A post-SCF quantum chemistry study on local minima of 8-oxo-guanine stacked with all four nucleic acid bases in B-DNA conformations

Journal of Heterocyclic Chemistry

Volumn 44, Issue 4, 2007, Pages 765-773

  Cysewski, Piotr ^a,b   Czyznikowska Balcerak, Zaneta ^a  

^a NICOLAUS COPERNICUS UNIVERSITY   (Poland)

^b UNIVERSITY OF TECHNOLOGY AND LIFE SCIENCES   (Poland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

8 HYDROXYGUANINE; DNA B; HYDROXYL RADICAL; NUCLEIC ACID BASE;

ARTICLE; DNA CONFORMATION; DNA DEGRADATION; ELECTRICITY; ENERGY TRANSFER; MOLECULAR INTERACTION; OXIDATION; QUANTUM CHEMISTRY; THERMODYNAMICS;

EID: 36749015011     PISSN: 0022152X     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/jhet.5570440403     Document Type: Article

References (28)

1. Lindahl, T. Nature, 1993, 362, 709.
2. Fromme, J. Ch.; Banerjee, A..; Huang, S. J.; Verdine, G. L. Nature, 2004, 424, 7, 652.
3. Kasai, H.; Chung, M. H.; Jones, D. S.; Inoue, H.; Ishikawa, H.; Kamiya, H.; Ohtsuka, E.; Nishimura, S. J. Toxicol. Sci. 1991, 16, 95.
4. Kasai, H.; Tanooka, H.; Nishimura, S. Gann. 1984, 75, 1037.
5. Akasaka, S.; Takimoto, K.; Yamamoto, K. Mol. Gen. Genet. 1992, 1, 235.
6. Kuchino, Y.; Moni, F.; Kasai, H. Nature, 1987, 327, 77.
7. Cysewski, P.; Jeziorek, D. J. Mol. Struct. THEOCHEM, 1998, 430, 219.
8. Culp, S. J.; Cho, B. P.; Kadlubar F. F.; Evans, F. E. Chem. Res. Toxicol. 1989, 2, 416.
9. Cysewski, P. Z. Phys. Chem. 2005, 219, 213.
10. Cysewski, P.; Czyznikowska-Balcerak, Ż.; Szefler, B. Polish J. Chem. 2003, 77, 1287.
11. Cysewski, P.; Czyznikowska-Balcerak, Z. J. Mol. Struct. THEOCHEM, 2005, 757, 29.
12. D. W. Ussery, Encyclopedia of Life Sciences, Macmillan Publishers Ltd, Nature Publishing Group, 2002.
13. Šponer, J.; Jurečka, P.; Marchan, I.; Luque, F. J.; Orozco, M.; Hobza, P. Chem. Eur. J. 2006, 12, 2854.
14. Jurečka, P.; Šponer, J.; Černý J.; Hobza, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 1985.
15. Hobza, P.; Sponer, J. J. Chem. Rev. 1999, 99, 3247.
16. Hobza, P.; Sponer, J. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 11802.
17. Šponer, J.; Leszczyński, J.; Hobza, P. Biopolymers 2001, 61, 3.
18. Waller, M. P.; Robertazzi, A.; Platts, J. A.; Hibbs D. E.; Williams, P. A. J. Comput. Chem. 2006, 27, 491.
19. Sponer, J.; Hobza, P. Chem. Phys. Lett. 1997, 267, 263.
20. Šponer, J.; Leszczyński, J.; Hobza, P. J. Mol. Struct. THEOCHEM, 2001, 573, 43.
21. Xiang-Jun L.; Olson, W. K. Nucleic Acids. Res. 2003, 31, 5108.
22. Kushwaha, P. S.; Kumar A.; Mishra, P. C. Spectrochimica Acta Part A, 2004, 60, T19.
23. S. F. Boys, S. F.; Bernardi, F. Mol. Phys., 1970, 19, 553.
24. Gaussian 03, Revision A.1, A.1, Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A.; Vreven, T. Jr.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Darmenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian, Inc., Pittsburgh PA, 2003.
25. Bixon, M.; Jortner, J. Adv. Chem. Phys. 1999 106.
26. Erkilla, K. E.; Oldom D. T.; Barton, J. K. Chem. Rev. 1999, 99, 2777.
27. Pyshnyi, D. V.; Ivanova, E. M. Russ. Chem. B, 2002, 51, 1145.
28. Yakovchuk, P.; Protozanova, E.; Frank-Kamenetskii, M. D. Nucleic Acids Res., 2006, 34, 564.