Toward one step analysis of cellular lipidomes using liquid chromatography coupled with mass spectrometry: Application to Saccharomyces cerevisiae and Schizosaccharomyces pombe lipidomics

Molecular BioSystems

Volumn 6, Issue 6, 2010, Pages 1008-1017

  Shui, Guanghou ^a,b   Guan, Xue Li ^a   Low, Choon Pei ^a   Chua, Gek Huey ^a   Goh, Joyce Sze Yuin ^a   Yang, Hongyuan ^c   Wenk, Markus R ^a,d  

^a NATIONAL UNIVERSITY OF SINGAPORE   (Singapore)

^b International Life Sciences Institute   (Singapore)

^c UNIVERSITY OF NEW SOUTH WALES   (Australia)

^d Department of Biological Sciences ^*  (Singapore)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CERAMIDE; LIPID; SPHINGOLIPID;

ARTICLE; CHEMISTRY; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; METHODOLOGY; SACCHAROMYCES CEREVISIAE; SCHIZOSACCHAROMYCES;

CERAMIDES; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; LIPIDS; MASS SPECTROMETRY; SACCHAROMYCES CEREVISIAE; SCHIZOSACCHAROMYCES; SPHINGOLIPIDS;

SACCHAROMYCES CEREVISIAE; SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE;

EID: 77952512222     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b913353d     Document Type: Article

References (52)

1. M. A. Welte Trends Cell Biol. 2007 17 363
2. X. L. Guan C. M. Souza H. Pichler G. Dewhurst O. Schaad K. Kajiwara H. Wakabayashi T. Ivanova G. A. Castillon M. Piccolis F. Abe R. Loewith K. Funato M. R. Wenk H. Riezman Mol. Biol. Cell 2009 20 2083
3. C. S. Ejsing J. L. Sampaio V. Surendranath E. Duchoslav K. Ekroos R. W. Klemm K. Simons A. Shevchenko Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 2136
4. M. R. Wenk Nat. Rev. Drug Discovery 2005 4 594
5. G. van Meer EMBO J. 2005 24 3159
6. R. Chan P. D. Uchil J. Jin G. Shui D. E. Ott W. Mothes M. R. Wenk J. Virol. 2008 82 11228
7. W. Fei G. Shui B. Gaeta X. Du L. Kuerschner P. Li A. J. Brown M. R. Wenk R. G. Parton H. Yang J. Cell Biol. 2008 180 473
8. S. Kutik M. Rissler X. L. Guan B. Guiard G. Shui N. Gebert P. N. Heacock P. Rehling W. Dowhan M. R. Wenk N. Pfanner N. Wiedemann J. Cell Biol. 2008 183 1213
9. L. H. Lee G. Shui A. A. Farooqui M. R. Wenk C. H. Tan W. Y. Ong Int. J. Neuropsychopharmacol. 2009 12 953
10. C. P. Low G. Shui L. P. Liew S. Buttner F. Madeo I. W. Dawes M. R. Wenk H. Yang J. Cell Sci. 2008 121 2671
11. T. J. Montine K. S. Montine W. McMahan W. R. Markesbery J. F. Quinn J. D. Morrow Antioxid. Redox Signaling 2005 7 269
12. X. L. Han R. W. Gross Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 1991 1069 37
13. X. L. Han R. W. Gross Biochemistry 1990 29 4992
14. X. L. Guan X. He W. Y. Ong W. K. Yeo G. Shui M. R. Wenk FASEB J. 2006 20 1152
15. M. Pulfer R. C. Murphy Mass Spectrom. Rev. 2003 22 332
16. X. Han R. W. Gross Mass Spectrom. Rev. 2005 24 367
17. R. Taguchi T. Houjou H. Nakanishi T. Yamazaki M. Ishida M. Imagawa T. Shimizu J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2005 823 26
18. G. Stubiger O. Belgacem Anal. Chem. 2007 79 3206
19. Q. Huang H. M. Shen G. Shui M. R. Wenk C. N. Ong Cancer Res. 2006 66 5807
20. K. Raith C. Brenner H. Farwanah G. Muller K. Eder R. H. Neubert J. Chromatogr., A 2005 1067 207
21. K. Karu M. Hornshaw G. Woffendin K. Bodin M. Hamberg G. Alvelius J. Sjovall J. Turton Y. Wang W. J. Griffiths J. Lipid Res. 2007 48 976
22. X. Han R. W. Gross Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994 91 10635
23. X. Han R. W. Gross Anal. Biochem. 2001 295 88
24. X. L. Guan M. R. Wenk Yeast 2006 23 465
25. R. Welti X. Wang Curr. Opin. Plant Biol. 2004 7 337
26. M. Hermansson A. Uphoff R. Kakela P. Somerharju Anal. Chem. 2005 77 2166
27. C. S. Ejsing E. Duchoslav J. Sampaio K. Simons R. Bonner C. Thiele K. Ekroos A. Shevchenko Anal. Chem. 2006 78 6202
28. D. Schwudke J. T. Hannich V. Surendranath V. Grimard T. Moehring L. Burton T. Kurzchalia A. Shevchenko Anal. Chem. 2007 79 4083
29. G. Shui A. K. Bendt K. Pethe T. Dick M. R. Wenk J. Lipid Res. 2007 48 1976
30. L. Yetukuri K. Ekroos A. Vidal-Puig M. Oresic Mol. BioSyst. 2008 4 121
31. A. H. Merrill, Jr. M. C. Sullards J. C. Allegood S. Kelly E. Wang Methods 2005 36 207
32. M. C. Sullards E. Wang Q. Peng A. H. Merrill, Jr. Cell Mol. Biol. (Noisy-le-Grand, France) 2003 49 789
33. Q. Zhang H. K. Chieu C. P. Low S. Zhang C. K. Heng H. Yang J. Biol. Chem. 2003 278 47145
34. H. L. Callender J. S. Forrester P. Ivanova A. Preininger S. Milne H. A. Brown Anal. Chem. 2007 79 263
35. A. M. McAnoy C. C. Wu R. C. Murphy J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005 16 1498
36. K. L. Low P. S. Srinivasa Rao G. Shui A. K. Bendt K. Pethe T. Dick M. R. Wenk J. Bacteriol. 2009
37. R. Koffel R. Tiwari L. Falquet R. Schneiter Mol. Cell. Biol. 2005 25 1655
38. K. Athenstaedt G. Daum J. Biol. Chem. 2003 278 23317
39. P. Oelkers D. Cromley M. Padamsee J. T. Billheimer S. L. Sturley J. Biol. Chem. 2002 277 8877
40. Y. L. Li X. Su P. D. Stahl M. L. Gross Anal. Chem. 2007 79 1569
41. D. S. Yeo R. Chan G. Brown L. Ying R. Sutejo J. Aitken B. H. Tan M. R. Wenk R. J. Sugrue Virology 2009 386 168
42. G. Haemmerle A. Lass R. Zimmermann G. Gorkiewicz C. Meyer J. Rozman G. Heldmaier R. Maier C. Theussl S. Eder D. Kratky E. F. Wagner M. Klingenspor G. Hoefler R. Zechner Science 2006 312 734
43. R. Zechner P. C. Kienesberger G. Haemmerle R. Zimmermann A. Lass J. Lipid Res. 2009 50 3
44. H. Du T. L. Cameron S. J. Garger G. P. Pogue L. A. Hamm E. White K. M. Hanley G. A. Grabowski J. Lipid Res. 2008 49 1646
45. M. Adiels M. R. Taskinen J. Boren Current Diabetes Reports 2008 8 60
46. M. Adiels J. Boren M. J. Caslake P. Stewart A. Soro J. Westerbacka B. Wennberg S. O. Olofsson C. Packard M. R. Taskinen Arterioscler., Thromb., Vasc. Biol. 2005 25 1697
47. R. M. Krauss P. W. Siri Endocrinol. Metab. Clin. North Am. 2004 33 405
48. A. M. Gotto, Jr. Am. J. Cardiol. 1995 76 3A
49. P. V. Gopalacharyulu V. R. Velagapudi E. Lindfors E. Halperin M. Oresic Mol. BioSyst. 2009 5 276
50. P. J. Espenshade A. L. Hughes Annu. Rev. Genet. 2007 41 401
51. S. Zhang J. Ren H. Li Q. Zhang J. S. Armstrong A. L. Munn H. Yang Traffic 2004 5 1017
52. M. J. Sharman G. Shui A. Z. Fernandis W. L. Lim T. Berger E. Hone K. Taddei I. J. Martins J. Ghiso J. Buxbaum S. Gandy M. R. Wenk R. N. Martins J. Alzheimers Dis. 2010