Heterologous expression systems for polyketide synthases

Natural Product Reports

Volumn 26, Issue 2, 2009, Pages 155-169

  Fujii, Isao ^a  

^a IWATE MEDICAL UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL PRODUCT; POLYKETIDE SYNTHASE;

BACTERIUM; CHEMICAL STRUCTURE; CLASSIFICATION; GENE EXPRESSION; GENETICS; METABOLISM; PLANT; REVIEW;

BACTERIA; BIOLOGICAL PRODUCTS; GENE EXPRESSION; MOLECULAR STRUCTURE; PLANTS; POLYKETIDE SYNTHASES;

EID: 59349116977     PISSN: 02650568     EISSN: 14604752     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b817092b     Document Type: Review

References (73)

1. F. Malpartida D. A. Hopwood Nature 1984 309 462 464
2. F. Gross N. Luniak O. Perlova N. Gaitatzis H. Jenke-Kodama K. Gerth D. Gottschalk E. Dittmann R. Müller Arch. Microbiol. 2006 185 28 38
3. U. Reimold M. Kröger F. Kreuzaler K. Hahlbrock EMBO J. 1983 2 1801 1805
4. T. Lanz S. Tropf F.-J. Marner J. Shröder G. Shröder J. Biol. Chem. 1991 266 9971 9976
5. S. Eckermann G. Schröder J. Schmidt D. Strack R. A. Edrada Y. Helariutta P. Elomaa M. Kotilainen I. Kilpeläinen P. Proksch T. H. Teeri J. Schröder Nature 1998 396 387 380
6. R. Lukǎcin K. Springob C. Urbanke C. Ernwein G. Schröder J. Schröder U. Matern FEBS Lett. 1999 448 135 140
7. I. Abe Y. Sano Y. Takahashi H. Noguchi J. Biol. Chem. 2003 278 25218 25226
8. I. Abe Y. Utsumi S. Oguro H. Noguchi FEBS Lett. 2004 562 171 176
9. I. Abe Y. Utsumi S. Oguro H. Morita Y. Sano H. Noguchi J. Am. Chem. Soc. 2005 127 1362 1363
10. I. Abe S. Oguro Y. Utsumi Y. Sano H. Noguchi J. Am. Chem. Soc. 2005 127 12709 12710
11. H. Morita S. Kondo S. Oguro H. Noguchi S. Sugio I. Abe T. Kohno Chem. Biol. 2007 14 359 369
12. I. Abe H. Morita S. Oguro H. Noma K. Wanibuchi N. Kawahara Y. Goda H. Noguchi T. Kohno J. Am. Chem. Soc. 2007 129 5976 5980
13. K. Springob S. Smappito A. Jindaprassert J. Schmidt J. E. Page W. De-Eknamkul T. M. Kutchan FEBS J. 2007 274 406 417
14. Y. Katsuyama M. Matsuzawa N. Funa S. Horinouchi J. Biol. Chem. 2007 282 37702 37709
15. S. Brand D. Hölscher A. Schierhorn A. Svatos J. Schröder B. Scheider Planta 2006 224 413 428
16. N. Funa Y. Ohnishi I. Fujii M. Shibuya Y. Ebizuka S. Horinouchi Nature 1999 400 897 899
17. P. Saxena G. Yadav D. Mohanty R. S. Gokhale J. Biol. Chem. 2003 278 44780 44790
18. R. Sankaranarayanan P. Saxena U. B. Marathe R. S. Gokhale V. M. Shanmugam R. Rukmini Nat. Struct. Mol. Biol. 2004 11 894 900
19. M. B. Austin M. Izumikawa M. E. Bowman D. W. Udwary J.-L. Ferrer B. S. Moore J. P. Noel J. Biol. Chem. 2004 279 45162 45174
20. L. Song F. Barona-Gomez C. Corre L. Xiang D. W. Udwary M. B. Austin J. P. Noel B. S. Moore G. L. Challis J. Am. Chem. Soc. 2006 128 14754 14755
21. S. Güschow T. J. Buchholz W. Seufert J. S. Dordick D. H. Sherman ChemBioChem 2007 8 863 868
22. N. Funa H. Ozawa A. Hirata S. Horinouchi Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006 103 6356 6361
23. J. Achar M. Xian H. Zhao J. W. Frost J. Am. Chem. Soc. 2005 127 5332 5333
24. W. Zha S. B. Rubin-Pitel H. Zhao J. Biol. Chem. 2006 281 32036 32047
25. Y. Seshime P. R. Juvvadi I. Fujii K. Kitamoto Biochem. Biophys. Res. Comm. 2005 331 253 260
26. N. Funa T. Awakawa S. Horinouchi J. Biol. Chem. 2007 282 14476 14476
27. Y. Katsuyama N. Funa I. Miyahisa S. Horinouchi Chem. Biol. 2007 14 613 621
28. R. McDaniel S. Ebert-Khosla D. Hopwood C. Khosla Science 1993 262 1546 1550
29. M. Bierman R. Logan K. O'Brien E. T. Seno R. N. Rao B. E. Schoner Gene 1992 116 43 49
30. E. Wendt-Peinkowski Y. Huang J. Zhang B. Li H. Jiang H. Kwon C. R. Hutchinson B. Shen J. Am. Chem. Soc. 2005 127 16442 16452
31. S. Gullón C. Olano M. S. Abdelfattah A. F. Braña J. Rohr C. Méndez J. A. Salas Appl. Environ. Microbiol. 2006 72 4172 4183
32. Z. Xu A. Schenk C. Hertwck J. Am. Chem. Soc. 2007 129 6022 6030
33. C. Hertweck L. Xiang J. A. Kalaitzis Q. Cheng M. Palzer B. S. Moore Chem. Biol. 2004 11 461 468
34. Y. Tang T. S. Lee C. Khosla PLos Biol. 2004 2 227 238
35. W. Zhang B. D. Ames S.-C. Tsai Y. Tang Appl. Environ. Microbiol. 2006 72 2573 2580
36. W. Zhang K. Watanabe C. C. C. Wang Y. Tang J. Nat. Prod. 2006 69 1633 1636
37. Q. Cheng L. Xiang M. Izumikawa D. Meluzzi B. S. Moore Nat. Chem. Biol. 2007 3 557 556
38. A. T. Keating-Clay D. A. Maltby K. F. Medzihradszky C. Khosla R. M. Stroud Nat. Struct. Mol. Biol. 2004 11 888 893
39. S. Gaisser A. Trefzer S. Stckert A. Kirshning A. Bechthold J. Bacteriol. 1997 179 6271 6278
40. B. Sthapit T.-J. Oh R. Lamichhane K. Liou H. C. Lee C.-G. Kim J. K. Sohng FEBS Lett. 2004 566 201 206
41. L. Shao X.-D. Qu X.-Y. Jia Q.-F. Zhao Z.-H. Tian M. Wang G.-L. Tang W. Liu Biochem. Biophys. Res. Commun. 2006 345 133 139
42. I. Fujii, A. Watanabe and Y. Ebizuka, in Advances in Fungal Biotechnology for Industrial, Agriculture, and Medicine, eds., J. S. Tkacz, and, L. Lange,, Kluwer Academic/Plenum Publishers, New York, 2004, pp. 97-125
43. S. Kroken N. L. Glass J. W. Taylor O. C. Yoder B. G. Turgeon Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003 100 15670 15675
44. R. J. Cox F. Glod D. Hurley C. M. Lazarus T. P. Nicholson B. A. M. Rudd T. J. Simpson B. Wilkinson Y. Zhang Chem. Commun. 2004 2260 2261
45. I. Fujii N. Yoshida S. Shimomaki H. Oikawa Y. Ebizuka Chem. Biol. 2005 12 1301 1309
46. K. Kasahara I. Fujii H. Oikawa Y. Ebizuka ChemBioChem 2006 7 920 924
47. L. M. Halo J. W. Marshall A. A. Yakasai Z. Song C. P. Butts M. P. Crump M. Heneghan A. M. Bailey T. J. Simpson C. M. Lazarus R. J. Cox ChemBioChem 2008 9 585 594
48. J. T. Kealey L. Liu D. V. Santi M. C. Betlach P. J. Barr Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1998 95 505 509
49. T. Moriguchi Y. Ebizuka I. Fujii ChemBioChem 2006 7 1869 1874
50. J. M. Crawford B. C. R. Dancy E. A. Hill D. W. Udwary C. A. Townsend Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006 103 16728 16733
51. Y. Ma L. H. Smith R. J. Cox P. Beltran-Alvarez C. J. Arthur T. J. Simpson ChemBioChem 2006 7 1951 1958
52. J. M. Crawford P. M. Thomas J. R. Scheerer A. L. Vagstad N. L. Kelleher C. A. Townsend Science 2008 320 243 246
53. S. M. Ma Y. Tang FEBS J. 2007 274 2854 2864
54. S. M. Ma J. Zhan K. Watanabe X. Xie W. Zhang C. C. Wang Y. Tang J. Am. Chem. Soc. 2007 129 10642 10643
55. H. Zhou J. Zhan K. Watanabe X. Xie Y. Tang Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008 105 6249 6254
56. S. Donadio M. J. Staver J. B. McAlpine S. J. Swanson L. Katz Science 1991 252 675 679
57. C. M. Kao L. Katz C. Khosla Science 1994 265 509 512
58. E. Rodriguez Z. Hu S. Ou Y. Volchegursky C. R. Hutchinson R. MacDaniel J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2003 30 480 488
59. E. Rodriguez S. Ward H. Fu W. P. Revill R. MacDaniel L. Katz Appl. Microb. Biotechnol. 2004 66 85 91
60. S. L. Ward Z. Hu A. Schirmer R. Reid W. P. Revill C. D. Reeves O. V. Petrakovsky S. D. Dong L. Katz Antimicrob. Agents Chemther 2004 78 4703 4712
61. C. D. Reeves S. L. Ward W. P. Revill H. Suzuki M. Marcus O. V. Petrakovsky S. Marquez H. Fu S. D. Dong L. Katz Chem. Biol. 2004 11 1465 1472
62. Y. Xue D. H. Sherman Nature 2000 403 571 575
63. W. S. Jung S. K. Lee J. S. J. Hong S. R. Park S. J. Jeong A. R. Han J. K. Sohng B. G. Kim A. Y. Choi D. H. Sherman Y. J. Yoon Appl. Microb. Biotechnol. 2006 72 763 769
64. E. Takano J. White C. J. Thompson M. J. Bibb Gene 1995 166 133 137
65. R. Zirkle J. M. Ligon I. Molnár Micribiolgoy 2004 150 2761 2774
66. F. Gross D. Gottschalk R. Müller Appl. Microb. Biotechnol. 2005 68 66 74
67. F. Gross M. W. Ring O. Periova J. Fu S. Schneider K. Gerth S. Kuhlmann A. F. Stewart Y. Zhang R. Müller Chem. Biol. 2006 13 1253 1264
68. S. Murli J. Kennedy L. C. Dayem J. R. Carney J. T. Kealy J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2003 30 500 509
69. H. G. Menzella S. J. Reisinger M. Welch J. T. Kealy J. Kennedy R. Reid C. Q. Tran D. V. Santi J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2006 33 22 28
70. H. G. Menzella R. Reid J. R. Carney S. S. Chandran S. J. Reisinger K. G. Paterl D. A. Hopwood D. V. Santi Nat. Biotech. 2005 23 1171 1176
71. S. Peirú H. G. Menzella E. Rodríguez J. Carney H. Gramajo Appl. Environ. Microbiol. 2005 71 2539 2547
72. H. G. Menzella J. R. Carney D. V. Santi Chem. Biol. 2007 14 143 151
73. S. C. Mutka J. R. Carney Y. Liu J. Kennedy Biochemisry 2006 45 1321 1330