Vinblastine perturbation of tubulin protofilament structure: A computational insight

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 12, Issue 47, 2010, Pages 15530-15536

  Rendine, Stefano ^a   Pieraccini, Stefano ^a   Sironi, Maurizio ^a,b  

^a UNIVERSITY OF MILAN   (Italy)

^b CNR   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

TUBULIN; TUBULIN MODULATOR; VINBLASTINE;

ANIMAL; ARTICLE; CHEMISTRY; DIMERIZATION; MOLECULAR DYNAMICS; PROTEIN TERTIARY STRUCTURE; SWINE; THERMODYNAMICS;

ANIMALS; DIMERIZATION; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; SWINE; THERMODYNAMICS; TUBULIN; TUBULIN MODULATORS; VINBLASTINE;

EID: 78649624129     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0cp00594k     Document Type: Article

References (50)

1. J. S. Hyams and C. W. Lloyd, Microtubules, in Modern Cell Biology, ed., J. B. Harford, Wiley-Liss, New York, 1993
2. G. C. Rogers S. L. Rogers D. J. Sharp J. Cell Sci. 2005 118 1105 1116
3. R. K. MacNeal D. L. Purich J. Biol. Chem. 1978 253 4683 4687
4. E. Nogales Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2001 30 397 420
5. D. Panda H. Miller L. Wilson Biochemistry 2002 41 1609 1617
6. T. Mitchison M. Kirschner Nature 1984 312 237 242
7. A. Desai T. J. Mitchison Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 1997 13 83 117
8. E. Nogales Cell. Mol. Life Sci. 1999 56 133 142
9. K. H. Downing Expert Opin. Ther. Targets 2000 4 219 237
10. M. A. Jordan Curr. Med. Chem. 2002 2 1 17
11. M. A. Jordan L. Wilson Nat. Rev. Cancer 2004 4 253 265
12. E. Pasquier M. Kavallaris IUBMB Life 2008 60 165 170
13. P. B. Schiff J. Fant S. B. Horwitz Nature 1979 277 665 667
14. W. B. Derry L. Wilson M. A. Jordan Biochemistry 1995 34 2203 2211
15. M. A. Jordan D. T. Thrower L. Wilson Cancer Res. 1991 51 2212 2222
16. B. Gigant A. Cormier A. Dorléans R. B. G. Ravelli M. Knossow Top. Curr. Chem. 2008 286 259 278
17. B. Gigant C. Wang R. B. G. Ravelli F. Roussi M. O. Steinmetz P. A. Curmi A. Sobel M. Knossow Nature 2005 435 519 522
18. Y. Pommier J. Cherfils Trends Pharmacol. Sci. 2005 26 138 145
19. B. Gigant A. Cormier A. Dorléans R. B. G. Ravelli M. Knossow Top. Curr. Chem. 2008 286 259 278
20. K. M. Haskins J. A. Donoso R. H. Himes J. Cell Sci. 1981 47 237 247
21. R. L. Noble Biochem. Cell Biol. 1990 68 1344 51
22. E. J. Carpenter J. T. Huzil R. F. Luduena J. A. Tuszynski Eur. Biophys. J. 2006 36 35 43
23. C. D. Katsetos G. Kontogeorgos J. F. Geddes M. M. Herman H. Tsimara-Papastamatiou Y. Yu L. I. Sakkas M. Tsokos A. S. Patchefsky H. Ehya H. S. Cooper J. Provencio A. J. Spano A. Frankfurter Arch. Pathol. Lab. Med. 2000 124 535 544
24. A. Mitra D. Sept Biochemistry 2004 43 13955 13962
25. I. Massova P. A. Kollmann J. Am. Chem. Soc. 1999 121 8133 8143
26. I. Massova P. A. Kollmann Perspect. Drug Discovery Des. 2000 18 113 135
27. T. Li M. Froeyen P. Herdewijn J. Mol. Graphics Modell. 2008 26 813 823
28. A. Hamza M. Tong M. D. M. AbdulHameed J. Liu A. C. Goren H. Tai C. Zhan J. Phys. Chem. B 2010 114 5605 5616
29. I. S. Moreira P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Phys. Chem. B 2006 110 10962 10969
30. I. S. Moreira P. A. Fernandes M. J. Ramos Theor. Chem. Acc. 2006 117 99 113
31. E. Nogales M. Whittaker R. A. Milligan K. H. Downing Cell 1999 96 79 88
32. J. Löwe H. Li K. H. Downing E. Nogales J. Mol. Biol. 2001 313 1045 1057
33. S. Pieraccini G. Saladino G. Cappelletti D. Cartelli P. Francescato G. Speranza P. Manitto M. Sironi Nat. Chem. 2009 1 642 648
34. R. B. G. Ravelli B. Gigant P. A. Curmi I. Jourdain S. Lachkar A. Sobel M. Knossow Nature 2004 428 198 202
35. K. R. Anders D. Botstein Mol. Biol. Cell 2001 12 3973 3986
36. K. Dai A. Mukherjee Y. Xu J. Lutkenhaus J. Bacteriol. 1994 176 130 136
37. C. Wang A. Cormier B. Gigant M. Knossow Biochemistry 2007 46 10595 10602
38. T. David-Pfeuty R. F. Ludueña J. Biol. Chem. 1979 254 11696 11702
39. E. Nogales S. G. Wolf K. H. Downing Nature 1998 391 199 203
40. D. A. Case, T. A. Darden, T. E. Cheatham, III, C. L. Simmerling, J. Wang, R. E. Duke, R. Luo, K. M. Merz, D. A. Pearlman, M. Crowley, R. C. Walker, W. Zhang, B. Wang, S. Hayik, A. Roitberg, G. Seabra, K. F. Wong, F. Paesani, X. Wu, S. Brozell, V. Tsui, H. Gohlke, L. Yang, C. Tan, J. Mongan, V. Hornak, G. Cui, P. Beroza, D. H. Mathews, C. Schafmeister, W. S. Ross and P. A. Kollman, AMBER 9, University of California, San Francisco, 2006
41. Y. Duan C. Wu S. Chowdhury M. C. Lee G. Xiong W. Zhang R. Yang P. Cieplak R. Luo T. Lee J. Caldwell J. Wang P. Kollman J. Comput. Chem. 2003 24 1999 2012
42. J. Wang R. M. Wolf J. W. Caldwell P. A. Kollman D. A. Case J. Comput. Chem. 2004 25 1157 1174
43. W. L. Jorgensen J. Chandrasekhar J. Madura M. L. Klein J. Chem. Phys. 1983 79 926 935
44. J. P. Ryckaert G. Ciccotti H. J. C. Berendsen J. Comput. Phys. 1977 23 327 341
45. T. Darden D. York L. Pedersen J. Chem. Phys. 1993 98 10089 10092
46. V. Zoete O. Michielin Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2007 67 1026 1047
47. B. Kuhn P. A. Kollman J. Med. Chem. 2000 43 3786 3791
48. W. Humphrey A. Dalke K. Schulten J. Mol. Graphics 1996 14 33 38
49. J. T. Huzil K. Barakat J. A. Tuszynsky Electromagnetic Biology and Medicine 2009 28 355 364
50. C. Tseng J. Y. Mane P. Winter L. Johnson T. Huzil E. Izbicka R. F. Luduena J. A. Tuszynsky Mol. Cancer 2010 9 131 149