GFP: From jellyfish to the Nobel prize and beyond

Chemical Society Reviews

Volumn 38, Issue 10, 2009, Pages 2823-2832

  Zimmer, Marc ^a  

^a Connecticut College   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 70349328443     PISSN: 03060012     EISSN: 14604744     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b904023d     Document Type: Article

References (89)

1. S. H. D. Haddock, C. M. McDougall and J. F. Case, “The Bioluminescence Web Page”, http://lifesci.ucsb.edu/∼biolum
2. Y. Haneda, H. Sie, Y. Masuda, I. Takatsuki, N. Sugiyama, Y. Saiga, F. H. Johnson, O. Shimomura, J. Cell. Comp. Physiol. 1961, 57, 55-62
3. A. A. Green, W. D. McElroy, Biochim. Biophys. Acta 1956, 20, 170-176
4. O. Shimomura, F. H. Johnson, Y. Saiga, J. Cell. Comp. Physiol. 1962, 59, 223-229
5. D. Davenport, J. A. C. Nicol, Proc. R. Soc. London, Ser. B 1955, 144, 399-411
6. O. Shimomura, J. Microsc. (Oxford) 2005, 217, 3-15
7. J. G. Morin, J. W. Hastings, J. Cell. Physiol. 1971, 77, 313-318
8. H. Morise, O. Shimomura, F. H. Johnson, J. Winant, Biochemistry 1974, 13, 2656-2662
9. J. W. Hastings, J. G. Morin, Biol. Bull. 1969, 137, 402
10. O. Shimomura, Biol. Bull. 1995, 189, 1-5
11. J. F. Head, S. Inouye, K. Teranishi, O. Shimomura, Nature 2000, 405, 372-376
12. W. W. Ward, C. W. Cody, R. C. Hart, M. J. Cormier, Photochem. Photobiol. 1980, 31, 611-615
13. O. Shimomura, FEBS Lett. 1979, 104, 220-222
14. C. W. Cody, D. C. Prasher, W. M. Westler, F. G. Prendergast, W. W. Ward, Biochemistry 1993, 32, 1212-1218
15. M. Ormoe, A. B. Cubitt, K. Kallio, L. A. Gross, R. Y. Tsien, S. J. Remington, Science 1996, 273, 1392-1395
16. F. Yang, L. G. Moss, G. N. Phillips, Nat. Biotechnol. 1996, 14, 1246-1251
17. M. Zimmer, Glowing Genes: A Revolution in Biotechnology, Prometheus Books, Amherst, N.Y. 2005
18. D. Prasher, R. O. McCann, M. J. Cormier, Biochem. Biophys. Res. Commun. 1985, 126, 1259-1268
19. M. Cormier, ASP News 2008, 39, 4-5
20. D. C. Prasher, V. K. Eckenrode, W. W. Ward, F. G. Prendergast, M. J. Cormier, Gene 1992, 111, 229-233
21. M. Zimmer, in The Providence Journal, 2008, http://www.projo.com/opinion/contributors/content/CT_zimmer22_10-22-08_EPBUEM2_v10.3e26e8e.html
22. M. Chalfie, Y. Tu, G. Euskirchen, W. W. Ward, D. C. Prasher, Science 1994, 263, 802-805
23. S. X. Wang, T. Hazelrigg, Nature 1994, 369, 400-403
24. R. Heim, D. C. Prasher, R. Y. Tsien, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994, 91, 12501-12504
25. K. Brejc, T. K. Sixma, P. A. Kitts, S. R. Kain, R. Y. Tsien, M. Ormo, S. J. Remington, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1997, 94, 2306-2311
26. R. Heim, A. Cubitt, R. Y. Tsien, Nature 1995, 373, 663-664
27. A. B. Cubitt, R. Heim, S. R. Adams, A. E. Boyd, L. A. Gross, R. Y. Tsien, Trends Biochem. Sci. 1995, 20, 448-455
28. M. A. Perozzo, K. B. Ward, R. B. Thompson, W. W. Ward, J. Biol. Chem. 1988, 263, 7713-7716
29. R. M. Wachter, M. A. Elsiger, K. Kallio, G. T. Hanson, S. J. Remington, Structure 1998, 6, 1267-1277
30. A. S. Mishin, F. V. Subach, I. V. Yampolsky, W. King, K. A. Lukyanov, V. V. Verkhusha, Biochemistry 2008, 47, 4666-4673
31. M. V. Matz, A. F. Fradkov, Y. A. Labas, A. P. Savitisky, A. G. Zaraisky, M. L. Markelov, S. A. Lukyanov, Nat. Biotechnol. 1999, 17, 969-973
32. N. O. Alieva, K. A. Konzen, S. F. Field, E. A. Meleshkevitch, M. E. Hunt, V. Beltran-Ramirez, D. J. Miller, J. Wiedenmann, A. Salih, M. V. Matz, PLoS ONE 2008, 3, e2680
33. Y. A. Labas, N. G. Gurskaya, Y. G. Yanushevich, A. F. Fradkov, K. A. Lukyanov, S. A. Lukyanov, M. V. Matz, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99, 4256-4261
34. L. A. Gross, G. S. Baird, R. C. Hoffman, K. K. Baldridge, R. Y. Tsien, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000, 97, 11990-11995
35. M. A. Wall, M. Socolich, R. Ranganathan, Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 1133-1138
36. D. Yarbrough, R. M. Wachter, K. Kallio, M. V. Matz, S. J. Remington, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001, 98, 462-467
37. R. E. Campbell, O. Tour, A. E. Palmer, P. A. Steinbach, G. S. Baird, D. A. Zacharias, R. Y. Tsien, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99, 7877-7882
38. L. Wang, W. C. Jackson, P. A. Steinbach, R. Y. Tsien, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004, 101, 16745-16749
39. N. C. Shaner, R. E. Campbell, P. A. Steinbach, B. N. G. Giepmans, A. E. Palmer, R. Y. Tsien, Nat. Biotechnol. 2004, 22, 1567-1572
40. N. C. Shaner, M. Z. Lin, M. R. McKeown, P. A. Steinbach, K. L. Hazelwood, M. W. Davidson, R. Y. Tsien, Nat. Methods 2008, 5, 545-551
41. J. Zhang, R. E. Campbell, A. Y. Ting, R. Y. Tsien, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2002, 3, 906-918
42. A. Miyawaki, J. Llopis, R. Heim, J. M. McCaffrey, J. A. Adams, M. Ikura, R. Y. Tsien, Nature 1997, 388, 882-887
43. M. T. Hasan, R. W. Friedrich, T. Euler, M. E. Larkum, G. Giese, M. Both, J. Duebel, J. Waters, H. Bujard, O. Griesbeck, R. Y. Tsien, T. Nagai, A. Miyawaki, W. Denk, PLoS Biol. 2004, 2, e163
44. R. Y. Tsien, R. Heim and A. Cubitt, US Pat. US5981200-A, 1999
45. A. Y. Ting, K. H. Kain, R. L. Klemke, R. Y. Tsien, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001, 98, 15003-15008
46. M. Zaccolo, F. De Giorgi, C. Y. Cho, L. X. Feng, T. Knapp, P. A. Negulescu, S. S. Taylor, R. Y. Tsien, T. Pozzan, Nat. Cell Biol. 2000, 2, 25-29
47. T. A. Dunn, C. T. Wang, M. A. Colicos, M. Zaccolo, L. M. DiPilato, J. Zhang, R. Y. Tsien, M. B. Feller, J. Neurosci. 2006, 26, 12807-12815
48. V. A. Pieribone and D. F. Gruber, Aglow in the Dark: The Revolutionary Science of Biofluorescence, Belknap Press of Harvard University Cambridge, Massachusetts, 2005
49. A. A. Pakhomov, V. I. Martynov, Chem. Biol. 2008, 15, 755-764
50. J. Y. Hasegawa, K. Fujimoto, B. Swerts, T. Miyahara, H. Nakatsuji, J. Comput. Chem. 2007, 28, 2443-2452
51. X. Lopez, M. A. L. Marques, A. Castro, A. Rubio, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12329-12337
52. A. Sinicropi, T. Andruniow, N. Ferre, R. Basosi, M. Olivucci, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 11534-11535
53. N. Taguchi, Y. Mochizuki, T. Nakano, S. Amari, K. Fukuzawa, T. Ishikawa, M. Sakurai, S. Tanaka, J. Phys. Chem. B 2009, 113, 1153-1161
54. S. Olsen, S. C. Smith, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 2054-2065
55. S. Olsen, S. C. Smith, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 8677-8689
56. V. Voliani, R. Bizzarri, R. Nifosi, S. Abbruzzetti, E. Grandi, C. Viappiani, F. Beltram, J. Phys. Chem. B 2008, 112, 10714-10722
57. S. Pletnev, D. Shcherbo, D. M. Chudakov, N. Pletneva, E. M. Merzlyak, A. Wlodawer, Z. Dauter, V. Pletnev, J. Biol. Chem. 2008, 283, 28980-28987
58. E. M. Merzlyak, J. Goedhart, D. Shcherbo, M. E. Bulina, A. S. Shcheglov, A. F. Fradkov, A. Gaintzeva, K. A. Lukyanov, S. Lukyanov, T. W. J. Gadella, D. M. Chudakov, Nat. Methods 2007, 4, 555-557
59. S. Kredel, F. Oswald, K. Nienhaus, K. Deuschle, C. Röcker, M. Wolff, R. Heilker, G. U. Nienhaus, J. Wiedenmann, PLoS ONE 2009, 4, e4391
60. Y. V. Kiseleva, A. S. Mishin, A. M. Bogdanov, Y. A. Labas, K. A. Luk’yanov, Russ. J. Bioorg. Chem. 2008, 34, 638-641
61. H. Niwa, S. Inouye, T. Hirano, T. Matsuno, S. Kojima, M. Kubota, M. Ohashi, F. I. Tsuji, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996, 93, 13617-13622
62. A. D. Kummer, J. Wiehler, T. A. Schuttrigkeit, B. W. Berger, B. Steipe, M. E. Michel-Beyerle, ChemBioChem 2002, 3, 659-663
63. L. X. Wu, K. Burgess, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 4089-4096
64. C. M. Megley, L. A. Dickson, S. L. Maddalo, G. J. Chandler, M. Zimmer, J. Phys. Chem. B 2009, 113, 302-308
65. D. E. Strongin, B. Bevis, N. Khuong, M. E. Downing, R. L. Strack, K. Sundaram, B. S. Glick, R. J. Keenan, Protein Eng. Des. Sel. 2007, 20, 525-534
66. F. Oswald, F. Schmitt, A. Leutenegger, S. Ivanchenko, C. D’Angelo, A. Salih, S. Maslakova, M. Bulina, R. Schirmbeck, G. U. Nienhaus, M. V. Matz, J. Wiedenmann, FEBS J. 2007, 274, 1102-1109
67. G. McNamara and C. A. Boswell, in Modern Research and Educational Topics in Microscopy, ed. A. Méndez-Vilas and J. Díaz, Formatex, 2008, pp. 287–296
68. D. A. Shagin, E. V. Barsova, Y. G. Yanushevich, A. F. Fradkov, K. A. Lukyanov, Y. A. Labas, T. N. Semenova, J. A. Ugalde, A. Meyers, J. M. Nunez, E. A. Widder, S. A. Lukyanov, M. V. Matz, Mol. Biol. Evol. 2004, 21, 841-850
69. D. D. Deheyn, K. Kubokawa, J. K. McCarthy, A. Murakami, M. Porrachia, G. W. Rouse, N. D. Holland, Biol. Bull. 2007, 213, 95-100
70. N. C. Shaner, G. H. Patterson, M. W. Davidson, J. Cell Sci. 2007, 120, 4247-4260
71. G. H. Patterson, J. Lippincott-Schwartz, Science 2002, 297, 1873-1877
72. J. Wiedenmann, S. Ivanchenko, F. Oswald, F. Schmitt, C. Rocker, A. Salih, K. D. Spindler, G. U. Nienhaus, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004, 101, 15905-15910
73. I. Hayashi, H. Mizuno, K. I. Tong, T. Furuta, F. Tanaka, M. Yoshimura, A. Miyawaki, M. Ikura, J. Mol. Biol. 2007, 372, 918-926
74. N. G. Gurskaya, V. V. Verkhusha, A. S. Shcheglov, D. B. Staroverov, T. V. Chepurnykh, A. F. Fradkov, S. Lukyanov, K. A. Lukyanov, Nat. Biotechnol. 2006, 24, 461-465
75. R. Ando, H. Hama, M. Yamamoto-Hino, H. Mizuno, A. Miyawaki, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99, 12651-12656
76. S. Habuchi, R. Ando, P. Dedecker, W. Verheijen, H. Mizuno, A. Miyawaki, J. Hofkens, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 9511-9516
77. J. N. Henderson, H. W. Ai, R. E. Campbell, S. J. Remington, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007, 104, 6672-6677
78. D. M. Chudakov, V. V. Belousov, A. G. Zaraisky, V. V. Novoselov, D. B. Staroverov, D. B. Zorov, S. Lukyanov, K. A. Lukyanov, Nat. Biotechnol. 2003, 21, 191-194
79. S. T. Hess, T. P. K. Girirajan, M. D. Mason, Biophys. J. 2006, 91, 4258-4272
80. E. Betzig, G. H. Patterson, R. Sougrat, O. W. Lindwasser, S. Olenych, J. S. Bonifacino, M. W. Davidson, J. Lippincott-Schwartz, H. F. Hess, Science 2006, 313, 1642-1645
81. G. Shtengel, J. A. Galbraith, C. G. Galbraith, J. Lippincott-Schwartz, J. M. Gillette, S. Manley, R. Sougrat, C. M. Waterman, P. Kanchanawong, M. W. Davidson, R. D. Fetter, H. F. Hess, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009, 106, 3125-3130
82. M. J. Rust, M. Bates, X. W. Zhuang, Nat. Methods 2006, 3, 793-795
83. V. Adam, M. Lelimousin, S. Boehme, G. Desfonds, K. Nienhaus, M. J. Field, J. Wiedenmann, S. McSweeney, G. U. Nienhaus, D. Bourgeois, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008, 105, 18343-18348
84. S. A. McKinney, C. S. Murphy, K. L. Hazelwood, M. W. Davidson, L. L. Looger, Nat. Methods 2009, 6, 131-133
85. F. V. Subach, G. H. Patterson, S. Manley, J. M. Gillette, J. Lippincott-Schwartz, V. V. Verkhusha, Nat. Methods 2009, 6, 153-159
86. M. Hopf, W. Gohring, A. Ries, R. Timpl, E. Hohenester, Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 634-640
87. B. S. W. Chang, J. A. Ugalde and M. V. Matz, in Molecular Evolution: Producing the Biochemical Data, Part B, 2005, vol. 395, pp. 652–670
88. J. Livet, T. A. Weissman, H. N. Kang, R. W. Draft, J. Lu, R. A. Bennis, J. R. Sanes, J. W. Lichtman, Nature 2007, 450, 56-62
89. A. Sakaue-Sawano, H. Kurokawa, T. Morimura, A. Hanyu, H. Hama, H. Osawa, S. Kashiwagi, K. Fukami, T. Miyata, H. Miyoshi, T. Imamura, M. Ogawa, H. Masai, A. Miyawaki, Cell 2008, 132, 487-498