Conformational preconditioning by electrophoresis of DNA through a finite obstacle array

Macromolecules

Volumn 41, Issue 14, 2008, Pages 5485-5492

  Balducci, A ^a   Doyle, P S ^a  

^a Massachusetts Institute of Technology Cambridge   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; ELECTRIC FIELDS; ELECTROCHEMISTRY; ELECTROMAGNETIC FIELD THEORY; ELECTROMAGNETIC FIELDS; ELECTROPHORESIS; GENES; NUCLEIC ACIDS; ORGANIC ACIDS; SHRINKAGE;

DNA CONFORMATIONS; GEOMETRICAL PARAMETERS; MICRO CHANNELS; MODEL SYSTEMS; OBSTACLE ARRAY; PRE-DEFORMATION; REPRODUCIBILITY;

CONFORMATIONS;

EID: 49049085054     PISSN: 00249297     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ma8010087     Document Type: Article

References (44)

1. Perkins, T.; Smith, D.; Chu, S. Science 1997, 276, 2016.
2. Smith, D.; Chu, S. Science 1998, 281, 1335.
3. de Gennes, P. G. Science 1997, 276, 1999.
4. Randall, G. C.; Schultz, K. M.; Doyle, P. S. Lab Chip 2006, 6, 516.
5. Chan, E. Y.; Goncalves, N. M.; Haeusler, R. A.; Hatch, A. J.; Larson, J. W.; Maletta, A. M.; Yantz, G. R.; Carstea, E. D.; Fuchs, M.; Wong, G. G.; Gullans, S. R.; Gilmanshin, R. Gen. Res. 2004, 14, 1137.
6. Larson, J. W.; Yantz, G. R.; Zhong, Q.; Charnas, R.; D'Antoni, C. M.; Gallo, M. V.; Gillis, K. A.; Neely, L. A.; Phillips, K. M.; Wong, G. G.; Gullans, S. R.; Gilmanshin, R. Lab Chip 2006, 9, 1187.
7. Schwartz, D. C.; Li, X.; Hernandez, L. I.; Ramnarain, S. P.; Huff, E. J.; Wang, Y.-K. Science 1993, 262, 110.
8. Riehn, R.; Lu, M.; Wang, Y.-M.; Lim, S. F.; Cox, E. C.; Austin, R. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 10012.
9. Jo, K.; Dhingra, D. M.; Odijk, T.; de Pablo, J. J.; Graham, M. D.; Runnheim, R.; Forrest, D.; Schwartz, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 2673.
10. Larson, R. G. J. Non-Newtonian Fluid Mech. 2000, 94, 37.
11. Larson, R. G. J. Rheol. 2005, 49, 1.
12. Kim, J. M.; Doyle, P. S. Lab Chip 2007, 7, 213.
13. Chun-Chen, Z.; Feng, J.; Qian-Qian, C.; Jing-Song, Y. Polymer 2008, 49, 809.
14. Larson, R. G.; Hu, H.; Smith, D. E.; Chu, S. J. Rheol. 1999, 43, 267.
15. Randall, G. C.; Doyle, P. S. Macromolecules 2006, 39, 7734.
16. Kim, J. M.; Doyle, P. S. Macromolecules 2007, 40, 9151.
17. Minc, N.; Fütterer, C.; Dorfman, K.; Bancaud, A.; Gosse, C.; Goubault, C.; Viovy, J.-L. Anal. Chem. 2004, 76, 3770.
18. Dorfman, K. D. Phys. Rev. E 2006, 73, 061922.
19. Mohan, A.; Doyle, P. S. Phys. Rev. E 2007, 76, 040903(R)
20. Sevick, E. M.; Williams, D. R. M. Phys. Rev. Lett. 1996, 76, 2595.
21. Nixon, G. I.; Slater, G. W. Phys. Rev. E 1994, 50, 5033.
22. Underhill, P. T.; Doyle, P. S. Phys. Rev. E 2007, 76, 011805.
23. Randall, G. C.; Doyle, P. S. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 05812(4)
24. Mohan, A.; Doyle, P. S. Macromolecules 2007, 40, 4301.
25. Saville, P. M.; Sevick, E. M. Macromolecules 1999, 32, 892.
26. Sevick, E. M.; Williams, D. R. M. Phys. Rev. E 1994, 50, 3357.
27. de Gennes, P. G. J. Chem. Phys. 1974, 60, 5030.
28. Magda, J. J.; Larson, R. G.; Mackay, M. E. J. Chem. Phys. 1988, 89, 2504.
29. Larson, R. G.; Magda, J. J. Macromolecules 1989, 22, 3004.
30. Marko, J. F.; Siggia, E. D. Macromolecules 1995, 28, 8759.
31. Wong, P.; Lee, Y.-K.; Ho, C.-M. J. Fluid Mech. 2003, 497, 55.
32. Lumley, J. L. Phys. Fluids 1977, 20, s64.
33. Randall, G. C.; Doyle, P. S. Macromolecules 2005, 38, 2410.
34. Tang, J.; Doyle, P. S. Appl. Phys. Lett. 2007, 90, 224103.
35. Juang, Y.-J.; Wang, S.; Hu, X.; Lee, L. J. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 268105.
36. Long, D.; Viovy, J.-L.; Ajdari, A. Phys. Rev. Lett. 1996, 76, 3858.
37. Deutsch, J. M.; Madden, T. L. J. Chem. Phys. 1989, 90, 2476.
38. Volkmuth, W. D.; Austin, R. H. Nature (London) 1992, 358, 600.
39. Kaji, N.; Tezuka, Y.; Takamura, Y.; Ueda, M.; Nishimoto, T.; Nakanishi, H.; Horiike, Y.; Baba, Y. Anal. Chem. 2004, 76, 15.
40. Patel, P. D.; Shaqfeh, E. S. G. J. Chem. Phys. 2003, 118, 2941.
41. Teclcmariam, N. P.; Beck, V. A.; Shaqfeh, E. S. G.; Muller, S. J. Macromolecules 2007, 40, 3848.
42. Randall, G. C.; Doyle, P. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 10813.
43. Doi, M.; Edwards, S. F. The Theory of Polymer Dynamics; Oxford University Press: Oxford, 1986.
44. Hsieh, C.-C.; Balducci, A.; Doyle, P. S. Macromolecules 2007, 40, 5196.