Reactivity of polynuclear zinc-thiolate sites

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 111, Issue 6, 2011, Pages 1239-1247

  Ohanessian, Gilles ^a   Picot, Delphine ^a   Frison, Gilles ^a  

^a CNRS   (France)

Author keywords

computational chemistry; metallothioneins; nucleophilicity; S ligands; zinc

Indexed keywords

DENSITY FUNCTIONAL THEORY CALCULATIONS; INORGANIC CLUSTERS; LEWIS ACID; METALLOTHIONEINS; NATURAL CLUSTERS; NUCLEOPHILICITIES; PROTEIN BACKBONE; PROTON AFFINITY; RELATIVE REACTIVITIES; S LIGANDS; SITE-SPECIFICITY; THIOLATES; ZINC FINGER;

COMPUTATIONAL CHEMISTRY; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; LIGANDS;

ZINC;

EID: 79952143059     PISSN: 00207608     EISSN: 1097461X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/qua.22866     Document Type: Conference Paper

References (80)

1. Sigel, A.; Sigel, H.; Sigel, R. K. O., Eds. Metallothioneins and Related Chelators. Metal Ions in Life Sciences, Vol. 5; RSC Publishing: Cambridge, 2009.
2. Romero-Isart, N.; Vasak, M. J., Inorg Biochem 2002, 88, 388.
3. Blindauer, C. A.; Sadler, P. J., Acc Chem Res 2005, 38, 62.
4. Palmiter, R. D., Proc Natl Acad Sci USA 1998, 95, 8428.
5. Coyle, P.; Philcox, J. C.; Carey, L. C.; Rofe, A. M., Cell Mol Life Sci 2002, 59, 627.
6. Arseniev, A.; Schultze, P.; Wörgötter, E.; Braun, W.; Wagner, G.; Vasak, M.; Kägi, J. H. R.; Wüthrich, K., J Mol Biol 1988, 201, 637.
7. Robbins, A. H.; McRee, D. E.; Williamson, M.; Collett, S. A.; Xuong, N. H.; Furey, W. F.; Wang, B. C.; Stout, C. D., J Mol Biol 1991, 221, 1269.
8. Braun, W.; Vasak, M.; Robbins, A. H.; Stout, C. D.; Wagner, G.; Kägi, J. H. R.; Wüthtich, K., Proc Natl Acad Sci USA 1992, 89, 10124.
9. Blindauer, C. A., J Inorg Biochem 2008, 102, 507.
10. Blindauer, C. A.; Harrison, M. D.; Parkinson, J. A.; Robinson, A. K.; Cavet, J. S.; Robinson, N. J.; Sadler, P. J., Proc Natl Acad Sci USA 2001, 98, 9593.
11. Peroza, E. A.; Schmucki, R.; Güntert, P.; Freisinger, E.; Zerbe, O., J Mol Biol 2009, 387, 207.
12. Maret, W., Biochemistry 2004, 43, 3301.
13. Maret, W., Biometals 2009, 22, 149.
14. Maret, W.; Vallee, B. L., Proc Natl Acad Sci USA 1998, 95, 3478.
15. Krezel, A.; Hao, Q.; Maret, W., Arch Biochem Biophys 2007, 463, 188.
16. Bell, S. G.; Vallee, B. L., Chem Biochem 2009, 10, 55.
17. Kröncke, K. D.; Klotz, L. O., Antioxid Redox Signal 2009, 11, 1015.
18. Wilcox, D. E.; Schenk, A. D.; Feldman, B. M.; Xu, Y., Antioxid Redox Signal 2001, 3, 549.
19. Ilbert, M.; Graf, P. C. F.; Jakob, U., Antioxid Redox Signal 2006, 8, 835.
20. Maret, W., Antioxid Redox Signal 2006, 8, 1419.
21. Myers, L. C.; Terranova, M. P.; Ferentz, A. E.; Wagner, G.; Verdine, G. L., Science 1993, 261, 1164.
22. Penner-Hahn, J., Curr Opin Chem Biol 2007, 11, 166.
23. Matthews, R. G.; Goulding, C. W., Curr Opin Chem Biol 1997, 1, 332.
24. Parkin, G., Chem Rev 2004, 104, 699.
25. Warthen, C. R.; Hammes, B. S.; Carrano, C. J.; Crans, D. C., J Biol Inorg Chem 2001, 6, 82.
26. Rombach, M.; Seebacher, J.; Ji, M.; Zhang, G. F.; He, G. S.; Ibrahim, M. M.; Benkmil, B.; Vahrenkamp, H., Inorg Chem 2006, 45, 4571.
27. Picot, D.; Ohanessian, G.; Frison, G., Inorg Chem 2008, 47, 8167.
28. Wilker, J. J.; Lippard, S. J., Inorg Chem 1997, 36, 969.
29. Maynard, A. T.; Covell, D. G., J Am Chem Soc 2001, 123, 1047.
30. Huang, M. J.; Maynard, A.; Turpin, J. A.; Graham, L.; Janini, G. M.; Covell, D. G.; Rice, W. G., J Med Chem 1998, 41, 1371.
31. Anzellotti, A. I.; Farrell, N. P., Chem Soc Rev 2008, 37, 1629.
32. Takinowaki, H.; Matsuda, Y.; Yoshida, T.; Kobayashi, Y.; Ohkubo, T., Protein Sci 2006, 15, 487.
33. Hathout, Y.; Fabris, D.; Han, M. S.; Sowder, R. C.; Henderson, L. E.; Fenselau, C., Drug Metab Dispos 1996, 24, 1395.
34. Munoz, A.; Petering, D. H.; Shaw, C. F., III., Inorg Chem 1999, 38, 5655.
35. Zaia, J.; Jiang, L.; Han, M. S.; Tabb, J. R.; Wu, Z.; Fabris, D.; Fenselau, C., Biochemistry 1996, 35, 2830.
36. Yu, X.; Wu, Z.; Fenselau, C., Biochemistry 1995, 34, 3377.
37. Antoine, M.; Fabris, D.; Fenselau, C., Drug Metab Dispos 1998, 26, 921.
38. Almaraz, E.; de Paula, Q. A.; Liu, Q.; Reibenspies, J. H.; Darensbourg, M. Y.; Farrell, N. P., J Am Chem Soc 2008, 130, 6272.
39. Karotki, A. V.; Vasak, M., Biochemistry 2008, 47, 10961.
40. Eckschlager, T.; Adam, V.; Hrabeta, J.; Figova, K.; Kizek, R., Curr Prot Pep Sci 2009, 10, 360.
41. Knipp, M., Curr Med Chem 2009, 16, 522.
42. Picot, D.; Ohanessian, G.; Frison, G. C. R., Chimie 2009, 12, 546.
43. Frenking, G.; Wagener, T., In Transition Metal Chemistry. Encyclopedia of Computational Chemistry;, Schleyer, P. V. R., Ed.; Wiley: Chichester, 1998; pp 3073-3084.
44. Koch, W.; Holthausen, M. C., A Chemist's Guide to Density Functional Theory, 2nd ed.; Wiley-VCH: Weinheim, Germany, 2000.
45. Diedenhofen, M.; Wagener, T.; Frenking, G., The accuracy of quantum chemical methods for the calculation of transition metal compounds. In: Computational Organometallic Chemistry;, Cundari, T., Ed.; Marcel Dekker: New York, 2001; p 69.
46. Vosko, S.; Wilk, L.; Nusair, M., Can J Phys 1980, 58, 1200.
47. Perdew, J. P., Phys Rev B 1986, 33, 8822.
48. Becke, A. D., Phys Rev A 1988, 38, 3098.
49. Frison, G.; Ohanessian, G., J Comput Chem 2008, 29, 416.
50. Amin, E. A.; Truhlar, D. G., J Chem Theory Comput 2008, 4, 75.
51. Sousa, S. F.; Carvalho, E. S.; Ferreira, D. M.; Tavares, I. S.; Fernandes, P. A.; Ramos, M. J.; Gomes, J. A. N. F., J Comput Chem 2009, 30, 2752.
52. Pesonen, H.; Aksela, R.; Laasonen, K., J Phys Chem A 2010, 114, 466.
53. Sierka, M.; Hogekamp, A.; Ahlrichs, R., J Chem Phys 2003, 118, 9136.
54. Ahlrichs, R.; Bär, M.; Häser, M.; Horn, H.; Kölmel, C., Chem Phys Lett 1989, 162, 165.
55. Schäfer, A.; Horn, H.; Ahlrichs, R., J Chem Phys 1992, 97, 2571.
56. Weigend, F.; Ahlrichs, R., Phys Chem Chem Phys 2005, 7, 3297.
57. Weigend, F., Phys Chem Chem Phys 2006, 8, 1057.
58. Scott, A. P.; Radom, L., J Phys Chem 1996, 100, 16502.
59. Lee, C. T.; Yang, W. T.; Parr, R. G., Phys Rev B 1988, 37, 785.
60. Becke, A. D., J Chem Phys 1993, 98, 5648.
61. Weigend, F.; Häser, M.; Patzelt, H.; Ahlrichs, R., Chem Phys Lett 1998, 294, 143.
62. Frison, G.; Ohanessian, G., Phys Chem Chem Phys 2009, 11, 374.
63. Rayon, V. M.; Valdes, H.; Diaz, N.; Suarez, D., J Chem Theory Comput 2008, 4, 243.
64. Sorkin, A.; Truhlar, D. G.; Amin, E. A., J Chem Theory Comput 2009, 5, 1254.
65. Picot, D.; Ohanessian, G.; Frison, G., Chem Asian J 2010, 5, 1445.
66. Klamt, A.; Schüürmann, G., J Chem Soc Perkin Trans 2 1993, 5, 799.
67. Pan, T.; Coleman, J. E., Biochemistry 1990, 29, 3023.
68. Bellon, S. F.; Rodgers, K. K.; Schatz, D. G.; Coleman, J. E.; Steitz, T. A., Nat Struct Biol 1997, 4, 586.
69. Cumberland, S. L.; Hanif, K. M.; Javier, A.; Khitrov, G. A.; Strouse, G. F.; Woessner, S. M.; Yun, C. S., Chem Mater 2002, 14, 1576.
70. Henkel, G.; Krebs, B., Chem Rev 2004, 104, 801.
71. Gruff, E. S.; Koch, S. A., J Am Chem Soc 1989, 111, 8762.
72. Matsunaga, Y.; Fujisawa, K.; Ibi, N.; Amir, N.; Miyashita, Y.; Okamoto, K., Bull Chem Soc Jpn 2005, 78, 1285.
73. Burth, R.; Gelinsky, M.; Vahrenkamp, H., Inorg Chem 1998, 37, 2833.
74. Hagen, K. S.; Stephan, D. W.; Holm, R. H., Inorg Chem 1982, 21, 3928.
75. Gelinsky, M.; Vahrenkamp, H. Z., Anorg Allg Chem 2002, 628, 1017.
76. Ahte, P.; Palumaa, P.; Tamm, T., J Phys Chem A 2009, 113, 9157.
77. Enescu, M.; Renault, J. P.; Pommeret, S.; Mialocq, J. C.; Pin, S., Phys Chem Chem Phys 2003, 5, 3762.
78. de Courcy, B.; Gresh, N.; Piquemal, J. P., Interdiscip Sci Comput Life Sci 2009, 1, 55.
79. Chung, W. P.; Dewan, J. C.; Walters, M. A., Inorg Chem 1991, 30, 4280.
80. Wilker, J. J.; Lippard, S. J., J Am Chem Soc 1995, 117, 8682.