R. Bakhtiar J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2003 14 605 613
43. H. J. Cooper M. H. Tatham E. Jaffray J. K. Heath T. T. Lam A. G. Marshall R. T. Hay Anal. Chem. 2005 77 6310 6319
44. H. J. Cooper J. K. Heath E. Jaffray R. T. Hay T. T. Lam A. G. Marshall Anal. Chem. 2004 76 6982 6988
45. D. L. Swaney G. C. McAlister M. Wirtala J. C. Schwartz J. E. P. Syka J. J. Coon Anal. Chem. 2007 79 477 485
46. M. Stensland A. Holm A. Kiehne B. Fleckenstein Rapid Commun. Mass Spectrom. 2009 23 2754 2762
47. G. Hao D. C. Wang J. Gu Q. Y. Shen S. S. Gross Y. M. Wang J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009 20 723 727
48. V. Goeb M. Thomas-L'Otellier R. Daveau R. Charlionet P. Fardellone X. Le Loet F. Tron D. Gilbert O. Vittecoq Arthritis Res. Ther. 2009 11 R38
49. M. Knipp M. Vasak Anal. Biochem. 2000 286 257 264
50. S. M. M. Sweet A. J. Creese H. J. Cooper Anal. Chem. 2006 78 7563 7569
51. J. K. Eng A. L. Mccormack J. R. Yates J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994 5 976 989
52. S. M. M. Sweet A. W. Jones D. L. Cunningham J. K. Heath A. J. Creese H. J. Cooper J. Proteome Res. 2009 8 5475 5484
53. D. M. Good C. D. Wenger G. C. McAlister D. L. Bai D. F. Hunt J. J. Coon J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009 20 1435 1440
54. D. L. Swaney G. C. McAlister J. J. Coon Nat. Methods 2008 5 959 964