The role of quaternary structure in (β/α)8-barrel proteins: Evolutionary happenstance or a higher level of structure-function relationships?

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 7, Issue 5, 2009, Pages 833-839

  Devenish, Sean R A ^a   Gerrard, Juliet A ^a  

^a UNIVERSITY OF CANTERBURY   (New Zealand)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACTIVE SITES; BROAD SPECTRUMS; CATALYSE; CATALYTIC ACTIVITIES; DYNAMIC MOTIONS; OLIGOMERIC STRUCTURES; QUATERNARY STRUCTURES; STRUCTURE-FUNCTION RELATIONSHIPS; THERMAL STABILITIES;

CATALYST ACTIVITY; ELECTROCHEMICAL SENSORS;

PROTEINS;

PROTEIN;

ARTICLE; CATALYSIS; CHEMISTRY; GENETICS; MOLECULAR EVOLUTION; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN QUATERNARY STRUCTURE;

CATALYSIS; EVOLUTION, MOLECULAR; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN STRUCTURE, QUATERNARY; PROTEINS;

EID: 60749098410     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b818251p     Document Type: Article

References (46)

1. R. N. Perham Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. B 1975 272 123 136
2. M. H. Ali B. Imperiali Bioorg. Med. Chem. 2005 13 5013 5020
3. I. M. A. Nooren J. M. Thornton EMBO J. 2003 22 3486 3492
4. S. J. Benkovic G. G. Hammes S. Hammes-Schiffer Biochemistry 2008 47 3317 3321
5. M. D. W. Griffin and J. A. Gerrard, in Protein dimerisation and oligomerisation in biology, ed., J. M. Matthews, Landes Bioscience, Austin, TX, 2007
6. A. G. Murzin S. E. Brenner T. Hubbard C. Chothia J. Mol. Biol. 1995 247 536 540
7. N. Nagano C. A. Orengo J. M. Thornton J. Mol. Biol. 2002 321 741 765
8. B. Höcker C. Jürgens M. Wilmanns R. Sterner Curr. Opin. Biotechnol. 2001 12 376 381
9. Q. Xu A. Canutescu Z. Obradovic R. L. Dunbrack Jr Bioinformatics 2006 22 2876 2882
10. K. Henrick J. M. Thornton Trends Biochem. Sci. 1998 23 358 361
11. N. J. Marianayagam M. Sunde J. M. Matthews Trends Biochem. Sci. 2004 29 618 625
12. D. S. Goodsell A. J. Olson Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2000 29 105 153
13. J. Backmann G. Schäfer Methods Enzymol 2001 334 328 342
14. H. Shen F. Xu H. Hu F. Wang Q. Wu Q. Huang H. Wang J. Struct. Biol. 2008 164 281 292
15. S. Cansu P. Doruker Biochemistry 2008 47 1358 1368
16. M. A. Navia P. M. D. Fitzgerald B. M. McKeever C. Leu J. C. Heimbach W. K. Herber I. S. Sigal P. L. Darke J. P. Springer Nature 1989 337 615 620
17. T. C. Appleby C. Kinsland T. P. Begley S. E. Ealick Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 2005 2010
18. R. C. J. Dobson K. Valegård J. A. Gerrard J. Mol. Biol. 2004 338 329 339
19. R. Thoma M. Hennig R. Sterner K. Kirschner Structure (London) 2000 8 265 276
20. P. T. Beernink D. R. Tolan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996 93 5374 5379
21. P. Rellos J. Sygusch T. M. Cox J. Biol. Chem. 2000 275 1145 1151
22. A. D. Malay S. L. Procious D. R. Tolan Arch. Biochem. Biophys. 2002 408 295 304
23. A. D. Malay K. N. Allen D. R. Tolan J. Mol. Biol. 2005 347 135 144
24. Y. Shi L. Niu X. Feng J. Yuan World J. Microbiol. Biotechnol. 2006 22 675 680
25. L. Niu X. Zhang Y. Shi J. Yuan Biotechnol. Lett. 2007 29 303 308
26. G. Kim H. Kim Biochem. Biophys. Res. Commun. 1998 243 96 100
27. Y. Mukohara T. Ishikawa K. Watabe H. Nakamura Biosci. Biotechnol. Biochem. 1994 58 1621 1626
28. Y. Cheon G. Kim H. Kim J. Mol. Catal. B: Enzymatic 2000 11 29 35
29. M. Robinson-Rechavi A. Alibés A. Godzik J. Mol. Biol. 2006 356 547 557
30. M. Hilge S. M. Gloor W. Rypniewski O. Sauer T. D. Heightman W. Zimmermann K. Winterhalter K. Piontek Structure (London) 1998 6 1433 1444
31. D. Shallom G. Golan G. Shoham Y. Shoham J. Bacteriol. 2004 186 6928 6937
32. M. B. Ottosen O. Björnberg S. Nørager S. Larsen B. A. Palfey K. F. Jensen Protein Sci. 2002 11 2575 2583
33. E. K. Jaffe S. Ali L. W. Mitchell K. M. Taylor M. Volin G. D. Markham Biochemistry 1995 34 244 251
34. S. Breinig J. Kervinen L. Stith A. S. Wasson R. Fairman A. Wlodawer A. Zdanov E. K. Jaffe Nat. Struct. Biol. 2003 10 757 763
35. L. Tang L. Stith E. K. Jaffe J. Biol. Chem. 2005 280 15786 15793
36. D. W. Bollivar C. Clauson R. Lighthall S. Forbes B. Kokona R. Fairman L. Kundrat E. K. Jaffe BMC Biochem. 2004 5 17
37. M. D. Griffin R. C. Dobson F. G. Pearce L. Antonio A. E. Whitten C. K. Liew J. P. Mackay J. Trewhella G. B. Jameson M. A. Perugini J. A. Gerrard J. Mol. Biol. 2008 380 691 703
38. B. R. Burgess R. C. J. Dobson M. F. Bailey S. C. Atkinson M. D. W. Griffin G. B. Jameson M. W. Parker J. A. Gerrard M. A. Perugini J. Biol. Chem. 2008 283 27598 27603
39. V. Zomosa-Signoret G. Hernández-Alcántara H. Reyes-Vivas E. Martínez-Martínez G. Garza-Ramos R. Pérez-Montfort M. Tuena, de Gómez-Puyou A. Gómez-Puyou Biochemistry 2003 42 3311 3318
40. V. Zomosa-Signoret B. Aguirre-López G. Hernández- Alcántara R. Pérez-Montfort M. T. D. Gómez-Puyou A. Gómez-Puyou Proteins: Struct. Funct. Bioinformat. 2007 67 75 83
41. A. Gómez-Puyou E. Saavedra-Lira I. Becker R. A. Zubillaga A. Rojo-Domínguez R. Pérez-Montfort Chem. Biol. 1995 2 847 855
42. A. Téllez-Valencia V. Olivares-Illana A. Hernández-Santoyo R. Pérez-Montfort M. Costas A. Rodríguez-Romero F. López-Calahorra M. Tuena, de Gómez-Puyou A. Gómez-Puyou J. Mol. Biol. 2004 341 1355 1365
43. V. Olivares-Illana R. Pérez-Montfort F. López-Calahorra M. Costas A. Rodríguez-Romero M. Tuena, de Gómez-Puyou A. Gómez-Puyou Biochemistry 2006 45 2556 2560
44. H. Reyes-Vivas A. Diaz J. Peon G. Mendoza-Hernandez G. Hernandez-Alcantara I. De, la Mora-De la Mora S. Enriquez-Flores L. Dominguez-Ramirez G. Lopez-Velazquez J. Mol. Biol. 2007 365 752 763
45. J. A. Gerrard C. A. Hutton M. A. Perugini Mini Rev. Med. Chem. 2007 7 151 157
46. E. Lolis T. Alber R. C. Davenport D. Rose F. C. Hartman G. A. Petsko Biochemistry 1990 29 6609 6618