Retinal models: Comparison of electronic absorption spectra in the gas phase and in methanol solution

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 29, 2008, Pages 8815-8823

  Muñoz Losa, Aurora ^a   Galván, Ignacio Fdez ^a   Aguilar, Manuel A ^a   Martín, M Elena ^a  

^a UNIVERSITY OF EXTREMADURA   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION; DYNAMICS; ELECTROMAGNETIC WAVE ABSORPTION; ENERGY ABSORPTION; GAS ABSORPTION; GAS DYNAMICS; HYDROCARBONS; LIGHT ABSORPTION; METHANOL; MOLECULAR DYNAMICS; QUANTUM CHEMISTRY; SOLVENTS; SPECTRUM ANALYSIS;

ABSORPTION SPECTRA; BROAD BANDS; COMPLETE SYSTEMS; CONDENSED-PHASE; ELECTRONIC ABSORPTION SPECTRUM; EXCITED STATES; GAS-PHASE; HIGH-LEVEL AB INITIO CALCULATIONS; IMINIUM; M ETHANOL SOLUTION; METHYL GROUPS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; PROTONATED SCHIFF BASE; SOLVENT SHIFT; SOLVENT STRUCTURES; VERTICAL TRANSITIONS;

GASES;

EID: 49149114429     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp800244h     Document Type: Article

References (42)

1. McBee, J. K.; Palczewski, K.; Baehr, W.; Pepperberg, D. R. Confronting Complexity: The Interlink of Phototransduction and Retinoid Metabolism in Vertebrate Retina. In Progress in Retinal and Eye Research; Elsevier: Oxford, Great Britain, 2001; Vol. 20, p 469.
2. Nathans, J.; Piantanida, T. P.; Eddy, R. L.; Shows, T. B.; Hogness, D. S. Science 1986, 232, 203.
3. Freedman, K. A.; Becker, R. S. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 1245.
4. Wald, G.; Brown, P. K. Science 1958, 127, 222.
5. Andersen, L. H.; Nielsen, I. B.; Kristensen, M. B.; El Ghazaly, M. O. A.; Haacke, S.; Nielsen, M. B.; Petersen, M. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12347.
6. Nielsen, I. B.; Lammich, L.; Andersen, L. H. Phys. Rev. Lett. 2006, 96, 018304.
7. Rajamani, R.; Gao, J. J. Comput. Chem. 2002, 23, 96.
8. Andruniów, T.; Ferré, N.; Olivucci, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 17908.
9. Muñoz Losa, A.; Fdez, Galván, I.; Martín, M. E.; Aguilar, M. A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 18064.
10. Fdez. Galván, I.; Sánchez, M. L.; Martín, M. E.; Olivares del Valle, F. J.; Aguilar, M. A. Comput. Phys. Commun. 2003, 155, 244,
11. González-Luque, R.; Garavelli, M.; Bernardi, F.; Merchán, M.; Robb, M. A.; Olivucci, M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000, 97, 9379.
12. Lee, H. M.; Kim, J.; Kim, C.-J.; Kim, K. S. J. Chem. Phys. 2002, 116, 6549.
13. Sánchez, M. L.; Aguilar, M. A.; Olivares del Valle, F. J. J. Comput. Chem. 1997, 18, 313.
14. Sánchez, M. L.; Martín, M. E.; Aguilar, M. A.; Olivares del Valle, F. J. J. Comput. Chem. 2000, 21, 705.
15. Martín, M. E.; Sánchez, M. L.; Olivares del Valle, F. J.; Aguilar, M. A. J. Chem. Phys. 2002, 116, 1613.
16. Sánchez, M. L.; Martín, M. E.; Fdez. Galván, I.; Olivares del Valle, F. J.; Aguilar, M. A. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 4813.
17. Fdez. Galván, I.; Olivares del Valle, F. J.; Martín, M. E.; Aguilar, M. A. Theor. Chem. Ace. 2004, 111, 196.
18. Martín, M. E.; Sánchez, M. L.; Olivares del Valle, F. J.; Aguilar, M. A. J. Chem. Phys. 2000, 113, 6308.
19. Martín, M. E.; Sánchez, M. L.; Aguilar, M. A.; Olivares del Valle, F. J. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2001, 537, 213.
20. Martín, M. E.; Muñoz Losa, A.; Fdez. Galván, I.; Aguilar, M. A. J. Chem. Phys. 2004, 121, 3710.
21. Fdez. Galván, I.; Aguilar, M. A.; Ruiz-López, M. F. J. Phys. Chem B 2005, 109, 23024.
22. Muñoz Losa, A.; Martín, M. E.; Fdez. Galván, I.; Aguilar, M. A. Chem. Phys. Lett. 2007, 443, 76.
23. Muñoz Losa, A.; Fdez. Galván, I.; Sánchez, M. L.; Martín, M. E.; Aguilar, M. A. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 877.
24. Fdez. Galván, I.; Sánchez, M. L.; Martín, M. E.; Olivares del Valle, F. J.; Aguilar, M. A. J. Chem. Phys. 2003, 118, 255.
25. Okuyama-Yoshida, N.; Nagaoka, M.; Yamabe, T. Int. J. Quantum Chem. 1998, 70, 95.
26. Okuyama-Yoshida, N.; Kataoka, K.; Nagaoka, M.; Yamabe, T. J. Chem. Phys. 2000, 113, 3519.
27. Hirao, H.; Nagae, Y.; Nagaoka, M. Chem. Phys. Lett. 2001, 348, 350.
28. Muñoz Losa, A.; Fdez. Galván, I.; Aguilar, M. A.; Martín, M. E. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 9864.
29. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Baboul, A. G.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Gonzalez, C.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
30. Andersson, K.; Barysz, M.; Bernhardsson, A.; Blomberg, M. R. A.; Carissan, Y.; Cooper, D. L.; Fülscher, M. P.; Gagliardi, L.; de Graaf, C.; Hess, B. A.; Hagberg, D.; Karlström, G.; Lindh, R.; Malmqvist, P.-Å.; Nakajima, T.; Neogrády, P.; Olsen, J.; Raab, J.; Roos, B. O.; Ryde, U.; Schimmelpfennig, B.; Schutz, M.; Seijo, L.; Serrano-Andrés, L.; Siegbahn, P. E. M.; Stålring, J.; Thorsteinsson, T.; Veryazov, V.; Widmark, P.-O. MOLCAS, version 6; University of Lund: Lund, Sweden, 2006.
31. Refson, K. Comput. Phys. Commun. 2000, 126, 310.
32. Refson, K. Physica 1985, 131 B, 256.
33. Röhrig, U. F.; Guidoni, L.; Rothlisberger, U. ChemPhysChem 2005, 6, 1836.
34. Platz, P. E.; Moheler, J. H. Biochemistry 1975, 14, 2340.
35. Cornell, W. D.; Cieplack, P.; Bayly, C. I.; Groud, K. M.; Fergurson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Cladwell, J. W.; Koliman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179.
36. Allen, M. P.; Tildesley, D. J. Computer Simulation of Liquids; Clarendon Press: Oxford, 1987; p 156.
37. Chirlian, L. E.; Francl, M. M. J. Comput. Chem. 1987, 8, 894.
38. Breneman, C. M.; Wiberg, K. B. J. Comput. Chem. 1990, 11, 361.
39. Hoover, W. G. Phys. Rev. A 1985, 31, 1695.
40. Cembran, A.; González-Luque, R.; Altoé, P.; Merchán, M.; Bernardi, F.; Olivucci, M.; Garavelli, M. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 6597.
41. Wanko, M.; Hoffman, M.; Strodel, P.; Koslowski, A.; Thiel, W.; Neese, F.; Frauenheim, T.; Elstner, M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 3606.
42. Hufen, J.; Sugihara, M.; Buss, V. J. Chem. Phys. B 2004, 108, 20419.