-
1
-
-
67349189383
-
-
Anfinsen, C. B.; Haber, E.; Sela, M.; White, F. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1961, 47, 1309-1314.
-
(1961)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. a
, vol.47
, pp. 1309-1314
-
-
Anfinsen, C.B.1
Haber, E.2
Sela, M.3
White, F.H.4
-
3
-
-
0037073934
-
-
Garcia-Mira, M. M.; Sadqi, M.; Fisher, N.; Sanchez-Ruiz, J. M.; Munoz, V. Science 2002, 298, 2191-2195.
-
(2002)
Science
, vol.298
, pp. 2191-2195
-
-
Garcia-Mira, M.M.1
Sadqi, M.2
Fisher, N.3
Sanchez-Ruiz, J.M.4
Munoz, V.5
-
4
-
-
0001071357
-
-
Nguyen, H.; Jäger, M.; Moretto, A.; Gruebele, M.; Kelly, J. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003, 100, 3948-3953.
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. a
, vol.100
, pp. 3948-3953
-
-
Nguyen, H.1
Jäger, M.2
Moretto, A.3
Gruebele, M.4
Kelly, J.W.5
-
6
-
-
58549088131
-
-
Li, P.; Oliva, F. Y.; Naganathan, A.; Munoz, V. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009, 106, 103-108.
-
(2009)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. a
, vol.106
, pp. 103-108
-
-
Li, P.1
Oliva, F.Y.2
Naganathan, A.3
Munoz, V.4
-
7
-
-
67651087326
-
-
Jha, S. K.; Dhar, D.; Krishnamoorthy, G.; Udgaonkar, J. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009, 106, 11113-11118.
-
(2009)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. a
, vol.106
, pp. 11113-11118
-
-
Jha, S.K.1
Dhar, D.2
Krishnamoorthy, G.3
Udgaonkar, J.B.4
-
10
-
-
0026801084
-
-
Gouda, H.; Torigoe, H.; Saito, A.; Sato, M.; Arata, Y.; Shimada, I. Biochemistry 1992, 31, 9665-9672.
-
(1992)
Biochemistry
, vol.31
, pp. 9665-9672
-
-
Gouda, H.1
Torigoe, H.2
Saito, A.3
Sato, M.4
Arata, Y.5
Shimada, I.6
-
11
-
-
14044266389
-
-
Liwo, A.; Khalili, M.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 2362-2367.
-
(2005)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. a
, vol.102
, pp. 2362-2367
-
-
Liwo, A.1
Khalili, M.2
Scheraga, H.A.3
-
12
-
-
33847123661
-
-
Liwo, A.; Khalili, M.; Czaplewski, C.; Kalinowski, S.; Ołdziej, S.; Wachucik, K.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 260-285.
-
(2007)
J. Phys. Chem. B
, vol.111
, pp. 260-285
-
-
Liwo, A.1
Khalili, M.2
Czaplewski, C.3
Kalinowski, S.4
Ołdziej, S.5
Wachucik, K.6
Scheraga, H.A.7
-
13
-
-
0030755502
-
-
Bai, Y. W.; Karimi, A.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Protein Sci. 1997, 6, 1449-1457.
-
(1997)
Protein Sci.
, vol.6
, pp. 1449-1457
-
-
Bai, Y.W.1
Karimi, A.2
Dyson, H.J.3
Wright, P.E.4
-
15
-
-
2342449128
-
-
Sato, S.; Religa, T. L.; Daggett, V.; Fersht, A. R. Proc. Natl Acad. Sci. U. S. A. 2004, 101, 6952-6956.
-
(2004)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. a
, vol.101
, pp. 6952-6956
-
-
Sato, S.1
Religa, T.L.2
Daggett, V.3
Fersht, A.R.4
-
16
-
-
33846073474
-
-
Huang, F.; Sato, S.; Shape, T. D.; Ying, L.; Fersht, A. R. Proc. Natl Acad. Sci. U. S. A. 2007, 104, 123-127.
-
(2007)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. a
, vol.104
, pp. 123-127
-
-
Huang, F.1
Sato, S.2
Shape, T.D.3
Ying, L.4
Fersht, A.R.5
-
17
-
-
65249086776
-
-
Huang, F.; Lerner, E.; Sato, S.; Amir, D.; Haas, E.; Fersht, A. R. Biochemistry 2009, 48, 3468-3476.
-
(2009)
Biochemistry
, vol.48
, pp. 3468-3476
-
-
Huang, F.1
Lerner, E.2
Sato, S.3
Amir, D.4
Haas, E.5
Fersht, A.R.6
-
20
-
-
0344304436
-
-
Vila, J. A.; Ripoll, D. R.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003, 100, 14812-14816.
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. a
, vol.100
, pp. 14812-14816
-
-
Vila, J.A.1
Ripoll, D.R.2
Scheraga, H.A.3
-
21
-
-
28944442465
-
-
Khalili, M.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. J. Mol. Biol. 2006, 355, 536-547.
-
(2006)
J. Mol. Biol.
, vol.355
, pp. 536-547
-
-
Khalili, M.1
Liwo, A.2
Scheraga, H.A.3
-
22
-
-
67249126712
-
-
Maisuradze, G. G.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. Phys. Rev. Lett. 2009, 102, 238102.
-
(2009)
Phys. Rev. Lett.
, vol.102
, pp. 238102
-
-
Maisuradze, G.G.1
Liwo, A.2
Scheraga, H.A.3
-
23
-
-
65249100163
-
-
Czaplewski, C.; Kalinowski, S.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. J. Chem. Theor. Comput. 2009, 5, 627-640.
-
(2009)
J. Chem. Theor. Comput
, vol.5
, pp. 627-640
-
-
Czaplewski, C.1
Kalinowski, S.2
Liwo, A.3
Scheraga, H.A.4
-
24
-
-
84986519238
-
-
Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021.
-
(1992)
J. Comput. Chem.
, vol.13
, pp. 1011-1021
-
-
Kumar, S.1
Bouzida, D.2
Swendsen, R.H.3
Kollman, P.A.4
-
26
-
-
77950108200
-
-
Maisuradze, G. G.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. J. Chem. Theoy. Comput. 2010, 6, 583-595.
-
(2010)
J. Chem. Theoy. Comput
, vol.6
, pp. 583-595
-
-
Maisuradze, G.G.1
Liwo, A.2
Scheraga, H.A.3
-
28
-
-
0036678831
-
-
Ghosh, A.; Elber, R.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99, 10394-10398.
-
(2002)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. a
, vol.99
, pp. 10394-10398
-
-
Ghosh, A.1
Elber, R.2
Scheraga, H.A.3
-
30
-
-
77951966932
-
-
Lewandowska, A.; Ołdziej, S.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. Biopolymers 2010, 93, 469-480.
-
(2010)
Biopolymers
, vol.93
, pp. 469-480
-
-
Lewandowska, A.1
Ołdziej, S.2
Liwo, A.3
Scheraga, H.A.4
-
31
-
-
33746102627
-
-
Sadqi, M.; Fushman, D.; Munoz, V. Nature 2006, 442, 317-321.
-
(2006)
Nature
, vol.442
, pp. 317-321
-
-
Sadqi, M.1
Fushman, D.2
Munoz, V.3
-
32
-
-
33645019703
-
-
Zuo, G.; Wang, J.; Wang, W. Proteins 2006, 63, 165-173.
-
(2006)
Proteins
, vol.63
, pp. 165-173
-
-
Zuo, G.1
Wang, J.2
Wang, W.3
-
33
-
-
47349126157
-
-
Zhang, J.; Li, W.; Wang, J.; Qin, M.; Wang, W. Proteins 2008, 72, 1038-1047.
-
(2008)
Proteins
, vol.72
, pp. 1038-1047
-
-
Zhang, J.1
Li, W.2
Wang, J.3
Qin, M.4
Wang, W.5
-
34
-
-
45849119074
-
-
Pitera, J. W.; Swope, W. C.; Abraham, F. F. Biophys. J. 2008, 94, 4837-4846.
-
(2008)
Biophys. J.
, vol.94
, pp. 4837-4846
-
-
Pitera, J.W.1
Swope, W.C.2
Abraham, F.F.3
-
35
-
-
44949091517
-
-
Fung, A.; Li, P.; Godoy-Ruiz, R.; Sanzhez-Ruiz, J. M.; Munoz, V. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 7489-7495.
-
(2008)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.130
, pp. 7489-7495
-
-
Fung, A.1
Li, P.2
Godoy-Ruiz, R.3
Sanzhez-Ruiz, J.M.4
Munoz, V.5
-
37
-
-
66149175453
-
-
Skwierawska, A.; Makowska, J.; Ołdziej, S.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2009, 75, 931-953.
-
(2009)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf
, vol.75
, pp. 931-953
-
-
Skwierawska, A.1
Makowska, J.2
Ołdziej, S.3
Liwo, A.4
Scheraga, H.A.5
-
38
-
-
68049145085
-
-
Skwierawska, A.; Zdmudzińska, W.; Ołdziej, S.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2009, 76, 637-654.
-
(2009)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf
, vol.76
, pp. 637-654
-
-
Skwierawska, A.1
Zdmudzińska, W.2
Ołdziej, S.3
Liwo, A.4
Scheraga, H.A.5
-
41
-
-
0028964062
-
-
Bayol, A.; Dupin, P.; Boe, J. F.; Claudy, P.; Letoffe, J. M. Biophys. Chem. 1995, 54, 229-235.
-
(1995)
Biophys. Chem.
, vol.54
, pp. 229-235
-
-
Bayol, A.1
Dupin, P.2
Boe, J.F.3
Claudy, P.4
Letoffe, J.M.5
-
42
-
-
0032560505
-
-
Zavodszky, P.; Kardos, J.; Svingor, A.; Petsko, G. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998, 95, 7406-7411.
-
(1998)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. a
, vol.95
, pp. 7406-7411
-
-
Zavodszky, P.1
Kardos, J.2
Svingor, A.3
Petsko, G.A.4
-
43
-
-
0000095892
-
-
Liwo, A.; Ołdziej, S.; Pincus, M. R.; Wawak, R. J.; Rackowsky, S.; Scheraga, H. A. J. Comput. Chem. 1997, 18, 849-873.
-
(1997)
J. Comput. Chem.
, vol.18
, pp. 849-873
-
-
Liwo, A.1
Ołdziej, S.2
Pincus, M.R.3
Wawak, R.J.4
Rackowsky, S.5
Scheraga, H.A.6
-
44
-
-
0035424584
-
-
Liwo, A.; Czaplewski, C.; Pillardy, J.; Scheraga, H. A. J. Chem. Phys. 2001, 115, 2323-2347.
-
(2001)
J. Chem. Phys.
, vol.115
, pp. 2323-2347
-
-
Liwo, A.1
Czaplewski, C.2
Pillardy, J.3
Scheraga, H.A.4
-
45
-
-
73949153636
-
Simulation of protein structure and dynamics with the coarse-grained UNRES force field
-
Voth; G., Ed., CRC Press: Boca Raton, FL, Chapter 8
-
Liwo, A.; Czaplewski, C.; Ołdziej, S.; Rojas, A. V.; Kaźmierkiewicz, R.; Makowski, M.; Murarka, R. K.; Scheraga, H. A. "Simulation of protein structure and dynamics with the coarse-grained UNRES force field". In Coarse-Graining of Condensed Phase and Biomolecular Systems; Voth; G., Ed., CRC Press: Boca Raton, FL, 2008; Chapter 8, pp 107-122.
-
(2008)
Coarse-Graining of Condensed Phase and Biomolecular Systems
, pp. 107-122
-
-
Liwo, A.1
Czaplewski, C.2
Ołdziej, S.3
Rojas, A.V.4
Kaźmierkiewicz, R.5
Makowski, M.6
Murarka, R.K.7
Scheraga, H.A.8
-
46
-
-
23144463330
-
-
Khalili, M.; Liwo, A.; Jagielska, A.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 13798-13810.
-
(2005)
J. Phys. Chem. B
, vol.109
, pp. 13798-13810
-
-
Khalili, M.1
Liwo, A.2
Jagielska, A.3
Scheraga, H.A.4
-
47
-
-
33845224693
-
-
Rakowski, F.; Grochowski, P.; Lesyng, B.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. J. Chem. Phys. 2006, 125, 204107.
-
(2006)
J. Chem. Phys.
, vol.125
, pp. 204107
-
-
Rakowski, F.1
Grochowski, P.2
Lesyng, B.3
Liwo, A.4
Scheraga, H.A.5
-
48
-
-
0037133165
-
-
Liwo, A.; Arłukowicz, P.; Czaplewski, C.; Ołdziej, S.; Pillardy, J.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99, 1937-1942.
-
(2002)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. a
, vol.99
, pp. 1937-1942
-
-
Liwo, A.1
Arłukowicz, P.2
Czaplewski, C.3
Ołdziej, S.4
Pillardy, J.5
Scheraga, H.A.6
-
49
-
-
33750587438
-
-
Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Di Nola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690.
-
(1984)
J. Chem. Phys.
, vol.81
, pp. 3684-3690
-
-
Berendsen, H.J.C.1
Postma, J.P.M.2
Gunsteren, W.F.3
Di Nola, A.4
Haak, J.R.5
-
50
-
-
36749110571
-
-
Swope, W. C.; Andersen, H. C.; Berens, P. H.; Wilson, K. R. J. Chem. Phys. 1982, 76, 637-649.
-
(1982)
J. Chem. Phys.
, vol.76
, pp. 637-649
-
-
Swope, W.C.1
Andersen, H.C.2
Berens, P.H.3
Wilson, K.R.4
-
51
-
-
0027435091
-
-
Liwo, A.; Pincus, M. R.; Wawak, R. J.; Rackovsky, S.; Scheraga, H. A. Protein Sci. 1993, 2, 1715-1731.
-
(1993)
Protein Sci.
, vol.2
, pp. 1715-1731
-
-
Liwo, A.1
Pincus, M.R.2
Wawak, R.J.3
Rackovsky, S.4
Scheraga, H.A.5
-
52
-
-
8344277888
-
-
Ołdziej, S.; Liwo, A.; Czaplewski, C.; Pillardy, J.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 16934-16949.
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 16934-16949
-
-
Ołdziej, S.1
Liwo, A.2
Czaplewski, C.3
Pillardy, J.4
Scheraga, H.A.5
|