Perturbation of the ground-state electronic structure of FMN by the conserved cysteine in phototropin LOV2 domains

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 10, Issue 44, 2008, Pages 6693-6702

  Alexandre, Maxime T A ^a,b   Van Grondelle, Rienk ^a   Hellingwerf, Klaas J ^b   Robert, Bruno ^c   Kennis, John T M ^a  

^a VU UNIVERSITY AMSTERDAM   (Netherlands)

^b UNIVERSITY OF AMSTERDAM   (Netherlands)

^c DIF   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CRYPTOCHROME; CYSTEINE; FLAVINE MONONUCLEOTIDE; FLAVOPROTEIN; RIBOFLAVIN DERIVATIVE; VEGETABLE PROTEIN;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; HYDROGEN BOND; INFRARED SPECTROSCOPY; METABOLISM; OAT; OXIDATION REDUCTION REACTION; PROTEIN BINDING; PROTEIN TERTIARY STRUCTURE; RAMAN SPECTROMETRY; SPECTROFLUOROMETRY;

AVENA SATIVA; CYSTEINE; FLAVIN MONONUCLEOTIDE; FLAVINS; FLAVOPROTEINS; HYDROGEN BONDING; MOLECULAR STRUCTURE; OXIDATION-REDUCTION; PLANT PROTEINS; PROTEIN BINDING; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE; SPECTROSCOPY, FOURIER TRANSFORM INFRARED; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN;

EID: 55849112690     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b810040c     Document Type: Article

References (66)

1. P. Hamm M. Zurek T. Röschinger H. Patselt D. Oesterhelt W. Zinth Chem. Phys. Lett. 1996 263 613 621
2. J. Herbst K. Heyne R. Diller Science 2002 297 822 825
3. G. G. Kochendoerfer R. A. Mathies Isr. J. Chem. 1995 35 211 226
4. K. J. Hellingwerf J. Hendriks T. Gensch J. Phys. Chem. A 2003 107 1082 1094
5. D. S. Larsen M. Vengris I. H. M. van stokkum M. van der Horst R. Cordfunke K. J. Hellingwerf R. van Grondelle Chem. Phys. Lett. 2003 369 563 569
6. D. S. Larsen M. Vengris I. H. M. van Stokkum M. A. van der Horst F. L. de Weerd K. J. Hellingwerf R. van Grondelle Biophys. J. 2004 86 2538 2550
7. D. S. Larsen M. Vengris I. H. M. van Stokkum M. A. van der Horst F. L. de Weerd K. J. Hellingwerf R. van Grondelle Biophys. J. 2004 87 1858 1872
8. A. Jung T. Domratcheva M. Tarutina Q. Wu W. H. Ko R. L. Shoeman M. Gomelsky K. H. Gardner L. Schlichting Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 12350 12355
9. S. Anderson V. Dragnea S. Masuda J. Ybe K. Moffat C. Bauer Biochemistry 2005 44 7998 8005
10. H. Yuan S. Anderson S. Masuda V. Dragnea K. Moffat C. Bauer Biochemistry 2006 45 12687 12694
11. M. Gauden I. H. van Stokkum J. M. Key D. Luhrs R. van Grondelle P. Hegemann J. T. Kennis Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 10895 10900
12. P. Zirak A. Penzkofer C. Lehmpfuhl T. Mathes P. Hegemann J. Photochem. Photobiol., B 2007 86 22 34
13. V. Dragnea M. Waegele S. Balascuta C. Bauer B. Dragnea Biochemistry 2005 44 15978 15985
14. M. Gauden J. S. Grinstead W. Laan I. H. M. van Stokkum K. C. Toh M. Avila-Perez R. Boelens R. Kaptein R. van Grondelle K. J. Hellingwerf J. T. M. Kennis Biochemistry 2007 46 7405 7415
15. J. T. M. Kennis M. L. Groot Curr. Opin. Struct. Biol. 2007 17 623 630
16. S. Masuda K. Hasegawa A. Ishii T. Ono Biochemistry 2004 43 5304 5313
17. B. Giovani M. Byrdin M. Ahmad K. Brettel Nat. Struct. Biol. 2003 10 489 490
18. A. Zeugner M. Byrdin J. P. Bouly N. Bakrim B. Giovani K. Brettel M. Ahmad J. Biol. Chem. 2005 280 19437 19440
19. V. Massey Biochem. Soc. Trans. 2000 28 283 296
20. R. Miura Chem. Rec. 2001 1 183 194
21. W. R. Briggs J. Biomed. Sci. 2007 14 499 504
22. J. M. Christie P. Reymond G. K. Powell P. Bernasconi A. A. Raibekas E. Liscum W. R. Briggs Science 1998 282 1698 1701
23. J. M. Christie and W. R. Briggs, in Handbook of Photosensory Receptors, ed., W. R. Briggs, and, J. L. Spudich,, Wiley-VCH Verlag GmbH & Co., Weinheim, 2005, pp. 277-304
24. T. E. Swartz S. B. Corchnoy J. M. Christie J. W. Lewis I. Szundi W. R. Briggs R. A. Bogomolni J. Biol. Chem. 2001 276 36493 36500
25. J. T. M. Kennis S. Crosson M. Gauden I. H. M. van Stokkum K. Moffat R. van Grondelle Biochemistry 2003 42 3385 3392
26. T. Kottke J. Heberle D. Hehn B. Dick P. Hegemann Biophys. J. 2003 84 1192 1201
27. W. Holzer A. Penzkofer M. Fuhrmann P. Hegemann Photochem. Photobiol. 2002 75 479 487
28. A. Losi E. Polverini B. Quest W. Gartner Biophys. J. 2002 82 2627 2634
29. A. Losi T. Kottke P. Hegemann Biophys. J. 2004 86 1051 1060
30. M. Salomon J. M. Christie E. Knieb U. Lempert W. R. Briggs Biochemistry 2000 39 9401 9410
31. M. Salomon W. Eisenreich H. Durr E. Schleicher E. Knieb V. Massey W. Rudiger F. Muller A. Bacher G. Richter Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 12357 12361
32. S. Crosson K. Moffat Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 2995 3000
33. S. Crosson K. Moffat Plant Cell 2002 14 1067 1075
34. R. Fedorov I. Schlichting E. Hartmann T. Domratcheva M. Fuhrmann P. Hegemann Biophys. J. 2003 84 2474 2482
35. T. E. Swartz P. J. Wenzel S. B. Corchnoy W. R. Briggs R. A. Bogomolni Biochemistry 2002 41 7183 7189
36. A. S. Halavaty K. Moffat Biochemistry 2007 46 14001 14009
37. T. A. Schuttrigkeit C. K. Kompa M. Salomon W. Rudiger M. E. Michel-Beyerle Chem. Phys. 2003 294 501 508
38. M. Kasahara T. E. Swartz M. A. Olney A. Onodera N. Mochizuki H. Fukuzawa E. Asamizu S. Tabata H. Kanegae M. Takano J. M. Christie A. Nagatani W. R. Briggs Plant Physiology 2002 129 762 773
39. R. I. Personov Spectrochim. Acta, Part B 1983 38 1533 1544
40. R. A. Avarmaa K. K. Rebane Spectrochim. Acta, Part A 1985 41 1365 1380
41. E. J. G. Peterman T. Pullerits R. vanGrondelle H. vanAmerongen J. Phys. Chem. B 1997 101 4448 4457
42. E. J. G. Peterman H. van Amerongen R. van Grondelle J. P. Dekker Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 6128 6133
43. S. M. Harper J. M. Christie K. H. Gardner Biochemistry 2004 43 16184 16192
44. S. M. Harper L. C. Neil K. H. Gardner Science 2003 301 1541 1544
45. T. Iwata D. Nozaki S. Tokutomi T. Kagawa M. Wada H. Kandori Biochemistry 2003 42 8183 8191
46. C. W. M. Kay E. Schleicher A. Kuppig H. Hofner W. Rudiger M. Schleicher M. Fischer A. Bacher S. Weber G. Richter J. Biol. Chem. 2003 278 10973 10982
47. M. T. Alexandre J. C. Arents R. van Grondelle K. J. Hellingwerf J. T. Kennis Biochemistry 2007 46 3129 3137
48. K. Ataka P. Hegemann J. Heberle Biophys. J. 2003 84 466 474
49. T. Iwata D. Nozaki S. Tokutomi H. Kandori Biochemistry 2005 44 7427 7434
50. W. D. Bowman T. G. Spiro Biochemistry 1981 20 3313 3318
51. M. Abe Y. Kyogoku Spectrochim. Acta, Part A 1987 43 1027 1037
52. Y. Nishina T. Kitagawa K. Shiga K. Horiike Y. Matsumura H. Watari T. Yamano J. Biochem. 1978 84 925 932
53. Y. Nishina K. Shiga K. Horiike H. Tojo S. Kasai K. Yanase K. Matsui H. Watari T. Yamano J. Biochem. 1980 88 403 409
54. P. K. Dutta R. Spencer C. Walsh T. G. Spiro Biochim. Biophys. Acta 1980 623 77 83
55. L. M. Schopfer M. D. Morris Biochemistry 1980 19 4932 4935
56. T. Iwata D. Nozaki Y. Sato K. Sato Y. Nishina K. Shiga S. Tokutomi H. Kandori Biochemistry 2006 45 15384 15391
57. G. Cooke Y.-M. Legrandab V. M. Rotellob Chem. Commun. 2004 1088 1089
58. A. Moglich K. Moffat J. Mol. Biol. 2007 373 112 126
59. T. Bednarz A. Losi W. Gartner P. Hegemann J. Heberle Photochem. Photobiol. Sci. 2004 3 575 579
60. Y. Sato M. Nabeno T. Iwata S. Tokutomi M. Sakurai H. Kandori Biochemistry 2007 46 10258 10265
61. M. Gauden, S. Crosson, I. H. M. van Stokkum, R. van Grondelle, K. Moffat and J. T. M. Kennis, Femtosecond Laser Applications in Biology, ed., S. Avrillier, and, J. M. Tualle,, Proceedings of SPIE, SPIE, Bellingham, WA, 2004, vol. 5463, pp. 97-104
62. S. B. Corchnoy T. E. Swartz J. W. Lewis I. Szundi W. R. Briggs R. A. Bogomolni J. Biol. Chem. 2003 278 724 731
63. E. G. Moore S. Ghisla V. Massey J. Biol. Chem. 1979 254 8173 8178
64. R. A. Mathies S. W. Lin J. B. Ames W. T. Pollard Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991 20 491 518
65. M. Kim R. A. Mathies W. D. Hoff K. J. Hellingwerf Biochemistry 1995 34 12669 12672
66. M. Unno M. Kumauchi J. Sasaki F. Tokunaga S. Yamauchi Biochemistry 2002 41 5668 5674