SWNT-DNA and SWNT-polyC hybrids: AFM study and computer modeling

Journal of Nanoscience and Nanotechnology

Volumn 8, Issue 3, 2008, Pages 1473-1480

  Karachevtsev, M V ^a   Lytvyn, O S ^b   Stepanian, S G ^a   Leontiev, V S ^a   Adamowicz, L ^c   Karachevtsev, V A ^a  

^a B VERKIN INSTITUTE FOR LOW TEMPERATURE PHYSICS AND ENGINEERING   (Ukraine)

^b INSTITUTE OF SEMICONDUCTOR PHYSICS   (Ukraine)

^c University of Arizona   (United States)

Author keywords

Ab initio calculation; Atom force microscopy; Biocompatibility; Bionanohybrids; Carbon nanotubes; DNA

Indexed keywords

INTERACTION ENERGY; INTERMOLECULAR INTERACTIONS;

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; DNA; POLYMERS; SELF ASSEMBLY;

SINGLE-WALLED CARBON NANOTUBES (SWCN);

CARBON NANOTUBE; DNA; POLYCYTIDYLIC ACID; SINGLE STRANDED DNA;

ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CHEMISTRY; CONFORMATION; METHODOLOGY; NANOTECHNOLOGY; THERMODYNAMICS;

DNA; DNA, SINGLE-STRANDED; MICROSCOPY, ATOMIC FORCE; NANOTECHNOLOGY; NANOTUBES, CARBON; NUCLEIC ACID CONFORMATION; POLY C; THERMODYNAMICS;

EID: 42449149205     PISSN: 15334880     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1166/jnn.2008.032     Document Type: Conference Paper

References (34)

1. A. Guiseppi-Elie, Ch. Lei, and R. H. Baughman. Nanotechnology 13, 559 (2002).
2. K. Besteman, J. O. Lee, F. G. Wiertz, H. A. Heering, and C. Dekker, Nano Lett. 3, 727 (2003).
3. A. Star, J.-Ch. P. Gabriel, K. Bradley, and G. Gruner, Nano Lett. 3, 459 (2003).
4. A. Salimia, R. G. Comptonb, and R. Hallaja, Analytical Biochemistry 333, 49 (2004).
5. Y. Lin, F. Lu, Yi Tu, and Z. Ren, Nano Lett. 4, 191 (2004).
6. D. M. Guildi, G. M. A. Rahman, F. Zeberetto, and M. Prato, Acc. Chem. Res. 38, 871 (2005).
7. Chlopek, B. Czajkowska, B. Szaraniec, E. Frackowiak, K. Szostak. and F. Berguin, Carbon 44, 1106 (2006).
8. K. Keren, R. S. Berman, E. Buchstab, U. Sivan, and E. Braun, Science 302, 1380 (2003).
9. N. Nakashima, S. Okuzono, H. Murakami, T. Nakai, and K. Yoshikawa, Chemistry Letters 32, 456 (2003).
10. M. Zheng, A. Jagota, E. Semke, B. Diner, R. Mclean, S. Lustig Richardson, and N. Tassi, Nature Materials 2, 338 (2003).
11. M. Zheng, A. Jagota, M. Strano, A. Santos, P. Barone, S. Chou, B. Diner, M. Dresselhaus, R. Mclean, G. Onoa, G. Samsonidze, E. Semke, M. Usrey, and D. Walls, Science 302, 1545 (2003).
12. B. Gigliotti, B. Sakizzie, D. S. Bethune, R. M. Shelby, and J. N. Cha, Nano Lett. 6, 159 (2006).
13. X. Hu, T. Wang, X. Qu, and S, J. Dong, J. Phys. Chem. B 110, 853 (2006).
14. E. S. Jeng, A. E. Moll, A. C. Roy, J. B. Gastala, and M. S. Strano, Nano Lett. 6, 371 (2006).
15. Y. Ma, S. R. Ali, A. S. Dodoo, and H. He, J. Phys. Chem. B 110, 16359 (2006).
16. N. Nakayama, E. Yenilmez, Y.-I. Chang, Q. Wang, X. Tang. S. Bansaruntip, Nano Lett. 6, 1632 (2006).
17. Y. Lu, S. Bangsaruntip, X. Wang, L. Zhang, Y. Nishi, and H. Dai. J. Am. Chem. Soc. 128, 3518 (2006).
18. G. Dukovic, M. Balaz, P. Doak, N. D. Berova, M. Zheng, R. S. Mclean, L. E. Brus, and J. Racemic, J. Am. Chem. Soc. 128, 9004 (2006).
19. V. A. Karachevtsev, A. Yu. Glamazda, U. Dettlaff-Weglikowska, V. S. Leontiev, P. V. Mateichenko, S. Roth, A. M. Rao, Carbon 44, 1292 (2006).
20. D. A. Heller, E. S. Jeng, T.-K. Yeung, B. M. Martinez, A. E. Moll. J. B. Gastala, and M. Strano, Science 311, 508 (2006).
21. V. A. Karachevtsev, A. Yu. Glamazda, V. S. Leontiev, O. S. Lytvyn, and U. Dettlaff-Weglikowska, Chem. Phys. Lett. 435, 104 (2007).
22. V. A. Karachevtsev, A. Yu. Glamazda, U. Dettlaff-Weglikowska, V. S. Kurnosov, E. D. Obraztsova, A. V. Peschanskii, V. V. Eremenko. S. Roth, Carbon 41, 1567 (2003).
23. G. O. Gladchenko, M. V. Karachevtsev, V. S. Leontiev, V. A. Valeev. A. Yu. Glamazda, A. M. Plokhotnichenko, S. G. Stepanian, Molecular Physics (2006) (has been accepted).
24. W. D. Cornell, P. Cieplak, C. I. Bayly, I. R. Gould, K. M. Merz, D. M. Ferguson, D. C. Spellmeyer, T. Fox, J. W. Caldwell, P. A. Kollman, J. Am. Chem. Soc. 117, 5179 (1995).
25. Gaussian 03, Revision B.05, M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin. D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, and J. A. Pople, Gaussian, Inc., Wallingford CT (2004).
26. S. Taeger, L. Y. Xuang, K. Gunther, M. Mertig, Electronic properties of novel materials, edited by H. Kuzmany, J. Fink, M. Mehring. S. Roth, AIP Conference Proceedings, 786, 262 (2005).
27. S. Wong, A. T. Woolley, T. Wang Odom, J.-L. Huang, P. Kim, D. V. Vezenov, C. M. Liebera, Appl. Phys. Lett. 73, "3465 (1998).
28. T. Thundat, D. P. Allison, and R. J. Warmack, Nucleic Acids Research 22, 4224 (1994).
29. Y. Lu, X. Yang, Y. Ma, F. Du, Z. Liu, and Y. Chen, Chem. Phys. Lett. 419, 390 (2006).
30. J. Rajendra and A. Rodger, Chem. Eur. J. 11, 4841 (2005).
31. W. Saenger, Principles of Nucleic Acid Structure, Springer-Verlag, Berlin, New York, Tokio (1984).
32. C. Bustamante, J. Vesenka, C. L. Tang, W. Rees, M. Guthold, and R. Keller, Biochemistry 31, 22 (1992).
33. J. Martinez, T. D. Yuzvinsky, A. M. Fennimore, A. Zettl, R. Garcia, and C. Bustamante, Nanotechnology 16, 2493 (2005).
34. S. G. Stepanian, V. K. Karachevtsev, A. Yu. Glamazda, U. Dettlaff-Weglikowska, L. Adamowicz, Mol. Phys. 101, 2609 (2003).