Uracil anion radical in aqueous solution: Thermodynamics versus spectroscopy

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 12, Issue 36, 2010, Pages 10736-10739

  Brancato, Giuseppe ^a   Rega, Nadia ^b   Barone, Vincenzo ^c,d  

^a CENTER FOR NANOTECHNOLOGY INNOVATION NEST   (Italy)

^b UNIVERSITY OF NAPLES FEDERICO II   (Italy)

^c SCUOLA NORMALE SUPERIORE   (Italy)

^d INFN SEZIONE DI PISA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FREE RADICAL; URACIL; WATER;

ARTICLE; CHEMISTRY; CONFORMATION; ELECTRON SPIN RESONANCE; MOLECULAR DYNAMICS; QUANTUM THEORY; SOLUTION AND SOLUBILITY; SPECTROSCOPY; THERMODYNAMICS;

ELECTRON SPIN RESONANCE SPECTROSCOPY; FREE RADICALS; MOLECULAR CONFORMATION; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; QUANTUM THEORY; SOLUTIONS; SPECTRUM ANALYSIS; THERMODYNAMICS; URACIL; WATER;

EID: 77956319557     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c003005h     Document Type: Article

References (32)

1. Effects of ionizing radiation on DNA: physical, chemical and biological aspects, ed. J. Hüttermann, W. Köhnlein, R. Teoule, A. J. Bertinchamps and G. Ahnström, Springer-Verlag, Berlin, 1978
2. C. von Sonntag, The Chemical Basis of Radiation Biology, Taylor & Francis, London, 1987
3. M. A. O’Neill, and J. K. Barton, in Charge Transfer in DNA: From Mechanism to Application, ed. H. A. Wagenknecht, Wiley-VCH, New York, 2005, p. 27
4. Long-range charge transfer in DNA, ed. G. B. Schuster, Springer Verlag, New York, 2004
5. M. Haranczyk, J. Rak, M. Gutowski J. Phys. Chem. A, 2005, 109, 11495-11503
6. R. A. Bachorz, J. Rak, M. Gutowski Phys. Chem. Chem. Phys., 2005, 7, 2116-2125
7. M. Haranczyk, M. Gutowski, X. Li, K. H. Bowen Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2007, 104, 4804-4807
8. J. H. Hendricks, S. A. Lyapustina, H. L. deClercq, J. T. Snodgrass, K. H. Bowen J. Chem. Phys., 1996, 104, 7788-7791
9. R. A. Bachorz, W. Klopper, M. Gutowski, X. Li, K. H. Bowen J. Chem. Phys., 2008, 129, 054309.
10. C. Desfrancois, H. AbdoulCarime, J. P. Schermann J. Chem. Phys., 1996, 104, 7792-7794
11. C. Desfrancois, V. Periquet, Y. Bouteiller, J. P. Schermann J. Phys. Chem. A, 1998, 102, 1274-1278
12. J. Schiedt, R. Weinkauf, D. M. Neumark, E. W. Schlag Chem. Phys., 1998, 239, 511-524
13. Free energy calculations, ed. C. Chipot and A. Pohorille, Springer, Berlin, 2007
14. G. Brancato, N. Rega, V. Barone J. Am. Chem. Soc., 2007, 129, 15380-15390
15. S. Kacprzak, R. Reviakine, M. Kaupp J. Phys. Chem. B, 2007, 111, 811-819
16. S. Kacprzak, R. Reviakine, M. Kaupp J. Phys. Chem. B, 2007, 111, 820-831
17. J. M. Lu, J. Geimer, S. Naumov, D. Beckert Phys. Chem. Chem. Phys., 2001, 3, 952-956
18. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. G. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, and J. A. Pople, GAUSSIAN 03 (Revision C.02), Gaussian, Inc., Wallingford, CT, 2004
19. A. D. Becke J. Chem. Phys., 1993, 98, 5648-5652
20. P. J. Stephens, F. J. Devlin, C. F. Chabalowski, M. J. Frisch J. Phys. Chem., 1994, 98, 11623-11627
21. V. Barone, M. Cossi J. Phys. Chem. A, 1998, 102, 1995-2001
22. M. Cossi, N. Rega, G. Scalmani, V. Barone J. Comput. Chem., 2003, 24, 669-681
23. M. Haranczyk, M. Gutowski, A. Warshel Phys. Chem. Chem. Phys., 2008, 10, 4442-4448
24. N. Rega, M. Cossi, V. Barone J. Chem. Phys., 1996, 105, 11060-11067
25. N. Rega, G. Brancato, V. Barone Chem. Phys. Lett., 2006, 422, 367-371
26. G. Brancato, N. Rega, V. Barone J. Chem. Phys., 2008, 128, 144501.
27. S. S. Iyengar, H. B. Schlegel, J. M. Millam, G. A. Voth, G. E. Scuseria, M. J. Frisch J. Chem. Phys., 2001, 115, 10291-10302
28. H. B. Schlegel, S. S. Iyengar, X. S. Li, J. M. Millam, G. A. Voth, G. E. Scuseria, M. J. Frisch J. Chem. Phys., 2002, 117, 8694-8704
29. H. B. Schlegel, J. M. Millam, S. S. Iyengar, G. A. Voth, A. D. Daniels, G. E. Scuseria, M. J. Frisch J. Chem. Phys., 2001, 114, 9758-9763
30. N. Rega, S. S. Iyengar, G. A. Voth, H. B. Schlegel, T. Vreven, M. J. Frisch J. Phys. Chem. B, 2004, 108, 4210-4220
31. G. Brancato, A. Di Nola, V. Barone, A. Amadei J. Chem. Phys., 2005, 122, 154109.
32. G. Brancato, N. Rega, V. Barone J. Chem. Phys., 2006, 124, 214505.