Diffusion of α-chymotrypsin in solution-crowded media. A fluorescence recovery after photobleaching study

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 11, 2010, Pages 4028-4034

  Pastor, Isabel ^a   Vilaseca, Eudald ^a   Madurga, Sergio ^a   Garcés, Josep Lluís ^b   Cascante, Marta ^a   Mas, Francesc ^a  

^a UNIVERSITY OF BARCELONA   (Spain)

^b UNIVERSITY OF LLEIDA   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CURVE FITTING; DEXTRAN; DISKS (STRUCTURAL COMPONENTS); FLUORESCENCE; GLUCOSE; ISOMERS; MACROMOLECULES; MICROSCOPES; PHOTOBLEACHING;

ANOMALOUS DIFFUSION; CIRCULAR DISK; CONCENTRATION OF; CONFOCAL LASER SCANNING MICROSCOPE; DEXTRAN MOLECULES; DIFFUSION PROCESS; EXPERIMENTAL CONDITIONS; FLUORESCENCE RECOVERY AFTER PHOTOBLEACHING; GAUSSIAN MODEL; GAUSSIANS; HIGH CONCENTRATION; IN-VITRO; PARAMETER VARIATION; PHYSICAL PHENOMENA; SLOW DIFFUSION;

DIFFUSION;

EID: 77949783433     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp910811j     Document Type: Article

References (66)

1. Minton, A. P. J. Biol. Chem. 2001, 276, 10577.
2. Ellis, R. J. Trends. Biochem. Sci. 2001, 26, 597.
3. Ellis, R. J.; Minton, A. P. Nature 2003, 425, 27.
4. Derham, B. K.; Harding, J. J. Biochim. Biophys. Acta 2006, 1764, 1000.
5. Zhou, H. X.; Rivas, G.; Minton, A. P. Annu. Rev. Biophys. 2008, 37, 375.
6. Agrawal, M.; Santra, S. B.; Anand, R.; Swaminathan, R. PRAMANA J. Phys. 2008, 71, 359.
7. Dix, J. A.; Verkman, A. S. Annu. Rev. Biophys. 2008, 37, 247.
8. Zhou, H. X. J. Phys. Chem. B. 2009, 113, 7995.
9. Saxton, M. J. Biophys. J. 1994, 66, 394.
10. Saxton, M. J. Biophys. J. 2001, 81, 2226.
11. Isvoran, A.; Vilaseca, E.; Garcés, J. L.; Unipan, L.; Mas, F. Proceedings of the 6th Conference of Balkan Physics Union, A. I. P., Istanbul, August 22-27, 2006; 2007; Vol.889, p 469.
12. Saxton, M. J. Biophys. J. 1987, 52, 989.
13. Saxton, M. J. Biophys. J. 1990, 58, 1303.
14. Saxton, M. J. Biophys. J. 1993, 64, 1053.
15. Isvoran, A.; Vilaseca, E.; Unipan, L.; Garcés, J. L.; Mas, F. Rom. Biophys. J. 2007, 17, 21.
16. Isvoran, A.; Vilaseca, E.; Unipan, L.; Garcés, J. L.; Mas, F. Rev. Rom. Chem. 2008, 53, 415.
17. Dix, J. A.; Han, E. F. Y.; Verkman, A. S. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 1896.
18. Kao, H. P.; Abney, J. R.; Verkman, A. S. J. Cell Biol. 1993, 120, 175.
19. Olveczki, B. P.; Verkman, A. S. Biophys. J. 1998, 74, 2722.
20. Wachsmuth, M.; Waldeck, W.; Langowski, J. J. Mol. Biol. 2000, 298, 677.
21. Arrio-Dupont, M.; Foucault, G.; Vacher, M.; Devaux, P. F.; Cribier, S. Biophys. J. 2001, 78, 901.
22. Fradin, C.; Abu-Arish, A.; Granek, R.; Elbaum, M. Biophys. J. 2003, 84, 2005.
23. Banks, D. S.; Fradin, C. Biophys. J. 2005, 89, 2960.
24. Franks, F. Protein biotechnology. Isolation, characterization and stabilization; Franks, F., Ed.; Humana Press: Clifton, NJ, 1993; p 133.
25. Schwille, P.; Korlach, J.; Webb, W. W. Cytrometry 1999, 36, 176.
26. Fatin-Rouge, N.; Milon, A.; Buffle, J.; Goulet, R. R.; Tessier, A. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 12126.
27. Weiss, M.; Elsner, M.; Kartberg, F.; Nilsson, T. Biophys. J. 2004, 87, 3518.
28. Szymański, J.; Patkowki, A.; Gapiński, J.; Wilk, A.; Holyst, R. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 7367.
29. Sanabria, H.; Kinbota, Y.; Waxham, M. N. Biophys. J. 2007, 92, 313.
30. Reitan, N. K.; Juthajan, A.; Lindmo, T.; de Lange Davias, C. J. Biomol. Opt. 2008, 13, 054040.
31. Cherdhirakorn, T.; Best, A.; Koynov, A.; Peneva, K.; Muellen, K.; Fytas, G. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 3355.
32. Feder, T. J.; Brust-Mascher, I.; Slattery, J. P.; Baird, B.; Webb, W. W. Biophys. J. 1996, 70, 2767.
33. Periasamy, N.; Verkman, A. S. Biophys. J. 1998, 75, 557.
34. Pyenta, P. S.; Schwille, P.; Webb, W. W.; Holowka, D.; Baird, B. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 8310.
35. Ratto, T. V.; Longo, M. L. Langmuir 2003, 19, 1788.
36. Dunham, S. M.; Pudavar, H. E.; Prasad, P. N.; Stachowiak, M. K. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 10540.
37. Heitzman, C. E.; Tu, H.; Braun, P. V. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 13764.
38. Pucadyil, T. J.; Chattopadhyay, A. J. Fluorescence 2006, 16, 87.
39. Pujalyil, T. J.; Mukherjee, S.; Chattopadhyay, A. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 1975.
40. Lukelski, A.; Klafter, J. Biophys. J. 2009, 96, 2055.
41. Braga, J.; Desterro, J. M. P.; Carmo-Fonseca, M. Mol. Biol. Cell 2004, 15, 4749.
42. Axelrod, D.; Koppel, D. E.; Schlessinger, J.; Elson, E.; Webb, W. W. Biophys. J. 1976, 16, 1055.
43. Blonk, J. C. G.; Don, A.; Aalst, H. V.; Birmingham, J. J. J. Microsc. 1992, 169, 363.
44. Kubitscheck, U.; Wedekind, P.; Peters, R. Biophys. J. 1994, 67, 948.
45. Braeckmans, K.; Peeters, L.; Sanders, N. N.; De Smedt, S. C.; Demeester, J. Biophys. J. 2003, 85, 2240.
46. Sprague, B. L.; Pego, R. L.; Stavreva, D. A.; McNally, J. G. Biophys. J. 2004, 86, 3473.
47. Soumpasis, D. M. Biophys. J. 1983, 41, 95.
48. Kang, M.; Day, A. C.; Drake, K.; Kenworthy, A. K.; DiBenedetto, E. Biophys. J. 2009, 97, 1501.
49. Fundueanu, G.; Nastruzzi, C.; Carpov, A.; Desbrieres, J.; Rinaudo, M. Biomaterials 1999, 20, 1427.
50. Schaefer, D. W.; Martin, J. E.; Wiltzius, P.; Cannell, D. S. Phys. Rev. Lett. 1984, 52, 2371.
51. Diehl, H.; Horchak-Morris, N. Talanta 1987, 34, 739.
52. Bouchaud, J. P.; Georges, A. Phys. Rep. 1990, 185, 127.
53. Metzler, R.; Klafter, J. Phys. Rep. 2000, 339, 1.
54. Havlin, S.; Ben-Avraham, D. Adv. Phys. 1987, 36, 695.
55. Almedia, P.; Vaz, W. Lateral diffusion in membranes. In Handbook of Biological Physics; Lipowsky, R., Sackmann, E., Eds.; Elsevier: New York, 1995; p 305.
56. Saxton, M. J. Biophys. J. 2007, 92, 1178.
57. Saxton, M. J. Biophys. J. 1996, 70, 1250.
58. Yguerabide, J.; Schimidt, J. A.; Yguerabide, E. E. Biophys. J. 1982, 39, 69.
59. Elson, E. L. Annu. Rev. Phys. Chem. 1985, 36, 379.
60. Lide, D. R. CRC Handbook of chemistry and physics, 89th ed. ; CRC Press: Boca Raton, FL, 2008.
61. Rao, M. S. N.; Kegeles, G. J. Am. Chem. Soc. 1658, 80, 5724.
62. Winzor, D. J.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. 1964, 68, 338.
63. Aune, K. C.; Goldsmith, L. C.; Timasheff, S. N. Biochemistry 1971, 10, 1617.
64. Patel, C. N.; Noble, S. M.; Weatherly, G. T.; Tripathy, A.; Winzor, D. J.; Pielak, G. J. Protein Sci. 2002, 11, 997.
65. Verkman, A. S. Trends Biochem. Sci. 2002, 27, 27.
66. loan, C. E.; Aberle, T.; Burchard, W. Macromolecules 2000, 33, 5730.