-
2
-
-
33749864323
-
-
Bemporad, F.; Galloni, G.; Campioni, S.; Plakoutsi, G.; Taddei, N.; Chiti, F. Acc. Chem. Res. 2006, 39, 620-627.
-
(2006)
Acc. Chem. Res.
, vol.39
, pp. 620-627
-
-
Bemporad, F.1
Galloni, G.2
Campioni, S.3
Plakoutsi, G.4
Taddei, N.5
Chiti, F.6
-
4
-
-
34548762001
-
-
Harrison, R. S.; Sharpe, P. C.; Singh, Y.; Fairlie, D. P. Rev. Physiol. Biochem. Pharmacol. 2007, 159, 1-77.
-
(2007)
Rev. Physiol. Biochem. Pharmacol.
, vol.159
, pp. 1-77
-
-
Harrison, R.S.1
Sharpe, P.C.2
Singh, Y.3
Fairlie, D.P.4
-
7
-
-
84906366196
-
-
Colombo, G.; Soto, P.; Gazit, E. Trends Biotechnol. 2007, 25, 211218.
-
(2007)
Trends Biotechnol.
, vol.25
, pp. 211218
-
-
Colombo, G.1
Soto, P.2
Gazit, E.3
-
8
-
-
34347403046
-
-
Chockalingam, K.; Blenner, M.; Banta, S. Protein Eng., Des. Sel. 2007, 20, 155-161.
-
(2007)
Protein Eng., Des. Sel.
, vol.20
, pp. 155-161
-
-
Chockalingam, K.1
Blenner, M.2
Banta, S.3
-
9
-
-
13244260999
-
-
Papanikolopoulou, K.; Schoehn, G.; Forge, V.; Forsyth, V. T.; Riekel, C.; Hernandez, J. F.; Ruigrok, R. W. H.; Mitraki, A. J. Biol. Chem. 2005, 280, 2481-2490.
-
(2005)
J. Biol. Chem.
, vol.280
, pp. 2481-2490
-
-
Papanikolopoulou, K.1
Schoehn, G.2
Forge, V.3
Forsyth, V.T.4
Riekel, C.5
Hernandez, J.F.6
Ruigrok, R.W.H.7
Mitraki, A.8
-
10
-
-
34249290108
-
-
Sawaya, M. R.; Sambashivan, S.; Nelson, R.; Ivanova, M. I.; Sievers, S. A.; Apostol, M. I.; Thompson, M. J.; Balbirnie, M.; Wiltzius, J. J. W.; McFarlane, H. T.; Madsen, A. O.; Riekel, C.; Eisenberg, D. Nature 2007, 447, 453-457.
-
(2007)
Nature
, vol.447
, pp. 453-457
-
-
Sawaya, M.R.1
Sambashivan, S.2
Nelson, R.3
Ivanova, M.I.4
Sievers, S.A.5
Apostol, M.I.6
Thompson, M.J.7
Balbirnie, M.8
Wiltzius, J.J.W.9
McFarlane, H.T.10
Madsen, A.O.11
Riekel, C.12
Eisenberg, D.13
-
11
-
-
84906364557
-
-
Knowles, T. P.; Fitzpatrick, A. W.; Meehan, S.; Mott, H. R.; Vendruscolo, M.; Dobson, C. M.; Welland, M. E. Science 2007, 318, 19001903.
-
(2007)
Science
, vol.318
, pp. 19001903
-
-
Knowles, T.P.1
Fitzpatrick, A.W.2
Meehan, S.3
Mott, H.R.4
Vendruscolo, M.5
Dobson, C.M.6
Welland, M.E.7
-
12
-
-
34347234780
-
-
Mesquida, P.; Riener, C. K.; MacPhee, C. E.; McKendry, R. A. J. Mater. Sci. Mater. Med. 2007, 18, 1325-1331.
-
(2007)
J. Mater. Sci. Mater. Med.
, vol.18
, pp. 1325-1331
-
-
Mesquida, P.1
Riener, C.K.2
MacPhee, C.E.3
McKendry, R.A.4
-
13
-
-
1542686314
-
-
Zanuy, D.; Porat, Y.; Gazit, E.; Nussinov, R. Structure 2004, 12, 439-455.
-
(2004)
Structure
, vol.12
, pp. 439-455
-
-
Zanuy, D.1
Porat, Y.2
Gazit, E.3
Nussinov, R.4
-
17
-
-
10844230140
-
-
Cecchini, M.; Rao, F.; Seeber, M.; Caflisch, A. J. Chem. Phys. 2004, 121, 10748-10756.
-
(2004)
J. Chem. Phys.
, vol.121
, pp. 10748-10756
-
-
Cecchini, M.1
Rao, F.2
Seeber, M.3
Caflisch, A.4
-
18
-
-
2942707921
-
-
Paci, E.; Gsponer, J.; Salvatella, X.; Vendruscolo, M. J. Mol. Biol. 2004, 340, 555-569.
-
(2004)
J. Mol. Biol.
, vol.340
, pp. 555-569
-
-
Paci, E.1
Gsponer, J.2
Salvatella, X.3
Vendruscolo, M.4
-
19
-
-
35748943830
-
-
Pellarin, R.; Guarnera, E.; Caflisch, A. J. Mol. Biol. 2007, 374, 917-924.
-
(2007)
J. Mol. Biol.
, vol.374
, pp. 917-924
-
-
Pellarin, R.1
Guarnera, E.2
Caflisch, A.3
-
20
-
-
33846036362
-
-
Nguyen, P. H.; Li, M. S.; Stock, G.; Straub, J. E.; Thirumalai, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 111.
-
(2007)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.104
, pp. 111
-
-
Nguyen, P.H.1
Li, M.S.2
Stock, G.3
Straub, J.E.4
Thirumalai, D.5
-
22
-
-
44149101188
-
-
Tarus, B.; Straub, J. E.; Thirumalai, D. J. Mol. Biol. 2008, 379, 815-829.
-
(2008)
J. Mol. Biol.
, vol.379
, pp. 815-829
-
-
Tarus, B.1
Straub, J.E.2
Thirumalai, D.3
-
23
-
-
46449133376
-
-
Song, W.; Wei, G.; Mousseau, N.; Derreumaux, P. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 4410-4418.
-
(2008)
J. Phys. Chem. B
, vol.112
, pp. 4410-4418
-
-
Song, W.1
Wei, G.2
Mousseau, N.3
Derreumaux, P.4
-
25
-
-
68949088198
-
-
Tamamis, P.; Adler-Abramovich, L.; Reches, M.; Marshall, K.; Sikorski, P.; Serpell, L.; Gazit, E.; Archontis, G. Biophys. J. 2009, 96, 5020-5029.
-
(2009)
Biophys. J.
, vol.96
, pp. 5020-5029
-
-
Tamamis, P.1
Adler-Abramovich, L.2
Reches, M.3
Marshall, K.4
Sikorski, P.5
Serpell, L.6
Gazit, E.7
Archontis, G.8
-
26
-
-
33845648118
-
-
Mitraki, A.; Papanikolopoulou, K.; van Raaij, M. J. Adv. Protein Chem. 2006, 73, 97-124.
-
(2006)
Adv. Protein Chem.
, vol.73
, pp. 97-124
-
-
Mitraki, A.1
Papanikolopoulou, K.2
Van Raaij, M.J.3
-
27
-
-
0033613385
-
-
van Raaj, M. J.; Mitraki, A.; Lavigne, G.; Cusack, S. Nature 1999, 401, 935-938.
-
(1999)
Nature
, vol.401
, pp. 935-938
-
-
Van Raaj, M.J.1
Mitraki, A.2
Lavigne, G.3
Cusack, S.4
-
29
-
-
4143062581
-
-
Papanikolopoulou, K.; Teixeria, S.; Belrhali, H.; Forsyth, V. T.; Mitraki, A.; van Raaij, M. J. J. Mol. Biol. 2004, 342, 219-227
-
(2004)
J. Mol. Biol.
, vol.342
, pp. 219-227
-
-
Papanikolopoulou, K.1
Teixeria, S.2
Belrhali, H.3
Forsyth, V.T.4
Mitraki, A.5
Van Raaij, M.J.6
-
30
-
-
0033956104
-
-
Luckey, M.; Hernandez, J.-F.; Arlaud, G.; Forsyth, V. T.; Ruigrok, R. W. H.; Mitraki, A. FEBS Lett. 2000, 468, 23-27.
-
(2000)
FEBS Lett.
, vol.468
, pp. 23-27
-
-
Luckey, M.1
Hernandez, J.-F.2
Arlaud, G.3
Forsyth, V.T.4
Ruigrok, R.W.H.5
Mitraki, A.6
-
34
-
-
1642546396
-
-
Nymeyer, H.; Gnanakaran, S.; Garcia, A. E. Methods Enzymol. 2004, 30, 119-149.
-
(2004)
Methods Enzymol.
, vol.30
, pp. 119-149
-
-
Nymeyer, H.1
Gnanakaran, S.2
Garcia, A.E.3
-
38
-
-
67549138051
-
-
Kasotakis, E.; Mossou, E.; Adler-Abramovich, L.; Mitchell, E. P.; Forsyth, V. T.; Gazit, E.; Mitraki, A. Biopolymers 2009, 92, 164-172.
-
(2009)
Biopolymers
, vol.92
, pp. 164-172
-
-
Kasotakis, E.1
Mossou, E.2
Adler-Abramovich, L.3
Mitchell, E.P.4
Forsyth, V.T.5
Gazit, E.6
Mitraki, A.7
-
39
-
-
0041784950
-
-
MacKerrell, A. D. Jr.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; JosephMcCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. K. T.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E. III.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616.
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3586-3616
-
-
MacKerrell Jr., A.D.1
Bashford, D.2
Bellott, M.3
Dunbrack, R.L.4
Evanseck, J.D.5
Field, M.J.6
Fischer, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Josephmccarthy, D.11
Kuchnir, L.12
Kuczera, K.13
Lau, F.K.T.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
Reiher III, W.E.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.C.23
Stote, R.24
Straub, J.25
Watanabe, M.26
Wiorkewicz-Kuczera, J.27
Yin, D.28
Karplus, M.29
more..
-
40
-
-
33646940952
-
-
Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1997, 23, 327-341.
-
(1997)
J. Comput. Phys.
, vol.23
, pp. 327-341
-
-
Ryckaert, J.P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, H.J.C.3
-
41
-
-
67650500988
-
-
Brooks, B. R.; Brooks, C. L. III; Mackerell, A. D. Jr.; Nilsson, L.; Petrella, R. J.; Roux, B.; Won, Y.; Archontis, G.; Bartels, C.; Boresch, S.; Caflisch, A.; Caves, L.; Cui, Q.; Dinner, A. R.; Feig, M.; Fischer, S.; Gao, J.; Hodoscek, M.; Im, W.; Kuczera, K.; Lazaridis, T.; Ma, J.; Ovchinnikov, V.; Paci, E.; Pastor, R. W.; Post, C. B.; Pu, J. Z.; Schaefer, M.; Tidor, B.; Venable, R. M.; Woodcock, H. L.; Wu, X.; Yang, W.; York, D. M.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 2009, 30, 1545-1614.
-
(2009)
J. Comput. Chem.
, vol.30
, pp. 1545-1614
-
-
Brooks, B.R.1
Brooks III, C.L.2
Mackerell Jr., A.D.3
Nilsson, L.4
Petrella, R.J.5
Roux, B.6
Won, Y.7
Archontis, G.8
Bartels, C.9
Boresch, S.10
Caflisch, A.11
Caves, L.12
Cui, Q.13
Dinner, A.R.14
Feig, M.15
Fischer, S.16
Gao, J.17
Hodoscek, M.18
Im, W.19
Kuczera, K.20
Lazaridis, T.21
Ma, J.22
Ovchinnikov, V.23
Paci, E.24
Pastor, R.W.25
Post, C.B.26
Pu, J.Z.27
Schaefer, M.28
Tidor, B.29
Venable, R.M.30
Woodcock, H.L.31
Wu, X.32
Yang, W.33
York, D.M.34
Karplus, M.35
more..
-
43
-
-
0004072342
-
-
Cambridge University Press: Cambridge, England
-
Chandrasekhar, S. Liquid Crystals; Cambridge University Press: Cambridge, England, 1992.
-
(1992)
Liquid Crystals
-
-
Chandrasekhar, S.1
-
46
-
-
2342425471
-
-
Berardi, R.; Muccioli, L.; Zannoni, C. ChemPhysChem. 2004, 5, 104-111.
-
(2004)
ChemPhysChem.
, vol.5
, pp. 104-111
-
-
Berardi, R.1
Muccioli, L.2
Zannoni, C.3
-
50
-
-
0036334192
-
-
Doerr, T. P.; Heman, D.; Mathur, H.; Taylor, P. L. Europhys. Lett. 2002, 59, 398-402.
-
(2002)
Europhys. Lett.
, vol.59
, pp. 398-402
-
-
Doerr, T.P.1
Heman, D.2
Mathur, H.3
Taylor, P.L.4
-
51
-
-
35748935079
-
-
Seeber, M.; Cecchini, M.; Rao, F.; Settanni, G.; Caflisch, A. Bioinformatics 2007, 23, 2625-2627.
-
(2007)
Bioinformatics
, vol.23
, pp. 2625-2627
-
-
Seeber, M.1
Cecchini, M.2
Rao, F.3
Settanni, G.4
Caflisch, A.5
-
52
-
-
3142714765
-
-
Mackerell, A. D. Jr.; Feig, M.; Brooks, C. L., III. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1400-1415.
-
(2004)
J. Comput. Chem.
, vol.25
, pp. 1400-1415
-
-
Mackerell Jr., A.D.1
Feig, M.2
Brooks III, C.L.3
-
53
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935.
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
54
-
-
0000036869
-
-
Neria, E.; Fischer, S.; Karplus, M. J. Chem. Phys. 1996, 105, 19021921.
-
(1996)
Chem. Phys.
, vol.105
, pp. 19021921
-
-
Neria, E.1
Fischer, S.2
Karplus, M.J.3
-
55
-
-
33846823909
-
-
Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092.
-
(1993)
J. Chem. Phys.
, vol.98
, pp. 10089-10092
-
-
Darden, T.1
York, D.2
Pedersen, L.3
-
57
-
-
36449007836
-
-
Feller, S.; Zhang, Y.; Pastor, R. W.; Brooks, B. J. Chem. Phys. 1995, 103, 4613-4621.
-
(1995)
J. Chem. Phys.
, vol.103
, pp. 4613-4621
-
-
Feller, S.1
Zhang, Y.2
Pastor, R.W.3
Brooks, B.4
-
58
-
-
25844466604
-
-
Tartaglia, G.; Cavalli, G. A.; Pellarin, R.; Caflisch, A. Protein Sci. 2005, 14, 2723-2734.
-
(2005)
Protein Sci.
, vol.14
, pp. 2723-2734
-
-
Tartaglia, G.1
Cavalli, G.A.2
Pellarin, R.3
Caflisch, A.4
-
59
-
-
33644821609
-
-
Cecchini, M.; Curcio, R.; Pappalardo, M.; Melki, R.; Caflisch, A. J. Mol. Biol. 2006, 357, 1306-1321.
-
(2006)
J. Mol. Biol.
, vol.357
, pp. 1306-1321
-
-
Cecchini, M.1
Curcio, R.2
Pappalardo, M.3
Melki, R.4
Caflisch, A.5
-
60
-
-
2542542833
-
-
Kajava, A. V.; Baxa, U.; Wickner, R. B.; Steven, A. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 7885-7890.
-
(2004)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.101
, pp. 7885-7890
-
-
Kajava, A.V.1
Baxa, U.2
Wickner, R.B.3
Steven, A.C.4
-
61
-
-
16244376187
-
-
Kajava, A. V.; Aebi, U.; Steven, A. C. J. Mol. Biol. 2005, 348, 247-252.
-
(2005)
J. Mol. Biol.
, vol.348
, pp. 247-252
-
-
Kajava, A.V.1
Aebi, U.2
Steven, A.C.3
-
62
-
-
40049108280
-
-
Koo, B. W.; Hebda, J. A.; Miranker, A. D. Protein Eng. Des. Sel. 2008, 21, 147-154.
-
(2008)
Protein Eng. Des. Sel.
, vol.21
, pp. 147-154
-
-
Koo, B.W.1
Hebda, J.A.2
Miranker, A.D.3
-
63
-
-
20444440728
-
-
Nelson, R.; Sawaya, M. R.; Balbirnie, M.; Madsen, A. Ø.; Riekel, C.; Grothe, R.; Eisenberg, D. Nature 2005, 435, 773-778.
-
(2005)
Nature
, vol.435
, pp. 773-778
-
-
Nelson, R.1
Sawaya, M.R.2
Balbirnie, M.3
Madsen, A.Ø.4
Riekel, C.5
Grothe, R.6
Eisenberg, D.7
|