Determining thermodynamic parameters from isothermal calorimetric isotherms of the binding of macromolecules to metal cations originally chelated by a weak ligand

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 2, 2008, Pages 604-611

  Hong, Lian ^a   Bush, William D ^a   Hatcher, Lanying Q ^a   Simon, John ^a  

^a DUKE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING ENERGY; CHELATION; MACROMOLECULES; PARAMETER ESTIMATION; PEPTIDES;

ALZHEIMER'S AMYLOID; BINDING CONSTANT; ISOTHERMAL CALORIMETRIC ISOTHERMS;

THERMODYNAMICS;

EID: 38749114643     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp075747r     Document Type: Article

References (50)

1. Wiseman, T.; Williston, S.; Brandts, J. F.; Lin, L. N. Anal. Biochem. 1989, 179, 131.
2. Bolles, T. F.; Drago, R. S. J. Am. Chem. Soc. 1965, 87, 5015.
3. Sigurskjold, B. W. Anal. Biochem. 2000, 277, 260.
4. Saboury, A. A. J. Iran. Chem. Soc. 2006, 3, 1.
5. ITC Data Analysis in Origin, Tutorial Guide, version 7.0; Micro-Cal: Northampton, MA, 2004.
6. Privalov, P. L.; Dragan, A. I. Biophys. Chem. 2007, 126, 16.
7. Homans, S. W. Top. Curr. Chem. 2007, 272, 51.
8. Behbehani, G. R.; Saboury, A. A. Thermochim. Acta 2007, 452, 76.
9. Ababou, A.; Ladbury, J. E. / Mol. Recognit. 2007, 20, 4.
10. Zerovnik, E.; Skerget, K.; Tusek-Znidaric, M.; Loeschner, C.; Brazier, M. W.; Brown, D. R. FEBS J. 2006, 273, 4250.
11. Velazquez-Campoy, A.; Freire, E. Nat. Protoc. 2006, 1, 186.
12. Sivaraja, V.; Kumar, T. K. S.; Rajalingam, D.; Graziani, I.; Prudovsky, I.; Yu, C. Biophys. J. 2006, 91, 1832.
13. Guilloreau, L.; Damian, L.; Coppel, Y.; Mazarguil, H.; Winterhalter, M.; Faller, P. JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2006, 11, 1024.
14. Frasca, V. Am. Biotechnol. Lab. 2006, 24, 8.
15. Ababou, A.; Ladbury, J. E. J. Mol. Recognit. 2006, 19, 79.
16. Tinoco, A. D.; Valentine, A. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 11218.
17. Thompsett, A. R.; Abdelraheim, S. R.; Daniels, M.; Brown, D. R. J. Biol. Chem. 2005, 280, 42750.
18. Creagh, A. L.; Tiong, J. W. C.; Tian, M. M.; Haynes, C. A.; Jefferies, W. A. J. Biol. Chem. 2005, 280, 15735.
19. Ladbury, J. E. BioTechniques 2004, 37, 885.
20. Kim, H.-S. J. Ind. Eng. Chem. (Seoul, Repub. Korea) 2004, 10, 273.
21. Clugston, S. L.; Yajima, R.; Honek, J. F. Biochem. J. 2004, 377, 309.
22. Bekker, E. G.; Creagh, A. L.; Sanaie, N.; Yumoto, F.; Lau, G. H. Y.; Tanokura, M.; Haynes, C. A.; Murphy, M. E. P. Biochem. 2004, 43, 9195.
23. Abajian, C.; Yatsunyk, L. A.; Ramirez, B. E.; Rosenzweig, A. C. J. Biol. Chem. 2004, 279, 53584.
24. Su, M.; Cavallo, S.; Stefanini, S.; Chiancone, E.; Chasteen, N. D. Biochem. 2005, 44, 5572.
25. Schilling, O.; Vogel, A.; Kostelecky, B.; Natal da luz, H.; Spemann, D.; Spaeth, B.; Marchfelder, A.; Troeger, W.; Meyer-Klaucke, W. Biochem. J. 2005, 385, 145.
26. Bou-Abdallah, F.; Arosio, P.; Levi, S.; Janus-Chandler, C.; Chasteen, N. D. J. Biol. Inorg. Chem. 2003, 8, 489.
27. Saboury, A. A.; Atri, M. S.; Sanati, M. H.; Moosavi-Movahedi, A. A.; Hakimelahi, G. H.; Sadeghi, M. Biopolymers 2006, 81, 120.
28. Atri, M. S.; Saboury, A. A.; Rezaei-Tavirani, M.; Sanati, M. H.; Moosavi-Movahedi, A. A.; Sadeghi, M.; Mansuri-Torshizi, H.; Khodabandeh, M. Thermochim. Acta 2005, 438, 178.
29. Saboury, A. A.; Atri, M. S.; Sanati, M. H.; Moosavi-Movahedi, A. A.; Haghbeen, K. Int. J. Biol. Macromol. 2005, 36, 305.
30. Bush, W. D.; Simon, J. D. Pigm. Cell Res. 2007, 20. 134.
31. CRC Handbook of Chemistry and Physics, 72nd ed.; CRC Press: Boca Raton, FL. 1992.
32. Hu, D. D.; Eftink, M. R. Biophys. Chem. 1994, 49, 233.
33. Zhang, Y.; Wilcox, D. E. JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2002, 7, 327.
34. VP-ITC Microcalorimeter. User's Manual; MicroCal: Northampton, MA, 2006.
35. Karr, J. W.; Kaupp, L. J.; Szalai, V. A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 13534.
36. Garzon-Rodriguez, W.; Yatsimirsky, A. K.; Glabe, C. G. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1999, 9, 2243.
37. Martell, A. E.; Smith, R. M.; Motekaitis, R. J. NIST critically selected stability constants of metal complexes. In NIST Standard Reference Database 46, version 8.0; National Institute of Standards and Technology: College Station, TX. 2004.
38. Atwood, C. S.; Scarpa, R. C.; Huang, X.; Moir, R. D.; Jones, W. D.; Fairlie, D. P.; Tanzi, R. E.; Bush, A. I. J. Neurochem. 2000, 75, 1219.
39. Atwood, C. S.; Moir, R. D.; Huang, X.; Scarpa, R. C.; Bacarra, N. M. E.; Romano, D. M.; Hartshorn, M. A.; Tanzi, R. E.; Bush, A. I. J. Biol. Chem. 1998, 273, 12817.
40. Opazo, C.; Ruiz, F. H.; Inestrosa, N. C. Biol. Res. 2000, 33, 125.
41. Kishita, A.; Nishino, S.; Nishida, Y. Pept. Sci. 2003, 39, 115.
42. Giuffrida, M. L.; Grasso, G.; Ruvo, M.; Pedone, C.; Saporito, A.; Marasco, D.; Pignataro, B.; Caseio, C.; Copani, A.; Rizzarelli, E. J. Neurosci. Res. 2007, 85, 623.
43. Ma, Q.-F.; Hu, J.; Wu, W.-H.; Liu, H.-D.; Du, J.-T.; Fu, Y.; Wu, Y.-W.; Lei, P.; Zhao, Y.-F.; Li, Y.-M. Biopolymers 2006, 83, 20.
44. Chen, Y. R.; Huang, H. B.; Chyan, C. L.; Shiao, M. S.; Lin, T. H.; Chen, Y. C. J. Biochem. (Tokyo) 2006, 139, 733.
45. Karr, J. W.; Akintoye, H.; Kaupp, L. J.; Szalai, V. A. Biochemistry 2005, 44, 5478.
46. Syme, C. D.; Nadal, R. C.; Rigby, S. E. J.; Viles, J. H. J. Biol. Chem. 2004, 279, 18169.
47. Karr, J. W.; Kaupp, L. J.; Szalai, V. A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 13534.
48. Fukada, H.; Takahashi, K. Proteins 1998, 33, 159.
49. Miura, T.; Suzuki, K.; Kohata, N.; Takeuchi, H. Biochemistry 2000, 39, 7024.
50. Dawson, R. M. C.; Elliott, D. C.; Elliott, W. H.; Jones, K. M. Data for Biochemical Research; Clarendon Press: Oxford, UK, 1986.