Asymmetric DNA origami for spatially addressable and index-free solution-phase DNA chips

Advanced Materials

Volumn 22, Issue 24, 2010, Pages 2672-2675

  Zhang, Zhao ^a,b   Wang, Ying ^b   Fan, Chunhai ^a,b   Li, Can ^a   Li, You ^a   Qian, Lulu ^a   Fu, Yanming ^a   Shi, Yongyong ^a   Hu, Jun ^b   He, Lin ^a  

^a SHANGHAI JIAO TONG UNIVERSITY   (China)

^b SHANGHAI INSTITUTE OF APPLIED PHYSICS   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA CHIP; DNA HYBRIDIZATION; FREE SOLUTIONS; LINEAR PROBE; POSITION INDEX; SELF-ASSEMBLED; SINGLE-STRANDED DNA;

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; GENES; OLIGONUCLEOTIDES;

DNA;

DNA; STREPTAVIDIN;

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CHEMISTRY; INSTRUMENTATION; METABOLISM; NANOTECHNOLOGY; REVIEW; SOLUTION AND SOLUBILITY;

DNA; MICROSCOPY, ATOMIC FORCE; NANOTECHNOLOGY; SOLUTIONS; STREPTAVIDIN;

EID: 77952609409     PISSN: 09359648     EISSN: 15214095     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/adma.201000151     Document Type: Review

References (54)

1. N. R. Kallenbach, R. Ma, N. C. Seeman, Nature 1983, 305, 829.
2. M. N. Stojanovic, D. Stefanovic, Nat. Biotechnol. 2003, 21, 1013.
3. P. W. Rothemund, N. Papadakis, E. Winfree, PLoS Biol. 2004, 2, e424.
4. P. W. Rothemund, Nature 2006, 440, 297.
5. E. Winfree, F. Liu, L. A. Wenzler, N. C. Seeman, Nature 1998, 394, 539.
6. S. M. Douglas, H. Dietz, T. Liedl, B. Hogberg, F. Graf, W. M. Shih, Nature 2009, 459, 414.
7. S. Y. Park, A. K. R. Lytton-Jean, B. Lee, S. Weigand, G. C. Schatz, C. A. Mirkin, Nature 2008, 451, 553.
8. D. Nykypanchuk, M. M. Maye, D. Lelie, O. Gang, Nature 2008, 451, 549.
9. H. Yan, S. H. Park, G. Finkelstein, J. H. Reif, T. H. LaBean, Science 2003, 301, 1882.
10. T. H. LaBean, H. Yan, J. Kopatsch, F. Liu, E. Winfree, J. H. Reif, N. C. Seeman, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1848.
11. S. H. Park, R. Barish, H. Li, J. H. Reif, G. Finkelstein, H. Yan, T. H. Labean, Nano Lett. 2005, 5, 693.
12. Y. He, Y. Chen, H. Liu, A. E. Ribbe, C. Mao, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12202.
13. Y. He, Y.Tian, Y. Chen, Z. Deng, A. E. Ribbe, C. Mao, Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 6694.
14. S. H. Park, C. Pistol, S. J. Ahn, J. H. Reif, A. R. Lebeck, C. Dwyer, T. H. LaBean, Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 735.
15. H. Yan, T. H. LaBean, L. Feng, J. H. Reif, Proc. Natl. Acad. Sci. 2003, 100, 8103.
16. K. Fujibayashi, R. Hariadi, S. H. Park, E. Winfree, S. Murata, Nano Lett. 2008, 8, 1791.
17. J. Sharma, R. Chhabra, A. Cheng, J. Brownell, Y. Liu, H. Yan, Science 2009, 323, 112.
18. P. Yin, R. F. Hariadi, S. Sahu, H. M. Choi, S. H. Park, T. H. Labean, J. H. Reif, Science 2008, 321, 824.
19. Y. Ke, J. Sharma, M. Liu, K. Jahn, Y. Liu, H. Yan, Nano Lett. 2009, 9, 2445.
20. E. S. Andersen, M. Dong, M. M. Nielsen, K. Jahn, R. Subramani, W. Mamdouh, M. M. Golas, B. Sander, H. Stark, C. L. Oliveira, J. S. Pedersen, V. Birkedal, F. Besenbacher, K. V. Gothelf, J. Kjems, Nature 2009, 459, 73.
21. Y. He, T. Ye, M. Su, C. Zhang, A. E. Ribbe, W. Jiang, C. Mao, Nature 2008, 452, 198.
22. W. M. Shih, J. D. Quispe, G. F. Joyce, Nature 2004, 427, 618.
23. L. Qian, Y. Wang, Z. Zhang, J. Zhao, D. Pan, Y. Zhang, Q. Liu, C. Fan, J. Hu, L. He, Chin. Sci. Bull. 2006, 51, 2973.
24. R. Chhabra, J. Sharma, Y. Ke, Y. Liu, S. Rinker, S. Lindsay, H. Yan, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 10304.
25. S. Rinker, Y. Ke, Y. Liu, R. Chhabra, H. Yan, Nat. Nanotechnol. 2008, 3, 418.
26. J. Sharma, R. Chhabra, C. S. Andersen, K. V. Gothelf, H. Yan, Y. Liu, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 7820.
27. S. M. Douglas, J. J. Chou, W. M. Shih, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 6644.
28. C. Fan, K. W. Plaxco, A. J. Heeger, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 9134.
29. G. Liu, Y.Wan, V. Gau, J. Zhang, L.Wang, S. Song, C. Fan, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 6820.
30. X. Zuo, S. Song, J. Zhang, D. Pan, L. Wang, C. Fan, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 1042.
31. D. A. Giljohann, C. A. Mirkin, Nat. Biotechnol. 2008, 26, 299.
32. Y. Ke, S. Lindsay, Y. Chang, Y. Liu, H. Yan, Science 2008, 319, 180.
33. H. Gu, J. Chao, S.-J. Xiao, N. C. Seeman, Not. Nanotechnol. 2009, 4, 245.
34. S. H. Park, P. Yin, Y. Liu, J. H. Reif, T. H. LaBean, H. Yan, Nano Lett. 2005, 5, 729.
35. C. Pistol, C. Dwyer, Nanotechnology 2007, 18.
36. A. Kuzyk, K. T. Laitinen, P. Torma, Nanotechnology 2009, 20, 235305.
37. A. Kuzyk, M. Kimura, K. Numajiri, N. Koshi, T. Ohnishi, F. Okada, M. Komiyama, Chem. Bio. Chem. 2009, 10, 1811.
38. P. W. Rothemund, A. Ekani-Nkodo, N. Papadakis, A. Kumar, D. K. Fygenson, E. Winfree, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 16344.
39. C. Lin, E. Katilius, Y. Liu, J. Zhang, H. Yan, Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 5296.
40. K. Lund, Y. Liu, S. Lindsay, H. Yan, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17606.
41. Y. Ke, J. Nangreave, H. Yan, S. Lindsay, Y. Liu, Chem. Commun. 2008, 5622.
42. J. D. Le, Y. Pinto, N. C. Seeman, K. Musier-Forsyth, T. A. Taton, R. A. Kiehl, Nano Lett. 2004, 4, 2343.
43. Y. Y. Pinto, J. D. Le, N. C. Seeman, K. Musier-Forsyth, T. A. Taton, R. A. Kiehl, Nono Lett. 2005, 5, 2399.
44. Z. Deng, Y. Tian, S. H. Lee, A. E. Ribbe, C. Mao, Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 3582.
45. J. Zhang, Y. Liu, Y. Ke, H. Yan, Nono Lett. 2006, 6, 248.
46. C. Lin, Y. Ke, Y. Liu, M. Mertig, J. Gu, H. Yan, Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 6089.
47. C. Lin, Y. Liu, H. Yan, Nano Lett. 2007, 7, 507.
48. B. A. Williams, K. Lund, Y. Liu, H. Yan, J. C. Chaput, Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 3051.
49. H. Li, J. Huang, J. Lv, H. An, X. Zhang, Z. Zhang, C. Fan, J. Hu, Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 5100.
50. L. Wang, X. Liu, X. Hu, S. Song, C. Fan, Chem. Commun. 2006, 3780.
51. J. Zhang, S. Song, L. Wang, D. Pan, C. Fan, Nat. Protoc. 2007, 2, 2888.
52. S. He, B. Song, D. Li, C. Zhu, W. Qi, Y. Wen, L. Wang, S. Song, H. Fang, C. Fan, Adv. Funct. Mater. 2010, 20, 453.
53. S. Song, Z. Liang, J. Zhang, L. Wang, G. Li, C. Fan, Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 8670.
54. www.generay.com.cn/english/ (last accessed May, 2009).