Solution-phase chelators for suppressing nonspecific protein-metal interactions in electrospray mass spectrometry

Analytical Chemistry

Volumn 81, Issue 12, 2009, Pages 5008-5015

  Pan, Jingxi ^a,b   Xu, Kun ^c   Yang, Xiaoda ^c   Choy, Wing Yiu ^a   Konermann, Lars ^a  

^a UNIVERSITY OF WESTERN ONTARIO   (Canada)

^b DALIAN UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (China)

^c PEKING UNIVERSITY HEALTH SCIENCE CENTER   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BENEFICIAL EFFECTS; BULK SOLUTIONS; CALCIUM BINDING; CALCIUM BINDING PROTEINS; DIVALENT METAL ION; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; GAINING INSIGHTS; GASPHASE; METAL ADDUCTS; METAL BINDING; METAL INTERACTIONS; METAL SOURCES; METALATION; QUALITATIVE INFORMATION; SHRINKING DROPLET; TEST SYSTEMS; ZINC BINDING;

CALCIUM; CALCIUM ALLOYS; CALCIUM CHLORIDE; CARBOXYLATION; CHELATION; ELECTROSPRAY IONIZATION; IONIZATION OF GASES; MASS SPECTROMETERS; MASS SPECTROMETRY; METAL COMPLEXES; METAL IONS; PROTEINS; SPECTRUM ANALYSIS; STOICHIOMETRY; TRACE ANALYSIS; ZINC;

METALS;

AMMONIUM ACETATE; CALCIUM ACETATE; CALCIUM BINDING PROTEIN; CALCIUM CHLORIDE; CHELATING AGENT; CITRATE CALCIUM; EDETATE CALCIUM; METAL COMPLEX; METAL ION; PROTHYMOSIN ALPHA; TARTARIC ACID; TARTRATE CALCIUM; UNCLASSIFIED DRUG; ZINC BINDING PROTEIN;

ADDUCTION; ARTICLE; BINDING AFFINITY; CALCIUM BINDING; CONTROLLED STUDY; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; METAL BINDING; PHASE TRANSITION; PROTEIN INTERACTION;

ARTIFACTS; CALCIUM; CALCIUM-BINDING PROTEINS; CHELATING AGENTS; METALS; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION; TARTRATES; ZINC;

EID: 67449094494     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac900423x     Document Type: Article

References (92)

1. Schriemer, D. C. Anal. Chem. 2004, 76, 441A-448A.
2. Schermann, S. M.; Simmons, D. A.; Konermann, L. Exp. Rev. Proteomics 2005, 2, 475-485.
3. Entzeroth, M. Curr. Opin. Pharmacol. 2003, 3, 522-529.
4. Roda, A.; Guardigli, M.; Pasini, P.; Mirasoli, M. Anal. Bioanal. Chem. 2003, 377, 826-833.
5. Auer, M.; Moore, K. J.; Meyer-Almes, F. J.; Guenther, R.; Pope, A. J.; Stoeckli, K. A. Drug Discovery Today 1998, 3, 457-565.
6. Fenn, J. B. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 3871-3894.
7. Powell, K. D.; Ghaemmaghami, S.; Wang, M. Z.; Ma, L.; Oas, T. G.; Fitzgerald, M. C. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 10256-10257.
8. Zhu, M. M.; Rempel, D. L.; Du, Z.; Gross, M. L. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 5252-5253.
9. Kamal, J. K. A.; Chance, M. R. Protein Sci. 2008, 17, 1-16.
10. Gerega, S. K.; Downard, K. M. Bioinformatics 2006, 22, 1702-1709.
11. Ganem, B.; Li, Y.-T.; Henion, J. D. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 6294-6296.
12. Katta, V.; Chait, B. T. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 8534-8535.
13. Benesch, J. L. P.; Ruotolo, B. T.; Simmons, D. A.; Robinson, C. V. Chem. Rev. 2007, 107, 3544-3567.
14. Loo, J. A. Int. J. Mass Spectrom. 2000, 200, 175-186.
15. Smith, A. M.; Jahn, T. R.; Ashcroft, A. E.; Radford, S. E. J. Mol. Biol. 2006, 364, 9-19.
16. Zhang, Z.; Krutchinsky, A.; Endicott, S.; Realini, C.; Rechsteiner, M.; Standing, K. G. Biochemistry 1999, 38, 5651-5658.
17. Boys, B. L.; Kuprowski, M. C.; Konermann, L. Biochemistry 2007, 46, 10675-10684.
18. Hagan, N.; Fabris, D. Biochemistry 2003, 42, 10736-10745.
19. Heck, A. J. R. Nat. Methods 2008, 5, 927-933.
20. Jecklin, M. C.; Touboul, D.; Bovet, C.; Wortmann, A.; Zenobi, R. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008, 19, 332-343.
21. Wang, W.; Kitova, E. N.; Klassen, J. S. Anal. Chem. 2003, 75, 4945-4955.
22. Daniel, J. M.; Friess, S. D.; Rajagopalan, S.; Wendt, S.; Zenobi, R. Int. J. Mass Spectrom. 2002, 216, 1-27.
23. Gabelica, V.; Galic, N.; Rosu, F.; Houssier, C.; De Pauw, E. J. Mass. Spectrom. 2003, 38, 491-501.
24. Frycak, P.; Schug, K. A. Anal. Chem. 2007, 79, 5407-5413.
25. Wigger, M.; Eyler, J. R.; Benner, S. A.; Li, W.; Marshall, A. G. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2002, 13, 1162-1169.
26. Ruotolo, B. T.; Giles, K.; Campuzano, I.; Sandercock, A. M.; Bateman, R. H.; Robinson, C. V. Science 2005, 310, 1658-1661.
27. van Duijn, E.; Barendregt, A.; Synowsky, S.; Versluis, C.; Heck, A. J. R. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1452-1459.
28. Wang, W.; Kitova, E. N.; Klassen, J. S. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13630-13631.
29. Jurchen, J. C.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 2817-2826.
30. Robinson, C. V.; Chung, E. W.; Kragelund, B. B.; Knudsen, J.; Aplin, R. T.; Poulsen, F. M.; Dobson, C. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 8646-8653.
31. Peschke, M.; Verkerk, U. H.; Kebarle, P. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2004, 15, 1424-1434.
32. Wang, W.; Kitova, E. N.; Klassen, J. S. Anal. Chem. 2005, 77, 3060-3071.
33. Tahallah, N.; Pinkse, M.; Maier, C. S.; Heck, A. J. R. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2001, 15, 596-601.
34. Schmidt, A.; Bahr, U.; M., K. Anal. Chem. 2001, 73, 6040-6046.
35. Chernushevich, I. V.; Thomson, B. A. Anal. Chem. 2004, 76, 1754-1760.
36. Sun, J.; Kitova, E. N.; Klassen, J. S. Anal. Chem. 2007, 79, 416-425.
37. Sun, J.; Kitova, E. N.; Wang, W.; Klassen, J. S. Anal. Chem. 2006, 78, 3010-3018.
38. Sun, J.; Kitova, E. N.; Sun, N.; Klassen, J. S. Anal. Chem. 2007, 79, 8301-8311.
39. Touboul, D.; Maillard, L.; Grässlin, A.; Moumne, R.; Seitz, M.; Robinson, J.; Zenobi, R. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009, 20, 303-311.
40. Daubenfeld, T.; Bouin, A.-P.; van der Rest, G. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2006, 17, 1239-1248.
41. Ceccarelli, C.; Liang, Z. X.; Strickler, M.; Prehna, G.; Goldstein, B. M.; Klinman, J. P.; Bahnson, B. J. Biochemistry 2004, 43, 5266-5277.
42. Dempsey, A. C.; Walsh, M. P.; Shaw, G. S. Structure 2003, 11, 887-897.
43. Rosenzweig, A. C. Chem. Biol. 2002, 9, 673-677.
44. Matthews, B. W. Acc. Chem. Res. 1988, 21, 333-340.
45. Ngu, T. T.; Stillman, M. J. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 12473-12483.
46. Verkerk, U. H.; Kebarle, P. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005, 16, 1325-1341.
47. Xu, N.; Lin, Y.; Hofstadler, S. A.; Matson, D.; Call, C. J.; Smith, R. D. Anal. Chem. 1998, 70, 3553-3556.
48. Yi, S.; Boys, B. L.; Brickenden, A.; Konermann, L.; Choy, W. Y. Biochemistry 2007, 46, 13120-13130.
49. Lion, N.; Gellon, J.; Jensen, H.; Girault, H. H. J. Chromatogr., A 2003, 1003, 11-19.
50. Hannis, J. C.; Muddiman, D. C. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1999, 13, 323-330.
51. Niessen, W. M. J. Chromatogr., A 1999, 856, 179-197.
52. Abian, J.; Oosterkamp, A. J.; Gelpi, E. J. Mass Spectrom. 1999, 34, 244-254.
53. Cavanagh, J.; Benson, L. M.; Thompson, R.; Naylor, S. Anal. Chem. 2003, 75, 3281-3286.
54. Iavarone, A. T.; Udekwu, O. A.; Williams, E. R. Anal. Chem. 2004, 76, 3944-3950.
55. Felitsyn, N.; Peschke, M.; Kebarle, P. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 2002, 219, 39-62.
56. Turner, K. B.; Monti, S. A.; Fabris, D. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 13353-13363.
57. Hu, P.; Ye, Q.-Z.; Loo, J. A. Anal. Chem. 1994, 66, 4190-4194.
58. Veenstra, T. D.; Johnson, K. L.; Tomlinson, A. J.; Naylor, S.; Kumar, R. Biochemistry 1997, 36, 3535-3542.
59. Hu, P.; Loo, J. A. J. Mass Spectrom. 1995, 30, 1076-1082.
60. Watt, S. J.; Oakley, A.; Sheil, M. M.; Beck, J. L. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2006, 19, 2123-2130.
61. Park, H. Y.; Kim, S. A.; Korlach, J.; Rhoades, E.; Kwok, L. W.; Zipfel, W. R.; Waxham, M. N.; Webb, W. W.; Pollack, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 542-547.
62. Nemirovskiy, O. V.; Ramanathan, R.; Gross, M. L. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1997, 8, 809-812.
63. Pukala, T. L.; Urathamakul, T.; Watt, S. J.; Beck, J. L.; Jackway, R. J.; Bowie, J. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2008, 22, 3501-3509.
64. Mathur, S.; Badertscher, M.; Scott, M.; Zenobi, R. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 6187-6198.
65. Lafitte, D.; Capony, J. P.; Grassy, G.; Haiech, J.; Calas, B. Biochemistry 1995, 34, 13825-13832.
66. Hill, T. J.; Lafitte, D.; Wallace, J. I.; Cooper, H. J.; Tsvetkov, P. O.; Derrick, P. J. Biochemistry 2000, 39, 7284-7290.
67. Kebarle, P.; Peschke, M. Anal. Chim. Acta 2000, 406, 11-35.
68. Juraschek, R.; Dulcks, T.; Karas, M. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1999, 10, 300-308.
69. Iavarone, A. T.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 2319-2327.
70. de la Mora, F. J. Anal. Chim. Acta 2000, 406, 93-104.
71. Kaltashov, I. A.; Mohimen, A. Anal. Chem. 2005, 77, 5370-5379.
72. Hu, J.; Jia, X.; Li, Q.; Yang, X.; Wang, K. Biochemistry 2004, 43, 2688-2698.
73. Permyakov, E. A.; Berliner, L. J. FEBS Lett. 2000, 473, 269-274.
74. Stuart, D. I.; Acharya, K. R.; Walker, N. P. C.; Smith, S. G.; Lewis, M.; Philips, D. C. Nature 1986, 324, 84-87.
75. Chandra, N.; Brew, K.; Acharya, K. R. Biochemistry 1998, 37, 4767-4772.
76. Farrell, H. M.; Thompson, M. P. Protoplasma 1990, 159, 157-167.
77. Nemirovskiy, O.; E., G. D.; Gross, M. L. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1999, 10, 711-718.
78. Invernizzi, G.; Samalikova, M.; Brocca, S.; Lotti, M.; Molinari, H.; Grandori, R. J. Mass Spectrom. 2006, 41, 717-727.
79. Grandori, R. Protein Sci. 2002, 11, 453-458.
80. Kaltashov, I. A.; Eyles, S. J. Mass Spectrom. Rev. 2002, 21, 37-71.
81. Konermann, L. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 6534-6543.
82. Watt, S. J.; Oakley, A.; Sheil, M. M.; Beck, J. L. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2005, 19, 2123-2130.
83. Kuprowski, M. C.; Konermann, L. Anal. Chem. 2007, 79, 2499-2506.
84. Milos, M.; Comte, M.; Schaer, J.-J.; Cox, J. A. J. Inorg. Biochem. 1989, 36, 11-25.
85. Cannan, R. K.; Kibrik, A. J. Am. Chem. Soc. 1938, 60, 2314-2320.
86. Thomas, W. C.; Pickett, W. C. Am. J. Physiol. 1960, 199, 103-106.
87. Shimomura, O.; Shimomura, A. Biochem. J. 1984, 221, 907-910.
88. Durham, A. C. H. Cell Calcium 1983, 4, 33-46.
89. Pineiro, A.; Cordero, O. J.; Nogueira, M. Peptides 2000, 21, 1433-1446.
90. Karapetian, R. N.; Evstafieva, A. G.; Abaeva, I. S.; Chichkova, N. V.; Filonov, G. S.; Rubtsov, Y. P.; Sukhacheva, E. A.; Melnikov, S. V.; Schneider, U.; Wanker, E. E.; Vartapetian, A. B. Mol. Cell. Biol. 2005, 25, 1089-1099.
91. Chichkova, N. V.; Evstafieva, A. G.; Lyakhov, I. G.; Tsvetkov, A. S.; Smirnova, T. A.; Karapetian, R. N.; Karger, E. M.; Vartapetian, A. B. Eur. J. Biochem. 2000, 267, 4745-4752.
92. Yin, S.; Xie, Y.; Loo, J. A. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008, 19, 1199-1208.