ATP hydrolysis analysis of severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus helicase

Bulletin of the Korean Chemical Society

Volumn 30, Issue 8, 2009, Pages 1724-1728

  Lee, Na Ra ^a   Lee, A Ram ^a   Lee, Bokhui ^b   Kim, Dong Eun ^b   Jeong, Yong Joo ^a  

^a Kookmin University   (South Korea)

^b Konkuk University   (South Korea)

Author keywords

ATP hydrolysis; Divalent cations; pH Dependence profile; Severe acute respiratory syndrome coronavirus helicase; Single stranded nucleic acids

Indexed keywords

ATP HYDROLYSIS; DIVALENT CATION; HELICASES; PH-DEPENDENCE; SEVERE ACUTE RESPIRATORY SYNDROME CORONAVIRUS; SINGLE-STRANDED NUCLEIC ACIDS;

BIOMOLECULES; DNA; GENES; MANGANESE; MANGANESE COMPOUNDS; NUCLEIC ACIDS; POSITIVE IONS;

HYDROLYSIS;

EID: 75649149117     PISSN: 02532964     EISSN: 12295949     Source Type: Journal    
DOI: 10.5012/bkcs.2009.30.8.1724     Document Type: Article

References (33)

1. Patel, S.S.; Picha, K.M. Annu. Rev. Biochem. 2000, 69, 651.
2. Patel, S.S.; Donmez, I. J. Biol. Chem. 2006, 281, 18265.
3. Lohman, T.M.; Bjornson, K.P. Annu. Rev. Biochem. 1996, 65, 169.
4. Ellis, N.A.; Groden, J.; Ye, T.Z.; Straughen, J.; Lennon, D.J.; Ciocci, S.; Proytcheva, M.; German, J. Cell 1995, 83, 655.
5. Yu, C.E.; Oshima, J.; Fu, Y.H.; Wijsman, E.M.; Hisama, F.; Alisch, R.; Matthews, S.; Nakura, J.; Miki, T.; Ouais, S.; Martin, G.M.; Mulligan, J.; Schellenberg, G.D. Science 1996, 272, 258.
6. Gray, M.D.; Shen, J.C.; Kamath-Loeb, A.S.; Blank, A.; Sopher, B.L.; Martin, G.M.; Oshima, J.; Loeb, L.A. Nature Genet. 1997, 17, 100.
7. Marra, M.A.; Jones, S.J.; Astell, C.R.; Holt, R.A.; Brooks-Wilson, A.; Butterfield, Y.S.; Khattra, J.; Asano, J.K.; Barber, S.A.; Chan, S.Y.; Cloutier, A.; Coughlin, S.M.; Freeman, D.; Girn, N.; Griffith, O.L.; Leach, S.R.; Mayo, M.; McDonald, H.; Montgomery, S.B.; Pandoh, P.K.; Petrescu, A.S.; Robertson, A.G.; Schein, J.E.; Siddiqui, A.; Smailus, D.E.; Stott, J.M.; Yang, G.S.; Plummer, F.; Andonov, A.; Artsob, H.; Bastien, N.; Bernard, K.; Booth, T.F.; Bowness, D.; Czub, M.; Drebot, M.; Fernando, L.; Flick, R.; Garbutt, M.; Gray, M.; Grolla, A.; Jones, S.; Feldmann, H.; Meyers, A.; Kabani, A.; Li, Y.; Normand, S.; Stroher, U.; Tipples, G.A.; Tyler, S.; Vogrig, R.; Ward, D.; Watson, B.; Brunham, R.C.; Krajden, M.; Petric, M.; Skowronski, D.M.; Upton, C.; Roper, R.L. Science 2003, 300, 1399.
8. Rota, P.A.; Oberste, M.S.; Monroe, S.S.; Nix, W.A.; Campagnoli, R.; Icenogle, J.P.; Penaranda, S.; Bankamp, B.; Maher, K.; Chen, M.H.; Tong, S.; Tamin, A.; Lowe, L.; Frace, M.; DeRisi, J.L.; Chen, Q.; Wang, D.; Erdman, D.D.; Peret, T.C.; Burns, C.; Ksiazek, T.G.; Rollin, P.E.; Sanchez, A.; Liffick, S.; Holloway, B.; Limor, J.; McCaustland, K.; Olsen-Rasmussen, M.; Fouchier, R.; Gunther, S.; Osterhaus, A.D.; Drosten, C.; Pallansch, M.A.; Anderson, L.J.; Bellini, W.J. Science 2003, 300, 1394.
9. Ziebuhr, J. Curr. Opin. Microbiol. 2004, 7, 412.
10. Holmes, K.V. J. Clin. Invest. 2003, 111, 1605.
11. Anand, K.; Ziebuhr, J.; Wadhwani, P.; Mesters, J.R.; Hilgenfeld, R. Science 2003, 300, 1763.
12. Kwong, A.D.; Rao, B.G.; Jeang, K.T. Nat. Rev. Drug. Discov. 2005, 4, 845.
13. Yang, N.; Tanner, J.A.; Wang, Z.; Huang, J.D.; Zheng, B.J.; Zhu, N.; Sun, H. Chem. Commun. (Camb) 2007, 42, 4413.
14. Yang, N.; Tanner, J.A.; Zheng, B.J.; Watt, R.M.; He, M.L.; Lu, L.Y.; Jiang, J.Q.; Shum, K.T.; Lin, Y.P.; Wong, K.L.; Lin, M.C.; Kung, H.F.; Sun, H.; Huang, J.D. Angew. Chem. Int. Ed.Engl. 2007, 46, 6464.
15. Tanner, J.A.; Zheng, B.J.; Zhou, J.; Watt, R.M.; Jiang, J.Q.; Wong, K.L.; Lin, Y.P.; Lu, L.Y.; He, M.L.; Kung, H.F.; Kesel, A.J.; Huang, J.D. Chem. Biol. 2005, 12, 303.
16. Lee, C.; Lee, J.M.; Lee, N.R.; Jin, B.S.; Jang, K.J.; Kim, D.E.; Jeong, Y.J.; Chong, Y. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 1636.
17. Shum, K.T.; Tanner, J.A. Chembiochem. 2008, 9, 3037.
18. Jang, K.J.; Lee, N.R.; Yeo, W.S.; Jeong, Y.J.; Kim, D.E. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008, 366, 738.
19. Levin, M.K.; Patel, S.S. J. Biol. Chem. 2002, 277, 29377.
20. Jeong, Y.J.; Kim, D.E.; Patel, S.S. J. Biol. Chem. 2004, 279, 18370.
21. Sambrook, J.; Fritsch, E.F.; Maniatis, T. In Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Second ed.; Ford, N.; Nolan, C.; Ferguson, M., Eds.; Cold Spring Harbor Laboratorty Press: 1989.
22. Piper, J.M.; Lovell, S. J. Anal. Biochem. 1981, 117, 70.
23. Tanner, J.A.; Watt, R.M.; Chai, Y.B.; Lu, L.Y.; Lin, M.C.; Peiris, J.S.; Poon, L.L.; Kung, H.F.; Huang, J.D. J. Biol. Chem. 2003, 278, 39578.
24. Washington, M.T.; Rosenberg, A.H.; Griffin, K.; Studier, F.W.; Patel, S.S. J. Biol. Chem. 1996, 271, 26825.
25. Patel, S.S.; Rosenberg, A.H.; Studier, F.W.; Johnson, K.A. J. Biol. Chem. 1992, 267, 15013.
26. Matson, S.W.; Richardson, C.C. J. Biol. Chem. 1983, 258, 14009.
27. Kadare G.; Haenni, A.L. J. Virol. 1997, 71, 2583.
28. Pang, P.S.; Jankowsky, E.; Planet, P.J.; Pyle, A.M. EMBO J. 2002, 21, 1168.
29. Jeong, Y.J.; Kim, D.E.; Patel, S.S. J. Biol. Chem. 2002, 277, 43778.
30. Levin, M.K.; Patel, S.S. J. Biol. Chem. 1999, 274, 31839.
31. Rajendran, S.; Jezewska, M.J.; Bujalowski, W. J. Mol. Biol. 2000, 303, 773.
32. Hoffmann, M.; Eitner, K.; von Grotthuss, M.; Rychlewski, L.; Banachowicz, E.; Grabarkiewicz, T.; Szkoda, T.; Kolinski, A. J. Comput. Aided Mol. Des. 2006, 20, 305.
33. Soultanas, P.; Dillingham, M.S.; Velankar, S.S.; Wigley, D.B. J. Mol. Biol. 1999, 290, 137.