-
1
-
-
0033520062
-
-
Dioumaev, A. K.; Brown, L. S.; Needleman, R.; Lanyi, J. K. Biochemistry 1999, 38, 10070-10078.
-
(1999)
Biochemistry
, vol.38
, pp. 10070-10078
-
-
Dioumaev, A.K.1
Brown, L.S.2
Needleman, R.3
Lanyi, J.K.4
-
2
-
-
0028982167
-
-
Balashov, S. P.; Govindjee, R.; Imasheva, E. S.; Misra, S.; Ebrey, T. G.; Feng, Y.; Crouch, R. K.; Menick, D. R. Biochemistry 1995, 34, 8820-8834.
-
(1995)
Biochemistry
, vol.34
, pp. 8820-8834
-
-
Balashov, S.P.1
Govindjee, R.2
Imasheva, E.S.3
Misra, S.4
Ebrey, T.G.5
Feng, Y.6
Crouch, R.K.7
Menick, D.R.8
-
4
-
-
58149376459
-
-
Phatak, P.; Ghosh, N.; Yu, H.; Cui, Q.; Elstner, M. Proc Natl Acad. Sci. USA. 2008, 105, 19672-19677.
-
(2008)
Proc Natl Acad. Sci. USA.
, vol.105
, pp. 19672-19677
-
-
Phatak, P.1
Ghosh, N.2
Yu, H.3
Cui, Q.4
Elstner, M.5
-
5
-
-
0032492706
-
-
Rammelsberg, R.; Huhn, G.; Luebben, M.; Gerwert, K. Biochemistry 1998, 37, 5001-5009.
-
(1998)
Biochemistry
, vol.37
, pp. 5001-5009
-
-
Rammelsberg, R.1
Huhn, G.2
Luebben, M.3
Gerwert, K.4
-
6
-
-
0032578378
-
-
Essen, L. O.; Siegert, R.; Lehmann, W. D.; Oesterhelt, D. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998, 95, 11673-11678.
-
(1998)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA.
, vol.95
, pp. 11673-11678
-
-
Essen, L.O.1
Siegert, R.2
Lehmann, W.D.3
Oesterhelt, D.4
-
7
-
-
0033545872
-
-
Zscherp, C.; Schlesinger, R.; Tittor, J.; Oesterhelt, D.; Heberle, J. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1999, 96, 5498-5503.
-
(1999)
Proc. Natl Acad. Sci. USA.
, vol.96
, pp. 5498-5503
-
-
Zscherp, C.1
Schlesinger, R.2
Tittor, J.3
Oesterhelt, D.4
Heberle, J.5
-
8
-
-
14844347271
-
-
Garczarek, F.; Brown, L. S.; Lanyi, J. K.; Gerwert, K. Proc. Nati. Acad Sei. USA. 2005, 102, 3633-3638.
-
(2005)
Proc. Nati. Acad Sei. USA.
, vol.102
, pp. 3633-3638
-
-
Garczarek, F.1
Brown, L.S.2
Lanyi, J.K.3
Gerwert, K.4
-
10
-
-
0033582945
-
-
Subramaniam, S.; Lindahl, M.; Bullough, P.; Faruqi, A. R.; Tittor, J.; Oesterhelt, D.; Brown, L.; Lanyi, J. K.; Henderson, R. J. Mol. Biol. 1999, 287, 145-161.
-
(1999)
J. Mol. Biol.
, vol.287
, pp. 145-161
-
-
Subramaniam, S.1
Lindahl, M.2
Bullough, P.3
Faruqi, A.R.4
Tittor, J.5
Oesterhelt, D.6
Brown, L.7
Lanyi, J.K.8
Henderson, R.9
-
11
-
-
0030901231
-
-
Sass, H. J.; Schachowa, I. W.; Rapp, G.; Koch, M. H. J.; Oesterhelt, D.; Dencher, N. A.; Buldt, G. EMBO J. 1997, 16, 1484-1491.
-
(1997)
EMBO J.
, vol.16
, pp. 1484-1491
-
-
Sass, H.J.1
Schachowa, I.W.2
Rapp, G.3
Koch, M.H.J.4
Oesterhelt, D.5
Dencher, N.A.6
Buldt, G.7
-
12
-
-
0346366810
-
-
Kouyama, T.; Nishikawa, T.; Tokuhisa, T.; Okumura, H. J. Mol. Biol 2004, 335, 531-546.
-
(2004)
J. Mol. Biol
, vol.335
, pp. 531-546
-
-
Kouyama, T.1
Nishikawa, T.2
Tokuhisa, T.3
Okumura, H.4
-
13
-
-
0025991585
-
-
Subramaniam, S.; Greenhalgh, D. A.; Rath, P.; Rothschild, K. J.; Khorana, H. G. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1991, 88, 6873-6877.
-
(1991)
Proc. Natl Acad. Sci. USA.
, vol.88
, pp. 6873-6877
-
-
Subramaniam, S.1
Greenhalgh, D.A.2
Rath, P.3
Rothschild, K.J.4
Khorana, H.G.5
-
14
-
-
0028864699
-
-
Brown, L. S.; Sasaki, J.; Kandori, H.; Maeda, A.; Needleman, R.; Lanyi, J. K. J. Biol. Chem. 1995, 270, 27122-27126.
-
(1995)
J. Biol. Chem.
, vol.270
, pp. 27122-27126
-
-
Brown, L.S.1
Sasaki, J.2
Kandori, H.3
Maeda, A.4
Needleman, R.5
Lanyi, J.K.6
-
15
-
-
0032516460
-
-
Dioumaev, A. K.; Brown, L. S.; Needleman, R.; Lanyi, J. K. Biochemistry 1998, 37, 9889-9893.
-
(1998)
Biochemistry
, vol.37
, pp. 9889-9893
-
-
Dioumaev, A.K.1
Brown, L.S.2
Needleman, R.3
Lanyi, J.K.4
-
16
-
-
0029969750
-
-
Richter, H. T.; Needleman, R.; Kandori, H.; Maeda, A.; Lanyi, J. K. Biochemistry 1996, 35, 15461-15466.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 15461-15466
-
-
Richter, H.T.1
Needleman, R.2
Kandori, H.3
Maeda, A.4
Lanyi, J.K.5
-
17
-
-
0026577708
-
-
Chizhov, I.; Engelhard, M.; Chernavskii, D. S.; Zubov, B.; Hess, B. Biophys. J. 1992, 67, 1001-1006.
-
(1992)
Biophys. J.
, vol.67
, pp. 1001-1006
-
-
Chizhov, I.1
Engelhard, M.2
Chernavskii, D.S.3
Zubov, B.4
Hess, B.5
-
18
-
-
0031738407
-
-
Ludmann, K.; Gergely, C.; Varó, G. Biophys. J. 1998, 75, 3110-3119.
-
(1998)
Biophys. J.
, vol.75
, pp. 3110-3119
-
-
Ludmann, K.1
Gergely, C.2
Varó, G.3
-
19
-
-
0034789953
-
-
Zscherp, C.; Schlesinger, R.; Heberle, J. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2001, 283, 57-63.
-
(2001)
Biochem. Biophys. Res. Commun.
, vol.283
, pp. 57-63
-
-
Zscherp, C.1
Schlesinger, R.2
Heberle, J.3
-
20
-
-
0030069626
-
-
Balashov, S. P.; Imasheva, E. S.; Govindjee, R.; Ebrey, T. G. Biophy. J. 1996, 70, 473-481.
-
(1996)
Biophy. J.
, vol.70
, pp. 473-481
-
-
Balashov, S.P.1
Imasheva, E.S.2
Govindjee, R.3
Ebrey, T.G.4
-
21
-
-
33746795960
-
-
Efremov, R.; Gordeliy, V. I.; Heberle, J.; Buldt, G. Biophy. J. 2006, 91, 1441-1451.
-
(2006)
Biophy. J.
, vol.91
, pp. 1441-1451
-
-
Efremov, R.1
Gordeliy, V.I.2
Heberle, J.3
Buldt, G.4
-
22
-
-
0035955561
-
-
Rouháni, S.; Cartailler, J. P.; Facciotti, M. T.; Walian, P.; Needleman, R.; Lanyi, J. K.; Glaeser, R. M.; Luecke, H. J. Mol. Biol. 2001, 313, 615-628.
-
(2001)
J. Mol. Biol.
, vol.313
, pp. 615-628
-
-
Rouháni, S.1
Cartailler, J.P.2
Facciotti, M.T.3
Walian, P.4
Needleman, R.5
Lanyi, J.K.6
Glaeser, R.M.7
Luecke, H.8
-
23
-
-
22544465841
-
-
Okumura, H.; Murakami, M.; Kouyama, T. J. Mol. Biol. 2005, 357, 481-495.
-
(2005)
J. Mol. Biol.
, vol.357
, pp. 481-495
-
-
Okumura, H.1
Murakami, M.2
Kouyama, T.3
-
24
-
-
0033609904
-
-
Luecke, H.; Schobert, B.; Richter, H. T.; Cartailler, J. P.; Lanyi, J. K. J. Mol. Biol. 1999, 291, 899-911.
-
(1999)
J. Mol. Biol.
, vol.291
, pp. 899-911
-
-
Luecke, H.1
Schobert, B.2
Richter, H.T.3
Cartailler, J.P.4
Lanyi, J.K.5
-
25
-
-
33846572339
-
-
Chen, D.; Wang, J. M.; Lanyi, J. K. J. Mol. Biol 2007, 366, 790-805.
-
(2007)
J. Mol. Biol
, vol.366
, pp. 790-805
-
-
Chen, D.1
Wang, J.M.2
Lanyi, J.K.3
-
26
-
-
33847250470
-
-
Bondar, A. N.; Suhai, S.; Fischer, S.; Smith, J. C.; Elstner, M. J. Struct. Biol 2007, 157, 454-469.
-
(2007)
J. Struct. Biol
, vol.157
, pp. 454-469
-
-
Bondar, A.N.1
Suhai, S.2
Fischer, S.3
Smith, J.C.4
Elstner, M.5
-
27
-
-
0033567092
-
-
Belrhali, H.; Nollert, P.; Royant, A.; Menzel, C.; Rosenbusch, J. P.; Landau, E. M.; Pebay-Peyroula, E. Structure 1999, 7, 909-917.
-
(1999)
Structure
, vol.7
, pp. 909-917
-
-
Belrhali, H.1
Nollert, P.2
Royant, A.3
Menzel, C.4
Rosenbusch, J.P.5
Landau, E.M.6
Pebay-Peyroula, E.7
-
28
-
-
0035201708
-
-
Facciotti, M. T.; Rouháni, S.; Burkard, F. T.; Betancourt, F. M.; Downing, K. H.; Rose, R. B.; McDermott, G.; Glaeser, R. M. Biophys. J. 2001, 81, 3442-3455.
-
(2001)
Biophys. J.
, vol.81
, pp. 3442-3455
-
-
Facciotti, M.T.1
Rouháni, S.2
Burkard, F.T.3
Betancourt, F.M.4
Downing, K.H.5
Rose, R.B.6
McDermott, G.7
Glaeser, R.M.8
-
29
-
-
0036452022
-
-
Matsui, Y.; Sakai, K.; Murakami, M.; Shiro, Y.; Adachi, S.; Okumura, H.; Kouyama, T. J. Mol Biol. 2002, 324, 469-481.
-
(2002)
J. Mol Biol.
, vol.324
, pp. 469-481
-
-
Matsui, Y.1
Sakai, K.2
Murakami, M.3
Shiro, Y.4
Adachi, S.5
Okumura, H.6
Kouyama, T.7
-
30
-
-
0001686867
-
-
Smith, S. O.; Pardoen, J. A.; Mulder, P. P. J.; Curry, B.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. Biochemistry 1983, 22, 6141-6148.
-
(1983)
Biochemistry
, vol.22
, pp. 6141-6148
-
-
Smith, S.O.1
Pardoen, J.A.2
Mulder, P.P.J.3
Curry, B.4
Lugtenburg, J.5
Mathies, R.6
-
31
-
-
84986512474
-
-
Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187-217.
-
(1983)
J. Comput. Chem.
, vol.4
, pp. 187-217
-
-
Brooks, B.R.1
Bruccoleri, R.E.2
Olafson, B.D.3
States, D.J.4
Swaminathan, S.5
Karplus, M.6
-
32
-
-
1542779956
-
-
Elstner, M.; Porezag, D.; Jungnickel, G.; Eisner, J.; Haugk, M.; Frauenheim, Th.; Suhái, S.; Seifert, G. Phys. Rev. B 1998, 58, 7260-7268.
-
(1998)
Phys. Rev. B
, vol.58
, pp. 7260-7268
-
-
Elstner, M.1
Porezag, D.2
Jungnickel, G.3
Eisner, J.4
Haugk, M.5
Frauenheim, Th.6
Suhái, S.7
Seifert, G.8
-
33
-
-
0035138648
-
-
Cui, Q.; Elstner, M.; Kaxiras, E.; Frauenheim, Th.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 569-585.
-
(2001)
J. Phys. Chem. B
, vol.105
, pp. 569-585
-
-
Cui, Q.1
Elstner, M.2
Kaxiras, E.3
Frauenheim, Th.4
Karplus, M.5
-
35
-
-
0346668338
-
-
Zhang, X.; Harrison, D. V. T.; Cui, Q. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14871-14878.
-
(2002)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.124
, pp. 14871-14878
-
-
Zhang, X.1
Harrison, D.V.T.2
Cui, Q.3
-
36
-
-
0037076062
-
-
Cui, Q.; Elstner, M.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2002, 706, 2721-2740.
-
(2002)
J. Phys. Chem. B
, vol.706
, pp. 2721-2740
-
-
Cui, Q.1
Elstner, M.2
Karplus, M.3
-
38
-
-
0041786771
-
-
Li, G.; Zhang, X.; Cui, Q. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 8643-8653.
-
(2003)
J. Phys. Chem. B
, vol.107
, pp. 8643-8653
-
-
Li, G.1
Zhang, X.2
Cui, Q.3
-
39
-
-
0141566583
-
-
Elstner, M.; Cui, Q.; Munih, P.; Kaxiras, E.; Frauenheim, T.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 2003, 24, 565.
-
(2003)
J. Comput. Chem.
, vol.24
, pp. 565
-
-
Elstner, M.1
Cui, Q.2
Munih, P.3
Kaxiras, E.4
Frauenheim, T.5
Karplus, M.6
-
40
-
-
0242558240
-
-
Elstner, M.; Frauenheim, T.; Suhái, S. THEOCHEM 2003, 632, 29-41.
-
(2003)
THEOCHEM
, vol.632
, pp. 29-41
-
-
Elstner, M.1
Frauenheim, T.2
Suhái, S.3
-
41
-
-
33845595256
-
-
Riccardi, D.; König, P.; Prat-Resina, X.; Yu, H.; Elstner, M.; Frauenheim, T.; Cui, Q. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 16302-16311.
-
(2006)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.128
, pp. 16302-16311
-
-
Riccardi, D.1
König, P.2
Prat-Resina, X.3
Yu, H.4
Elstner, M.5
Frauenheim, T.6
Cui, Q.7
-
42
-
-
0037087047
-
-
Zhou, H.; Tajkhorshid, E.; Frauenheim, T.; Suhái, S.; Elstner, M. Chem. Phys. 2002, 277, 91-103.
-
(2002)
Chem. Phys.
, vol.277
, pp. 91-103
-
-
Zhou, H.1
Tajkhorshid, E.2
Frauenheim, T.3
Suhái, S.4
Elstner, M.5
-
43
-
-
84869617047
-
-
Bondar, A. N.; Elstner, M.; Suhái, S.; Smith, J. C.; Fischer, S. Structure 2004, 72, 1-20.
-
(2004)
Structure
, vol.72
, pp. 1-20
-
-
Bondar, A.N.1
Elstner, M.2
Suhái, S.3
Smith, J.C.4
Fischer, S.5
-
44
-
-
7744225102
-
-
Bondar, A. N.; Fischer, S.; Smith, J. C.; Elstner, M.; Suhái, S. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 14668-14677.
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.126
, pp. 14668-14677
-
-
Bondar, A.N.1
Fischer, S.2
Smith, J.C.3
Elstner, M.4
Suhái, S.5
-
45
-
-
23844465277
-
-
Bondar, A. N.; Fischer, S.; Suhai, S.; Smith, J. C. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 14786-14788.
-
(2005)
J. Phys. Chem. B
, vol.109
, pp. 14786-14788
-
-
Bondar, A.N.1
Fischer, S.2
Suhai, S.3
Smith, J.C.4
-
46
-
-
57449095198
-
-
Bondar, A. N.; Baudry, J.; Suhai, S.; Fischer, S.; Smith, J. C. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 14729-14741.
-
(2008)
J. Phys. Chem. B
, vol.112
, pp. 14729-14741
-
-
Bondar, A.N.1
Baudry, J.2
Suhai, S.3
Fischer, S.4
Smith, J.C.5
-
47
-
-
4344581120
-
-
Okada, T.; Sugihara, M.; Bondar, A. N.; Elstner, M.; Entel, P.; Buss, V. J. Mol. Biol. 2004, 342, 571-583.
-
(2004)
J. Mol. Biol.
, vol.342
, pp. 571-583
-
-
Okada, T.1
Sugihara, M.2
Bondar, A.N.3
Elstner, M.4
Entel, P.5
Buss, V.6
-
48
-
-
14844348202
-
-
Wanko, M.; Hoffmann, M.; Strodel, P.; Koslowski, A.; Thiel, W.; Neese, F.; Frauenheim, T.; Elstner, M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 3606-3615.
-
(2005)
J. Phys. Chem. B
, vol.109
, pp. 3606-3615
-
-
Wanko, M.1
Hoffmann, M.2
Strodel, P.3
Koslowski, A.4
Thiel, W.5
Neese, F.6
Frauenheim, T.7
Elstner, M.8
-
49
-
-
33747787695
-
-
Hoffmann, M.; Wanko, M.; Strodel, P.; Koenig, P.; Frauenheim, T.; Schulten, K.; Thiel, W.; Tajkhorshid, E.; Elstner, M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 10808-10818.
-
(2006)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.128
, pp. 10808-10818
-
-
Hoffmann, M.1
Wanko, M.2
Strodel, P.3
Koenig, P.4
Frauenheim, T.5
Schulten, K.6
Thiel, W.7
Tajkhorshid, E.8
Elstner, M.9
-
50
-
-
53049106598
-
-
Wanko, M.; Hoffmann, M.; Frauenheim, T.; Elstner, M. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 11462-11467.
-
(2008)
J. Phys. Chem. B
, vol.112
, pp. 11462-11467
-
-
Wanko, M.1
Hoffmann, M.2
Frauenheim, T.3
Elstner, M.4
-
51
-
-
53049096961
-
-
Wanko, M.; Hoffmann, M.; Fraehmcke, J.; Frauenheim, T.; Elstner, M. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 11468-11478.
-
(2008)
J. Phys. Chem. B
, vol.112
, pp. 11468-11478
-
-
Wanko, M.1
Hoffmann, M.2
Fraehmcke, J.3
Frauenheim, T.4
Elstner, M.5
-
53
-
-
84986513644
-
-
Field, M.; Bash, P.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1990, 6, 700-733.
-
(1990)
J. Comput. Chem.
, vol.6
, pp. 700-733
-
-
Field, M.1
Bash, P.2
Karplus, M.3
-
57
-
-
0041320967
-
-
Hayashi, S.; Tajkhorshid, E.; Schulten, K. Biophys. J. 2003, 85, 1440-1449.
-
(2003)
Biophys. J.
, vol.85
, pp. 1440-1449
-
-
Hayashi, S.1
Tajkhorshid, E.2
Schulten, K.3
-
59
-
-
0036708439
-
-
Hayashi, S.; Tajkhorshid, E.; Schulten, K. Biophy. J. 2002, 83, 1281-1297.
-
(2002)
Biophy. J.
, vol.83
, pp. 1281-1297
-
-
Hayashi, S.1
Tajkhorshid, E.2
Schulten, K.3
-
60
-
-
4344595068
-
-
Hayashi, S.; Tajkhorshid, E.; Schulten, K. J. Am. Chem. Soc 2004, 126, 10516-10517.
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc
, vol.126
, pp. 10516-10517
-
-
Hayashi, S.1
Tajkhorshid, E.2
Schulten, K.3
-
61
-
-
2342666659
-
-
Rousseau, R.; Kleinschmidt, V.; Schmitt, U. W.; Marx, D. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 1848-1859.
-
(2004)
Phys. Chem. Chem. Phys.
, vol.6
, pp. 1848-1859
-
-
Rousseau, R.1
Kleinschmidt, V.2
Schmitt, U.W.3
Marx, D.4
-
63
-
-
43049134414
-
-
Braun-sand, S.; Sharma, P.; Chu, Z.; Pisliakov, A. V.; Warshel, A. Biochim. Biophy. Acta 2008, 1777, 441-452.
-
(2008)
Biochim. Biophy. Acta
, vol.1777
, pp. 441-452
-
-
Braun-sand, S.1
Sharma, P.2
Chu, Z.3
Pisliakov, A.V.4
Warshel, A.5
-
64
-
-
0035923404
-
-
Ren, L.; Martin, C. H.; Wise, K. J.; Gillespie, N. B.; Luecke, H.; Lanyi, J. K.; Spudich, J. L.; Birge, R. R. Biochemistry 2001, 40, 13906-13914.
-
(2001)
Biochemistry
, vol.40
, pp. 13906-13914
-
-
Ren, L.1
Martin, C.H.2
Wise, K.J.3
Gillespie, N.B.4
Luecke, H.5
Lanyi, J.K.6
Spudich, J.L.7
Birge, R.R.8
-
65
-
-
0035909727
-
-
Hayashi, S.; Tajkhorshid, E.; Pebay-Peyroula, E.; Royant, R.; Landau, E.; Navarro, J.; Schulten, K. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 10124-10131.
-
(2001)
J. Phys. Chem. B
, vol.105
, pp. 10124-10131
-
-
Hayashi, S.1
Tajkhorshid, E.2
Pebay-Peyroula, E.3
Royant, R.4
Landau, E.5
Navarro, J.6
Schulten, K.7
-
66
-
-
28844489888
-
-
Fujimoto, K.; Hasegawa, J.; Hayashi, S.; Kato, S.; Nakatsuji, H. Chem. Phys. Lett. 2005, 414, 239-242.
-
(2005)
Chem. Phys. Lett.
, vol.414
, pp. 239-242
-
-
Fujimoto, K.1
Hasegawa, J.2
Hayashi, S.3
Kato, S.4
Nakatsuji, H.5
-
67
-
-
34848877217
-
-
Fujimoto, K.; Hayashi, S.; Hasegawa, J.; Nakatsuji, H. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 605-618.
-
(2007)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.3
, pp. 605-618
-
-
Fujimoto, K.1
Hayashi, S.2
Hasegawa, J.3
Nakatsuji, H.4
-
68
-
-
33749176449
-
-
Matsuura, A.; Sato, H.; Houjou, H.; Saito, S.; Hayashi, T.; Sakurai, M. J. Comput. Chem. 2006, 27, 1623-1630.
-
(2006)
J. Comput. Chem.
, vol.27
, pp. 1623-1630
-
-
Matsuura, A.1
Sato, H.2
Houjou, H.3
Saito, S.4
Hayashi, T.5
Sakurai, M.6
-
69
-
-
34548059996
-
-
Schaefer, P.; Riccardi, D.; Cui, Q. J. Chem. Phys. 2005, 723,014905-014914.
-
(2005)
J. Chem. Phys.
, vol.723
, pp. 014905-014914
-
-
Schaefer, P.1
Riccardi, D.2
Cui, Q.3
-
71
-
-
33646356998
-
-
Riccardi, D.; Schaefer, P.; Yang, Y.; Yu, H.; Ghosh, N.; Prat-Resina, X.; Koenig, P.; Li, G.; Xu, D.; Guo, H.; Elstner, M.; Cui, Q. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 6458-6469.
-
(2006)
J. Phys. Chem. B
, vol.110
, pp. 6458-6469
-
-
Riccardi, D.1
Schaefer, P.2
Yang, Y.3
Yu, H.4
Ghosh, N.5
Prat-Resina, X.6
Koenig, P.7
Li, G.8
Xu, D.9
Guo, H.10
Elstner, M.11
Cui, Q.12
-
72
-
-
70349159387
-
-
Canuto, S., Ed.; Springer, Chapter "Combined QM/MM methods for the simulation of condensed phase processes using an approximate DFT approach,"
-
Elstner, M.; Cui, Q. In Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics, Vol.6; Canuto, S., Ed.; Springer, 2008; Chapter "Combined QM/MM methods for the simulation of condensed phase processes using an approximate DFT approach," pp 381-405.
-
(2008)
Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics
, vol.6
, pp. 381-405
-
-
Elstner, M.1
Cui, Q.2
-
73
-
-
70349090414
-
-
Lee, T.; York. D., Ed.; Springer, in press;Chapter Multi-scale QM/MM methods with Self-ConsistentCharge Density-Functional-Tight-Binding (SCC-DFTB)
-
Cui, Q.; Elstner, M. In Multi-scale Quantum Models for Biocatalysis: Modern Techniques and Applications; Lee, T.; York. D., Ed.; Springer, in press;Chapter Multi-scale QM/MM methods with Self-ConsistentCharge Density-Functional-Tight-Binding (SCC-DFTB).
-
Multi-scale Quantum Models for Biocatalysis: Modern Techniques and Applications
-
-
Cui, Q.1
Elstner, M.2
-
78
-
-
26344435738
-
-
Schäfer, A.; Horn, H.; Ahlrichs, R. J. Chem. Phys. 1992, 97, 2571-2577.
-
(1992)
J. Chem. Phys.
, vol.97
, pp. 2571-2577
-
-
Schäfer, A.1
Horn, H.2
Ahlrichs, R.3
-
80
-
-
35948946987
-
-
Yang, Y.; Yu, H.; York, D.; Cui, Q.; Elstner, M. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 10861-10873.
-
(2007)
J. Phys. Chem. A
, vol.111
, pp. 10861-10873
-
-
Yang, Y.1
Yu, H.2
York, D.3
Cui, Q.4
Elstner, M.5
-
83
-
-
19944408652
-
-
König, P. H.; Hoffmann, M.; Frauenheim, Th.; Cui, Q. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 9082-9095.
-
(2005)
J. Phys. Chem. B
, vol.109
, pp. 9082-9095
-
-
König, P.H.1
Hoffmann, M.2
Frauenheim, Th.3
Cui, Q.4
-
84
-
-
0342646933
-
-
Sass, H. J.; Büldt, G.; Gessenich, R.; Hehn, D.; Neff, D.; Schlesinger, R.; Berendzen, J.; Ormos, P. Nature (London) 2000, 406, 649-653.
-
(2000)
Nature (London)
, vol.406
, pp. 649-653
-
-
Sass, H.J.1
Büldt, G.2
Gessenich, R.3
Hehn, D.4
Neff, D.5
Schlesinger, R.6
Berendzen, J.7
Ormos, P.8
-
85
-
-
0038056334
-
-
Dinner, X.; Lopez, A. R.; Karplus, M. Theor. Chem. Acc 2003, 109, 118.
-
(2003)
Theor. Chem. Acc
, vol.109
, pp. 118
-
-
Dinner, X.1
Lopez, A.R.2
Karplus, M.3
-
86
-
-
0000300950
-
-
Simmons, C. J.; Liu, R. S. H.; Denny, M.; Seff, K.Acta Crystallogr. B 1981, 37, 2197-2205.
-
(1981)
Acta Crystallogr. B
, vol.37
, pp. 2197-2205
-
-
Simmons, C.J.1
Liu, R.S.H.2
Denny, M.3
Seff, K.4
-
87
-
-
0000523887
-
-
Hamanaka, T.; Mitsui, T.; Ashida, T.; Kakudo, M.Acta Crystallogr. B 1972, 28, 214-222.
-
(1972)
Acta Crystallogr. B
, vol.28
, pp. 214-222
-
-
Hamanaka, T.1
Mitsui, T.2
Ashida, T.3
Kakudo, M.4
-
88
-
-
0001059089
-
-
Santarsiero, B. D.; James, M. N. G.; Mahendran, M.; Childs, R. F. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 9416-9418.
-
(1990)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.112
, pp. 9416-9418
-
-
Santarsiero, B.D.1
James, M.N.G.2
Mahendran, M.3
Childs, R.F.4
-
89
-
-
0001385068
-
-
Fahmy, K.; Siebert, F.; Grossjean, M. F.; Tavan, P. J. Mol. Struct. 1989, 214, 257-288.
-
(1989)
J. Mol. Struct.
, vol.214
, pp. 257-288
-
-
Fahmy, K.1
Siebert, F.2
Grossjean, M.F.3
Tavan, P.4
-
90
-
-
0000035284
-
-
El-Sayed, M. A.; Lin, C. T.; Mason, W. R. Proc Natl Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 5376-5379.
-
(1989)
Proc Natl Acad. Sci. U.S.A.
, vol.86
, pp. 5376-5379
-
-
El-Sayed, M.A.1
Lin, C.T.2
Mason, W.R.3
-
92
-
-
0034128699
-
-
Tajkhorshid, E.; Baudry, J.; Schulten, K.; Suhai, S. Biophy. J. 2000, 78, 683-693.
-
(2000)
Biophy. J.
, vol.78
, pp. 683-693
-
-
Tajkhorshid, E.1
Baudry, J.2
Schulten, K.3
Suhai, S.4
-
93
-
-
0037080338
-
-
Lansing, J. C.; Hohwy, M.; Jaroniec, C. P.; Creemers, A. F. L.; Lugtenburg, J.; Herzfeld, J.; Griffin, R. G. Biochemistry 2002, 41, 431-438.
-
(2002)
Biochemistry
, vol.41
, pp. 431-438
-
-
Lansing, J.C.1
Hohwy, M.2
Jaroniec, C.P.3
Creemers, A.F.L.4
Lugtenburg, J.5
Herzfeld, J.6
Griffin, R.G.7
-
94
-
-
0021848415
-
-
Smith, S. O.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. J. Membr. Biol. 1985, 85, 95-109.
-
(1985)
J. Membr. Biol.
, vol.85
, pp. 95-109
-
-
Smith, S.O.1
Lugtenburg, J.2
Mathies, R.3
-
95
-
-
0036971196
-
-
Schobert, B.; Cupp-Vickery, J.; Hornak, V.; Smith, S.; Lanyi, J. K. J. Mol. Biol. 2002, 321, 715-726.
-
(2002)
J. Mol. Biol.
, vol.321
, pp. 715-726
-
-
Schobert, B.1
Cupp-Vickery, J.2
Hornak, V.3
Smith, S.4
Lanyi, J.K.5
-
97
-
-
0035852677
-
-
Kandori, H.; Yamazaki, Y.; Shichida, Y.; Raap, J.; Lugtenburg, J.; Belenky, M.; Herzfeld, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 1571-1576.
-
(2001)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.98
, pp. 1571-1576
-
-
Kandori, H.1
Yamazaki, Y.2
Shichida, Y.3
Raap, J.4
Lugtenburg, J.5
Belenky, M.6
Herzfeld, J.7
-
98
-
-
0031042723
-
-
Subramaniam, S.; Faruqi, A. R.; Oesterhelt, D.; Henderson, R. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997, 94, 1767-1772.
-
(1997)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA.
, vol.94
, pp. 1767-1772
-
-
Subramaniam, S.1
Faruqi, A.R.2
Oesterhelt, D.3
Henderson, R.4
-
101
-
-
0027429642
-
-
Hessling, B.; Souvignier, G.; Gerwert, K. Biophy. J. 1993, 65, 1929-1941.
-
(1993)
Biophy. J.
, vol.65
, pp. 1929-1941
-
-
Hessling, B.1
Souvignier, G.2
Gerwert, K.3
-
102
-
-
0029878720
-
-
Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33-38.
-
(1996)
J. Mol. Graphics
, vol.14
, pp. 33-38
-
-
Humphrey, W.1
Dalke, A.2
Schulten, K.3
-
103
-
-
70349094756
-
-
note
-
48 This difference can be attributed to the large QM region used here (retinal, Asp85, Asp212, and three water molecules), whereas in ref 48 only retinal has been treated with QM.
-
-
-
|