Bonding patterns of [Ag2-alanine]0,± hybrid complexes and the implementation of molecular logic gates

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 110, Issue 12, 2010, Pages 2237-2246

  Zhang, C G ^a   Periyasamy, G ^a   Remacle, F ^a  

^a UNIVERSITY OF LIÈGE   (Belgium)

Author keywords

Bonding patterns; Metal hybrid complexes; Molecular logic; Quantum chemistry; Silver amino acid

Indexed keywords

AMINE NITROGEN; BINARY LOGIC; BONDING PATTERNS; CARBOXYLIC GROUP; CHARGE STATE; CHARGED CLUSTERS; COMPUTATIONAL ANALYSIS; COVALENT BONDING; ELECTROSTATIC POTENTIAL CHARGES; FAN-OUT; HYBRID COMPLEXES; MOLECULAR LOGIC; MOLECULAR LOGIC GATES; NEUTRAL CLUSTERS; POSITIVELY CHARGED; SILVER COORDINATION; STABLE CONFORMERS;

AMINO ACIDS; COORDINATION REACTIONS; HYDROGEN BONDS; LOGIC GATES; ORGANIC ACIDS; QUANTUM CHEMISTRY; QUANTUM THEORY;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY;

EID: 77955208560     PISSN: 00207608     EISSN: 1097461X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/qua.22786     Document Type: Article

References (62)

1. Lee, T. H.; Gonzalez, J. I.; Dickson, R. M. Proc Natl Acad Sci USA 2002, 99, 10272.
2. Lee, T. H.; Dickson, R. M. Proc Natl Acad Sci USA 2003, 100, 3043.
3. Gleitsmann, T.; Stegemann, B.; Bernhardt, T. M. Appl Phys Lett 2004, 84, 4050.
4. Lee, T. H.; Gonzalez, J. I.; Zheng, J.; Dickson, R. M. Acc Chem Res 2005, 38, 534.
5. Peyser, L. A.; Vinson, A. E.; Bartko, A. P.; Dickson, R. M.Science 2001, 291, 103.
6. Peyser-Capadona, L.; Zheng, J.; Gonzalez, J. I.; Lee, T. H.; Patel, S. A.; Dickson, R. M. Phys Rev Lett 94:058301, 2005.
7. Gleitsmann, T.; Bernhardt, T. M.; Woste, L. Appl Phys A 2006, 82, 125.
8. Felix, C.; Sieber, C.; Harbich, W.; Buttet, J.; Rabin, I.; Schulze, W.; Ertl, G. Chem Phys Lett 1999, 313.
9. Felix, C.; Sieber, C.; Harbich, W.; Buttet, J.; Rabin, I.; Schulze, W.; Ertl, G. Phys Rev Lett 2001, 86.
10. Rabin, I.; Schulze, W.; Ertl, G.; Felix, C.; Siebach, C.; Harbich, W.; Buttet, J. Chem Phys Lett 2000, 320.
11. Fielden, J.; Long, D. L.; Slawin, A. M. Z.; Kogerler, P.; Cronin, L. Inorg Chem 2007, 46, 9090.
12. Giese, B.; McNaughton, D. J Phys Chem B 2002, 106, 101.
13. Iliescu, T.; Maniu, D.; Chis, V.; Irimie, F. D.; Paizs, C.; Tosa, M. Chem Phys 2005, 310, 189.
14. Jensen, L.; Zhao, L. L.; Schatz, G. C. J Phys Chem C 2007, 111, 4756.
15. Wu, D. Y.; Liu, X. M.; Duan, S.; Xu, X.; Ren, B.; Lin, S. H.; Tian, Z. Q. J Phys Chem C 2008, 112, 4195.
16. Mitric, R.; Petersen, J.; Kulesza, A.; Bonacic-Koutecky, V.; Tabarin, T.; Compagnon, I.; Antoine, R.; Broyer, M.; Dugourd, P. Chem Phys 2008, 343, 372.
17. Fleming, G. D.; Finnerty, J. J.; Campos-Vallette, M.; Celis, F.; Aliaga, A. E.; Fredes, C.; Koch, R. J Raman Spectr 2009, 40, 632.
18. Barcelo-oliver, M.; Tasada, A.; Fiol, J. J.; Garcia-Raso, A.; Terron, A.; Molins, E. Polyhedron 2006, 25, 71.
19. Compagnon, I.; Tabarin, T.; Antoine, R.; Broyer, M.; Dugourd, P.; Mitric, R.; Petersen, J.; Bonacic-Koutecky, V. J Chem Phys 2006, 125.
20. Antoine, R.; Tabarin, T.; Broyer, M.; Dugourd, P.; Mitric, R.; Bonacic-Koutecky, V. Chemphyschem 2006, 7, 524.
21. Baishya, K.; Idrobo, J. C.; Ogut, S.; Yang, M. L.; Jackson, K.; Jellinek, J. Phys Rev B 2008, 78.
22. Kulesza, A.; Mitric, R.; Bonacic-Koutecky, V. Eur Phys J D 2009, 52, 203.
23. Tabarin, T.; Antoine, R.; Broyer, M.; Dugourd, P. Eur Phys J D 2009, 52, 191.
24. de Silva, A. P.; Uchiyama, S. Nat Nanotechnol 2007, 2, 399.
25. de Silva, A. P.; Dobbin, C. M.; Vancea, T. P.; Wannalerse, B. Chem Commun 2009, 1386.
26. Stoddart, J. F.; Colquhoun, H. M. Tetrahedron 2008, 64, 8231.
27. Remacle, F.; Levine, R. D. Nanotechnology; Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim, 2008; Vol.4.
28. Szacilowski, K. Chem Rev 2008, 108, 3481.
29. de Silva, A. P.; Dixon, I. M.; Gunaratne, H. Q. N.; Gunnlaugsson, T.; Maxwell, P. R. S.; Rice, T. E. J Am Chem Soc 1999, 121, 1393.
30. Pischel, U. Angew Chem Int Ed 2007, 46, 4026.
31. Ashton, P. R.; Baldoni, V.; Balzani, V.; Credi, A.; Hoffmann, H. D. A.; Martinez-Diaz, M. V.; Raymo, F. M.; Stoddart, J. F.; Venturi, M. Chem Eur J 2001, 7, 3482.
32. de Silva, A. P.; Fox, D. B.; Moody, T. S.; Weir, S. M. Pure Appl Chem 2001, 73, 503.
33. Margulies, D.;Melman, G.; Shanzer, A. Nat Mater 2005, 4, 768.
34. Margulies, D.; Melman, G.; Shanzer, A. J Am Chem Soc 2006, 128, 4865.
35. Brown, G. J.; de Silva, A. P.; Pagliari, S. Chem Commun 2002, 2461.
36. Leigh, D. A.; Thomson, A. R. Tetrahedron 2008, 64, 8411.
37. Remacle, F.; Levine, R. D. J Chem Phys 2001, 114, 10239.
38. Remacle, F.; Speiser, S.; Levine, R. D. J Phys Chem A 2001, 105, 5589.
39. Remacle, F.; Levine, R. D. Phys Rev A 2006, 73, 033820.
40. Remacle, F.; Weinkauf, R.; Levine, R. D. J Phys Chem A 2006, 110, 177.
41. Collier, C. P.; Mattersteig, G.; Wong, E. W.; Luo, Y.; Beverly, K.; Sampaio, J.; Raymo, F. M.; Stoddart, J. F.; Heath, J. R. Science 2000, 289, 1172.
42. Duchemin, I.; Joachim, C. Chem Phys Lett 2005, 406, 167.
43. Remacle, F.; Heath, J. R.; Levine, R. D. Proc Natl Acad Sci USA 2005, 102, 5653.
44. Klein, M.; Lansbergen, G. P.; Mol, J. A.; Rogge, S.; Levine, R. D.; Remacle, F. ChemPhysChem 2009, 10, 162.
45. Baron, R.; Lioubashevski, O.; Katz, E.; Niazov, T.; Willner, I. Angew Chem Int Ed 2006, 45, 1572.
46. Gupta, T.; van der Boom, M. E. Angew Chem Int Ed 2008, 47, 5322.
47. Baron, R.; Onopriyenko, A.; Katz, E.; Lioubashevski, O.; Willner, I.; Sheng, W.; Tian, H. Chem Commun 2006, 2147.
48. Klein, M.; Levine, R. D.; Remacle, F. J Appl Phys 2008, 104, 044509-44511
49. Periyasamy, G.; Collin, J.-P.; Sauvage, J. P.; Levine, R. D.; Remacle, F. Chem Eur J 2009, 15, 1310.
50. Kryachko, E. S.; Remacle, F. Mol Phys 2008, 106, 521.
51. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys Rev B 1988, 37, 785.
52. Parr, R. G.; Wang, W. Density-Functional Theory of Atoms and Molecules; Oxford University Press: New York, 1989.
53. Becke, A. D. J Chem Phys 1993, 98, 5648.
54. Hay, P. J.; Wadt, W. R. J Chem Phys 1985, 82, 270.
55. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; J. A. Montgomery, Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; J. Tomasi; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; N. Rega; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; J. B. Cross; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision C. 02, 2003.
56. Boys, S. F.; Bernardi, F. Mol Phys 1970, 19.
57. Simon, S.; Duran,M.; Dannenberg, J. J. J Chem Phys 1996, 105.
58. Reed, A. E.; Curtiss, L. A.;Weinhold, F. Chem Rev 1988, 88, 899.
59. Weinhold, F.; Carpenter, J. E. The Structure of Small Molecules and Ions. Plenum, 1988; Vol.227-236.
60. Kryachko, E. S.; Remacle, F. Nano Lett 2005, 5, 735.
61. Kryachko, E. S.; Remacle, F. Chem Phys Lett 2005, 404, 142.
62. Kryachko, E. S.; Remacle, F. J Chem Phys 2007, 127, 194305.