Effect of surface structure on the dynamical behavior of an aromatic carboxylic acid molecule on au surfaces

Journal of Physical Chemistry C

Volumn 113, Issue 14, 2009, Pages 5573-5584

  Lee, Wen Jay ^a   Ju, Shin Pon ^a   Chen, Hui Chuan ^a  

^a NATIONAL SUN YAT SEN UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AROMATIC CARBOXYLIC ACIDS; ATOMIC STRUCTURES; AU SURFACES; AU(100); DYNAMICAL BEHAVIORS; GEOMETRIC RELATIONSHIPS; INTERACTION ENERGIES; LOCK AND KEYS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; ROTATIONAL MOTIONS; TRANSLATIONAL MOTIONS; TRICARBOXYLIC ACID DERIVATIVES;

ADSORPTION; BENZENE; CARBOXYLIC ACIDS; DYNAMICS; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULES; ORGANIC ACIDS; SURFACE DIFFUSION;

SURFACE STRUCTURE;

EID: 65249131217     PISSN: 19327447     EISSN: 19327455     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp802429q     Document Type: Article

References (52)

1. Keddie, J. L.; Jones, R. A. L.; Cory. R. A. Europhys. Lett.. 1994, 27, 59.
2. Keddie, J. L.; Jones, R. A. L.; Cory, R. A. Faraday Discuss. Chem. Soc. 1994, 98, 219.
3. Melick, H.; Van Dijken, A.; Van Toonder, J.; Den; Govaert, L.; Meijer, H. Philos. Mag. A 2002, 82, 2093.
4. Zankovych, S.; Hoffmann, T.; Seekamp, J.; Bruch, J.-U.; Sotomayor Torres, C. M. Nanotechnology 2001, 12, 91.
5. Martin, C.; Rius, G.; Borrisé, X.; Pérez-Murano. F. Nanotechnology 2005, 16, 1016.
6. Fukao, K.; Miyamoto, Y. Phys. Rev. E 2000, 61, 1743.
7. Bauer, C.; Bohmer, R.; Moreno-Flores, S.; Richert, R.; Sillescu, H.; Neher, D. Phys. Rev. E 2000, 61, 1755.
8. Keddie, J. L.; Jones, R. A. L.; Cory. R. A. Europhys. Lett. 1994, 27, 59.
9. Maggio, G. B. d.; Frieze, W. E.; Gidley, D. W.; Zhu, M.; Hristov, H. A.; Yee, A. F. Phys. Rev. Lett. 1997, 78, 1524.
10. Wallace, W. E.; Zanten, J. H. v.; Wu, W. L. Phys. Rev. E 1995, 52, R3329.
11. Fukao, K.; Miyamoto, Y. Europhys. Lett. 1999, 46, 649.
12. Fukao, K.; Miyamoto, Y. Phys. Rev. E 2001, 64, 011803.
13. Fukao, K.; Uno, S.; Miyamoto, Y.; Hoshino, A.; Miyaji. H. Phys. Rev. E 2001, 64, 051807.
14. Hartmann, L.; Kratzmüller, Th.; Braun, H.-G.; Kremer, F. Macromol. Rapid Commun. 2000, 21, 814.
15. Yan, H. J.; Lu, J.: Wan, L. J.; Bai. C. L. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 11251.
16. Stepanow, S.; Lingenfelder, M.; Dmitriev, A.; Spillmann, H.; Delvigne, E.; Lin, N.: Deng, X.; Cai, C.; Barth, J. V.; Kern, K. Nat. Mater. 2004, 3, 229.
17. Stepanow, S.; Lin, N.; Vidal, F.; Landa, A.; Ruben, M.; Barth, J. V.; Kern, K. Nano Lett. 2005, 5, 901.
18. Clair, S.; Pons, S.; Seitsonen, A. P.; Brune, H.; Kern, K.; Barth, J. V. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 14585.
19. Yokoyama, T.; Yokoyama, S.; Kamikado, T.; Okuno, Y.; Mashiko, S. Nature 2001, 413, 619.
20. Messina, P.; Dmitriev, A.; Lin, N.; Spillmann, H.; Abel, M.; Barth, J. V.; Kern, K. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14000.
21. Dmitriev, A.; Spillmann, H.; Lingenfelder, M.; Lin, N.; Barth, J. V.; Kern, K. Langmuir 2004, 20, 4799.
22. Zhang, J.; Gesquière, A.; Sieffert, M.; Klapper, M.; Müllen, K.; Schryver, F. C. D.; Feyter, S. D. Nano Lett. 2005, 5, 1395.
23. Dmitriev, A.; Lin. N.; Weckesser, J.; Barth, J. V.; Kern, K. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 6907.
24. Suzuki, H.; Yamada, T.; Kamikado, T.; Okuno, Y.; Mashiko, S. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 13296.
25. Schull, G.: Douillard, L.; Céline, F. D.; Charra, F.; Mathevet, F.; Kreher. D.; A.; Attias, J. Nano Lett. 2006, 6, 1360.
26. Xu, S.; Dong, M.; Rauls, E.; Otero, R.; Linderoth, T. R.; Besenbacher, F. Nano Lett. 2006, 6, 1434.
27. Braun, R.; Sarikaya, M.; Schulten, K. J. Biomater. Sci., Polym. Ed. 2002, 13, 747.
28. Pint, C. L.; Roth, M. W.; Wexler, C. Phys. Rev. B 2006, 73, 085422.
29. Otero, R.; Hümmelink, F.; Sato, F.; Legoas, S. B.; Thostrup, P.; Lægsgaard, E.; Stensgaard, I.; Galvão, D. S.; Besenbacher, F. Nat. Mater. 2004, 3, 779.
30. Su, G. J.; Zhang, H. M.; Wan, L. J.; Bai, C. L.; Wandlowski, T. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 1931.
31. Shirai, Y.; Osgood, A. J.; Zhao, Y.; Kelly, K. F.; Tour, J. M. Nano Lett. 2005, 5, 2330.
32. Yan, H. J.; Lu, J.; Wan, L. J.; Bai, C. L. J. Phys. Chem. B. 2004, 108, 11251.
33. Lu, J.; Zeng, Q.-d.; Wang, C.; Zeng. Q.-y; Wan. L.; Bai. C. J. Mater. Chem. 2002, 12, 2856.
34. Wang, S.; Xing, H.; Li, Y.; Bai, J.; Pan, Y.; Scheer, M.; You, X. Eur. J. Inorg. Chem. 2006, 2006, 3041.
35. Roth, M. W.; Pint, C. L.; Wexler, C. Phys. Rev. B 2005, 71, 155427.
36. Awasthi, A.; Hendy, S. C.; Zoontjens, P.; Brown, S. A.; Natali, F. Phys. Rev. B 2007, 76, 115437.
37. Mylvaganam, K.; Zhang, L. C. Carbon 2004, 42, 2025.
38. Cai, M. B.; Li, X. P.; Rahman, M. J. Manufact. Sci. Eng. 2006, 129, 281.
39. Ju, S. P.; Lee, W. J.; Chen, H. C.; Chang, J. G. Appl. Phys. Lett. 2007, 90, 143112.
40. Frenkel, D.; Smit, B. Understanding Molecular Simulation from Algorithms to Applications; Academic Press: New York, 2002.
41. Allen, M. P.; Tildesley, D. J. Computer Simulation in Chemical Physics; Kluwer/NATO ASI Series Mathematical and Physical Sciences, 1993; p 397.
42. Haile, J. M. Molecular Dynamics Simulation: Elementary Methods; John Wiley & Sons: New York l997.
43. Rapaport, D. C. The Art of Molecular Dynamics Simulation; Cambridge University Press: New York, 1996.
44. Levitt, M.; Hirshberg, M.; Sharon, R.; Daggett, V. Comput. Phys. Commun. 1995, 91, 215.
45. Levitt, M.; Hirshberg, M.: Sharon, R.: Laiding, K. E.; Daggett, V. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 5051.
46. Rosato, V.; Guillope, M.; Legrand, B. Philos. Mag. A 1989, 59, 321.
47. Cleri, F.; Rosato, V. Phys. Rev. B 1993, 48, 22.
48. Jang, S. S.; Jang, Y. H.; Kim, Y. H.; Goddard, W. A., ITT; Flood, A. H.; Laursen, B. W.; Tseng, H. R.; Stoddart, J. F.; Jeppesen, J. O.; Choi, J. W.; Steuerman, D. W.; Delonno, E.; Heath, J. R. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1563.
49. Stryer, L. Biochemistry; Freeman: New York, 1997.
50. Bondi, A. J. Phys. Chem. 1964, 68, 441.
51. Mandal, P. K.; Amnan, E. J. Chem. Phys. 2001, 114, 3880.
52. Batsanov. S. S. Struct. Chem. 1999, 6, 395.