A structural and catalytic model for zinc phosphoesterases

Dalton Transactions

Volumn , Issue 43, 2008, Pages 6045-6054

  Buchholz, Rebecca R ^a   Etienne, Morgan E ^a   Dorgelo, Anneke ^a   Mirams, Ruth E ^a   Smith, Sarah J ^a   Chow, Shiao Yun ^a   Hanton, Lyall R ^b   Jameson, Geoffrey B ^c   Schenk, Gerhard ^a   Gahan, Lawrence R ^a  

^a UNIVERSITY OF QUEENSLAND   (Australia)

^b UNIVERSITY OF OTAGO   (New Zealand)

^c MASSEY UNIVERSITY   (New Zealand)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACETIC ACID; ACIDS; AMINATION; AMINES; CRYSTAL STRUCTURE; LIGANDS; LITHIUM; MASS SPECTROMETRY; MODEL STRUCTURES; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PH; PH EFFECTS; PHOTODEGRADATION; ZINC COMPOUNDS;

ACTIVE SITES; DINUCLEAR COMPLEXES; MASS SPECTROSCOPIES; ORGANO-PHOSPHATES; PHOSPHOESTERASES; STRUCTURAL MODELS; TETRAMER; X-RAY CRYSTAL STRUCTURES; ZINC COMPLEXES; ZN COMPLEXES;

ZINC;

ESTERASE; PHOSPHATE; ZINC;

ARTICLE; BIOCATALYSIS; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; HYDROGEN BOND; MASS SPECTROMETRY; METABOLISM; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

BIOCATALYSIS; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; ESTERASES; HYDROGEN BONDING; MASS SPECTROMETRY; MODELS, MOLECULAR; PHOSPHATES; ZINC;

EID: 55149118943     PISSN: 14779226     EISSN: 14779234     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b806391e     Document Type: Article

References (80)

1. F. Ely J. L. Foo C. J. Jackson L. R. Gahan D. L. Ollis G. Schenk Curr. Top. Biochem. Res. 2007 9 63 78
2. N. Mitic S. J. Smith A. Neves L. W. Guddat L. R. Gahan G. Schenk Chem. Rev. 2006 106 3338 3363
3. E. Kimura Curr. Opin. Chem. Biol. 2000 4 207 213
4. E. Ghanem Y. Li C. Xu F. M. Raushel Biochemistry 2007 46 9032 9040
5. M. M. Benning J. M. Kuo F. M. Raushel H. M. Holden Biochemistry 1994 33 15001 15007
6. E. Ghanem F. M. Raushel Toxicol. Appl. Pharmacol. 2005 207 S459 470
7. D. P. Dumas S. R. Caldwell J. R. Wild F. M. Raushel J. Biol. Chem. 1989 264 19659 19665
8. S. S. Rowland M. K. Speedie B. M. Pogell Appl. Environ. Microbiol. 1991 57 440 444
9. H. Yang P. D. Carr S. Y. McLoughlin J.-W. Liu I. Horne X. Qiu C. M. J. Jeffries R. J. Russell J. G. Oakeshott D. L. Ollis Protein Eng. 2003 16 135 145
10. I. Horne T. D. Sutherland R. L. Harcourt R. J. Russell J. G. Oakeshott Appl. Environ. Microbiol. 2002 68 3371 3376
11. J. A. Gerlt W. H. Y. Wan Biochemistry 1979 18 4630 4638
12. S. Y. McLoughlin C. J. Jackson J.-W. Liu D. L. Ollis Appl. Environ. Microbiol. 2004 70 404 412
13. C. J. Jackson P. D. Carr J.-W. Liu S. J. Watt J. Mol. Biol. 2007 367 1047 1062
14. C. J. Jackson P. D. Carr H.-K. Kim J.-W. Liu P. Herrald N. Mitic G. Schenk C. A. Smith D. L. Ollis Biochem. J. 2006
15. G. A. Omburo J. M. Kuo L. S. Mullins F. M. Raushel J. Biol. Chem. 1992 267 13278 13283
16. M. M. Benning H. Shim F. M. Raushel H. M. Holden Biochemistry 2001 40 2712 2722
17. S. D. Aubert Y. Li F. M. Raushel Biochemistry 2004 43 5707 5715
18. M. M. Benning J. M. Kuo F. M. Raushel H. M. Holden Biochemistry 1995 34 7973 7978
19. C. J. Jackson H.-K. Kim P. D. Carr J.-W. Liu D. L. Ollis Biochim. Biophys. Acta 2005 1752 56 64
20. C. J. Jackson J.-L. Foo H.-K. Kim P. D. Carr J.-W. Liu G. Salem D. L. Ollis J. Mol. Biol. 2008 375 1189 1196
21. V. E. Lewis W. J. Donarski J. R. Wild F. M. Raushel Biochemistry 1988 27 1591 1597
22. H. Shim F. M. Raushel Biochemistry 2000 39 7357 7364
23. M. Jarenmark H. Carlsson E. Nordlander C. R. Chim. 2007 10 433 462
24. R. Kramer T. Gajda Perspect. Bioinorg. Chem. 1999 4 209 240
25. H. Carlsson M. Haukka E. Nordlander Inorg. Chem. 2004 43 5681 5687
26. M. Jarenmark S. Kappen M. Haukka E. Nordlander Dalton Trans. 2008 993 996
27. A. K. Boudalis R. E. Aston S. J. Smith R. E. Mirams M. J. Riley G. Schenk A. G. Blackman L. R. Hanton L. R. Gahan Dalton Trans. 2007 5132 5139
28. J. Chen X. Wang Y. Zhu J. Lin X. Yang Y. Li Y. Lu Z. Guo Inorg. Chem. 2005 44 3422 3430
29. P. Karsten A. Neves A. J. Bortoluzzi M. Lanznaster V. Drago Inorg. Chem. 2002 41 4624 4626
30. M. Lanznaster A. Neves A. J. Bortoluzzi V. V. E. Aires B. Szpoganicz H. Terenzi P. C. Severino J. M. Fuller S. C. Drew L. R. Gahan G. R. Hanson M. J. Riley G. Schenk JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2005 10 319 332
31. S. J. Smith A. Casellato K. S. Hadler N. Mitic M. J. Riley A. J. Bortoluzzi B. Szpoganicz G. Schenk A. Neves L. R. Gahan JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2007 12 1207 1220
32. J. K. Bashkin Curr. Opin. Chem. Biol. 1999 3 752 758
33. A. Neves M. Lanznaster A. J. Bortoluzzi R. A. Peralta A. Casellato E. E. Castellano P. Herrald M. J. Riley G. Schenk J. Am. Chem. Soc. 2007 129 7486 7487
34. A. Neves M. A. de Brito V. Drago K. Griesar W. Haase Inorg. Chim. Acta 1995 237 131 135
35. G. Schenk R. A. Peralta S. C. Batista A. J. Bortoluzzi B. Szpoganicz A. K. Dick P. Herrald G. R. Hanson R. K. Szilagyi M. J. Riley L. R. Gahan A. Neves JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2008 13 139 155
36. L. L. Koh J. O. Ranford W. T. Robinson J. O. Svensson A. L. C. Tan D. Wu Inorg. Chem. 1996 35 6466 6472
37. J. M. Botha K. Umakoshi Y. Sasaki G. J. Lamprecht Inorg. Chem. 1998 37 1609 1615
38. R. T. Paine Y.-C. Tan X.-M. Gan Inorg. Chem. 2001 40 7009 7013
39. N. M. F. Carvalho A. Horn Jr. R. B. Faria A. J. Bortoluzzi V. Drago O. A. C. Antunes Inorg. Chim. Acta 2006 359 4250 4258
40. A. M. W. Cargill Thompson D. A. Bardwell J. C. Jeffery M. D. Ward Inorg. Chim. Acta 1998 267 239 247
41. C. White S. J. Thompson P. M. Maitlis J. Organomet. Chem. 1977 134 319 325
42. S. Kitagawa M. Kondo S. Kawata S. Wada M. Maekawa M. Munakata Inorg. Chem. 1995 34 1455 1465
43. U. Bossek G. Haselhorst S. Ross K. Wieghardt B. Nuber J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1994 2041 2048
44. N. G. Connelly T. Einig G. G. Herbosa P. M. Hopkins C. Mealli A. G. Orpen G. M. Rosair F. Viguri J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1994 2025 2039
45. A. R. Sherman, in Pyridine, Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis, ed., L. A. Paquette, J. Wiley & Sons, New York, 2004
46. G. P. Mullen E. H. Sepersu L. J. Ferrin L. A. Loeb A. S. Midvan J. Biol. Chem. 1990 265 14327
47. I. H. Segel, Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems, Wiley-Interscience, New York, 1975
48. J. Xia Y. Shi Y. Zhang Q. Miao W. Tang Inorg. Chem. 2003 42 70 77
49. B. Bauer-Siebenlist F. Meyer E. Farkas D. Vidovic J. A. Cuesta-Seijo R. Herbst-Irmer H. Pritzkow Inorg. Chem. 2004 43 4189 4202
50. C. Bazzicalupi A. Bencini E. Berni A. Bianchi V. Fedi V. Fusi C. Giorgi P. Paolettti B. Valtancoli Inorg. Chem. 1999 38 4115 4122
51. A. Bencini E. Berni A. Bianchi V. Fedi C. Giorgi P. Paolettti B. Valtancoli Inorg. Chem. 1999 38 6323 6325
52. M. Arca A. Bencini E. Berni C. Caltagrione F. A. Devillanova F. Isaia A. Garau C. Giorgi V. Lippolis A. Perra L. Tei B. Valtancoli Inorg. Chem. 2003 42 6929 6939
53. B. Bauer-Siebenlist F. Meyer E. Farkas D. Vidovic S. Dechert Chem.-Eur. J. 2005 11 4349 4360
54. E. Kimura T. Shiota T. Koike M. Shiro M. Kodama J. Am. Chem. Soc. 1990 112 5805 5811
55. T. Koike E. Kimura J. Am. Chem. Soc. 1991 113 8935 8941
56. Y. Gultneh A. R. Khan D. Blaise S. Chaudhry B. Ahvazi B. B. Marvey R. J. Butcher J. Inorg. Biochem. 1999 75 7 18
57. M. Yashiro H. Kaneiwa K. Onaka M. Komiyama Dalton Trans. 2004 605 610
58. L. M. Berreau Eur. J. Inorg. Chem. 2006 273 283
59. M. Livieri F. Mancin U. Tonellato J. Chin Chem. Commun. 2002 2862 2863
60. R. Mitra M. W. Peters M. J. Scott Dalton Trans. 2007 3924 3935
61. N. V. Kaminskaia C. He S. J. Lippard Inorg. Chem. 2000 39 3365 3373
62. C. He S. J. Lippard J. Am. Chem. Soc. 2000 122 184 185
63. C. R. Samples T. Howard F. M. Raushel V. J. De Rose Biochemistry 2005 44 11005 11013
64. K.-Y. Wong J. Gao Biochemistry 2007 46 13352 13369
65. G. Schenk L. R. Gahan L. E. Carrington N. Mitic M. Valizadeh S. E. Hamilton J. De Jersey L. W. Guddat Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 273 278
66. R. S. Cox G. Schenk N. Mitic L. R. Gahan A. C. Hengge J. Am. Chem. Soc. 2007 129 9550 9551
67. D. W. Christianson Acc. Chem. Res. 2005 38 191 201
68. S. Ciurli, Urease: Recent Insights on the Role of Nickel, Metal Ions in Life Sciences, ed., A. Sigel, H. Sigel, and, R. Sigel, John Wiley & Sons, Chichester, 2007
69. S. Ciurli S. Benini W. R. Rypniewski K. S. Wilson S. Miletti S. Mangani Coord. Chem. Rev. 1999 190-192 331 355
70. C. R. Samples F. M. Raushel V. J. DeRose Biochemistry 2007 46 3435 3442
71. X. Wang R. Y. N. Ho A. K. Whiting L. Que Jr. J. Am. Chem. Soc. 1999 121 9235 9236
72. M. B. Twitchett A. G. Sykes Eur. J. Inorg. Chem. 1999 2105 2115
73. B. K. Takasaki J. Chin J. Am. Chem. Soc. 1995 117 8582 8585
74. G. Feng D. Natale R. Prabaharan J. C. Mareque-Rivas N. H. Williams Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 7056 7059
75. M. Monroe, Molecular weight calculator for Windows 9x/ME/NT/00/XP, version 6.35, http://www.alchemistmatt.com
76. A. Altomare M. C. Burla M. Camalli G. L. Cascarano C. Giacovazzo A. Guagliardi A. G. G. Moliterni G. Polidori R. Spagna J. Appl. Crystallogr. 1999 32 115
77. G. M. Sheldrick, SHELXL-97, Program for refinement of crystal structures, University of Göttingen, Germany, 1997
78. L. J. Farrugia J. Appl. Crystallogr. 1999 32 837 838
79. L. J. Farrugia J. Appl. Crystallogr. 1999 30 565
80. P. Gans A. Sabatini A. Vacca J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1985 1195 1200