SCOPUS 정보 검색 플랫폼

New Journal of Chemistry

Volumn 34, Issue 5, 2010, Pages 910-917

RNA structural motifs that entail hydrogen bonds involving sugar-phosphate backbone atoms of RNA

(2) Ulyanov, Nikolai B a James, Thomas L a

a UNIVERSITY OF CALIFORNIA (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

NUCLEOTIDE; OXYGEN; PHOSPHODIESTERASE; RIBOSE; RIBOSE PHOSPHATE; RNA; SUGAR PHOSPHATE;

ARTICLE; HUMAN; HYDROGEN BOND; PRIORITY JOURNAL; RNA STRUCTURE;

EID: 77952575647 PISSN: 11440546 EISSN: 13699261 Source Type: Journal
DOI: 10.1039/b9nj00754g Document Type: Article

Times cited : (28)

References (45)

1
- 20444481991
- S. R. Holbrook Curr. Opin. Struct. Biol. 2005 15 302 308
- (2005) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.15 , pp. 302-308
- Holbrook, S.R.¹

2
- 48249125095
- S. R. Holbrook Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2008 37 445 464
- (2008) Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. , vol.37 , pp. 445-464
- Holbrook, S.R.¹

3
- 0035010211
- N. B. Leontis E. Westhof RNA 2001 7 499 512
- (2001) RNA , vol.7 , pp. 499-512
- Leontis, N.B.¹ Westhof, E.²

4
- 0344702704
- L. J. Murray W. B. Arendall, 3rd D. C. Richardson J. S. Richardson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 13904 13909
- (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.100 , pp. 13904-13909
- Murray, L.J.¹ Arendall III, W.B.² Richardson, D.C.³ Richardson, J.S.⁴

5
- 0141974927
- G. E. Sims S. H. Kim Nucleic Acids Res. 2003 31 5607 5616
- (2003) Nucleic Acids Res. , vol.31 , pp. 5607-5616
- Sims, G.E.¹ Kim, S.H.²

6
- 3042668602
- B. Schneider Z. Moravek H. M. Berman Nucleic Acids Res. 2004 32 1666 1677
- (2004) Nucleic Acids Res. , vol.32 , pp. 1666-1677
- Schneider, B.¹ Moravek, Z.² Berman, H.M.³

7
- 33747602081
- D. K. Hendrix S. E. Brenner S. R. Holbrook Q. Rev. Biophys. 2005 38 221 243
- (2005) Q. Rev. Biophys. , vol.38 , pp. 221-243
- Hendrix, D.K.¹ Brenner, S.E.² Holbrook, S.R.³

8
- 40449091092
- J. S. Richardson B. Schneider L. W. Murray G. J. Kapral R. M. Immormino J. J. Headd D. C. Richardson D. Ham E. Hershkovits L. D. Williams K. S. Keating A. M. Pyle D. Micallef J. Westbrook H. M. Berman RNA 2008 14 465 481
- (2008) RNA , vol.14 , pp. 465-481
- Richardson, J.S.¹ Schneider, B.² Murray, L.W.³ Kapral, G.J.⁴ Immormino, R.M.⁵ Headd, J.J.⁶ Richardson, D.C.⁷ Ham, D.⁸ Hershkovits, E.⁹ Williams, L.D.¹⁰ Keating, K.S.¹¹ Pyle, A.M.¹² Micallef, D.¹³ Westbrook, J.¹⁴ Berman, H.M.¹⁵

9
- 57049151833
- Y. Xin C. Laing N. B. Leontis T. Schlick RNA 2008 14 2465 2477
- (2008) RNA , vol.14 , pp. 2465-2477
- Xin, Y.¹ Laing, C.² Leontis, N.B.³ Schlick, T.⁴

10
- 59749092307
- W. K. Olson M. Esguerra Y. Xin X. J. Lu Methods 2009 47 177 186
- (2009) Methods , vol.47 , pp. 177-186
- Olson, W.K.¹ Esguerra, M.² Xin, Y.³ Lu, X.J.⁴

11
- 65549163541
- J. Stombaugh C. L. Zirbel E. Westhof N. B. Leontis Nucleic Acids Res. 2009 37 2294 2312
- (2009) Nucleic Acids Res. , vol.37 , pp. 2294-2312
- Stombaugh, J.¹ Zirbel, C.L.² Westhof, E.³ Leontis, N.B.⁴

12
- 58149204071
- Y. Xin W. K. Olson Nucleic Acids Res. 2009 37 D83 D88
- (2009) Nucleic Acids Res. , vol.37
- Xin, Y.¹ Olson, W.K.²

13
- 35548950310
- R. Das D. Baker Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 14664 14669
- (2007) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.104 , pp. 14664-14669
- Das, R.¹ Baker, D.²

14
- 40449139010
- M. Parisien F. Major Nature 2008 452 51 55
- (2008) Nature , vol.452 , pp. 51-55
- Parisien, M.¹ Major, F.²

15
- 58249111738
- M. A. Jonikas R. J. Radmer A. Laederach R. Das S. Pearlman D. Herschlag R. B. Altman RNA 2009 15 189 199
- (2009) RNA , vol.15 , pp. 189-199
- Jonikas, M.A.¹ Radmer, R.J.² Laederach, A.³ Das, R.⁴ Pearlman, S.⁵ Herschlag, D.⁶ Altman, R.B.⁷

16
- 0029820625
- J. H. Cate A. R. Gooding E. Podell K. Zhou B. L. Golden C. E. Kundrot T. R. Cech J. A. Doudna Science 1996 273 1678 1685
- (1996) Science , vol.273 , pp. 1678-1685
- Cate, J.H.¹ Gooding, A.R.² Podell, E.³ Zhou, K.⁴ Golden, B.L.⁵ Kundrot, C.E.⁶ Cech, T.R.⁷ Doudna, J.A.⁸

17
- 0032505999
- C. C. Correll A. Munishkin Y. L. Chan Z. Ren I. G. Wool T. A. Steitz Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 13436 13441
- (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.95 , pp. 13436-13441
- Correll, C.C.¹ Munishkin, A.² Chan, Y.L.³ Ren, Z.⁴ Wool, I.G.⁵ Steitz, T.A.⁶

18
- 0035942248
- P. Nissen J. A. Ippolito N. Ban P. B. Moore T. A. Steitz Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 4899 4903
- (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.98 , pp. 4899-4903
- Nissen, P.¹ Ippolito, J.A.² Ban, N.³ Moore, P.B.⁴ Steitz, T.A.⁵

19
- 0036071391
- M. G. Gagnon S. V. Steinberg RNA 2002 8 873 877
- (2002) RNA , vol.8 , pp. 873-877
- Gagnon, M.G.¹ Steinberg, S.V.²

20
- 0036314898
- M. Tamura S. R. Holbrook J. Mol. Biol. 2002 320 455 474
- (2002) J. Mol. Biol. , vol.320 , pp. 455-474
- Tamura, M.¹ Holbrook, S.R.²

21
- 0345531092
- C. C. Correll J. Beneken M. J. Plantinga M. Lubbers Y. L. Chan Nucleic Acids Res. 2003 31 6806 6818
- (2003) Nucleic Acids Res. , vol.31 , pp. 6806-6818
- Correll, C.C.¹ Beneken, J.² Plantinga, M.J.³ Lubbers, M.⁴ Chan, Y.L.⁵

22
- 33846026769
- M. G. Gagnon A. Mukhopadhyay S. V. Steinberg J. Biol. Chem. 2006 281 39349 39357
- (2006) J. Biol. Chem. , vol.281 , pp. 39349-39357
- Gagnon, M.G.¹ Mukhopadhyay, A.² Steinberg, S.V.³

23
- 33645006571
- A. Mokdad M. V. Krasovska J. Sponer N. B. Leontis Nucleic Acids Res. 2006 34 1326 1341
- (2006) Nucleic Acids Res. , vol.34 , pp. 1326-1341
- Mokdad, A.¹ Krasovska, M.V.² Sponer, J.³ Leontis, N.B.⁴

24
- 33947729952
- S. V. Steinberg Y. I. Boutorine RNA 2007 13 549 554
- (2007) RNA , vol.13 , pp. 549-554
- Steinberg, S.V.¹ Boutorine, Y.I.²

25
- 70349238567
- C. Laing S. Jung A. Iqbal T. Schlick J. Mol. Biol. 2009 393 67 82
- (2009) J. Mol. Biol. , vol.393 , pp. 67-82
- Laing, C.¹ Jung, S.² Iqbal, A.³ Schlick, T.⁴

26
- 69849114530
- C. L. Zirbel J. E. Sponer J. Sponer J. Stombaugh N. B. Leontis Nucleic Acids Res. 2009 37 4898 4918
- (2009) Nucleic Acids Res. , vol.37 , pp. 4898-4918
- Zirbel, C.L.¹ Sponer, J.E.² Sponer, J.³ Stombaugh, J.⁴ Leontis, N.B.⁵

27
- 0035073865
- E. A. Doherty R. T. Batey B. Masquida J. A. Doudna Nat. Struct. Biol. 2001 8 339 343
- (2001) Nat. Struct. Biol. , vol.8 , pp. 339-343
- Doherty, E.A.¹ Batey, R.T.² Masquida, B.³ Doudna, J.A.⁴

28
- 34250815810
- S. V. Steinberg Y. I. Boutorine RNA 2007 13 1036 1042
- (2007) RNA , vol.13 , pp. 1036-1042
- Steinberg, S.V.¹ Boutorine, Y.I.²

29
- 0028037302
- H. W. Pley K. M. Flaherty D. B. McKay Nature 1994 372 111 113
- (1994) Nature , vol.372 , pp. 111-113
- Pley, H.W.¹ Flaherty, K.M.² McKay, D.B.³

30
- 0032582795
- N. B. Leontis E. Westhof J. Mol. Biol. 1998 283 571 583
- (1998) J. Mol. Biol. , vol.283 , pp. 571-583
- Leontis, N.B.¹ Westhof, E.²

31
- 33947277419
- K. Shefer Y. Brown V. Gorkovoy T. Nussbaum N. B. Ulyanov Y. Tzfati Mol. Cell. Biol. 2007 27 2130 2143
- (2007) Mol. Cell. Biol. , vol.27 , pp. 2130-2143
- Shefer, K.¹ Brown, Y.² Gorkovoy, V.³ Nussbaum, T.⁴ Ulyanov, N.B.⁵ Tzfati, Y.⁶

32
- 0033954256
- H. M. Berman J. Westbrook Z. Feng G. Gilliland T. N. Bhat H. Weissig I. N. Shindyalov P. E. Bourne Nucleic Acids Res. 2000 28 235 242
- (2000) Nucleic Acids Res. , vol.28 , pp. 235-242
- Berman, H.M.¹ Westbrook, J.² Feng, Z.³ Gilliland, G.⁴ Bhat, T.N.⁵ Weissig, H.⁶ Shindyalov, I.N.⁷ Bourne, P.E.⁸

33
- 48349090037
- S. Kurata A. Weixlbaumer T. Ohtsuki T. Shimazaki T. Wada Y. Kirino K. Takai K. Watanabe V. Ramakrishnan T. Suzuki J. Biol. Chem. 2008 283 18801 18811
- (2008) J. Biol. Chem. , vol.283 , pp. 18801-18811
- Kurata, S.¹ Weixlbaumer, A.² Ohtsuki, T.³ Shimazaki, T.⁴ Wada, T.⁵ Kirino, Y.⁶ Takai, K.⁷ Watanabe, K.⁸ Ramakrishnan, V.⁹ Suzuki, T.¹⁰

34
- 0031081961
- M. C. Wahl M. Sundaralingam Trends Biochem. Sci. 1997 22 97 102
- (1997) Trends Biochem. Sci. , vol.22 , pp. 97-102
- Wahl, M.C.¹ Sundaralingam, M.²

35
- 0032540011
- Y. Mandel-Gutfreund H. Margalit R. L. Jernigan V. B. Zhurkin J. Mol. Biol. 1998 277 1129 1140
- (1998) J. Mol. Biol. , vol.277 , pp. 1129-1140
- Mandel-Gutfreund, Y.¹ Margalit, H.² Jernigan, R.L.³ Zhurkin, V.B.⁴

36
- 0028863271
- N. B. Ulyanov T. L. James Methods Enzymol. 1995 261 90 120
- (1995) Methods Enzymol. , vol.261 , pp. 90-120
- Ulyanov, N.B.¹ James, T.L.²

37
- 4444221565
- E. F. Pettersen T. D. Goddard C. C. Huang G. S. Couch D. M. Greenblatt E. C. Meng T. E. Ferrin J. Comput. Chem. 2004 25 1605 1612
- (2004) J. Comput. Chem. , vol.25 , pp. 1605-1612
- Pettersen, E.F.¹ Goddard, T.D.² Huang, C.C.³ Couch, G.S.⁴ Greenblatt, D.M.⁵ Meng, E.C.⁶ Ferrin, T.E.⁷

38
- 33644860901
- G. S. Couch D. K. Hendrix T. E. Ferrin Nucleic Acids Res. 2006 34 e29
- (2006) Nucleic Acids Res. , vol.34 , pp. 29
- Couch, G.S.¹ Hendrix, D.K.² Ferrin, T.E.³

39
- 55249114833
- A. Serganov L. Huang D. J. Patel Nature 2008 455 1263 1267
- (2008) Nature , vol.455 , pp. 1263-1267
- Serganov, A.¹ Huang, L.² Patel, D.J.³

40
- 0037512360
- T. Kobayashi O. Nureki R. Ishitani A. Yaremchuk M. Tukalo S. Cusack K. Sakamoto S. Yokoyama Nat. Struct. Biol. 2003 10 425 432
- (2003) Nat. Struct. Biol. , vol.10 , pp. 425-432
- Kobayashi, T.¹ Nureki, O.² Ishitani, R.³ Yaremchuk, A.⁴ Tukalo, M.⁵ Cusack, S.⁶ Sakamoto, K.⁷ Yokoyama, S.⁸

41
- 38349100453
- J. D. Ye V. Tereshko J. K. Frederiksen A. Koide F. A. Fellouse S. S. Sidhu S. Koide A. A. Kossiakoff J. A. Piccirilli Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 82 87
- (2008) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.105 , pp. 82-87
- Ye, J.D.¹ Tereshko, V.² Frederiksen, J.K.³ Koide, A.⁴ Fellouse, F.A.⁵ Sidhu, S.S.⁶ Koide, S.⁷ Kossiakoff, A.A.⁸ Piccirilli, J.A.⁹

42
- 46049091176
- S. Thore C. Frick N. Ban J. Am. Chem. Soc. 2008 130 8116 8117
- (2008) J. Am. Chem. Soc. , vol.130 , pp. 8116-8117
- Thore, S.¹ Frick, C.² Ban, N.³

43
- 0037111875
- P. B. Rupert A. P. Massey S. T. Sigurdsson A. R. Ferre-D'Amare Science 2002 298 1421 1424
- (2002) Science , vol.298 , pp. 1421-1424
- Rupert, P.B.¹ Massey, A.P.² Sigurdsson, S.T.³ Ferre-D'Amare, A.R.⁴

44
- 27644557445
- T. M. Schmeing K. S. Huang D. E. Kitchen S. A. Strobel T. A. Steitz Mol. Cell 2005 20 437 448
- (2005) Mol. Cell , vol.20 , pp. 437-448
- Schmeing, T.M.¹ Huang, K.S.² Kitchen, D.E.³ Strobel, S.A.⁴ Steitz, T.A.⁵

45
- 35448950462
- T. Hainzl S. Huang A. E. Sauer-Eriksson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 14911 14916
- (2007) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.104 , pp. 14911-14916
- Hainzl, T.¹ Huang, S.² Sauer-Eriksson, A.E.³

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.