Mass-spectrometric and computational study of tryptophan radicals (Trp + H) produced by collisional electron transfer to protonated tryptophan in the gas phase

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 12, Issue 41, 2010, Pages 13434-13447

  Gregersen, Joshua A ^a   Tureek, Frantiek ^a  

^a UNIVERSITY OF WASHINGTON   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FREE RADICAL; HYDROGEN; PROTON; TRYPTOPHAN;

ARTICLE; CHEMISTRY; ELECTRON TRANSPORT; GAS; ISOMERISM; KINETICS; MASS SPECTROMETRY; THERMODYNAMICS;

ELECTRON TRANSPORT; FREE RADICALS; GASES; HYDROGEN; ISOMERISM; KINETICS; MASS SPECTROMETRY; PROTONS; THERMODYNAMICS; TRYPTOPHAN;

EID: 77958091737     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0cp00597e     Document Type: Article

References (106)

1. I. Weinryb and R. F. Steiner, in Excited States of Proteins and Nucleic Acids, ed., R. F. Steiner, and, I. Weinryb, Plenum Press, New York, 1971, ch. 5
2. D. M. Rogers N. A. Besley P. O'Shea J. D. Hirst J. Phys. Chem. B 2005 109 23061 23069
3. C. Clavaguera F. Piuzzi J.-P. Dognon J. Phys. Chem. B 2009 113 16443 16448
4. M. E. Akopyan Yy. V. Loginov High Energy Chem. 1967 1 83
5. J. W. Hager S. C. Wallace Anal. Chem. 1988 60 5 10
6. K. R. Wilson M. Jimenez-Cruz C. Nicolas L. Belau S. R. Leone M. Ahmed J. Phys. Chem. A 2006 110 2106 2113
7. M. J. Betts and R. B. Russell, Amino acid properties and consequences of substitutions, in Bioinformatics for Geneticists, ed., M. R. Barnes, and, I. C. Gray, Wiley, 2003
8. A. G. Szabo D. M. Rayner J. Am. Chem. Soc. 1980 102 554 563
9. J. W. Petrich M. C. Chang D. B. McDonald G. R. Fleming J. Am. Chem. Soc. 1983 105 3824 3832
10. J. R. Lakowicz Photochem. Photobiol. 2000 72 421 437
11. A. Ozarowski A. H. Maki J. Phys. Chem. B 2000 104 1122 1127
12. A. L. Sobolewski D. Shemesh W. Domcke J. Phys. Chem. A 2009 113 542 550
13. T. R. Rizzo Y. D. Park L. A. Peteanu D. H. Levy J. Chem. Phys. 1986 84 2534 2541
14. J. R. Cable M. J. Tubergen D. H. Levy J. Am. Chem. Soc. 1988 110 7349 7355
15. S. R. Mercier O. V. Boyarkin A. Kamariotis M. Guglielmi I. Tavernelli M. Cascella U. Rothlisberger T. R. Rizzo J. Am. Chem. Soc. 2006 128 16938 16943
16. M. P. Pileni M. Bazin R. Santus Chem. Phys. Lett. 1977 51 61 64
17. K. L. Stevenson G. A. Papadantonakis P. R. LeBreton J. Photochem. Photobiol., A 2000 133 159 167
18. P. S. Sherin O. A. Snytnikova Y. P. Tsentalovich Chem. Phys. Lett. 2004 391 44 49
19. D. Shemesh R. B. Gerber J. Phys. Chem. A 2006 110 8401 8408
20. P. S. Sherin O. A. Snytnikova Yu. P. Tsentalovich R. Z. Sagdeev J. Chem. Phys. 2006 125 144511
21. G. W. A. Milne T. Axenrod H. M. Fales J. Am. Chem. Soc. 1970 92 5170 5175
22. C. W. Tsang A. G. Harrison J. Am. Chem. Soc. 1976 98 1301 1308
23. F. Rogalewicz Y. Hoppilliard G. Ohanessian Int. J. Mass Spectrom. 2000 195-196 565 590
24. H. Lioe R. A. J. O'Hair G. E. Reid J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2004 15 65 76
25. H. Lioe R. A. J. O'Hair G. E. Reid Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004 18 978 988
26. H. El Aribi G. Orlova A. C. Hopkinson K. W. M. Siu J. Phys. Chem. A 2004 108 3844 3853
27. H. Kang C. Dedonder-Lardeux C. Jouvet S. Martrenchard G. Grégoire C. Desfranois J. P. Schermann M. Barat J. A. Fayeton Phys. Chem. Chem. Phys. 2004 6 2628 2632
28. H. Kang C. Dedonder-Lardeux C. Jouvet G. Grégoire C. Desfranois J.-P. Schermann M. Barat J. Fayeton J. Phys. Chem. A 2005 109 2417 2420
29. G. Grégoire C. Jouvet C. Dedonder A. L. Sobolewski Chem. Phys. 2006 324 398 404
30. V. Lepère B. Lucas M. Barat J. A. Fayeton Y. J. Picard C. Jouvet P. arabal I. Nielsen C. Dedonder-Lardeux G. Grégoire A. Fujii Phys. Chem. Chem. Phys. 2007 9 5330 5334
31. V. Lepère B. Lucas M. Barat J. A. Fayeton Y. J. Picard C. Jouvet P. arabal I. Nielsen C. Dedonder-Lardeux G. Grégoire A. Fujii J. Chem. Phys. 2007 127 134313
32. U. Kadhane J. U. Andersen A. Ehlerding P. Hvelplund M. S. Kirketerp M. K. Lykkegaard S. B. Nielsen S. Panja J. A. Wyer H. Zettergren J. Chem. Phys. 2008 129 184304
33. Z. B. Maksic B. Kovacevic Chem. Phys. Lett. 1999 307 497 504
34. T. C. Dinadayalane G. N. Sastry J. Leszczynski Int. J. Quantum Chem. 2006 106 2920 2933
35. C. Bleiholder S. Suhai B. Paizs J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2006 17 1275 1281
36. J. Moan O. Kaalhus J. Chem. Phys. 1974 61 3556 3566
37. S. V. Jovanovic S. Steenken M. G. Simic J. Phys. Chem. 1991 95 684 687
38. C. Essenmacher S. T. Kim M. Atamian G. T. Babcock A. Sancar J. Am. Chem. Soc. 1993 115 1602 1603
39. G. M. Jensen D. B. Goodin S. W. Bunte J. Phys. Chem. 1996 100 954 959
40. S. E. Walden R. A. Wheeler J. Phys. Chem. 1996 100 1530 1535
41. R. Weinkauf J. Schiedt Photochem. Photobiol. 1997 66 569 575
42. J. E. Miller C. Gradinaru B. R. Crane A. J. Di Bilio W. A. Wehbi S. Un J. R. Winkler H. B. Gray J. Am. Chem. Soc. 2003 125 14220 14221
43. L. Joly R. Antoine A.-R. Allouche P. Dugourd J. Am. Chem. Soc. 2008 130 13832 13833
44. D. C. M. Ng T. Song S. O. Siu C. K. Siu J. Laskin I. K. Chu J. Phys. Chem. B 2010 114 2270 2280
45. R. A. Zubarev N. L. Kelleher F. W. McLafferty J. Am. Chem. Soc. 1998 120 3256 3266
46. J. E P. Syka J. J. Coon M. J. Schroeder J. Shabanowitz D. F. Hunt Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 9528 9533
47. R. A. Zubarev N. A. Kruger E. K. Fridriksson M. A. Lewis D. M. Horn B. K. Carpenter F. W. McLafferty J. Am. Chem. Soc. 1999 121 2857 2862
48. H. J. Cooper R. R. Hudgins K. Hakansson A. G. Marshall J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2002 13 241 249
49. Y. M. E. Fung T.-W. D. Chan J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005 16 1523 1535
50. H. Han Y. Xia S. A. McLuckey J. Proteome Res. 2007 6 3062 3069
51. B. W. Williams R. F. Porter J. Chem. Phys. 1980 73 5598 5604
52. P. O. Danis C. Wesdemiotis F. W. McLafferty J. Am. Chem. Soc. 1983 105 7454 7455
53. P. J. Burgers J. L. Holmes A. A. Mommers J. K. Terlouw Chem. Phys. Lett. 1983 102 1 3
54. C. A. Schalley G. Hornung D. Schröder H. Schwarz Chem. Soc. Rev. 1998 27 91 104
55. D. V. Zagorevskii J. L. Holmes Mass Spectrom. Rev. 1999 18 87 118
56. F. Tureek Top. Curr. Chem. 2003 225 77 129
57. G. C. Shields F. T. Moran J. Phys. Chem. 1985 89 4027 4031
58. G. C. Shields P. A. Steiner, IV P. R. Nelson M. C. Trauner T. F. Moran Org. Mass Spectrom. 1987 22 64 69
59. I. Saito H. Sugiyama A. Yamamoto S. Muramatsu T. Matsuura J. Am. Chem. Soc. 1984 106 4286 4287
60. F. Tureek M. Gu S. A. Shaffer J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1992 3 493 501
61. J. L. Seymour E. A. Syrstad C. C. Langley F. Tureek Int. J. Mass Spectrom. 2003 228 687 702
62. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery Jr, T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austn, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez and J. A. Pople, GAUSSIAN 03 (Revision B.05), Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 2003
63. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 1372 1377
64. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 5648 5652
65. P. J. Stephens F. J. Devlin C. F. Chabalowski M. J. Frisch J. Phys. Chem. 1994 98 11623 11627
66. G. Rahut P. Pulay J. Phys. Chem. 1995 99 3093 3100
67. C. Møller M. S. Plesset Phys. Rev. 1934 46 618 622
68. H. B. Schlegel J. Chem. Phys. 1986 84 4530 4534
69. I. Mayer Adv. Quantum Chem. 1980 12 189 262
70. R. McWeeny G. Diercksen J. Chem. Phys. 1968 49 4852 4856
71. C. J. Parkinson P. M. Mayer L. Radom J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1999 2305 2313
72. F. Tureek J. Phys. Chem. A 1998 102 4703 4713
73. F. Tureek J. K. Wolken J. Phys. Chem. A 1999 103 1905 1912
74. F. Tureek M. Poláek A. J. Frank M. Sadílek J. Am. Chem. Soc. 2000 122 2361 2370
75. M. Poláek F. Tureek J. Am. Chem. Soc. 2000 122 9511 9524
76. P. R. Rablen J. Am. Chem. Soc. 2000 122 357 368
77. P. R. Rablen J. Org. Chem. 2000 65 7930 7937
78. P. R. Rablen K. H. Bentrup J. Am. Chem. Soc. 2003 125 2142 2147
79. M. Hirama T. Tokosumi T. Ishida J. Aihara Chem. Phys. 2004 305 307 316
80. J. íek J. Paldus L. roubková Int. J. Quantum Chem. 1969 3 149 167
81. G. D. Purvis, III.R. J. Bartlett J. Chem. Phys. 1982 76 1910 1918
82. L. A. Curtiss K. Raghavachari J. A. Pople J. Chem. Phys. 1993 98 1293 1298
83. R. E. Stratmann G. E. Scuseria M. J. Frisch J. Chem. Phys. 1998 109 8218 8224
84. R. G. Gilbert and S. C. Smith, Theory of Unimolecular and Recombination Reactions, Blackwell Scientific Publications, Oxford, 1990, pp. 52-132
85. L. Zhu and W. L. Hase, Quantum Chemistry Program Exchange, Indiana University, Bloomington, 1994; Program No. QCPE 644
86. R. G. Cooks, J. H. Beynon, R. M. Caprioli and G. R. Lester, Metastable Ions, Elsevier, Amsterdam, 1973, p. 93
87. G. S. Gorman J. P. Speir C. A. Turner I. J. Amster J. Am. Chem. Soc. 1992 114 3986 3988
88. G. Bojesen T. Breindahl J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1994 1029 1037
89. A. G. Harrison Mass Spectrom. Rev. 1997 16 201 217
90. S. P. Mirza S. Prabhakar M. Vairamani Rapid Commun. Mass Spectrom. 2001 15 957 962
91. B. W. Williams R. F. Porter J. Chem. Phys. 1980 73 5598
92. S. A. Shaffer F. Tureek J. Am. Chem. Soc. 1994 116 8647 8653
93. V. Q. Nguyen M. Sadílek A. J. Frank J. G. Ferrier F. Tureek J. Phys. Chem. A 1997 101 3789 3799
94. C. Yao F. Tureek Phys. Chem. Chem. Phys. 2005 7 912 920
95. F. Tureek Int. J. Mass Spectrom. 2003 227 327 338
96. B. J. Lynch P. L. Fast M. Harris D. G. Truhlar J. Phys. Chem. A 2000 104 4811 4815
97. A. K. Chandra M. T. Nguyen Faraday Discuss. 2007 135 191 201
98. P. M. Mayer C. Poon Mass Spectrom. Rev. 2009 28 608 639
99. E. E. Rennie P. M. Mayer J. Chem. Phys. 2004 120 10561 10578
100. J. K. Wolken F. Tureek J. Am. Chem. Soc. 1999 121 6010 6018
101. J. K. Wolken F. Tureek J. Phys. Chem. A 1999 103 6268 6281
102. E. A. Syrstad S. Vivekananda F. Tureek J. Phys. Chem. A 2001 105 8339 8351
103. J. K. Wolken F. Tureek J. Phys. Chem. A 2001 105 8352 8360
104. F. Tureek Top. Curr. Chem. 2003 225 77 129
105. F. Tureek J. Am. Chem. Soc. 2003 125 5954 5963
106. T. W. Chung F. Tureek Int. J. Mass Spectrom. 2010 10.1016/j.ijms.2010.06. 025