Overview of single-cell analyses: Microdevices and applications

Lab on a Chip

Volumn 10, Issue 24, 2010, Pages 3363-3372

  Lindström, Sara ^a   Andersson Svahn, Helene ^b  

^a KAROLINSKA INSTITUTE   (Sweden)

^b ROYAL INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CELL AGGREGATION; CELL ASSAY; CELL COMPARTMENTALIZATION; CELL CULTURE; CELL DIFFERENTIATION; CELL SELECTION; CELL SEPARATION; CELL STRUCTURE; CELL VIABILITY; CLONOGENESIS; CYTOLYSIS; CYTOTOXICITY; DNA HYBRIDIZATION; ELECTROPHORESIS; FLOW CYTOMETRY; FLUORESCENCE ACTIVATED CELL SORTING; GENE EXPRESSION; HYDRODYNAMICS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN EXPRESSION; REVIEW;

EID: 78649499977     PISSN: 14730197     EISSN: 14730189     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0lc00150c     Document Type: Review

References (105)

1. J. L. Spudich D. E. Koshland, Jr Nature 1976 262 467 471
2. R. H. Templer O. Ces J. R. Soc. Interface 2008 5 suppl 2 S111 S112
3. H. Andersson Svahn A. Van den Berg Lab Chip 2007 7 544 546
4. D. Di Carlo L. P. Lee Anal. Chem. 2006 78 7918 7925
5. D. Longo J. Hasty Mol. Syst. Biol. 2006 2 64
6. C. E. Sims N. L. Allbritton Lab Chip 2007 7 423 440
7. J. Voldman Curr. Opin. Biotechnol. 2006 17 532 537
8. S. Le Gac A. van den Berg Trends Biotechnol. 2010 28 55 62
9. G. M. Cooper and R. E. Hausman, The Cell, ASM Press, Washington, DC, 4th edn, 2007
10. J. T. Mettetal D. Muzzey J. M. Pedraza E. M. Ozbudak A. van Oudenaarden Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 7304 7309
11. J. Yu J. Xiao X. Ren K. Lao X. S. Xie Science 2006 311 1600 1603
12. B. H. Villas Cell Vision 1998 5 56 61
13. P. O. Krutzik G. P. Nolan Nat. Methods 2006 3 361 368
14. J. P. Nolan L. A. Sklar Nat. Biotechnol. 1998 16 633 638
15. J. C. Martin D. E. Swartzendruber Science 1980 207 199 201
16. J. Roostalu A. Joers H. Luidalepp N. Kaldalu T. Tenson BMC Microbiol. 2008 8 68
17. M. Oheim Br. J. Pharmacol. 2007 152 1 4
18. R. Pepperkok J. Ellenberg Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2006 7 690 696
19. M. M. Harnett Nat. Rev. Immunol. 2007 7 897 904
20. I. G. Arcibal M. F. Santillo A. G. Ewing Anal. Bioanal. Chem. 2007 387 51 57
21. J. Kehr Curr. Opin. Plant Biol. 2003 6 617 621
22. S. Lindstrom R. Larsson H. A. Svahn Electrophoresis 2008 29 1219 1227
23. S. Lindstrom H. Andersson-Svahn Biochim. Biophys. Acta 2010 10.1016/j.bbagen.2010.1004.1009
24. S. Lindstrom M. Hammond H. Brismar H. Andersson-Svahn A. Ahmadian Lab Chip 2009 9 3465 3471
25. S. Lindstrom M. Eriksson T. Vazin J. Sandberg J. Lundeberg J. Frisen H. Andersson-Svahn PLoS One 2009 4 e6997
26. M. Friedman S. Lindstrom L. Ekerljung H. Andersson-Svahn J. Carlsson H. Brismar L. Gedda F. Y. Frejd S. Stahl Biotechnol. Appl. Biochem. 2009 54 121 131
27. S. Lindstrom A. Iles J. Persson H. Hosseinkhani M. Hosseinkhani A. Khademhosseini H. Lindstrom H. Andersson Svahn J. Biomech. Sci. Eng. 2010 5 272 279
28. S. Lindstrom K. Mori T. Ohashi H. Andersson-Svahn Electrophoresis 2009 30 4166 4171
29. M. Charnley M. Textor A. Khademhosseini M. P. Lutolf Integr. Biol. 2009 1 625 634
30. R. S. Kane S. Takayama E. Ostuni D. E. Ingber G. M. Whitesides Biomaterials 1999 20 2363 2376
31. M. Kato M. Mrksich J. Am. Chem. Soc. 2004 126 6504 6505
32. M. Tanase E. J. Felton D. S. Gray A. Hultgren C. S. Chen D. H. Reich Lab Chip 2005 5 598 605
33. R. A. Chandra E. S. Douglas R. A. Mathies C. R. Bertozzi M. B. Francis Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 896 901
34. J. Nakanishi T. Takarada K. Yamaguchi M. Maeda Anal. Sci. 2008 24 67 72
35. H. Kaji K. Tsukidate T. Matsue M. Nishizawa J. Am. Chem. Soc. 2004 126 15026 15027
36. Y. Sugio K. Kojima H. Moriguchi H. Takahashi T. Kaneko K. Yasuda Sens. Actuators, B 2004 99 156 162
37. X. Jiang D. A. Bruzewicz A. P. Wong M. Piel G. M. Whitesides Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 975 978
38. M. Thery V. Racine A. Pepin M. Piel Y. Chen J. B. Sibarita M. Bornens Nat. Cell Biol. 2005 7 947 953
39. C. S. Chen M. Mrksich S. Huang G. M. Whitesides D. E. Ingber Science 1997 276 1425 1428
40. E. Ostuni R. Kane C. S. Chen D. E. Ingber G. M. Whitesides Langmuir 2000 16 7811 7819
41. R. S. Ashton J. Peltier C. A. Fasano A. O'Neill J. Leonard S. Temple D. V. Schaffer R. S. Kane Stem Cells 2007 25 2928 2935
42. J. Nilsson M. Evander B. Hammarstrom T. Laurell Anal. Chim. Acta 2009 649 141 157
43. D. Di Carlo L. Y. Wu L. P. Lee Lab Chip 2006 6 1445 1449
44. A. M. Skelley O. Kirak H. Suh R. Jaenisch J. Voldman Nat. Methods 2009 6 147 152
45. S. Lee J. Y. Kang I. Lee S. Ryu S. Kwak K. Shin C. Kim H. Jung T. Kim Sens. Actuators, A 2008 143 64 69
46. W. Liu N. Dechev I. G. Foulds R. Burke A. Parameswaran E. J. Park Lab Chip 2009 9 2381 2390
47. A. H. de Vries B. E. Krenn R. van Driel J. S. Kanger Biophys. J. 2005 88 2137 2144
48. A. Winkleman K. L. Gudiksen D. Ryan G. M. Whitesides Appl. Phys. Lett. 2004 85 2411 2413
49. A. Valero F. Merino F. Wolbers R. Luttge I. Vermes H. Andersson A. van den Berg Lab Chip 2005 5 49 55
50. A. Valero J. N. Post J. W. van Nieuwkasteele P. M. Ter Braak W. Kruijer A. van den Berg Lab Chip 2008 8 62 67
51. S. Zheng H. Lin J. Q. Liu M. Balic R. Datar R. J. Cote Y. C. Tai J. Chromatogr., A 2007 1162 154 161
52. D. G. Grier Nature 2003 424 810 816
53. K. Ramser D. Hanstorp J. Biophotonics 2010 3 187 206
54. S. C. Grover A. G. Skirtach R. C. Gauthier C. P. Grover J. Biomed. Opt. 2001 6 14 22
55. J. R. Kovac J. Voldman Anal. Chem. 2007 79 9321 9330
56. B. M. Taff J. Voldman Anal. Chem. 2005 77 7976 7983
57. X. Hu P. H. Bessette J. Qian C. D. Meinhart P. S. Daugherty H. T. Soh Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 15757 15761
58. L. P. Gor'kov Sov. Phys. Dokl. (Engl. Transl.) 1962 6 773 775
59. M. Evander L. Johansson T. Lilliehorn J. Piskur M. Lindvall S. Johansson M. Almqvist T. Laurell J. Nilsson Anal. Chem. 2007 79 2984 2991
60. J. Hultstrom O. Manneberg K. Dopf H. M. Hertz H. Brismar M. Wiklund Ultrasound Interact. Biol. Med., [Proc. Int. Symp.] 2007 33 145 151
61. O. Manneberg B. Vanherberghen J. Svennebring H. M. Hertz B. Önfelt M. Wiklund Appl. Phys. Lett. 2008 93 063901
62. J. Shi D. Ahmed X. Mao S. C. Lin A. Lawit T. J. Huang Lab Chip 2009 9 2890 2895
63. J. F. Edd D. Di Carlo K. J. Humphry S. Koster D. Irimia D. A. Weitz M. Toner Lab Chip 2008 8 1262 1264
64. M. Chabert K. D. Dorfman J. L. Viovy Electrophoresis 2005 26 3706 3715
65. D. R. Link S. L. Anna D. A. Weitz H. A. Stone Phys. Rev. Lett. 2004 92 054503
66. K. H. Ahn C. H. Kerbage P. H. Hunt R. M. Westervelt D. R. Link D. A. Weitz Appl. Phys. Lett. 2006 88 024104
67. S. Koster F. E. Angile H. Duan J. J. Agresti A. Wintner C. Schmitz A. C. Rowat C. A. Merten D. Pisignano A. D. Griffiths D. A. Weitz Lab Chip 2008 8 1110 1115
68. J. Clausell-Tormos D. Lieber J. C. Baret A. El-Harrak O. J. Miller L. Frenz J. Blouwolff K. J. Humphry S. Koster H. Duan C. Holtze D. A. Weitz A. D. Griffiths C. A. Merten Chem. Biol. 2008 15 427 437
69. M. He J. S. Edgar G. D. Jeffries R. M. Lorenz J. P. Shelby D. T. Chiu Anal. Chem. 2005 77 1539 1544
70. H. N. Joensson M. L. Samuels E. R. Brouzes M. Medkova M. Uhlen D. R. Link H. Andersson-Svahn Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 2518 2521
71. J. C. Baret O. J. Miller V. Taly M. Ryckelynck A. El-Harrak L. Frenz C. Rick M. L. Samuels J. B. Hutchison J. J. Agresti D. R. Link D. A. Weitz A. D. Griffiths Lab Chip 2009 9 1850 1858
72. E. Brouzes M. Medkova N. Savenelli D. Marran M. Twardowski J. B. Hutchison J. M. Rothberg D. R. Link N. Perrimon M. L. Samuels Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 14195 14200
73. A. R. Wheeler W. R. Throndset R. J. Whelan A. M. Leach R. N. Zare Y. H. Liao K. Farrell I. D. Manger A. Daridon Anal. Chem. 2003 75 3581 3586
74. S. Takayama E. Ostuni P. LeDuc K. Naruse D. E. Ingber G. M. Whitesides Nature 2001 411 1016
75. L. Kim M. D. Vahey H. Lee J. Voldman Lab Chip 2006 6 394 406
76. A. Khademhosseini J. Yeh G. Eng J. Karp H. Kaji J. Borenstein O. C. Farokhzad R. Langer Lab Chip 2005 5 1380 1386
77. K. R. King S. Wang D. Irimia A. Jayaraman M. Toner M. L. Yarmush Lab Chip 2007 7 77 85
78. R. Cheong C. J. Wang A. Levchenko Mol. Cell. Proteomics 2009 8 433 442
79. M. Deutsch A. Deutsch O. Shirihai I. Hurevich E. Afrimzon Y. Shafran N. Zurgil Lab Chip 2006 6 995 1000
80. A. Y. Fu H. P. Chou C. Spence F. H. Arnold S. R. Quake Anal. Chem. 2002 74 2451 2457
81. D. A. Ateya J. S. Erickson P. B. Howell, Jr L. R. Hilliard J. P. Golden F. S. Ligler Anal. Bioanal. Chem. 2008 391 1485 1498
82. K. Park J. Jang D. Irimia J. Sturgis J. Lee J. P. Robinson M. Toner R. Bashir Lab Chip 2008 8 1034 1041
83. T. G. Leong C. L. Randall B. R. Benson A. M. Zarafshar D. H. Gracias Lab Chip 2008 8 1621 1624
84. L. J. Millet M. E. Stewart J. V. Sweedler R. G. Nuzzo M. U. Gillette Lab Chip 2007 7 987 994
85. S. Rydholm T. Frisk J. M. Kowalewski H. Andersson Svahn G. Stemme H. Brismar Biomed. Microdevices 2008 10 555 560
86. R. T. Kennedy M. D. Oates B. R. Cooper B. Nickerson J. W. Jorgenson Science 1989 246 57 63
87. A. G. Ewing J. Neurosci. Methods 1993 48 215 224
88. Z. Zhang S. Krylov E. A. Arriaga R. Polakowski N. J. Dovichi Anal. Chem. 2000 72 318 322
89. H. Wu A. Wheeler R. N. Zare Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 12809 12813
90. L. Cai N. Friedman X. S. Xie Nature 2006 440 358 362
91. L. Y. Wu, D. Di Carlo and L. P. Lee, Proceedings of Micro Total Analysis Systems, 2007, vol. 1, pp. 709-711
92. C. Ionescu-Zanetti A. Blatz M. Khine Biomed. Microdevices 2008 10 113 116
93. J. C. Love J. L. Ronan G. M. Grotenbreg A. G. van der Veen H. L. Ploegh Nat. Biotechnol. 2006 24 703 707
94. A. Jin T. Ozawa K. Tajiri T. Obata S. Kondo K. Kinoshita S. Kadowaki K. Takahashi T. Sugiyama H. Kishi A. Muraguchi Nat. Med. (N. Y.) 2009 15 1088 1092
95. L. Fink G. Kwapiszewska J. Wilhelm R. M. Bohle Exp. Toxicol. Pathol. 2006 57 suppl 2 25 29
96. S. D. Ginsberg Methods 2005 37 229 237
97. J. G. Kralj A. Player H. Sedrick M. S. Munson D. Petersen S. P. Forry P. Meltzer E. Kawasaki L. E. Locascio Lab Chip 2009 9 917 924
98. N. Bontoux L. Dauphinot T. Vitalis V. Studer Y. Chen J. Rossier M. C. Potier Lab Chip 2008 8 443 450
99. M. Cordey M. Limacher S. Kobel V. Taylor M. P. Lutolf Stem Cells 2008 26 2586 2594
100. V. I. Chin P. Taupin S. Sanga J. Scheel F. H. Gage S. N. Bhatia Biotechnol. Bioeng. 2004 88 399 415
101. L. C. Taylor D. R. Walt Anal. Biochem. 2000 278 132 142
102. A. Revzin K. Sekine A. Sin R. G. Tompkins M. Toner Lab Chip 2005 5 30 37
103. J. R. Rettig A. Folch Anal. Chem. 2005 77 5628 5634
104. Y. Tokimitsu H. Kishi S. Kondo R. Honda K. Tajiri K. Motoki T. Ozawa S. Kadowaki T. Obata S. Fujiki C. Tateno H. Takaishi K. Chayama K. Yoshizato E. Tamiya T. Sugiyama A. Muraguchi Cytometry, Part A 2007 71 1003 1010
105. C. Holtze A. C. Rowat J. J. Agresti J. B. Hutchison F. E. Angile C. H. Schmitz S. Koster H. Duan K. J. Humphry R. A. Scanga J. S. Johnson D. Pisignano D. A. Weitz Lab Chip 2008 8 1632 1639