What is adenine doing in photolyase?

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 11, 2010, Pages 4101-4106

  Acocella, Angela ^a   Jones, Garth A ^b   Zerbetto, Francesco ^a  

^a UNIVERSITY OF BOLOGNA   (Italy)

^b UNIVERSITY OF ESSEX   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BUTANE; DNA; ELECTRON TRANSITIONS; ELECTROSTATICS; GENES; HYDROCARBONS; QUANTUM THEORY; REPAIR;

ARTIFICIAL SYSTEMS; ATOMIC CHARGE; CHARGE FLOW; COFACTORS; CYCLOBUTANE RING; DNA LESIONS; ELECTRON DONORS; ELECTRON TRANSFER DYNAMICS; ELECTRON TRANSFER PROCESS; ELECTRON WAVE FUNCTIONS; ELECTROSTATIC INTERACTIONS; METHYL GROUP; PHOTOLYASES; POLARIZATION EFFECT; PYRIMIDINE BASIS; QUANTUM MECHANICAL; REPAIR MECHANISM; TIME-DEPENDENT;

DYNAMICS;

EID: 77949784440     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp101093z     Document Type: Article

References (23)

1. Carell, T.; Burgdorf, L. T.; Kundu, L. M.; Cichon, M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2001, 5, 491-498.
2. Sanear, A. Chem. Rev. 2003, 103, 2203-2237.
3. Heelis, P. F.; Hartman, R. F.; Rose, S. D. Chem. Soc. Rev. 1995, 24, 289-297.
4. Miaskiewicz, K.; Miller, J.; Cooney, M.; Osman, R. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 9156-9163.
5. Harrison, C. B.; O'Neil, L. L.; Wiest, O. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 7001-7012.
6. Song, Q.-H.; Tang, W.-J.; Ji, X.-B.; Guo, Q.-X. Chem.-Eur. J. 2007, 13, 7762-7770.
7. Borg, O. A.; Eriksson, L. A.; Durbeej, B. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 2351-2361.
8. Mees, A.; Klar, T.; Gnau, P.; Hennecke, U.; Eker, A. P. M.; Carell, T.; Essen, L.-O. Science 2004, 306, 1789-1793.
9. Kao, Y.-T.; Saxena, C.; Wang, L.; Sanear, A.; Zhong, D. Proc. Natl. Acad, Sci. U.S.A. 2005, 102, 16128-16132.
10. Antony, J.; Medvedev, D. M.; Stuchebrukhov, A. A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1057-1065.
11. Medvedev, D. M.; Stuchebrukhov, A. A. J. Theor. Biol. 2001, 122, 237-248.
12. Prytkova, T. R.; Beretan, D. N.; Skourtis, S. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 802-807.
13. Weber, S.; Möbius, K.; Richter, G.; Kay, C. W. M. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3790.
14. Case, D. A.; Darden, T. A.; Cheatham, T. E., III; Simmerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Merz, K. M.; Wang, B.; Pearlman, D. A.; Crowley, M.; Brozell, S.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Mongan, J.; Hornak, V.; Cui, G.; Beroza, P.; Schafmeister, C.; Caldwell, J. W.; Ross, W. S.; Kollman, P. A. AMBER 8; University of California: San Francisco, 2004.
15. Case, D. A.; Cheatham, T. E., III; Darden, T.; Gohlke, H.; Luo, R.; Merz, K. M., Jr.; Onufriev, A.; Simmerling, C.; Wang, B.; Woods, R. J. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1668-1688.
16. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision B05; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
17. Allen, R. E. Phys. Rev. B 1994, 50, 18629.
18. Graves, J. S.; Allen, R. E. Phys. Rev. B 1998, 58, 13627.
19. Torralva, B. R.; Allen, R. E. J. Mol. Opt. 2002, 49, 593.
20. Dou, Y. S.; Torralva, B. R.; Allen, R. E. J. Mod. Opt. 2003, 50, 2615.
21. Jones, G. A.; Acocella, A.; Zerbetto, F. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 9650-9656.
22. Jones, G. A.; Acocella, A.; Zerbetto, F. Theor. Chem. Ace 2007, 118, 99-106.
23. Acocella, A.; Jones, G. A.; Zerbetto, F. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 5164-5172.