A solid-state 17O NMR study of l -tyrosine in different ionization states: Implications for probing tyrosine side chains in proteins

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 35, 2010, Pages 11681-11688

  Zhu, Jianfeng ^a   Lau, Justin Y C ^a   Wu, Gang ^a  

^a QUEEN S UNIVERSITY   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; CHEMICAL BONDS; CHEMICAL COMPOUNDS; CHEMICAL SHIFT; IONIZATION; MOLECULAR ORIENTATION; OXYGEN; PARTICLE DETECTORS; PHENOLS; PHOSPHATASES; PROTEINS; SODIUM;

CHEMICAL BONDINGS; CROSS-OVER; EXPERIMENTAL CHARACTERIZATION; IONIZATION STATE; L-TYROSINE; MOLECULAR FRAME; NMR STUDIES; NMR TENSORS; PHENOL GROUPS; PHENOLIC OXYGEN; QUADRUPOLE COUPLING; SIDE CHAINS; TENSOR COMPONENTS; TENSOR ORIENTATION;

TENSORS;

EID: 77956317815     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp1055123     Document Type: Article

References (85)

1. Lematre, V.; Smith, M. E.; Watts, A. Solid State Nucl. Magn. Reson. 2004, 26, 215-235
2. Wu, G. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2008, 52, 118-169
3. Dong, S.; Yamada, K.; Wu, G. Z. Naturforsch., A 2000, 55, 21-28
4. Zhang, Q.; Chekmenev, E. Y.; Wittebort, R. J. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9140-9146
5. Wu, G.; Yamada, K. Solid State Nucl. Magn. Reson. 2003, 24, 196-208
6. Wong, A.; Pike, K. J.; Jenkins, R.; Clarkson, G. J.; Anupld, T.; Howes, A. P.; Crout, D. H. G.; Samoson, A.; Dupree, R.; Smith, M. E. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 1824-1835
7. Wu, G.; Dong, S. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 9119-9125
8. Lematre, V.; Pike, K. J.; Watts, A.; Anupld, T.; Samoson, A.; Smith, M. E.; Dupree, R. Chem. Phys. Lett. 2003, 371, 91-97
9. Pike, K. J.; Lematre, V.; Kukol, A.; Anupld, T.; Samoson, A.; Howes, A. P.; Watts, A.; Smith, M. E.; Dupree, R. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 9256-9263
10. Howes, A. P.; Anupld, T.; Lematre, V.; Kukol, A.; Watts, A.; Samoson, A.; Smith, M. E.; Dupree, R. Chem. Phys. Lett. 2006, 421, 42-46
11. Wong, A.; Howes, A. P.; Pike, K. J.; Lematre, V.; Watts, A.; Anupld, T.; Past, J.; Samoson, A.; Dupree, R.; Smith, M. E. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 7744-7745
12. Yamada, K.; Shimizu, T.; Tansho, M.; Nemoto, T.; Asanuma, M.; Yoshida, M.; Yamazaki, T.; Hirota, H. Magn. Reson. Chem. 2007, 45, 547-556
13. Yamada, K.; Shimizu, T.; Ohki, S.; Yamazaki, T. Magn. Reson. Chem. 2008, 46, 226-234
14. Yamauchi, K.; Kuroki, S.; Ando, I.; Ozaki, T.; Shoji, A. Chem. Phys. Lett. 1999, 302, 331-336
15. Lematre, V.; De Planque, M. R. R.; Howes, A. P.; Smith, M. E.; Dupree, R.; Watts, A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 15320-15321
16. Hu, J.; Chekmenev, E. Y.; Gan, Z.; Gorkov, P. L.; Saha, S.; Brey, W. W.; Cross, T. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 11922-11923
17. Waddell, K. W.; Chekmenev, E. Y.; Wittebort, R. J. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 22935-22941
18. Chekmenev, E. Y.; Waddell, K. W.; Hu, J.; Gan, Z.; Wittebort, R. J.; Cross, T. A. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 9849-9855
19. Gullion, T.; Yamauchi, K.; Okonogi, M.; Asakura, T. Macromolecules 2007, 40, 1363-1365
20. Wu, G.; Dong, S.; Ida, R. Chem. Commun. 2001, 891-892
21. Wu, G.; Dong, S.; Ida, R.; Reen, N. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 1768-1777
22. Hung, I.; Uldry, A.-C.; Becker-Baldus, J.; Webber, A. L.; Wong, A.; Smith Mark, E.; Joyce, S. A.; Yates, J. R.; Pickard, C. J.; Dupree, R.; Brown, S. P. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1820-1834
23. Kwan, I. C. M.; Mo, X.; Wu, G. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 2398-2407
24. Wu, G.; Yamada, K.; Dong, S.; Grondey, H. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 4215-4216
25. Yamada, K.; Dong, S.; Wu, G. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 11602-11609
26. Dong, S.; Ida, R.; Wu, G. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 11194-11202
27. Scheubel, W.; Zimmermann, H.; Haeberlen, U. J. Magn. Reson. 1985, 63, 544-555
28. Wu, G.; Mason, P.; Mo, X.; Terskikh, V. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 1024-1032
29. Zhu, J.; Geris, A. J.; Wu, G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, 11, 6972-6980
30. Sefzik, T. H.; Houseknecht, J. B.; Clark, T. M.; Prasad, S.; Lowary, T. L.; Gan, Z.; Grandinetti, P. J. Chem. Phys. Lett. 2007, 434, 312-315
31. Wu, G.; Zhu, J.; Mo, X.; Wang, R. Y.; Terskikh, V. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 5143-5155
32. Zhu, J.; Ye, E.; Terskikh, V.; Wu, G. Angew. Chem., Int. Ed. [Online early access]. DOI: 10.1002/anie.201002041. Published Online: Jul 29, 2010.
33. Dollinger, G.; Eisenstein, L.; Lin, S.-L.; Nakanishi, K.; Termini, J. Biochemistry 1986, 25, 6524-6533
34. Roepe, P. D.; Ahl, P. L.; Herzfeld, J.; Lugtenburg, J.; Rothschild, K. J. J. Biol. Chem. 1988, 263, 5110-5117
35. Harada, I.; Yamagishi, T.; Uchida, K.; Takeuchi, H. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 2443-2445
36. Atkins, W. M.; Wang, R. W.; Bird, A. W.; Newton, D. J.; Lu, A. Y. H. J. Biol. Chem. 1993, 268, 19188-19191
37. Sackett, D. L.; Ruvinov, S. B.; Thompson, J. Protein Sci. 1999, 8, 2121-2129
38. Sonar, S.; Lee, C.-P.; Coleman, M.; Patel, N.; Liu, X.; Marti, T.; Gobind Khorana, H.; RajBhandary, U. L.; Rothschild, K. J. Nat. Struct. Biol. 1994, 1, 512-517
39. Tremmel, S.; Beyermann, M.; Oschkinat, H.; Bienert, M.; Naumann, D.; Fabian, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 4631-4635
40. Harada, I.; Yamagishi, T.; Uchida, K.; Takeuchi, H. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 2443-2445
41. Wilbur, D. J.; Allerhand, A. J. Biol. Chem. 1976, 251, 5187-5194
42. Howarth, O. W.; Lilley, D. M. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 1978, 12, 1-40
43. Kato-Toma, Y.; Iwashita, T.; Masuda, K.; Oyama, Y.; Ishiguro, M. Biochem. J. 2003, 371, 175-181
44. Norton, R. S.; Bradbury, J. H. J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1974, 870-871
45. Herzfeld, J.; Das Gupta, S. K.; Farrar, M. R.; Harbison, G. S.; McDermott, A. E.; Pelletier, S. L.; Raleigh, D. P.; Smith, S. O.; Winkel, C.; Lugtenburg, J.; Griffin, R. G. Biochemistry 1990, 29, 5567-5574
46. De Groot, H. J. M.; Raap, J.; Winkel, C.; Hoff, A. J.; Lugtenburg, J. Chem. Phys. Lett. 1990, 169, 307-310
47. Eckert, H.; Fiat, D. Int. J. Pept. Protein Res. 1986, 27, 613-616
48. Gerothanassis, I. P.; Birlirakis, N.; Sakarellos, C.; Marraud, M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 9043-9047
49. Boykin, D. W.; Baumstark, A. L.; Beeson, M. J. Org. Chem. 1991, 56, 1969-1971
50. Brinkmann, A.; Kentgens, A. P. M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 16089-16101
51. Gervais, C.; Dupree, R.; Pike, K. J.; Bonhomme, C.; Profeta, M.; Pickard, C. J.; Mauri, F. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 6960-6969
52. Gullion, T. J. Magn. Reson., Ser. A 1995, 117, 326-329
53. Goldbourt, A.; Vega, S.; Gullion, T.; Vega Alexander, J. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 11194-11195
54. Brinkmann, A.; Kentgens, A. P. M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 14758-14759
55. Ye, C.; Fu, R.; Hu, J.; Ding, S. Magn. Reson. Chem. 1993, 31, 699-704
56. Ohgo, K.; Niemczura, W. P.; Kumashiro, K. K. Macromolecules 2009, 42, 7024-7030
57. Eichele, K.; Wasylishen, R. E. WSOLIDS1: Solid-State NMR Simulations, version 1.19.11 ed.; Dalhousie University: Halifax, Canada, 2009.
58. Massiot, D.; Fayon, F.; Capron, M.; King, I.; Le Calve, S.; Alonso, B.; Durand, J.-O.; Bujoli, B.; Gan, Z.; Hoatson, G. Magn. Reson. Chem. 2002, 40, 70-76
59. Segall, M. D.; Lindan, P. J. D.; Probert, M. J.; Pickard, C. J.; Hasnip, P. J.; Clark, S. J.; Payne, M. C. J. Phys.: Condens. Matter 2002, 14, 2717-2744
60. Profeta, M.; Mauri, F.; Pickard, C. J. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 541-548
61. Frey, M. N.; Koetzle, T. F.; Koetzle, F.; Lehmann, M. S.; Hamilton, W. C. J. Chem. Phys. 1973, 58, 2547-2556
62. Te Velde, G.; Bickelhaupt, F. M.; Baerends, E. J.; Fonseca Guerra, C.; Van Gisbergen, S. J. A.; Snijders, J. G.; Ziegler, T. J. Comput. Chem. 2001, 22, 931-967
63. Vosko, S. H.; Wilk, L.; Nusair, M. Can. J. Phys. 1980, 58, 1200-1211
64. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865-3868
65. Schreckenbach, G.; Ziegler, T. Int. J. Quantum Chem. 1997, 61, 899-918
66. van Lenthe, E.; Baerends, E. J.; Snijders, J. G. J. Chem. Phys. 1993, 99, 4597-4610
67. van Lenthe, E.; Baerends, E. J.; Snijders, J. G. J. Chem. Phys. 1994, 101, 9783-9792
68. van Lenthe, E.; Snijders, J. G.; Baerends, E. J. J. Chem. Phys. 1996, 105, 6505-6516
69. Van Lenthe, E.; Van Leeuwen, R.; Baerends, E. J.; Snijders, J. G. Int. J. Quantum Chem. 1996, 57, 281-293
70. Pyykko, P. Mol. Phys. 2001, 99, 1617-1629
71. Wasylishen, R. E.; Bryce, D. L. J. Chem. Phys. 2002, 117, 10061-10066
72. Shannon, R. D. Acta Crystallogr., Sect. A 1976, A32, 751-767
73. Morgan, K. R.; Newman, R. H. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 4-7
74. Frydman, L.; Chingas, G. C.; Lee, Y. K.; Grandinetti, P. J.; Eastman, M. A.; Barrall, G. A.; Pines, A. Isr. J. Chem. 1992, 32, 161-164
75. de Dios, A. C.; Laws, D. D.; Oldfield, E. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 7784-7786
76. Chen, X.; Zhan, C.-G. J. Mol. Struct. 2004, 682, 73-82
77. Portalone, G.; Schultz, G.; Domenicano, A.; Hargittai, I. Chem. Phys. Lett. 1992, 197, 482-488
78. Larsen, N. W. J. Mol. Struct. 1979, 51, 175-190
79. Ramsey, N. F. Phys. Rev. 1950, 78, 699-703
80. Jameson, C. J.; Gutowsky, H. S. J. Chem. Phys. 1964, 40, 1714-1724
81. Flygare, W. H.; Lowe, J. T. J. Chem. Phys. 1965, 43, 3645-3653
82. Flygare, W. H.; Weise, V. W. J. Chem. Phys. 1966, 45, 2785-2792
83. Zilm, K. W.; Grant, D. M. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 2913-2922
84. Wu, G.; Lumsden, M. D.; Ossenkamp, G. C.; Eichele, K.; Wasylishen, R. E. J. Phys. Chem. 1995, 99, 15806-15813
85. Kirby, C. W.; Lumsden, M. D.; Wasylishen, R. E. Can. J. Chem. 1995, 73, 604-613