Absorption of schiff-base retinal chromophores in vacuo

Journal of the American Chemical Society

Volumn 127, Issue 35, 2005, Pages 12347-12350

  Andersen, Lars H ^a   Nielsen, Iben B ^a   Kristensen, Michael B ^a   El Ghazaly, Mohamed O A ^a   Haacke, Stefan ^b   Nielsen, Mogens Brøndsted ^c   Petersen, Michael Åxman ^c  

^a AARHUS UNIVERSITY   (Denmark)

^b INSTITUT DE PHYSIQUE ET CHIMIE DES MATÉRIAUX DE STRASBOURG   (France)

^c UNIVERSITY OF COPENHAGEN   (Denmark)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION; BACTERIA; PROTEINS; PROTON IRRADIATION; PROTONS;

ACIDIFICATION; DEPROTONATION; PROTONATION;

CHROMOPHORES;

BACTERIORHODOPSIN; METHANOL; PROTEIN; RHODOPSIN; SCHIFF BASE; SOLVENT;

ABSORPTION SPECTROPHOTOMETRY; ACIDIFICATION; ARTICLE; CHROMATOPHORE; COLOR; DIPOLE; GAS; MEASUREMENT; PROTON TRANSPORT; RETINA;

BACTERIORHODOPSINS; PROTONS; RETINALDEHYDE; RHODOPSIN; SCHIFF BASES; SOLVENTS; SPECTROPHOTOMETRY;

EID: 24644516977     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja051638j     Document Type: Article

References (35)

1. Wald, G. Science 1968, 162, 230.
2. Kochendoerfer, G. G.; Lin, S. W.; Sakmar, T.; Mathies, R. A. Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 300.
3. Fung, B. K.; Stryer, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1980, 77, 2500.
4. Palczewski, K.; et al. Science 2000, 289, 739-745.
5. Oesterhelt, D.; Stoeckenius, W. Nat. New Biol. 1971, 233, 149.
6. Haupts, U.; Tittor, J.; Oesterhelt, D. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1999, 28, 367.
7. Lanyi, J. K. Nature 1995, 375, 461.
8. Freedman, K. A.; Becker, R. S. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 1245.
9. Nakanishi, N. K.; Balogh-Nair, V.; Arnaboldi, M.; Tsujimoto, K.; Honig, B. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 7945.
10. Stryer, L. Biochemistry; Freeman: New York, 2000.
11. Irving, C. S.; Byers, G. W.; Leermake, P. A. Biochemistry 1970, 9, 858.
12. Albeck, A.; Livnah, N.; Gottlieb, H.; Sheves, M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 2400.
13. Zhukovsky, E. A.; Oprian, D. D. Science 1989, 246, 928.
14. Gonzáles-Luque, R.; Garavelli, M.; Bernardi, F.; Merchán, M.; Robb, M. A.; Olivucci, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 9379.
15. Vreven, T.; Morokuma, K. Theor. Chem. Acc. 2003, 109, 125.
16. Rajamani, J.; Gao, J. Comput. Chem. 2002, 23, 96.
17. Andersen, J. U.; Hvelplund, P.; Nielsen, S. B.; Tomita, S.; Wahlgreen, H.; Møller, S. P.; Pedersen, U. V.; Forster, J. S.; Jørgensen, T. J. D. Rev. Sci. Instrum. 2002, 73, 1284.
18. Møller, S. P. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res., Sect. A 1997, 394, 281.
19. Andersen, L. H.; Heber, O.; Zajfman, D. J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys. 2004, 37, R57.
20. Andersen, L. H.; Bluhme, H.; Boye, S.; Jørgensen, T. J. D.; Krogh, H.; Nielsen, I. B.; Nielsen, S. B.; Svendsen, A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2617-2627.
21. Salem, L.; Bruckmann, P. Nature 1975, 258, 526.
22. Warshel, A. Nature 1976, 260, 679.
23. Nielsen, S. B.; Andersen, J. U.; Forster, J. S.; Hvelplund, P.; Liu, B.; Pedersen, U. V.; Tomita, S. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 048302.
24. Ben-Nun, M.; Molnar, F.; Schulten, K.; Martinez, T. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 1769.
25. Cembran, A.; Gonzáles-Luque, R.; Altoè, P.; Merchán, M.; Bernardi, F.; Olivucci, M.; Garavelli, M. J. Phys. Chem. A, in press.
26. Nielsen, S. B.; Lapierre, A.; Andersen, J. U.; Pedersen, U. V.; Tomita, S.; Andersen L. H. Phys. Rev. Lett. 2001, 87, 2281021.
27. Andersen, L. H.; Lapierre, A.; Nielsen, S. B.; Nielsen, I. B.; Pedersen, S. U.; Pedersen, U. V.; Tomita, S. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 597-600.
28. Boyé, S.; Nielsen, S. B.; Krogh, H.; Nielsen, I. B.; Pedersen, U. V.; Bell, A. F.; He, X.; Tonge, P. J.; Andersen, L. H. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 5, 3021-3026.
29. Nielsen, I. B.; Boyé-Péronne, S.; El Ghazaly, M. O. A.; Kristensen, M. B.; Brøndsted Nielsen, S.; Andersen, L. H. Biophys. J., to appear.
30. Merbs, S. L.; Nathans, J. Nature 1992, 356, 433.
31. Mathies, R.; Stryer, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1976, 73, 2169.
32. Subramaniam, S.; Marti, T.; Khorana, H. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 1013.
33. Andruniow, T.; Ferré, N.; Olivucci, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 17908.
34. Birge, R. R.; Cooper, T. M.; La Wrence, A. F.; Masthay, M. B.; Vasilakis, C.; Zhang, C. F.; Zidovetzki, R. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 4063-4074.
35. Schreiber, M.; Buss, V.; Sugihara, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 12045.