α-helical peptides are not protonated at the N-terminus in the gas phase

Journal of the American Chemical Society

Volumn 126, Issue 39, 2004, Pages 12278-12279

  Wieczorek, Robert ^a,b   Dannenberg, J J ^a  

^a CITY UNIVERSITY OF NEW YORK   (United States)

^b UNIVERSITY OF WROC AW   (Poland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALANINE; PEPTIDE; SYNTHETIC PEPTIDE;

ALPHA HELIX; AMINO TERMINAL SEQUENCE; ARTICLE; BINDING AFFINITY; CARBOXY TERMINAL SEQUENCE; ENERGY TRANSFER; GAS; GEOMETRY; HYDRATION; HYDROGEN BOND; PROTEIN STRUCTURE; PROTON TRANSPORT; QUANTUM CHEMISTRY;

ALANINE; GASES; MODELS, MOLECULAR; PEPTIDES; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; THERMODYNAMICS; WATER;

EID: 4644266470     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja048033s     Document Type: Article

References (26)

1. Moisan, S.; Dannenberg, J. J. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 12842.
2. (a) Kennedy, R. J.; Tsang, K.-Y.; Kemp, D. S. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 934.
3. (b) Smythe, M. L.; Huston, S. E.; Marshall, G. R. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5445.
4. (c) Hanson, P.; Martinez, G.; Millhauser, G.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C.; Vita, C. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 271.
5. (d) Wolf, W. M.; Stasiak, M.; Leplawy, M. T.; Bianco, A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 11558.
6. (e) Karle, I. L. J. Mol. Struct. 1999, 474, 103.
7. (f) Jaravine, V. A.; Alexandrescu, A. T.; Grzesiek, S. Protein Sci. 2001, 10, 943.
8. (g) Silva, R. A. G. D.; Yasui, S. C.; Kubelka, J.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C.; Keiderling, T. A. Biopolymers 2002, 65, 229.
9. (a) Mohle, K.; Hofmann, H.-J. J. Pept. Res. 1998, 51, 19.
10. (b) Topol, I. A.; Burt, S. K.; Deretey, E.; Tang, T.-H.; Perczel, A.; Rashin, A.; Csizmadia, I. G. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 6054-6060.
11. (c) Elstner, M.; Jalkanen, K. J.; Knapp-Mohammady, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S. Chem. Phys. 2000, 256, 15.
12. (d) Wu, Y.-D.; Zhao, Y.-L. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 5313.
13. (e) Wu, X.; Wang, S. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 2227.
14. (f) Kubelka, J.; Gangani, R. A.; Silva, D.; Keiderling, T. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 5325.
15. (g) Bour, P.; Kubelka, J.; Keiderling, T. A. Biopolymers 2002, 65, 45.
16. (h) Ireta, J.; Neugebauer, J.; Scheffler, M.; Rojo, A.; Galvan, M. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 1432.
17. (a) Wieczorek, R.; Dannenberg, J. J. J. Am. Chem. Soc 2003, 125, 8124.
18. (b) Wieczorek, R.; Dannenberg, J. J. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, in press.
19. Kobko, N.; Dannenberg, J. J. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 10389.
20. Dapprich, S.; Komiromi, I.; Byun, K. S.; Morokuma, K.; Frisch, M. J. THEOCHEM 1999, 0166.
21. Dewar, M. J. S.; Zoebisch, E. G.; Healy, E. F.; Stewart, J. J. P. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 3902.
22. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98, revision A.11; A.11 ed.; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998-2001.
23. (a) Hudgins, R. R.; Mao, Y.; Ratner, M. A.; Jarrold, M. F. Biophys. J. 1999, 76, 1591.
24. (b) Hudgins, R. R.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 3494.
25. (a) Goodman, M.; Listowsky, I.; Masuda, Y.; Boardman, F. Biopolymers 1963, 1, 33.
26. (b) Wallimann, P.; Kennedy, R. J.; Miller, J. S.; Shalongo, W.; Kemp, D. S. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 1203.