Computational study on the characteristics of the interaction in naphthalene⋯(H2X)n=1,2 (X = O, S) clusters

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 112, Issue 28, 2008, Pages 6344-6350

  Cabaleiro Lago, Enrique M ^a   Rodríguez Otero, Jesús ^b   Peña Gallego, Ángeles ^b  

^a Facultade de Ciencias   (Spain)

^b UNIVERSITY OF SANTIAGO DE COMPOSTELA   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FLOW INTERACTIONS;

COMPUTATIONAL STUDIES;

NAPHTHALENE;

HYDROGEN SULFIDE; NAPHTHALENE; NAPHTHALENE DERIVATIVE; WATER;

ARTICLE; CHEMICAL MODEL; CHEMISTRY; ELECTRON; HYDROGEN BOND;

ELECTRONS; HYDROGEN BONDING; HYDROGEN SULFIDE; MODELS, CHEMICAL; NAPHTHALENES; WATER;

EID: 50249146834     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp8021979     Document Type: Article

References (50)

1. Hobza, P.; Zaradnik, R. Intermolecular complexes: the role of van der Waals systems in physical chemistry and the biodisciplines; Elsevier: Amsterdam, 1988.
2. Meyer, E. A.; Castellano, R. K.; Diederich, F. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 1210.
3. Tsuzuki, S.; Uchimaru, T. Curr. Org. Chem. 2006, 10, 745.
4. Ma, J. C.; Dougherty, D. A. Chem. Rev. 1997, 97, 1303.
5. Nishio, M.; Hirota, M.; Umezawa, Y. The CH/[pi] interaction: evidence, nature and consequences; Wiley: New York, 1998.
6. Dykstra, C. E.; Lisy, J. M. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2000, 500, 375.
7. Garau, C.; Frontera, A.; Quiñonero, D.; Ballester, P.; Costa, A.; Deyá, P. M. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 9423.
8. Alkorta, I.; Elguero, J. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 9400.
9. Kim, D.; Tarakeshwar, P.; Kim, K. S. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 1250.
10. Desfrancois, C.; Carles, S.; Schermann, J. P. Chem. Rev. 2000, 100, 3943.
11. Kim, K. S.; Tarakeshwar, P.; Lee, J. Y. Chem. Rev. 2000, 100, 4145.
12. Hermida-Ramon, J. M.; Cabaleiro-Lago, E. M.; Rodriguez-Otero, J. J. Chem. Phys 2005, 122, 204315/1.
13. Duan, G. L.; Smith, V. H.; Weaver, D. F. Mol. Phys. 2001, 99, 1689.
14. Cheney, B. V.; Schultz, M. W.; Cheney, J. Biochim. Biophys. Acta 1989, 996, 116.
15. Tauer, T. P.; Derrick, M. E.; Sherrill, C. D. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 191.
16. Ringer, A. L.; Senenko, A.; Sherrill, C. D. Protein Sci. 2007, 16, 2216.
17. Tsuzuki, S.; Honda, K.; Uchimaru, T.; Mikami, M. J. Chem. Phys. 2004, 120, 647.
18. Feller, D.; Jordan, K. D. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 9971.
19. Hermida-Ramon, J. M.; Grana, A. M. J. Comput. Chem. 2007, 28, 504.
20. Zeinalipour-Yazdi, C. D.; Pullman, D. P. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 24260.
21. Reyes, A.; Tlenkopatchev, M. A.; Fomina, L.; Guadarrama, P.; Fomine, S. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 7027.
22. Sato, T.; Tsuneda, T.; Hirao, K. J. Chem. Phys. 2005, 123, 104307/1.
23. Walsh, T. R. Chem. Phys. Lett. 2002, 363, 45.
24. Collignon, B.; Hoang, P. N. M.; Picaud, S.; Liotard, D.; Rayez, M. T.; Rayez, J. C. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2006, 772, 1.
25. Brutschy, B. Chem. Rev. 2000, 100, 3891.
26. Ringer, A. L.; Figgs, M. S.; Sinnokrot, M. O.; Sherrill, C. D. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 10822.
27. van Mourik, T.; Price, S. L.; Clary, D. C. Chem. Phys. Lett. 2000, 331, 253.
28. van Mourik, T. Chem. Phys. 2004, 304, 317.
29. Zhang, R. B.; Somers, K. R. F.; Kryachko, E. S.; Nguyen, M. T.; Zeegers-Huyskens, T.; Ceulemans, A. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 8028.
30. Somers, K. R. F.; Kryachko, E. S.; Ceulemans, A. Chem. Phys. 2004, 301, 61.
31. Klarner, F.-G.; Panitzky, J.; Preda, D.; Scott, L. T. J. Mol. Model. 2000, 6, 318.
32. Kamieth, M.; Burkert, U.; Corbin, P. S.; Dell, S. J.; Zimmermann, S. C.; Klarner, F.-G. Eur. J. Org. Chem. 1999, 2741.
33. Hermida-Ramon, J. M.; Estevez, C. M. Chem. Eur. J. 2007, 13, 4743.
34. Horak, J.; Lindner, W. J. Chromatogr. A 2004, 1043, 177.
35. Kawamata, H.; Maeyama, T.; Mikami, N. Chem. Phys. Lett. 2003, 370, 535.
36. Schdiet, J.; Knott, W. J.; Le Barbu, K.; Schlag, E. W.; Weinkauf, R. J. Chem. Phys. 2000, 113, 9470.
37. Kryachko, E. S.; Nguyen, M. T. J. Phys. Chem A 2002, 106, 4267.
38. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theor. Comput. 2005, 1, 415.
39. Boys, S. F.; bernardi, F. Mol. Phys. 1970, 18, 553.
40. Chalasinski, G.; Szczesniak, M. M. Chem. Rev. 2000, 100, 4227.
41. Cabaleiro-Lago, E. M.; Otero, J. R. J. Chem. Phys. 2002, 117, 1621.
42. Cabaleiro-Lago, E. M.; Hermida-Ramon, J. M.; Pena-Gallego, A.; Martinez-Nunez, E.; Fernandez-Ramos, A. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2000, 498, 21.
43. Jeziorski, B.; Moszynski, R.; Szalewicz, K. Chem. Rev 1994, 94, 1887.
44. Misquitta, A. J.; Podeszwa, R.; Jeziorski, B.; Szalewicz, K. J. Chem. Phys. 2005, 123, 214103.
45. Bukowski, R.; Cencek, W.; Jankowski, P.; Jeziorska, M.; Jeziorski, B.; Kucharski, S. A.; Lotrich, V. F.; Misquitta, A. J.; Moszynski, R.; Patkowski, K.; Podeszwa, R.; Rybak, S.; Szalewicz, K.; Williams, H. L.; Wheatley, R. J.; Wormer, P. E. S.; Zuchowski, P. S. SAPT 2006: An Ab Initio Program for Many-Body Symmetry-Adapted Perturbation Theory Calculations of Intermolecular Interaction Energies. Sequential and parallel versions. Seehttp://www.physics.udel.edu/ ~szalewic/SAPT/index.html.
46. DALTON, a molecular electronic structure program, release 2.0 (2005), see: http://www.kjemi.uio.no/software/dalton/dalton.html.
47. Neese, F. ORCA - An Ab initio, DFT, and Semiempirical Electronic Structure Package, version 2.6-00; University of Bonn: Germany, 2007.
48. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; J. A. Montgomery, J.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D., Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
49. Tsuzuki, S.; Honda, K.; Uchimaru, T.; Mikami, N.; Tanabe, K. J. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 11450.
50. Bandyopadhyay, I.; Lee, H. M.; Kim, K. S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 1720.