Microhydration of 9-methylguanine:1-methylcytosine base pair and its radical anion: A density functional theory study

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 12, Issue 6, 2010, Pages 1253-1263

  Chen, Hsing Yin ^a   Hsu, Sodio C N ^a   Kao, Chai Lin ^a  

^a KAOHSIUNG MEDICAL UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

1 METHYLCYTOSINE; 1-METHYLCYTOSINE; 9 METHYLGUANINE; 9-METHYLGUANINE; CYTOSINE; DRUG DERIVATIVE; FREE RADICAL; GUANINE; PROTON; WATER;

ARTICLE; BASE PAIRING; CHEMISTRY; ELECTRON; QUANTUM THEORY;

BASE PAIRING; CYTOSINE; ELECTRONS; FREE RADICALS; GUANINE; PROTONS; QUANTUM THEORY; WATER;

EID: 77951908798     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b920603e     Document Type: Article

References (51)

1. P. O. Löwdin Rev. Mod. Phys. 1963 35 724 732
2. P. O. Löwdin Adv. Quantum Chem. 1966 2 213 361
3. I. Dbkowska J. Rak M. Gutowski Eur. Phys. J. D 2005 35 429 435
4. J. Gu J. Wang J. Rak J. Leszczynski Angew. Chem., Int. Ed. 2007 46 3479 3481
5. J. Florián J. Leszczyński J. Am. Chem. Soc. 1996 118 3010 3017
6. L. Gorb Y. Podolyan P. Dziekonski W. A. Sokalski J. Leszczyński J. Am. Chem. Soc. 2004 126 10119 10129
7. G. Villani Chem. Phys. 2006 324 438 446
8. G. Villani Chem. Phys. 2005 316 1 8
9. A. Kornberg and T. A. Baker, DNA Replication, W. H. Freeman, New York, 1992
10. Z. Cai M. D. Sevilla Top. Curr. Chem. 2004 237 103 127
11. C. A. M. Seidel A. Schulz M. H. M. Sauer J. Phys. Chem. 1996 100 5541 5553
12. X. Li Z. Cai M. D. Sevilla J. Phys. Chem. A 2002 106 9345 9351
13. B. Giese Annu. Rev. Biochem. 2002 71 51 70
14. S. Steenken J. P. Telo H. M. Novais L. P. J. Candeias J. Am. Chem. Soc. 1992 114 4701 4709
15. L. P. Candeias S. Steenken J. Am. Chem. Soc. 1989 111 1094 1099
16. S. Steenken Chem. Rev. 1989 89 503 520
17. X. Li Z. Cai M. D. Sevilla J. Phys. Chem. B 2001 105 10115 10123
18. J. Gu Y. Xie H. F. Schaefer J. Chem. Phys. 2007 127 155107
19. A. Kumar M. D. Sevilla J. Phys. Chem. B 2009 113 11359 11361
20. M. Harańczyk R. Bachorz J. Rak M. Gutowski D. Radisic S. T. Stokes J. M. Nilles K. H. Bowen J. Phys. Chem. B 2003 107 7889 7895
21. I. Dbkowska J. Rak M. Gutowski J. M. Nilles S. T. Stokes D. Radisic K. H. Bowen Phys. Chem. Chem. Phys. 2004 6 4351 4357
22. M. Harańczyk I. Dbkowska J. Rak M. Gutowski J. M. Nilles S. T. Stokes D. Radisic K. H. Bowen J. Phys. Chem. B 2004 108 6919 6921
23. I. Dbkowska J. Rak M. Gutowski J. M. Nilles S. T. Stokes K. H. Bowen J. Chem. Phys. 2004 120 6064 6071
24. M. Harańczyk J. Rak M. Gutowski D. Radisic S. T. Stokes K. H. Bowen J. Phys. Chem. B 2005 109 13383 13391
25. K. Mazurkiewicz M. Harańczyk P. Storoniak M. Gutowski J. Rak D. Radisic S. N. Eustis D. Wang K. H. Bowen Chem. Phys. 2007 342 215 222
26. K. Mazurkiewicz M. Harańczyk M. Gutowski J. Rak D. Radisic S. N. Eustis D. Wang K. H. Bowen J. Am. Chem. Soc. 2007 129 1216 1224
27. D. Radisic K. H. Bowen I. Dbkowska P. Storoniak J. Rak M. Gutowski J. Am. Chem. Soc. 2005 127 6443 6450
28. A. Szyperska J. Rak J. Leszczynski X. Li Y. J. Ko H. Wang K. H. Bowen J. Am. Chem. Soc. 2009 131 2663 2669
29. H. Y. Chen I. Chao ChemPhysChem 2004 5 1855 1863
30. H. Y. Chen P. Y. Young S. C. N. Hsu J. Chem. Phys. 2009 130 165101
31. H. A. Wagenknecht Angew. Chem., Int. Ed. 2003 42 2454 2460
32. T. Ito S. E. Rokita Angew. Chem., Int. Ed. 2004 43 1839 1842
33. A. K. Ghosh G. B. Schuster J. Am. Chem. Soc. 2006 128 4172 4173
34. A. Kumar M. D. Sevilla S. Suhai J. Phys. Chem. B 2008 112 5189 5198
35. A. Kumar P. C. Mishra S. Suhai J. Phys. Chem. A 2005 109 3971 3979
36. S. Kim H. F. Schaefer J. Phys. Chem. A 2007 111 10381 10389
37. C. Lee G. Fitzgerald M. Planas J. J. Novoa J. Phys. Chem. 1996 100 7398 7404
38. C. Lee C. Sosa M. Planas J. J. Novoa J. Chem. Phys. 1996 104 7081 7085
39. L. Gonzalez O. Mo M. YaCez J. Elguero J. Mol. Struct. 1996 371 1 10
40. M. Alfredsson L. OjanWe K. G. Hermansson Int. J. Quantum Chem. 1996 60 767 778
41. I. Dabkowska J. Rak M. Gutowski J. Phys. Chem. A 2002 106 7423 7433
42. J. Rak P. Skurski J. Simons M. Gutowski J. Am. Chem. Soc. 2001 123 11695 11707
43. A. Dkhissi L. Adamowicz G. Maes J. Phys. Chem. A 2000 104 2112 2119
44. B. Makiabadi H. Roohi Chem. Phys. Lett. 2008 460 72 78
45. P. N. Simões I. Reva L. M. Pedroso R. Fausto A. A. Portugal J. Phys. Chem. A 2008 112 3432 3443
46. J. C. Rienstra-Kiracofe G. S. Tschumper H. F. Schaefer Chem. Rev. 2002 102 231 282
47. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr, T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. G. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez and J. A. Pople, GAUSSIAN 03 (Revision C.02), Gaussian, Inc., Wallingford, CT, 2004
48. G. S. Hammond J. Am. Chem. Soc. 1955 77 334 338
49. B. Schneider H. M. Berman Biophys. J. 1995 69 2661 2669
50. H. Y. Chen C. L. Kao S. C. N. Hsu J. Am. Chem. Soc. 2009 131 15930 15938
51. N. A. Richardson S. S. Wesolowski H. F. Schaefer J. Am. Chem. Soc. 2002 124 10163 10170