Developing oligonucleotide microarray-based resonance light scattering assay for DNA detection on the PAMAM dendrimer modified surface

Analytical Methods

Volumn 2, Issue 8, 2010, Pages 1008-1012

  Li, Xiaomei ^a   Gao, Jingqing ^a   Liu, Dianjun ^a   Wang, Zhenxin ^a  

^a CHANGCHUN INSTITUTE OF APPLIED CHEMISTRY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

3-D MICROARRAY; DETECTION SENSITIVITY; DETECTION SYSTEM; DNA DETECTION; GLUTARALDEHYDES; GOLD NANOPARTICLES; HIGH SELECTIVITY; HIGHLY EFFICIENCY; MODIFIED OLIGONUCLEOTIDES; MODIFIED SURFACES; OLIGONUCLEOTIDE MICROARRAY; OLIGONUCLEOTIDE SEQUENCES; PAMAM DENDRIMER; POLYAMIDOAMINE DENDRIMERS; RESONANCE LIGHT SCATTERING; SIGNAL ENHANCEMENT; SIGNAL-TO-BACKGROUND RATIO; SILVER DEPOSITION; SINGLE NUCLEOTIDES; THREE-DIMENSIONAL (3D);

ALDEHYDES; ASSAYS; DENDRIMERS; GALLIUM ALLOYS; GOLD COATINGS; GOLD DEPOSITS; LIGHT SCATTERING; ORGANIC POLYMERS; REFRACTION; RESONANCE; SIGNAL DETECTION; SILVER; THREE DIMENSIONAL;

OLIGONUCLEOTIDES;

EID: 77958101503     PISSN: 17599660     EISSN: 17599679     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0ay00226g     Document Type: Article

References (53)

1. R. Lucito J. Healy J. Alexander A. Reiner D. Esposito M. Y. Chi L. Rodgers A. Brady J. Sebat J. Troge J. A. West S. Rostan K. C. Q. Nguyen S. Powers K. Q. Ye A. Olshen E. Venkatraman L. Norton M. Wigler Genome Res. 2003 13 2291 2305
2. C. A. Harrington C. Rosenow J. Retief Curr. Opin. Microbiol. 2000 3 285 291
3. M. Schena D. Shalon R. W. Davis P. O. Brown Science 1995 270 467 470
4. R. P. Balog Y. E. P. de Souza H. M. Tang G. M. DeMasellis B. Gao A. Avila D. J. Gaban D. Mittelman J. D. Minna K. J. Luebke H. R. Garner Anal. Biochem. 2002 309 301 310
5. C. L. Warren N. C. Kratochvil K. E. Hauschild S. Foister M. L. Brezinski P. B. Dervan G. N. Phillips A. Z. Ansari Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 867 872
6. Y. Chen M. R. Shortreed M. Olivier L. M. Smith Anal. Chem. 2005 77 2400 2405
7. H. Matsuzaki H. Loi S. Dong Y. Y. Tsai J. Fang J. Law X. J. Di W. M. Liu G. Yang G. Y. Liu J. Huang G. C. Kennedy T. B. Ryder G. A. Marcus P. S. Walsh M. D. Shriver J. M. Puck K. W. Jones R. Mei Genome Res. 2004 14 414 425
8. A. Sassolas B. D. Leca-Bouvier L. J. Blum Chem. Rev. 2008 108 109 139
9. V. G. Cheung M. Morley F. Aguilar A. Massimi R. Kucherlapati G. Childs Nat. Genet. 1999 21 15 19
10. M. C. Pirrung Angew. Chem., Int. Ed. 2002 41 1276 1289
11. A. Camp I. J. Bruce Top. Curr. Chem. 2005 260 77 111
12. E. Fahy G. R. David L. J. DiMichele S. S. Ghosh Nucleic Acids Res. 1993 21 1819 1826
13. V. Afanassiev V. Hanemann S. Wolfl Nucleic Acids Res. 2000 28 66e
14. M. Beier J. D. Hoheisel Nucleic Acids Res. 1999 27 1970 1977
15. R. Benters C. M. Niemeyer D. Wöhrle ChemBioChem 2001 2 686 694
16. R. Benters C. M. Niemeyer D. Wöhrle Nucleic Acids Res. 2002 30 10e
17. E. Tre'visiol V. L. Berre J. Leclaire G. Pratviel A. M. Caminade J. P. Majoral J. M. FrancËois B. Meunier New J. Chem. 2003 27 1713 1719
18. V. L. Berre E. Tre visiol A. Dagkessamanskaia S. Sokol A. M. Caminade J. P. Majoral B. Meunier J. M. FrancËois Nucleic Acids Res. 2003 31 88e
19. S. S. Mark N. Sandhyarani C. Zhu C. Campagnolo C. A. Batt Langmuir 2004 20 6808 6817
20. A. W. Bosman H. M. Janssen E. W. Meijer Chem. Rev. 1999 99 1665 1688
21. B. H. Zinselmeyer S. P. Mackay A. G. Schatzlein I. F. Uchegbu Pharm. Res. 2002 19 960 967
22. C. S. Braun J. A. Vetro D. A. Tomalia G. S. Koe C. R. Middaugh J. Pharm. Sci. 2005 94 423 436
23. B. Schweitzer S. Wiltshire J. Lambert S. O'Malley K. Kukanskis Z. Zhu S. F. Kingsmore P. M. Lizardi D. C. Ward Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 10113 10119
24. T. Kodadek Chem. Biol. 2001 8 105 115
25. M. Schena, Microarray analysis, Wiley-Liss: Hoboken, NJ, 2003
26. T. A. Taton C. A. Mirkin R. L. Letsinger Science 2000 289 1757 1760
27. J. Yguerabide E. E. Yguerabide J. Cell. Biochem. 2001 84 s37 71 81
28. S. J. Oldenburg C. C. Genick K. A. Clark D. A. Schultz Anal. Biochem. 2002 309 109 116
29. M. Han X. Gao J. Z. Su S. Nie Nat. Biotechnol. 2001 19 631 635
30. A. P. Alivisatos Nat. Biotechnol. 2004 22 47 52
31. E. Katz I. Willner Angew. Chem., Int. Ed. 2004 43 6042 6108
32. C.-C. You M. De V. M. Rotello Curr. Opin. Chem. Biol. 2005 9 639 646
33. C. D. Medley J. E. Smith Z. Tang Y. Wu S. Bamrungsap W. Tan Anal. Chem. 2008 80 1067 1072
34. J. Wang F. Song F. Zhou Langmuir 2002 18 6653 6658
35. Y. Chen J. Aveyard R. Wilson Chem. Commun. 2004 2804 2805
36. J. J. Storhoff S. S. Marla P. Bao S. Hagenow H. Mehta A. Lucas V. Garimella T. Patno W. Buckingham W. Cork U. R. Müller Biosens. Bioelectron. 2004 19 875 883
37. G. J. Zhang R. Möller R. Kretschmer A. Csáki W. Fritzsche J. Fluoresc. 2004 14 369 375
38. R. Q. Liang W. Li Y. Li C.y. Tan J. X. Li Y. X. Jin K. C. Ruan Nucleic Acids Res. 2005 33 e17
39. Z. X. Wang R. Lévy D. G. Fernig M. Brust Bioconjugate Chem. 2005 16 497 500
40. Z. X. Wang J. Lee A. Cossins M. Brust IEE Proc.: Nanobiotechnol. 2005 152 85 88
41. G. A. Blab L. Cognet S. Berciaud I. Alexandre D. Husar J. Remacle B. Lounis Biophys. J. 2006 90 L13 L15
42. A. K. R. Lytton M. S. Han C. A. Mirkin Anal. Chem. 2007 79 6037 6041
43. A. Girigoswami T. Li C. Jung H. Y. Mun H. G. Park J. Nanosci. Nanotechnol. 2009 9 1019 1024
44. C. R. Hsiao C. H. Chen Anal. Biochem. 2009 389 118 123
45. H. Kim H. Takei K. Yasuda Sens. Actuators, B 2010 144 6 10
46. J. Turkevich P. C. Stevenson J. Hillier Discuss. Faraday Soc. 1951 11 55 75
47. G. Frens Nat. Phys. Sci. 1973 241 20 22
48. A. G. Kanaras Z. X. Wang A. D. Bates R. Cosstick M. Brust Angew. Chem., Int. Ed. 2003 42 191 194
49. Z. X. Wang J. Lee A. Cossins M. Brust Anal. Chem. 2005 77 5770 5774
50. J. Q. Gao D. J. Liu Z. X. Wang Anal. Chem. 2008 80 8822 8827
51. http://www.arrayit.com/Products/MicroarrayI/Scanner/scanner.html
52. P. K. Jain K. S. Lee I. H. El-Sayed M. A. El-Sayed J. Phys. Chem. B 2006 110 7238 7248
53. S. Ikuta K. Takagi R. Bruce Wallace K. Itakura Nucleic Acids Res. 1987 15 797 811